Protein–RNA interactions for Protein: Q06676

YFT2, FIT family protein YFT2, yeastyeast

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YFT2Q06676 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.1■□□□□ 0.81
YFT2Q06676 NOP1YDL014W 984 nt19.74■□□□□ 0.75
YFT2Q06676 NSR1YGR159C 1245 nt19.74■□□□□ 0.75
YFT2Q06676 YKL036CYKL036C 393 nt18.53■□□□□ 0.56
YFT2Q06676 Q0297Q0297 156 nt17.4■□□□□ 0.38
YFT2Q06676 YJL027CYJL027C 417 nt17.34■□□□□ 0.37
YFT2Q06676 SRX1YKL086W 384 nt17.25■□□□□ 0.35
YFT2Q06676 MDJ1YFL016C 1536 nt17.12■□□□□ 0.33
YFT2Q06676 SCS3YGL126W 1143 nt17.01■□□□□ 0.31
YFT2Q06676 YCR051WYCR051W 669 nt16.35■□□□□ 0.21
YFT2Q06676 YOL085CYOL085C 342 nt16.04■□□□□ 0.16
YFT2Q06676 PKP1YIL042C 1185 nt15.71■□□□□ 0.11
YFT2Q06676 RPP1BYDL130W 321 nt15.6■□□□□ 0.09
YFT2Q06676 SCJ1YMR214W 1134 nt15.58■□□□□ 0.08
YFT2Q06676 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.37■□□□□ 0.05
YFT2Q06676 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.37■□□□□ 0.05
YFT2Q06676 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.37■□□□□ 0.05
YFT2Q06676 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.37■□□□□ 0.05
YFT2Q06676 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.37■□□□□ 0.05
YFT2Q06676 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.37■□□□□ 0.05
YFT2Q06676 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.37■□□□□ 0.05
YFT2Q06676 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.37■□□□□ 0.05
YFT2Q06676 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.37■□□□□ 0.05
YFT2Q06676 ATS1YAL020C 1002 nt15.34■□□□□ 0.05
YFT2Q06676 DBP2YNL112W 1641 nt15.32■□□□□ 0.04
YFT2Q06676 CCC1YLR220W 969 nt15.19■□□□□ 0.02
YFT2Q06676 PET122YER153C 765 nt14.84□□□□□ -0.03
YFT2Q06676 SCR1SCR1 522 nt14.8□□□□□ -0.04
YFT2Q06676 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.66□□□□□ -0.06
YFT2Q06676 YBR190WYBR190W 312 nt14.56□□□□□ -0.08
YFT2Q06676 RVS167YDR388W 1449 nt14.5□□□□□ -0.09
YFT2Q06676 RRN5YLR141W 1092 nt14.47□□□□□ -0.09
YFT2Q06676 RSB1YOR049C 1065 nt14.25□□□□□ -0.13
YFT2Q06676 RTC3YHR087W 336 nt14.22□□□□□ -0.13
YFT2Q06676 YDJ1YNL064C 1230 nt14.21□□□□□ -0.13
YFT2Q06676 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.18□□□□□ -0.14
YFT2Q06676 PST2YDR032C 597 nt14.16□□□□□ -0.14
YFT2Q06676 SHR5YOL110W 714 nt14.08□□□□□ -0.16
YFT2Q06676 GAR1YHR089C 618 nt13.79□□□□□ -0.2
YFT2Q06676 YKL097CYKL097C 411 nt13.76□□□□□ -0.21
YFT2Q06676 DEP1YAL013W 1218 nt13.52□□□□□ -0.25
YFT2Q06676 SHU1YHL006C 453 nt13.47□□□□□ -0.25
YFT2Q06676 URN1YPR152C 1398 nt13.45□□□□□ -0.26
YFT2Q06676 SSA3YBL075C 1950 nt13.44□□□□□ -0.26
YFT2Q06676 YNL208WYNL208W 600 nt13.4□□□□□ -0.26
YFT2Q06676 RPN10YHR200W 807 nt13.35□□□□□ -0.27
YFT2Q06676 TIR1YER011W 765 nt13.33□□□□□ -0.28
YFT2Q06676 OPI9YLR338W 858 nt13.2□□□□□ -0.3
