Protein–RNA interactions for Protein: Q06451

TPO3, Polyamine transporter 3, yeastyeast

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TPO3Q06451 NSR1YGR159C 1245 nt17.75■□□□□ 0.43
TPO3Q06451 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.44■□□□□ 0.38
TPO3Q06451 NOP1YDL014W 984 nt16.72■□□□□ 0.27
TPO3Q06451 MDJ1YFL016C 1536 nt16.32■□□□□ 0.2
TPO3Q06451 YKL036CYKL036C 393 nt15.53■□□□□ 0.08
TPO3Q06451 YJL027CYJL027C 417 nt14.98□□□□□ -0.01
TPO3Q06451 Q0297Q0297 156 nt14.68□□□□□ -0.06
TPO3Q06451 SRX1YKL086W 384 nt14.62□□□□□ -0.07
TPO3Q06451 DBP2YNL112W 1641 nt14.21□□□□□ -0.13
TPO3Q06451 SCS3YGL126W 1143 nt14.2□□□□□ -0.14
TPO3Q06451 YBR190WYBR190W 312 nt14.01□□□□□ -0.17
TPO3Q06451 YCR051WYCR051W 669 nt13.88□□□□□ -0.19
TPO3Q06451 RTC3YHR087W 336 nt13.7□□□□□ -0.22
TPO3Q06451 SSA3YBL075C 1950 nt13.6□□□□□ -0.23
TPO3Q06451 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.52□□□□□ -0.25
TPO3Q06451 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.52□□□□□ -0.25
TPO3Q06451 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.52□□□□□ -0.25
TPO3Q06451 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.52□□□□□ -0.25
TPO3Q06451 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.52□□□□□ -0.25
TPO3Q06451 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.52□□□□□ -0.25
TPO3Q06451 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.52□□□□□ -0.25
TPO3Q06451 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.52□□□□□ -0.25
TPO3Q06451 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.52□□□□□ -0.25
TPO3Q06451 YOL085CYOL085C 342 nt13.46□□□□□ -0.25
TPO3Q06451 CCC1YLR220W 969 nt13.4□□□□□ -0.26
TPO3Q06451 PKP1YIL042C 1185 nt13.26□□□□□ -0.29
TPO3Q06451 RVS167YDR388W 1449 nt13.22□□□□□ -0.29
TPO3Q06451 RPP1BYDL130W 321 nt13.17□□□□□ -0.3
TPO3Q06451 PUT4YOR348C 1884 nt13.16□□□□□ -0.3
TPO3Q06451 SCJ1YMR214W 1134 nt13.07□□□□□ -0.32
TPO3Q06451 ARE1YCR048W 1833 nt12.76□□□□□ -0.37
TPO3Q06451 ATS1YAL020C 1002 nt12.71□□□□□ -0.37
TPO3Q06451 POA1YBR022W 534 nt12.71□□□□□ -0.37
TPO3Q06451 SHR5YOL110W 714 nt12.63□□□□□ -0.39
TPO3Q06451 URN1YPR152C 1398 nt12.63□□□□□ -0.39
TPO3Q06451 SAH1YER043C 1350 nt12.62□□□□□ -0.39
TPO3Q06451 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.61□□□□□ -0.39
TPO3Q06451 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.61□□□□□ -0.39
TPO3Q06451 PET122YER153C 765 nt12.6□□□□□ -0.39
TPO3Q06451 OPI9YLR338W 858 nt12.54□□□□□ -0.4
TPO3Q06451 BSC6YOL137W 1494 nt12.53□□□□□ -0.4
TPO3Q06451 DEP1YAL013W 1218 nt12.49□□□□□ -0.41
TPO3Q06451 SCR1SCR1 522 nt12.45□□□□□ -0.42
TPO3Q06451 SPT5YML010W 3192 nt12.35□□□□□ -0.43
TPO3Q06451 RPN10YHR200W 807 nt12.29□□□□□ -0.44
TPO3Q06451 BUD23YCR047C 828 nt12.28□□□□□ -0.44
