RNA–Protein interactions for RNA: YBL058W

SHP1, Transcript of UBX (ubiquitin regulatory X) domain-containing protein, yeastyeast

Gene SHP1, Length 1,272 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHP1YBL058W YER184CP39961 794 aa5.01□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W MDE1P47095 244 aa5.01□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W YIP5P53108 310 aa5.01□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W GPI1P53306 609 aa5.01□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W TNA1P53322 534 aa5.01□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W APM1Q00776 475 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W GMC1Q04399 608 aa5.01□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W ATG26Q06321 1198 aa5.01□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W IPK1Q06667 281 aa5.01□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W ASA1Q06822 443 aa5.01□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W MIM1Q08176 113 aa5.01□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W SIA1Q12212 622 aa5.01□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W ARO3P14843 370 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W PRP4P20053 465 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W APA2P22108 325 aa5□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W NTG1P31378 399 aa5□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W VPH2P32341 215 aa5□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W CCZ1P38273 704 aa5□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W GLR1P41921 483 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W GPI8P49018 411 aa5□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W RRN5Q02983 363 aa5□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W YDR391CQ04170 232 aa5□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W HFD1Q04458 532 aa5□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W TAZ1Q06510 381 aa5□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W NDL1Q06568 189 aa5□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W CSI2Q08054 341 aa5□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W SNX3Q08826 162 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W SPC3Q12133 184 aa5□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W FRE8Q12209 686 aa5□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W ADE8P04161 214 aa4.99□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W MSS18P08593 268 aa4.99□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W RPL11AP0C0W9 174 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W HNM1P19807 563 aa4.99□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W CMK2P22517 447 aa4.99□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W PCL1P24867 279 aa4.99□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W MLH1P38920 769 aa4.99□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W BUR6P40096 142 aa4.99□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W GET1P53192 235 aa4.99□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W SPR6Q01684 191 aa4.99□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W HMO1Q03973 246 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W PEX12Q04370 399 aa4.99□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W SSK1Q07084 712 aa4.99□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W MCT1Q12283 360 aa4.99□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W RPL11BQ3E757 174 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W YPR053CQ6Q5F3 151 aa4.99□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W RPL6BP05739 176 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W DPM1P14020 267 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W CPR2P23285 205 aa4.98□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W POL4P25615 582 aa4.98□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W GLC7P32598 312 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W VMA11P32842 164 aa4.98□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W SKG1P36169 355 aa4.98□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W SWD1P39706 426 aa4.98□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W MRX1P40050 688 aa4.98□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W BNA7Q04066 261 aa4.98□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W TPO3Q06451 622 aa4.98□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W YPR196WQ06595 470 aa4.98□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W YPR071WQ12346 211 aa4.98□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W YCL048W-AQ2V2Q2 79 aa4.98□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W NFT1P0CE68 1218 aa4.97□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W APL3P38065 1025 aa4.97□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W YBR138CP38277 524 aa4.97□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W RTC2P38279 296 aa4.97□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W SLZ1P40167 298 aa4.97□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W MAM33P40513 266 aa4.97□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W PFS2P42841 465 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W IRC5P43610 853 aa4.97□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W MIG2P53035 382 aa4.97□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W YGL101WP53144 215 aa4.97□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W RIM9Q04734 239 aa4.97□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W BCP1Q06338 283 aa4.97□□□□□ -1.61
SHP1YBL058W MSW1P04803 379 aa4.96□□□□□ -1.62
SHP1YBL058W RPC40P07703 335 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
SHP1YBL058W MET3P08536 511 aa4.96□□□□□ -1.62
SHP1YBL058W YML003WP0CF16 290 aa4.96□□□□□ -1.62
SHP1YBL058W CLG1P35190 452 aa4.96□□□□□ -1.62
SHP1YBL058W ECM8P38246 354 aa4.96□□□□□ -1.62
SHP1YBL058W CTR2P38865 189 aa4.96□□□□□ -1.62
SHP1YBL058W RBG1P39729 369 aa4.96□□□□□ -1.62
SHP1YBL058W FLX1P40464 311 aa4.96□□□□□ -1.62
SHP1YBL058W STB1P42845 420 aa4.96□□□□□ -1.62
SHP1YBL058W YHC3P47040 408 aa4.96□□□□□ -1.62
SHP1YBL058W YJL055WP47044 245 aa4.96□□□□□ -1.62
SHP1YBL058W NOP9P47077 666 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
SHP1YBL058W YGR168CP53293 376 aa4.96□□□□□ -1.62
SHP1YBL058W DSL1P53847 754 aa4.96□□□□□ -1.62
SHP1YBL058W APJ1P53940 528 aa4.96□□□□□ -1.62
SHP1YBL058W MCH4Q08268 501 aa4.96□□□□□ -1.62
SHP1YBL058W NFI1Q12216 726 aa4.96□□□□□ -1.62
SHP1YBL058W YDL007C-AQ2V2Q0 85 aa4.96□□□□□ -1.62
SHP1YBL058W HBN1Q96VH4 193 aa4.96□□□□□ -1.62
SHP1YBL058W RPL39P04650 51 aa4.95□□□□□ -1.62
SHP1YBL058W OPI3P05375 206 aa4.95□□□□□ -1.62
SHP1YBL058W YME2P32843 850 aa4.95□□□□□ -1.62
SHP1YBL058W CTF8P38877 133 aa4.95□□□□□ -1.62
SHP1YBL058W SGN1P40561 250 aaKnown RBP RIP-Chip data4.95□□□□□ -1.62not detected
SHP1YBL058W HMS2P47175 358 aa4.95□□□□□ -1.62
SHP1YBL058W RMD9P53140 646 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
SHP1YBL058W RRN9P53437 365 aa4.95□□□□□ -1.62
SHP1YBL058W SMM1P53720 384 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
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