Protein–RNA interactions for Protein: Q06616

YPR174C, Nuclear envelope protein YPR174C, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPR174CQ06616 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.07■□□□□ 0.64
YPR174CQ06616 NSR1YGR159C 1245 nt18.9■□□□□ 0.62
YPR174CQ06616 NOP1YDL014W 984 nt18.57■□□□□ 0.56
YPR174CQ06616 YKL036CYKL036C 393 nt17.2■□□□□ 0.34
YPR174CQ06616 MDJ1YFL016C 1536 nt16.7■□□□□ 0.26
YPR174CQ06616 Q0297Q0297 156 nt16.28■□□□□ 0.2
YPR174CQ06616 SRX1YKL086W 384 nt16.23■□□□□ 0.19
YPR174CQ06616 YJL027CYJL027C 417 nt16.07■□□□□ 0.16
YPR174CQ06616 SCS3YGL126W 1143 nt15.68■□□□□ 0.1
YPR174CQ06616 YCR051WYCR051W 669 nt15.4■□□□□ 0.06
YPR174CQ06616 YOL085CYOL085C 342 nt14.89□□□□□ -0.03
YPR174CQ06616 DBP2YNL112W 1641 nt14.81□□□□□ -0.04
YPR174CQ06616 PKP1YIL042C 1185 nt14.65□□□□□ -0.06
YPR174CQ06616 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.63□□□□□ -0.07
YPR174CQ06616 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.63□□□□□ -0.07
YPR174CQ06616 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.63□□□□□ -0.07
YPR174CQ06616 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.63□□□□□ -0.07
YPR174CQ06616 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.63□□□□□ -0.07
YPR174CQ06616 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.63□□□□□ -0.07
YPR174CQ06616 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.63□□□□□ -0.07
YPR174CQ06616 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.63□□□□□ -0.07
YPR174CQ06616 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.63□□□□□ -0.07
YPR174CQ06616 RPP1BYDL130W 321 nt14.61□□□□□ -0.07
YPR174CQ06616 CCC1YLR220W 969 nt14.48□□□□□ -0.09
YPR174CQ06616 YBR190WYBR190W 312 nt14.23□□□□□ -0.13
YPR174CQ06616 ATS1YAL020C 1002 nt14.05□□□□□ -0.16
YPR174CQ06616 SCJ1YMR214W 1134 nt13.98□□□□□ -0.17
YPR174CQ06616 RVS167YDR388W 1449 nt13.95□□□□□ -0.18
YPR174CQ06616 PET122YER153C 765 nt13.94□□□□□ -0.18
YPR174CQ06616 RTC3YHR087W 336 nt13.92□□□□□ -0.18
YPR174CQ06616 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.86□□□□□ -0.19
YPR174CQ06616 SCR1SCR1 522 nt13.82□□□□□ -0.2
YPR174CQ06616 RRN5YLR141W 1092 nt13.55□□□□□ -0.24
YPR174CQ06616 SHR5YOL110W 714 nt13.48□□□□□ -0.25
YPR174CQ06616 YDJ1YNL064C 1230 nt13.41□□□□□ -0.26
YPR174CQ06616 RSB1YOR049C 1065 nt13.3□□□□□ -0.28
YPR174CQ06616 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.28□□□□□ -0.28
YPR174CQ06616 GAR1YHR089C 618 nt13.1□□□□□ -0.31
YPR174CQ06616 DEP1YAL013W 1218 nt13.07□□□□□ -0.32
YPR174CQ06616 URN1YPR152C 1398 nt13.06□□□□□ -0.32
YPR174CQ06616 PST2YDR032C 597 nt13□□□□□ -0.33
YPR174CQ06616 RPN10YHR200W 807 nt12.88□□□□□ -0.35
YPR174CQ06616 YNL208WYNL208W 600 nt12.88□□□□□ -0.35
YPR174CQ06616 PUT4YOR348C 1884 nt12.86□□□□□ -0.35
YPR174CQ06616 OPI9YLR338W 858 nt12.85□□□□□ -0.35
YPR174CQ06616 SAH1YER043C 1350 nt12.75□□□□□ -0.37
YPR174CQ06616 TIR1YER011W 765 nt12.66□□□□□ -0.38
YPR174CQ06616 ARE1YCR048W 1833 nt12.65□□□□□ -0.38
YPR174CQ06616 YKL097CYKL097C 411 nt12.52□□□□□ -0.41
