Protein–RNA interactions for Protein: Q12212

SIA1, Protein SIA1, yeastyeast

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SIA1Q12212 NSR1YGR159C 1245 nt18.52■□□□□ 0.56
SIA1Q12212 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.3■□□□□ 0.52
SIA1Q12212 NOP1YDL014W 984 nt17.58■□□□□ 0.4
SIA1Q12212 MDJ1YFL016C 1536 nt16.87■□□□□ 0.29
SIA1Q12212 YKL036CYKL036C 393 nt16.04■□□□□ 0.16
SIA1Q12212 YJL027CYJL027C 417 nt15.51■□□□□ 0.07
SIA1Q12212 SRX1YKL086W 384 nt15.37■□□□□ 0.05
SIA1Q12212 Q0297Q0297 156 nt15.26■□□□□ 0.03
SIA1Q12212 DBP2YNL112W 1641 nt14.76□□□□□ -0.05
SIA1Q12212 YCR051WYCR051W 669 nt14.64□□□□□ -0.07
SIA1Q12212 SCS3YGL126W 1143 nt14.5□□□□□ -0.09
SIA1Q12212 YBR190WYBR190W 312 nt14.47□□□□□ -0.09
SIA1Q12212 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.15□□□□□ -0.14
SIA1Q12212 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.15□□□□□ -0.14
SIA1Q12212 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.15□□□□□ -0.14
SIA1Q12212 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.15□□□□□ -0.14
SIA1Q12212 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.15□□□□□ -0.14
SIA1Q12212 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.15□□□□□ -0.14
SIA1Q12212 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.15□□□□□ -0.14
SIA1Q12212 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.15□□□□□ -0.14
SIA1Q12212 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.15□□□□□ -0.14
SIA1Q12212 RTC3YHR087W 336 nt14.15□□□□□ -0.14
SIA1Q12212 CCC1YLR220W 969 nt14.04□□□□□ -0.16
SIA1Q12212 YOL085CYOL085C 342 nt13.88□□□□□ -0.19
SIA1Q12212 PKP1YIL042C 1185 nt13.81□□□□□ -0.2
SIA1Q12212 RVS167YDR388W 1449 nt13.76□□□□□ -0.21
SIA1Q12212 RPP1BYDL130W 321 nt13.72□□□□□ -0.21
SIA1Q12212 SCJ1YMR214W 1134 nt13.62□□□□□ -0.23
SIA1Q12212 SSA3YBL075C 1950 nt13.6□□□□□ -0.23
SIA1Q12212 PUT4YOR348C 1884 nt13.48□□□□□ -0.25
SIA1Q12212 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.25□□□□□ -0.29
SIA1Q12212 PET122YER153C 765 nt13.17□□□□□ -0.3
SIA1Q12212 SHR5YOL110W 714 nt13.17□□□□□ -0.3
SIA1Q12212 ARE1YCR048W 1833 nt13.12□□□□□ -0.31
SIA1Q12212 URN1YPR152C 1398 nt13.08□□□□□ -0.31
SIA1Q12212 POA1YBR022W 534 nt13.03□□□□□ -0.32
SIA1Q12212 SAH1YER043C 1350 nt13.01□□□□□ -0.33
SIA1Q12212 SCR1SCR1 522 nt13□□□□□ -0.33
SIA1Q12212 DEP1YAL013W 1218 nt12.98□□□□□ -0.33
SIA1Q12212 OPI9YLR338W 858 nt12.97□□□□□ -0.33
SIA1Q12212 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.94□□□□□ -0.34
SIA1Q12212 ATS1YAL020C 1002 nt12.9□□□□□ -0.34
SIA1Q12212 BSC6YOL137W 1494 nt12.82□□□□□ -0.36
SIA1Q12212 YDJ1YNL064C 1230 nt12.8□□□□□ -0.36
SIA1Q12212 RPN10YHR200W 807 nt12.77□□□□□ -0.37
SIA1Q12212 RRN5YLR141W 1092 nt12.77□□□□□ -0.37
SIA1Q12212 YNL208WYNL208W 600 nt12.7□□□□□ -0.38
