Protein–RNA interactions for Protein: P0CF16

YML003W, UPF0507 protein YML003W, yeastyeast

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YML003WP0CF16 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.4■□□□□ 0.38
YML003WP0CF16 NSR1YGR159C 1245 nt17.27■□□□□ 0.36
YML003WP0CF16 NOP1YDL014W 984 nt17■□□□□ 0.31
YML003WP0CF16 YKL036CYKL036C 393 nt15.67■□□□□ 0.1
YML003WP0CF16 MDJ1YFL016C 1536 nt15.22■□□□□ 0.03
YML003WP0CF16 Q0297Q0297 156 nt14.83□□□□□ -0.04
YML003WP0CF16 SRX1YKL086W 384 nt14.79□□□□□ -0.04
YML003WP0CF16 YJL027CYJL027C 417 nt14.63□□□□□ -0.07
YML003WP0CF16 SCS3YGL126W 1143 nt14.23□□□□□ -0.13
YML003WP0CF16 YCR051WYCR051W 669 nt14.04□□□□□ -0.16
YML003WP0CF16 YOL085CYOL085C 342 nt13.52□□□□□ -0.25
YML003WP0CF16 DBP2YNL112W 1641 nt13.44□□□□□ -0.26
YML003WP0CF16 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.34□□□□□ -0.27
YML003WP0CF16 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.34□□□□□ -0.27
YML003WP0CF16 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.34□□□□□ -0.27
YML003WP0CF16 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.34□□□□□ -0.27
YML003WP0CF16 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.34□□□□□ -0.27
YML003WP0CF16 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.34□□□□□ -0.27
YML003WP0CF16 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.34□□□□□ -0.27
YML003WP0CF16 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.34□□□□□ -0.27
YML003WP0CF16 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.34□□□□□ -0.27
YML003WP0CF16 RPP1BYDL130W 321 nt13.31□□□□□ -0.28
YML003WP0CF16 PKP1YIL042C 1185 nt13.28□□□□□ -0.28
YML003WP0CF16 SSA3YBL075C 1950 nt13.23□□□□□ -0.29
YML003WP0CF16 CCC1YLR220W 969 nt13.18□□□□□ -0.3
YML003WP0CF16 YBR190WYBR190W 312 nt13.09□□□□□ -0.31
YML003WP0CF16 RVS167YDR388W 1449 nt12.82□□□□□ -0.36
YML003WP0CF16 RTC3YHR087W 336 nt12.76□□□□□ -0.37
YML003WP0CF16 ATS1YAL020C 1002 nt12.74□□□□□ -0.37
YML003WP0CF16 SCJ1YMR214W 1134 nt12.73□□□□□ -0.37
YML003WP0CF16 PET122YER153C 765 nt12.67□□□□□ -0.38
YML003WP0CF16 SCR1SCR1 522 nt12.65□□□□□ -0.38
YML003WP0CF16 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.62□□□□□ -0.39
YML003WP0CF16 PUT4YOR348C 1884 nt12.38□□□□□ -0.43
YML003WP0CF16 SHR5YOL110W 714 nt12.33□□□□□ -0.44
YML003WP0CF16 RRN5YLR141W 1092 nt12.3□□□□□ -0.44
YML003WP0CF16 YDJ1YNL064C 1230 nt12.25□□□□□ -0.45
YML003WP0CF16 RSB1YOR049C 1065 nt12.11□□□□□ -0.47
YML003WP0CF16 Q0182Q0182 405 nt12.1□□□□□ -0.47
YML003WP0CF16 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.06□□□□□ -0.48
YML003WP0CF16 ARE1YCR048W 1833 nt11.95□□□□□ -0.5
YML003WP0CF16 URN1YPR152C 1398 nt11.93□□□□□ -0.5
YML003WP0CF16 GAR1YHR089C 618 nt11.93□□□□□ -0.5
YML003WP0CF16 POA1YBR022W 534 nt11.93□□□□□ -0.5
YML003WP0CF16 DEP1YAL013W 1218 nt11.9□□□□□ -0.5
YML003WP0CF16 RPN10YHR200W 807 nt11.88□□□□□ -0.51
YML003WP0CF16 BSC6YOL137W 1494 nt11.81□□□□□ -0.52