TPO3Q06451 RRN5YLR141W 1092 nt12.22□□□□□ -0.45
TPO3Q06451 YNL208WYNL208W 600 nt12.19□□□□□ -0.46
TPO3Q06451 SSA4YER103W 1929 nt12.18□□□□□ -0.46
TPO3Q06451 YDJ1YNL064C 1230 nt12.18□□□□□ -0.46
TPO3Q06451 PUN1YLR414C 792 nt12.16□□□□□ -0.46
TPO3Q06451 PTC2YER089C 1395 nt12.13□□□□□ -0.47
TPO3Q06451 GAR1YHR089C 618 nt12.03□□□□□ -0.48
TPO3Q06451 NAB2YGL122C 1578 nt12.03□□□□□ -0.48
TPO3Q06451 RSB1YOR049C 1065 nt12.01□□□□□ -0.49
TPO3Q06451 YJR018WYJR018W 363 nt12□□□□□ -0.49
TPO3Q06451 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.99□□□□□ -0.49
TPO3Q06451 FIS1YIL065C 468 nt11.83□□□□□ -0.52
TPO3Q06451 MEP2YNL142W 1500 nt11.81□□□□□ -0.52
TPO3Q06451 DAL1YIR027C 1383 nt11.77□□□□□ -0.53
TPO3Q06451 BDF1YLR399C 2061 nt11.76□□□□□ -0.53
TPO3Q06451 FPR4YLR449W 1179 nt11.76□□□□□ -0.53
TPO3Q06451 PST2YDR032C 597 nt11.75□□□□□ -0.53
TPO3Q06451 YJR120WYJR120W 351 nt11.72□□□□□ -0.53
TPO3Q06451 PHO4YFR034C 939 nt11.68□□□□□ -0.54
TPO3Q06451 TIR1YER011W 765 nt11.64□□□□□ -0.55
TPO3Q06451 DCW1YKL046C 1350 nt11.64□□□□□ -0.55
TPO3Q06451 YPS1YLR120C 1710 nt11.63□□□□□ -0.55
TPO3Q06451 SSA1YAL005C 1929 nt11.63□□□□□ -0.55
TPO3Q06451 INM2YDR287W 879 nt11.62□□□□□ -0.55
TPO3Q06451 RPP2BYDR382W 333 nt11.61□□□□□ -0.55
TPO3Q06451 TAT1YBR069C 1860 nt11.59□□□□□ -0.55
TPO3Q06451 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.55□□□□□ -0.56
TPO3Q06451 YDR095CYDR095C 411 nt11.47□□□□□ -0.57
TPO3Q06451 EMI2YDR516C 1503 nt11.45□□□□□ -0.58
TPO3Q06451 YBL100CYBL100C 315 nt11.45□□□□□ -0.58
TPO3Q06451 YBR220CYBR220C 1683 nt11.42□□□□□ -0.58
TPO3Q06451 YMR090WYMR090W 684 nt11.4□□□□□ -0.58
TPO3Q06451 SRB2YHR041C 633 nt11.35□□□□□ -0.59
TPO3Q06451 YKL097CYKL097C 411 nt11.34□□□□□ -0.59
TPO3Q06451 YDL221WYDL221W 552 nt11.32□□□□□ -0.6
TPO3Q06451 FUN26YAL022C 1554 nt11.3□□□□□ -0.6
TPO3Q06451 SDH1YKL148C 1923 nt11.29□□□□□ -0.6
TPO3Q06451 CAC2YML102W 1407 nt11.29□□□□□ -0.6
TPO3Q06451 BDH2YAL061W 1254 nt11.29□□□□□ -0.6
TPO3Q06451 PTP1YDL230W 1008 nt11.27□□□□□ -0.61
TPO3Q06451 SHU1YHL006C 453 nt11.27□□□□□ -0.61
TPO3Q06451 RPP2AYOL039W 321 nt11.25□□□□□ -0.61
TPO3Q06451 ALF1YNL148C 765 nt11.24□□□□□ -0.61
TPO3Q06451 PAC11YDR488C 1602 nt11.19□□□□□ -0.62
TPO3Q06451 TRM9YML014W 840 nt11.16□□□□□ -0.62
TPO3Q06451 SCC4YER147C 1875 nt11.15□□□□□ -0.63
TPO3Q06451 IRC15YPL017C 1500 nt11.12□□□□□ -0.63
TPO3Q06451 PCH2YBR186W 1695 nt11.11□□□□□ -0.63
TPO3Q06451 CCT6YDR188W 1641 nt11.09□□□□□ -0.63
TPO3Q06451 GUT2YIL155C 1950 nt11.07□□□□□ -0.64
TPO3Q06451 SIS1YNL007C 1059 nt11.07□□□□□ -0.64
TPO3Q06451 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.06□□□□□ -0.64
TPO3Q06451 GIS3YLR094C 1509 nt11.05□□□□□ -0.64
TPO3Q06451 WWM1YFL010C 636 nt11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.5 ms