Protein–RNA interactions for Protein: P27654

TIP1, Temperature shock-inducible protein 1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TIP1P27654 NSR1YGR159C 1245 nt16.97■□□□□ 0.31
TIP1P27654 YML009W-BYML009W-B 477 nt16.55■□□□□ 0.24
TIP1P27654 NOP1YDL014W 984 nt15.88■□□□□ 0.13
TIP1P27654 MDJ1YFL016C 1536 nt15.57■□□□□ 0.08
TIP1P27654 YJL027CYJL027C 417 nt14.28□□□□□ -0.12
TIP1P27654 YKL036CYKL036C 393 nt14.16□□□□□ -0.14
TIP1P27654 SRX1YKL086W 384 nt13.91□□□□□ -0.18
TIP1P27654 Q0297Q0297 156 nt13.78□□□□□ -0.2
TIP1P27654 DBP2YNL112W 1641 nt13.62□□□□□ -0.23
TIP1P27654 YBR190WYBR190W 312 nt13.43□□□□□ -0.26
TIP1P27654 SSA3YBL075C 1950 nt13.16□□□□□ -0.3
TIP1P27654 YCR051WYCR051W 669 nt13.09□□□□□ -0.31
TIP1P27654 RTC3YHR087W 336 nt13.02□□□□□ -0.33
TIP1P27654 TRN1tP(UGG)A 72 nt12.92□□□□□ -0.34
TIP1P27654 SUF9tP(UGG)F 72 nt12.92□□□□□ -0.34
TIP1P27654 SUF8tP(UGG)H 72 nt12.92□□□□□ -0.34
TIP1P27654 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt12.92□□□□□ -0.34
TIP1P27654 SUF7tP(UGG)M 72 nt12.92□□□□□ -0.34
TIP1P27654 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt12.92□□□□□ -0.34
TIP1P27654 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt12.92□□□□□ -0.34
TIP1P27654 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt12.92□□□□□ -0.34
TIP1P27654 SUF11tP(UGG)O2 72 nt12.92□□□□□ -0.34
TIP1P27654 CCC1YLR220W 969 nt12.69□□□□□ -0.38
TIP1P27654 PUT4YOR348C 1884 nt12.65□□□□□ -0.38
TIP1P27654 SCS3YGL126W 1143 nt12.63□□□□□ -0.39
TIP1P27654 RVS167YDR388W 1449 nt12.58□□□□□ -0.4
TIP1P27654 SCJ1YMR214W 1134 nt12.49□□□□□ -0.41
TIP1P27654 RPP1BYDL130W 321 nt12.34□□□□□ -0.43
TIP1P27654 YOL085CYOL085C 342 nt12.31□□□□□ -0.44
TIP1P27654 ARE1YCR048W 1833 nt12.25□□□□□ -0.45
TIP1P27654 POA1YBR022W 534 nt12.15□□□□□ -0.46
TIP1P27654 PKP1YIL042C 1185 nt12.14□□□□□ -0.47
TIP1P27654 SHR5YOL110W 714 nt12.06□□□□□ -0.48
TIP1P27654 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.05□□□□□ -0.48
TIP1P27654 SAH1YER043C 1350 nt12.05□□□□□ -0.48
TIP1P27654 URN1YPR152C 1398 nt12.04□□□□□ -0.48
TIP1P27654 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.02□□□□□ -0.49
TIP1P27654 BSC6YOL137W 1494 nt12.02□□□□□ -0.49
TIP1P27654 SPT5YML010W 3192 nt12.01□□□□□ -0.49
TIP1P27654 OPI9YLR338W 858 nt12□□□□□ -0.49
TIP1P27654 PET122YER153C 765 nt11.86□□□□□ -0.51
TIP1P27654 DEP1YAL013W 1218 nt11.85□□□□□ -0.51
TIP1P27654 SSA4YER103W 1929 nt11.75□□□□□ -0.53
TIP1P27654 RPN10YHR200W 807 nt11.71□□□□□ -0.53
TIP1P27654 BUD23YCR047C 828 nt11.67□□□□□ -0.54
TIP1P27654 YDJ1YNL064C 1230 nt11.65□□□□□ -0.54
TIP1P27654 YNL208WYNL208W 600 nt11.64□□□□□ -0.55