SIA1Q12212 BUD23YCR047C 828 nt12.62□□□□□ -0.39
SIA1Q12212 GAR1YHR089C 618 nt12.62□□□□□ -0.39
SIA1Q12212 PUN1YLR414C 792 nt12.58□□□□□ -0.4
SIA1Q12212 SPT5YML010W 3192 nt12.55□□□□□ -0.4
SIA1Q12212 PTC2YER089C 1395 nt12.53□□□□□ -0.4
SIA1Q12212 RSB1YOR049C 1065 nt12.52□□□□□ -0.41
SIA1Q12212 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.49□□□□□ -0.41
SIA1Q12212 YJR018WYJR018W 363 nt12.45□□□□□ -0.42
SIA1Q12212 NAB2YGL122C 1578 nt12.41□□□□□ -0.42
SIA1Q12212 SSA4YER103W 1929 nt12.28□□□□□ -0.44
SIA1Q12212 TIR1YER011W 765 nt12.21□□□□□ -0.45
SIA1Q12212 FIS1YIL065C 468 nt12.19□□□□□ -0.46
SIA1Q12212 YJR120WYJR120W 351 nt12.17□□□□□ -0.46
SIA1Q12212 SSA1YAL005C 1929 nt12.16□□□□□ -0.46
SIA1Q12212 DAL1YIR027C 1383 nt12.16□□□□□ -0.46
SIA1Q12212 FPR4YLR449W 1179 nt12.15□□□□□ -0.46
SIA1Q12212 MEP2YNL142W 1500 nt12.07□□□□□ -0.48
SIA1Q12212 RPP2BYDR382W 333 nt12.07□□□□□ -0.48
SIA1Q12212 PHO4YFR034C 939 nt12.05□□□□□ -0.48
SIA1Q12212 INM2YDR287W 879 nt12.04□□□□□ -0.48
SIA1Q12212 YPS1YLR120C 1710 nt11.97□□□□□ -0.49
SIA1Q12212 PST2YDR032C 597 nt11.93□□□□□ -0.5
SIA1Q12212 DCW1YKL046C 1350 nt11.9□□□□□ -0.5
SIA1Q12212 SRB2YHR041C 633 nt11.89□□□□□ -0.51
SIA1Q12212 YBL100CYBL100C 315 nt11.88□□□□□ -0.51
SIA1Q12212 BDF1YLR399C 2061 nt11.87□□□□□ -0.51
SIA1Q12212 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.86□□□□□ -0.51
SIA1Q12212 YDR095CYDR095C 411 nt11.81□□□□□ -0.52
SIA1Q12212 BDH2YAL061W 1254 nt11.77□□□□□ -0.53
SIA1Q12212 FUN26YAL022C 1554 nt11.73□□□□□ -0.53
SIA1Q12212 EMI2YDR516C 1503 nt11.71□□□□□ -0.53
SIA1Q12212 TAT1YBR069C 1860 nt11.68□□□□□ -0.54
SIA1Q12212 YMR090WYMR090W 684 nt11.65□□□□□ -0.54
SIA1Q12212 ALF1YNL148C 765 nt11.64□□□□□ -0.55
SIA1Q12212 YBR220CYBR220C 1683 nt11.63□□□□□ -0.55
SIA1Q12212 TRM9YML014W 840 nt11.63□□□□□ -0.55
SIA1Q12212 WWM1YFL010C 636 nt11.61□□□□□ -0.55
SIA1Q12212 CAC2YML102W 1407 nt11.6□□□□□ -0.55
SIA1Q12212 PTP1YDL230W 1008 nt11.6□□□□□ -0.55
SIA1Q12212 RPP2AYOL039W 321 nt11.6□□□□□ -0.55
SIA1Q12212 YDL221WYDL221W 552 nt11.58□□□□□ -0.56
SIA1Q12212 SHU1YHL006C 453 nt11.55□□□□□ -0.56
SIA1Q12212 SDH1YKL148C 1923 nt11.53□□□□□ -0.56
SIA1Q12212 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.53□□□□□ -0.56
SIA1Q12212 LSM3YLR438C-A 270 nt11.53□□□□□ -0.56
SIA1Q12212 CCT6YDR188W 1641 nt11.53□□□□□ -0.56
SIA1Q12212 SIS1YNL007C 1059 nt11.47□□□□□ -0.57
SIA1Q12212 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.45□□□□□ -0.58
SIA1Q12212 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.45□□□□□ -0.58
SIA1Q12212 YKL097CYKL097C 411 nt11.45□□□□□ -0.58
SIA1Q12212 IRC15YPL017C 1500 nt11.42□□□□□ -0.58
SIA1Q12212 SCC4YER147C 1875 nt11.4□□□□□ -0.58
SIA1Q12212 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.3 ms