YPR174CQ06616 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.49□□□□□ -0.41
YPR174CQ06616 PUN1YLR414C 792 nt12.49□□□□□ -0.41
YPR174CQ06616 SSA1YAL005C 1929 nt12.49□□□□□ -0.41
YPR174CQ06616 POA1YBR022W 534 nt12.47□□□□□ -0.41
YPR174CQ06616 SSA3YBL075C 1950 nt12.47□□□□□ -0.41
YPR174CQ06616 YJR018WYJR018W 363 nt12.46□□□□□ -0.41
YPR174CQ06616 SHU1YHL006C 453 nt12.45□□□□□ -0.42
YPR174CQ06616 PTC2YER089C 1395 nt12.31□□□□□ -0.44
YPR174CQ06616 SRB2YHR041C 633 nt12.29□□□□□ -0.44
YPR174CQ06616 YJR120WYJR120W 351 nt12.27□□□□□ -0.45
YPR174CQ06616 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.24□□□□□ -0.45
YPR174CQ06616 RPP2BYDR382W 333 nt12.23□□□□□ -0.45
YPR174CQ06616 BUD23YCR047C 828 nt12.21□□□□□ -0.45
YPR174CQ06616 BSC6YOL137W 1494 nt12.18□□□□□ -0.46
YPR174CQ06616 NAB2YGL122C 1578 nt12.14□□□□□ -0.47
YPR174CQ06616 WWM1YFL010C 636 nt12.11□□□□□ -0.47
YPR174CQ06616 YGR021WYGR021W 873 nt12.07□□□□□ -0.48
YPR174CQ06616 HOM6YJR139C 1080 nt12.03□□□□□ -0.48
YPR174CQ06616 INM2YDR287W 879 nt12.01□□□□□ -0.49
YPR174CQ06616 YOR139CYOR139C 393 nt12□□□□□ -0.49
YPR174CQ06616 DAL1YIR027C 1383 nt12□□□□□ -0.49
YPR174CQ06616 BDH2YAL061W 1254 nt11.99□□□□□ -0.49
YPR174CQ06616 FIS1YIL065C 468 nt11.98□□□□□ -0.49
YPR174CQ06616 MNP1YGL068W 585 nt11.97□□□□□ -0.49
YPR174CQ06616 FPR4YLR449W 1179 nt11.97□□□□□ -0.49
YPR174CQ06616 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.92□□□□□ -0.5
YPR174CQ06616 YBL100CYBL100C 315 nt11.91□□□□□ -0.5
YPR174CQ06616 NPL3YDR432W 1245 nt11.89□□□□□ -0.51
YPR174CQ06616 PHO4YFR034C 939 nt11.89□□□□□ -0.51
YPR174CQ06616 LSM3YLR438C-A 270 nt11.86□□□□□ -0.51
YPR174CQ06616 RKM5YLR137W 1104 nt11.85□□□□□ -0.51
YPR174CQ06616 YOL037CYOL037C 354 nt11.81□□□□□ -0.52
YPR174CQ06616 FUN26YAL022C 1554 nt11.77□□□□□ -0.53
YPR174CQ06616 TRM9YML014W 840 nt11.76□□□□□ -0.53
YPR174CQ06616 CCT6YDR188W 1641 nt11.64□□□□□ -0.55
YPR174CQ06616 YPS1YLR120C 1710 nt11.63□□□□□ -0.55
YPR174CQ06616 ALF1YNL148C 765 nt11.58□□□□□ -0.56
YPR174CQ06616 YDR095CYDR095C 411 nt11.56□□□□□ -0.56
YPR174CQ06616 SPT5YML010W 3192 nt11.53□□□□□ -0.56
YPR174CQ06616 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.53□□□□□ -0.56
YPR174CQ06616 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.53□□□□□ -0.56
YPR174CQ06616 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.53□□□□□ -0.56
YPR174CQ06616 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.53□□□□□ -0.56
YPR174CQ06616 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.53□□□□□ -0.56
YPR174CQ06616 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.53□□□□□ -0.56
YPR174CQ06616 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.53□□□□□ -0.56
YPR174CQ06616 YLR281CYLR281C 468 nt11.53□□□□□ -0.56
YPR174CQ06616 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.5□□□□□ -0.57
YPR174CQ06616 WHI5YOR083W 888 nt11.49□□□□□ -0.57
YPR174CQ06616 PUS2YGL063W 1113 nt11.44□□□□□ -0.58
YPR174CQ06616 MEP2YNL142W 1500 nt11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.3 ms