TIP1P27654 PUN1YLR414C 792 nt11.63□□□□□ -0.55
TIP1P27654 PTC2YER089C 1395 nt11.57□□□□□ -0.56
TIP1P27654 SCR1SCR1 522 nt11.53□□□□□ -0.56
TIP1P27654 NAB2YGL122C 1578 nt11.5□□□□□ -0.57
TIP1P27654 YJR018WYJR018W 363 nt11.44□□□□□ -0.58
TIP1P27654 RRN5YLR141W 1092 nt11.44□□□□□ -0.58
TIP1P27654 GAR1YHR089C 618 nt11.42□□□□□ -0.58
TIP1P27654 BDF1YLR399C 2061 nt11.41□□□□□ -0.58
TIP1P27654 MEP2YNL142W 1500 nt11.35□□□□□ -0.59
TIP1P27654 FIS1YIL065C 468 nt11.35□□□□□ -0.59
TIP1P27654 DAL1YIR027C 1383 nt11.26□□□□□ -0.61
TIP1P27654 YJR120WYJR120W 351 nt11.25□□□□□ -0.61
TIP1P27654 TAT1YBR069C 1860 nt11.24□□□□□ -0.61
TIP1P27654 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.24□□□□□ -0.61
TIP1P27654 PHO4YFR034C 939 nt11.16□□□□□ -0.62
TIP1P27654 DCW1YKL046C 1350 nt11.16□□□□□ -0.62
TIP1P27654 YPS1YLR120C 1710 nt11.15□□□□□ -0.62
TIP1P27654 ATS1YAL020C 1002 nt11.15□□□□□ -0.62
TIP1P27654 FPR4YLR449W 1179 nt11.14□□□□□ -0.63
TIP1P27654 INM2YDR287W 879 nt11.11□□□□□ -0.63
TIP1P27654 SSA1YAL005C 1929 nt11.1□□□□□ -0.63
TIP1P27654 TIR1YER011W 765 nt11.09□□□□□ -0.63
TIP1P27654 RPP2BYDR382W 333 nt11.03□□□□□ -0.64
TIP1P27654 YDR095CYDR095C 411 nt11.01□□□□□ -0.65
TIP1P27654 RSB1YOR049C 1065 nt11.01□□□□□ -0.65
TIP1P27654 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11□□□□□ -0.65
TIP1P27654 YBR220CYBR220C 1683 nt11□□□□□ -0.65
TIP1P27654 EMI2YDR516C 1503 nt10.98□□□□□ -0.65
TIP1P27654 YBL100CYBL100C 315 nt10.91□□□□□ -0.66
TIP1P27654 YMR090WYMR090W 684 nt10.9□□□□□ -0.66
TIP1P27654 YDL221WYDL221W 552 nt10.87□□□□□ -0.67
TIP1P27654 SRB2YHR041C 633 nt10.85□□□□□ -0.67
TIP1P27654 SDH1YKL148C 1923 nt10.85□□□□□ -0.67
TIP1P27654 PTP1YDL230W 1008 nt10.84□□□□□ -0.67
TIP1P27654 CAC2YML102W 1407 nt10.83□□□□□ -0.68
TIP1P27654 PAC11YDR488C 1602 nt10.8□□□□□ -0.68
TIP1P27654 FUN26YAL022C 1554 nt10.78□□□□□ -0.68
TIP1P27654 BDH2YAL061W 1254 nt10.77□□□□□ -0.69
TIP1P27654 RPP2AYOL039W 321 nt10.77□□□□□ -0.69
TIP1P27654 PCH2YBR186W 1695 nt10.7□□□□□ -0.7
TIP1P27654 Q0182Q0182 405 nt10.69□□□□□ -0.7
TIP1P27654 IRC15YPL017C 1500 nt10.68□□□□□ -0.7
TIP1P27654 GUT2YIL155C 1950 nt10.68□□□□□ -0.7
TIP1P27654 SCC4YER147C 1875 nt10.68□□□□□ -0.7
TIP1P27654 ALF1YNL148C 765 nt10.68□□□□□ -0.7
TIP1P27654 SEC11YIR022W 504 nt10.65□□□□□ -0.7
TIP1P27654 TRM9YML014W 840 nt10.62□□□□□ -0.71
TIP1P27654 SIS1YNL007C 1059 nt10.62□□□□□ -0.71
TIP1P27654 CCT6YDR188W 1641 nt10.62□□□□□ -0.71
TIP1P27654 GIS3YLR094C 1509 nt10.6□□□□□ -0.71
TIP1P27654 PIB2YGL023C 1908 nt10.57□□□□□ -0.72
TIP1P27654 LSM3YLR438C-A 270 nt10.54□□□□□ -0.72
TIP1P27654 GFD2YCL036W 1701 nt10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 58.5 ms