YFT2Q06676 YOR139CYOR139C 393 nt13.14□□□□□ -0.31
YFT2Q06676 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.13□□□□□ -0.31
YFT2Q06676 SSA1YAL005C 1929 nt13.08□□□□□ -0.32
YFT2Q06676 SAH1YER043C 1350 nt13□□□□□ -0.33
YFT2Q06676 NPL3YDR432W 1245 nt12.95□□□□□ -0.34
YFT2Q06676 PUT4YOR348C 1884 nt12.93□□□□□ -0.34
YFT2Q06676 SRB2YHR041C 633 nt12.9□□□□□ -0.34
YFT2Q06676 YJR018WYJR018W 363 nt12.87□□□□□ -0.35
YFT2Q06676 YGR021WYGR021W 873 nt12.85□□□□□ -0.35
YFT2Q06676 PUN1YLR414C 792 nt12.83□□□□□ -0.36
YFT2Q06676 HOM6YJR139C 1080 nt12.81□□□□□ -0.36
YFT2Q06676 ARE1YCR048W 1833 nt12.81□□□□□ -0.36
YFT2Q06676 WWM1YFL010C 636 nt12.79□□□□□ -0.36
YFT2Q06676 MNP1YGL068W 585 nt12.76□□□□□ -0.37
YFT2Q06676 YJR120WYJR120W 351 nt12.73□□□□□ -0.37
YFT2Q06676 YOL037CYOL037C 354 nt12.73□□□□□ -0.37
YFT2Q06676 RPP2BYDR382W 333 nt12.71□□□□□ -0.37
YFT2Q06676 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.63□□□□□ -0.39
YFT2Q06676 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.63□□□□□ -0.39
YFT2Q06676 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.63□□□□□ -0.39
YFT2Q06676 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.63□□□□□ -0.39
YFT2Q06676 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.63□□□□□ -0.39
YFT2Q06676 RKM5YLR137W 1104 nt12.62□□□□□ -0.39
YFT2Q06676 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.61□□□□□ -0.39
YFT2Q06676 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.6□□□□□ -0.39
YFT2Q06676 PTC2YER089C 1395 nt12.58□□□□□ -0.4
YFT2Q06676 POA1YBR022W 534 nt12.55□□□□□ -0.4
YFT2Q06676 BDH2YAL061W 1254 nt12.52□□□□□ -0.41
YFT2Q06676 LSM3YLR438C-A 270 nt12.45□□□□□ -0.42
YFT2Q06676 YLR281CYLR281C 468 nt12.42□□□□□ -0.42
YFT2Q06676 INM2YDR287W 879 nt12.4□□□□□ -0.42
YFT2Q06676 PUS2YGL063W 1113 nt12.4□□□□□ -0.42
YFT2Q06676 NAB2YGL122C 1578 nt12.39□□□□□ -0.43
YFT2Q06676 BUD23YCR047C 828 nt12.35□□□□□ -0.43
YFT2Q06676 WHI5YOR083W 888 nt12.31□□□□□ -0.44
YFT2Q06676 YBL100CYBL100C 315 nt12.3□□□□□ -0.44
YFT2Q06676 DAL1YIR027C 1383 nt12.29□□□□□ -0.44
YFT2Q06676 MOT3YMR070W 1473 nt12.26□□□□□ -0.45
YFT2Q06676 FPR4YLR449W 1179 nt12.24□□□□□ -0.45
YFT2Q06676 TRM9YML014W 840 nt12.23□□□□□ -0.45
YFT2Q06676 FIS1YIL065C 468 nt12.22□□□□□ -0.45
YFT2Q06676 BSC6YOL137W 1494 nt12.2□□□□□ -0.46
YFT2Q06676 FUN26YAL022C 1554 nt12.17□□□□□ -0.46
YFT2Q06676 PHO4YFR034C 939 nt12.16□□□□□ -0.46
YFT2Q06676 Q0182Q0182 405 nt12.1□□□□□ -0.47
YFT2Q06676 CCT6YDR188W 1641 nt12.09□□□□□ -0.47
YFT2Q06676 DSK2YMR276W 1122 nt12.09□□□□□ -0.47
YFT2Q06676 IMP2'YIL154C 1041 nt12.08□□□□□ -0.48
YFT2Q06676 YPR011CYPR011C 981 nt12.07□□□□□ -0.48
YFT2Q06676 FMP45YDL222C 930 nt12.06□□□□□ -0.48
YFT2Q06676 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.06□□□□□ -0.48
YFT2Q06676 YLR236CYLR236C 324 nt12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.2 ms