Protein–RNA interactions for Protein: P15202

CTA1, Peroxisomal catalase A, yeastyeast

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTA1P15202 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.33■□□□□ 0.52
CTA1P15202 NSR1YGR159C 1245 nt18.18■□□□□ 0.5
CTA1P15202 NOP1YDL014W 984 nt17.8■□□□□ 0.44
CTA1P15202 YKL036CYKL036C 393 nt16.53■□□□□ 0.24
CTA1P15202 MDJ1YFL016C 1536 nt16.12■□□□□ 0.17
CTA1P15202 Q0297Q0297 156 nt15.69■□□□□ 0.1
CTA1P15202 SRX1YKL086W 384 nt15.62■□□□□ 0.09
CTA1P15202 YJL027CYJL027C 417 nt15.42■□□□□ 0.06
CTA1P15202 SCS3YGL126W 1143 nt15.11■□□□□ 0.01
CTA1P15202 YCR051WYCR051W 669 nt14.77□□□□□ -0.05
CTA1P15202 YOL085CYOL085C 342 nt14.36□□□□□ -0.11
CTA1P15202 DBP2YNL112W 1641 nt14.36□□□□□ -0.11
CTA1P15202 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.12□□□□□ -0.15
CTA1P15202 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.12□□□□□ -0.15
CTA1P15202 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.12□□□□□ -0.15
CTA1P15202 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.12□□□□□ -0.15
CTA1P15202 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.12□□□□□ -0.15
CTA1P15202 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.12□□□□□ -0.15
CTA1P15202 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.12□□□□□ -0.15
CTA1P15202 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.12□□□□□ -0.15
CTA1P15202 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.12□□□□□ -0.15
CTA1P15202 PKP1YIL042C 1185 nt14.12□□□□□ -0.15
CTA1P15202 RPP1BYDL130W 321 nt14.06□□□□□ -0.16
CTA1P15202 CCC1YLR220W 969 nt13.91□□□□□ -0.18
CTA1P15202 YBR190WYBR190W 312 nt13.74□□□□□ -0.21
CTA1P15202 ATS1YAL020C 1002 nt13.53□□□□□ -0.24
CTA1P15202 PET122YER153C 765 nt13.45□□□□□ -0.26
CTA1P15202 SCJ1YMR214W 1134 nt13.44□□□□□ -0.26
CTA1P15202 RTC3YHR087W 336 nt13.42□□□□□ -0.26
CTA1P15202 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.36□□□□□ -0.27
CTA1P15202 RVS167YDR388W 1449 nt13.34□□□□□ -0.27
CTA1P15202 SCR1SCR1 522 nt13.22□□□□□ -0.29
CTA1P15202 RRN5YLR141W 1092 nt13.06□□□□□ -0.32
CTA1P15202 SHR5YOL110W 714 nt12.97□□□□□ -0.33
CTA1P15202 YDJ1YNL064C 1230 nt12.92□□□□□ -0.34
CTA1P15202 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.82□□□□□ -0.36
CTA1P15202 RSB1YOR049C 1065 nt12.76□□□□□ -0.37
CTA1P15202 PUT4YOR348C 1884 nt12.64□□□□□ -0.39
CTA1P15202 GAR1YHR089C 618 nt12.6□□□□□ -0.39
CTA1P15202 DEP1YAL013W 1218 nt12.58□□□□□ -0.4
CTA1P15202 URN1YPR152C 1398 nt12.56□□□□□ -0.4
CTA1P15202 PST2YDR032C 597 nt12.56□□□□□ -0.4
CTA1P15202 OPI9YLR338W 858 nt12.39□□□□□ -0.43
CTA1P15202 YNL208WYNL208W 600 nt12.37□□□□□ -0.43
CTA1P15202 SSA3YBL075C 1950 nt12.37□□□□□ -0.43
CTA1P15202 ARE1YCR048W 1833 nt12.34□□□□□ -0.43
CTA1P15202 SAH1YER043C 1350 nt12.31□□□□□ -0.44
CTA1P15202 RPN10YHR200W 807 nt12.31□□□□□ -0.44