YML003WP0CF16 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.8□□□□□ -0.52
YML003WP0CF16 YNL208WYNL208W 600 nt11.79□□□□□ -0.52
YML003WP0CF16 SPT5YML010W 3192 nt11.77□□□□□ -0.52
YML003WP0CF16 PST2YDR032C 597 nt11.76□□□□□ -0.53
YML003WP0CF16 OPI9YLR338W 858 nt11.76□□□□□ -0.53
YML003WP0CF16 SAH1YER043C 1350 nt11.75□□□□□ -0.53
YML003WP0CF16 SSA4YER103W 1929 nt11.69□□□□□ -0.54
YML003WP0CF16 MOT3YMR070W 1473 nt11.68□□□□□ -0.54
YML003WP0CF16 TIR1YER011W 765 nt11.54□□□□□ -0.56
YML003WP0CF16 BUD23YCR047C 828 nt11.47□□□□□ -0.57
YML003WP0CF16 PUN1YLR414C 792 nt11.47□□□□□ -0.57
YML003WP0CF16 YJR018WYJR018W 363 nt11.4□□□□□ -0.58
YML003WP0CF16 YKL097CYKL097C 411 nt11.39□□□□□ -0.59
YML003WP0CF16 SSA1YAL005C 1929 nt11.33□□□□□ -0.6
YML003WP0CF16 BDF1YLR399C 2061 nt11.32□□□□□ -0.6
YML003WP0CF16 PTC2YER089C 1395 nt11.28□□□□□ -0.6
YML003WP0CF16 SHU1YHL006C 453 nt11.27□□□□□ -0.61
YML003WP0CF16 RPP2BYDR382W 333 nt11.26□□□□□ -0.61
YML003WP0CF16 NAB2YGL122C 1578 nt11.25□□□□□ -0.61
YML003WP0CF16 MEP2YNL142W 1500 nt11.17□□□□□ -0.62
YML003WP0CF16 TAT1YBR069C 1860 nt11.16□□□□□ -0.62
YML003WP0CF16 YJR120WYJR120W 351 nt11.12□□□□□ -0.63
YML003WP0CF16 YGR021WYGR021W 873 nt11.06□□□□□ -0.64
YML003WP0CF16 SRB2YHR041C 633 nt11.06□□□□□ -0.64
YML003WP0CF16 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.04□□□□□ -0.64
YML003WP0CF16 INM2YDR287W 879 nt11.02□□□□□ -0.65
YML003WP0CF16 FIS1YIL065C 468 nt11.01□□□□□ -0.65
YML003WP0CF16 DAL1YIR027C 1383 nt11.01□□□□□ -0.65
YML003WP0CF16 WWM1YFL010C 636 nt10.99□□□□□ -0.65
YML003WP0CF16 BDH2YAL061W 1254 nt10.98□□□□□ -0.65
YML003WP0CF16 PAC11YDR488C 1602 nt10.97□□□□□ -0.65
YML003WP0CF16 FPR4YLR449W 1179 nt10.96□□□□□ -0.65
YML003WP0CF16 DCW1YKL046C 1350 nt10.95□□□□□ -0.66
YML003WP0CF16 HOM6YJR139C 1080 nt10.93□□□□□ -0.66
YML003WP0CF16 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.9□□□□□ -0.66
YML003WP0CF16 YBL100CYBL100C 315 nt10.9□□□□□ -0.66
YML003WP0CF16 YPS1YLR120C 1710 nt10.89□□□□□ -0.67
YML003WP0CF16 PHO4YFR034C 939 nt10.88□□□□□ -0.67
YML003WP0CF16 MNP1YGL068W 585 nt10.86□□□□□ -0.67
YML003WP0CF16 LSM3YLR438C-A 270 nt10.86□□□□□ -0.67
YML003WP0CF16 NPL3YDR432W 1245 nt10.85□□□□□ -0.67
YML003WP0CF16 YBR220CYBR220C 1683 nt10.83□□□□□ -0.68
YML003WP0CF16 YOR139CYOR139C 393 nt10.83□□□□□ -0.68
YML003WP0CF16 YMR090WYMR090W 684 nt10.82□□□□□ -0.68
YML003WP0CF16 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.81□□□□□ -0.68
YML003WP0CF16 EMI2YDR516C 1503 nt10.8□□□□□ -0.68
YML003WP0CF16 YOL037CYOL037C 354 nt10.8□□□□□ -0.68
YML003WP0CF16 RKM5YLR137W 1104 nt10.79□□□□□ -0.68
YML003WP0CF16 TRM9YML014W 840 nt10.78□□□□□ -0.68
YML003WP0CF16 FUN26YAL022C 1554 nt10.75□□□□□ -0.69
YML003WP0CF16 YDR095CYDR095C 411 nt10.72□□□□□ -0.69
YML003WP0CF16 SDH1YKL148C 1923 nt10.68□□□□□ -0.7
YML003WP0CF16 YDL221WYDL221W 552 nt10.67□□□□□ -0.7
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