RNA–Protein interactions for RNA: YKR080W

MTD1, Transcript of NAD-dependent 5,10-methylenetetrahydrafolate dehydrogenase, yeast

Gene MTD1, Length 963 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MTD1	YKR080W	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	3.46	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	GAA1	P39012	614 aa		3.46	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	SEC9	P40357	651 aa		3.46	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	YNL143C	P53908	130 aa		3.46	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	YLR152C	P54072	576 aa		3.46	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	SFG1	Q12507	346 aa		3.46	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		3.46	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	NAG1	Q8TGN9	163 aa		3.46	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	TRA1	P38811	3744 aa		3.45	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	YHL026C	P38740	315 aa		3.45	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	DFG10	P40526	253 aa		3.45	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	TIS11	P47977	285 aa		3.45	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	AQR1	P53943	586 aa		3.45	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	LIP2	Q06005	328 aa		3.45	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	SHS1	Q07657	551 aa		3.45	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	YDL199C	Q12407	687 aa		3.45	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	YMR010W	Q03687	405 aa		3.44	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	YET2	Q04210	160 aa		3.44	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	YDR286C	Q05530	114 aa		3.44	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	GAT3	Q07928	141 aa		3.44	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	YOR338W	Q99326	363 aa		3.44	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	FSH3	Q99369	266 aa		3.44	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	RAD50	P12753	1312 aa		3.44	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	SEN1	Q00416	2231 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	MAS1	P10507	462 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	SMI1	P32566	505 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	YEL043W	P32618	956 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	BUD2	P33314	1104 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	3.43	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	YER186C	P40101	306 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	FIS1	P40515	155 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	3.43	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	3.43	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	ADD37	Q03233	198 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	3.43	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	3.43	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	YOR012W	Q12351	137 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	STE3	P06783	470 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	GRR1	P24814	1151 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	CDC50	P25656	391 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	VAM7	P32912	316 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	EFM3	P47163	339 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	PRM1	P53835	661 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	PGC1	Q08959	321 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	GLE1	Q12315	538 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	PSY3	Q12318	242 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	HMS1	Q12398	434 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	SAG1	P20840	650 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	PCL1	P24867	279 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	HMX1	P32339	317 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	YHR182W	P38870	785 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	MOB1	P40484	314 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	HAL1	Q01766	294 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	YLH47	Q06493	454 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	MSB2	P32334	1306 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MTD1	YKR080W	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
MTD1	YKR080W	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
MTD1	YKR080W	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
MTD1	YKR080W	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
MTD1	YKR080W	COY1	P34237	679 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MTD1	YKR080W	OM14	P38325	134 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MTD1	YKR080W	CIN2	P46670	268 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MTD1	YKR080W	YNL146W	P53906	100 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MTD1	YKR080W	SMP3	Q04174	516 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MTD1	YKR080W	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
MTD1	YKR080W	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
MTD1	YKR080W	CSF1	Q12150	2958 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MTD1	YKR080W	CKI1	P20485	582 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MTD1	YKR080W	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
MTD1	YKR080W	IES6	P32617	166 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MTD1	YKR080W	UTH1	P36135	365 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MTD1	YKR080W	PFS1	P38872	237 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MTD1	YKR080W	TIM17	P39515	158 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MTD1	YKR080W	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 51.9 ms