CTA1P15202 POA1YBR022W 534 nt12.23□□□□□ -0.45
CTA1P15202 TIR1YER011W 765 nt12.19□□□□□ -0.46
CTA1P15202 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.18□□□□□ -0.46
CTA1P15202 SSA1YAL005C 1929 nt12.08□□□□□ -0.48
CTA1P15202 SHU1YHL006C 453 nt12.03□□□□□ -0.48
CTA1P15202 YKL097CYKL097C 411 nt12.02□□□□□ -0.49
CTA1P15202 BSC6YOL137W 1494 nt12.01□□□□□ -0.49
CTA1P15202 YJR018WYJR018W 363 nt11.99□□□□□ -0.49
CTA1P15202 PUN1YLR414C 792 nt11.99□□□□□ -0.49
CTA1P15202 SRB2YHR041C 633 nt11.98□□□□□ -0.49
CTA1P15202 YJR120WYJR120W 351 nt11.95□□□□□ -0.5
CTA1P15202 BUD23YCR047C 828 nt11.89□□□□□ -0.51
CTA1P15202 PTC2YER089C 1395 nt11.87□□□□□ -0.51
CTA1P15202 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.81□□□□□ -0.52
CTA1P15202 NAB2YGL122C 1578 nt11.76□□□□□ -0.53
CTA1P15202 RPP2BYDR382W 333 nt11.69□□□□□ -0.54
CTA1P15202 WWM1YFL010C 636 nt11.68□□□□□ -0.54
CTA1P15202 SPT5YML010W 3192 nt11.63□□□□□ -0.55
CTA1P15202 YOR139CYOR139C 393 nt11.62□□□□□ -0.55
CTA1P15202 HOM6YJR139C 1080 nt11.61□□□□□ -0.55
CTA1P15202 FIS1YIL065C 468 nt11.6□□□□□ -0.55
CTA1P15202 YGR021WYGR021W 873 nt11.58□□□□□ -0.56
CTA1P15202 MNP1YGL068W 585 nt11.56□□□□□ -0.56
CTA1P15202 DAL1YIR027C 1383 nt11.55□□□□□ -0.56
CTA1P15202 BDH2YAL061W 1254 nt11.54□□□□□ -0.56
CTA1P15202 INM2YDR287W 879 nt11.53□□□□□ -0.56
CTA1P15202 FPR4YLR449W 1179 nt11.52□□□□□ -0.57
CTA1P15202 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.46□□□□□ -0.57
CTA1P15202 PHO4YFR034C 939 nt11.45□□□□□ -0.58
CTA1P15202 YBL100CYBL100C 315 nt11.44□□□□□ -0.58
CTA1P15202 RKM5YLR137W 1104 nt11.42□□□□□ -0.58
CTA1P15202 LSM3YLR438C-A 270 nt11.4□□□□□ -0.58
CTA1P15202 NPL3YDR432W 1245 nt11.39□□□□□ -0.59
CTA1P15202 YOL037CYOL037C 354 nt11.34□□□□□ -0.59
CTA1P15202 FUN26YAL022C 1554 nt11.33□□□□□ -0.6
CTA1P15202 SSA4YER103W 1929 nt11.32□□□□□ -0.6
CTA1P15202 YPS1YLR120C 1710 nt11.31□□□□□ -0.6
CTA1P15202 MEP2YNL142W 1500 nt11.3□□□□□ -0.6
CTA1P15202 TRM9YML014W 840 nt11.27□□□□□ -0.61
CTA1P15202 CCT6YDR188W 1641 nt11.22□□□□□ -0.61
CTA1P15202 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.2□□□□□ -0.62
CTA1P15202 YDR095CYDR095C 411 nt11.19□□□□□ -0.62
CTA1P15202 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.15□□□□□ -0.62
CTA1P15202 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.15□□□□□ -0.62
CTA1P15202 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.15□□□□□ -0.62
CTA1P15202 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.15□□□□□ -0.62
CTA1P15202 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.15□□□□□ -0.62
CTA1P15202 YLR281CYLR281C 468 nt11.13□□□□□ -0.63
CTA1P15202 DCW1YKL046C 1350 nt11.11□□□□□ -0.63
CTA1P15202 ALF1YNL148C 765 nt11.09□□□□□ -0.63
CTA1P15202 WHI5YOR083W 888 nt11.06□□□□□ -0.64
CTA1P15202 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.1 ms