Protein–RNA interactions for Protein: P53835

PRM1, Plasma membrane fusion protein PRM1, yeastyeast

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRM1P53835 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.74■□□□□ 0.91
PRM1P53835 NSR1YGR159C 1245 nt20.41■□□□□ 0.86
PRM1P53835 NOP1YDL014W 984 nt20.21■□□□□ 0.83
PRM1P53835 YKL036CYKL036C 393 nt18.8■□□□□ 0.6
PRM1P53835 MDJ1YFL016C 1536 nt17.98■□□□□ 0.47
PRM1P53835 Q0297Q0297 156 nt17.71■□□□□ 0.43
PRM1P53835 SRX1YKL086W 384 nt17.64■□□□□ 0.41
PRM1P53835 YJL027CYJL027C 417 nt17.59■□□□□ 0.41
PRM1P53835 SCS3YGL126W 1143 nt17.19■□□□□ 0.34
PRM1P53835 YCR051WYCR051W 669 nt16.78■□□□□ 0.28
PRM1P53835 YOL085CYOL085C 342 nt16.26■□□□□ 0.19
PRM1P53835 PKP1YIL042C 1185 nt16.01■□□□□ 0.15
PRM1P53835 DBP2YNL112W 1641 nt15.94■□□□□ 0.14
PRM1P53835 RPP1BYDL130W 321 nt15.91■□□□□ 0.14
PRM1P53835 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.85■□□□□ 0.13
PRM1P53835 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.85■□□□□ 0.13
PRM1P53835 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.85■□□□□ 0.13
PRM1P53835 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.85■□□□□ 0.13
PRM1P53835 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.85■□□□□ 0.13
PRM1P53835 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.85■□□□□ 0.13
PRM1P53835 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.85■□□□□ 0.13
PRM1P53835 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.85■□□□□ 0.13
PRM1P53835 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.85■□□□□ 0.13
PRM1P53835 CCC1YLR220W 969 nt15.72■□□□□ 0.11
PRM1P53835 SCJ1YMR214W 1134 nt15.42■□□□□ 0.06
PRM1P53835 ATS1YAL020C 1002 nt15.41■□□□□ 0.06
PRM1P53835 YBR190WYBR190W 312 nt15.27■□□□□ 0.04
PRM1P53835 PET122YER153C 765 nt15.18■□□□□ 0.02
PRM1P53835 RVS167YDR388W 1449 nt15.09■□□□□ 0.01
PRM1P53835 SCR1SCR1 522 nt15.09■□□□□ 0.01
PRM1P53835 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.05■□□□□ -0
PRM1P53835 RTC3YHR087W 336 nt14.99□□□□□ -0.01
PRM1P53835 RRN5YLR141W 1092 nt14.75□□□□□ -0.05
PRM1P53835 SHR5YOL110W 714 nt14.58□□□□□ -0.08
PRM1P53835 YDJ1YNL064C 1230 nt14.54□□□□□ -0.08
PRM1P53835 RSB1YOR049C 1065 nt14.53□□□□□ -0.08
PRM1P53835 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.46□□□□□ -0.09
PRM1P53835 PST2YDR032C 597 nt14.22□□□□□ -0.13
PRM1P53835 GAR1YHR089C 618 nt14.22□□□□□ -0.13
PRM1P53835 DEP1YAL013W 1218 nt14.12□□□□□ -0.15
PRM1P53835 URN1YPR152C 1398 nt14.08□□□□□ -0.16
PRM1P53835 RPN10YHR200W 807 nt13.93□□□□□ -0.18
PRM1P53835 YNL208WYNL208W 600 nt13.91□□□□□ -0.18
PRM1P53835 OPI9YLR338W 858 nt13.82□□□□□ -0.2
PRM1P53835 YKL097CYKL097C 411 nt13.8□□□□□ -0.2
PRM1P53835 TIR1YER011W 765 nt13.74□□□□□ -0.21
PRM1P53835 PUT4YOR348C 1884 nt13.72□□□□□ -0.21
PRM1P53835 SAH1YER043C 1350 nt13.7□□□□□ -0.22
PRM1P53835 SHU1YHL006C 453 nt13.62□□□□□ -0.23
PRM1P53835 ARE1YCR048W 1833 nt13.54□□□□□ -0.24
PRM1P53835 SSA1YAL005C 1929 nt13.52□□□□□ -0.25
PRM1P53835 YJR018WYJR018W 363 nt13.43□□□□□ -0.26
PRM1P53835 PUN1YLR414C 792 nt13.43□□□□□ -0.26
PRM1P53835 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.39□□□□□ -0.27
PRM1P53835 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.37□□□□□ -0.27
PRM1P53835 POA1YBR022W 534 nt13.33□□□□□ -0.28
PRM1P53835 SRB2YHR041C 633 nt13.3□□□□□ -0.28
PRM1P53835 SSA3YBL075C 1950 nt13.27□□□□□ -0.29
PRM1P53835 PTC2YER089C 1395 nt13.23□□□□□ -0.29
PRM1P53835 RPP2BYDR382W 333 nt13.23□□□□□ -0.29
PRM1P53835 YJR120WYJR120W 351 nt13.23□□□□□ -0.29
PRM1P53835 YOR139CYOR139C 393 nt13.17□□□□□ -0.3
PRM1P53835 WWM1YFL010C 636 nt13.16□□□□□ -0.3
PRM1P53835 YGR021WYGR021W 873 nt13.14□□□□□ -0.31
PRM1P53835 BUD23YCR047C 828 nt13.11□□□□□ -0.31
PRM1P53835 NPL3YDR432W 1245 nt13.08□□□□□ -0.32
PRM1P53835 HOM6YJR139C 1080 nt13.08□□□□□ -0.32
PRM1P53835 MNP1YGL068W 585 nt13.07□□□□□ -0.32
PRM1P53835 NAB2YGL122C 1578 nt13.04□□□□□ -0.32
PRM1P53835 BSC6YOL137W 1494 nt13□□□□□ -0.33
PRM1P53835 BDH2YAL061W 1254 nt12.97□□□□□ -0.33
PRM1P53835 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.94□□□□□ -0.34
PRM1P53835 INM2YDR287W 879 nt12.92□□□□□ -0.34
PRM1P53835 YOL037CYOL037C 354 nt12.92□□□□□ -0.34
PRM1P53835 FPR4YLR449W 1179 nt12.91□□□□□ -0.34
PRM1P53835 DAL1YIR027C 1383 nt12.91□□□□□ -0.34
PRM1P53835 RKM5YLR137W 1104 nt12.9□□□□□ -0.34
PRM1P53835 FIS1YIL065C 468 nt12.87□□□□□ -0.35
PRM1P53835 YBL100CYBL100C 315 nt12.85□□□□□ -0.35
PRM1P53835 LSM3YLR438C-A 270 nt12.83□□□□□ -0.36
PRM1P53835 PHO4YFR034C 939 nt12.78□□□□□ -0.36
PRM1P53835 TRM9YML014W 840 nt12.71□□□□□ -0.37
PRM1P53835 FUN26YAL022C 1554 nt12.69□□□□□ -0.38
PRM1P53835 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.65□□□□□ -0.38
PRM1P53835 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.65□□□□□ -0.38
PRM1P53835 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.65□□□□□ -0.38
PRM1P53835 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.65□□□□□ -0.38
PRM1P53835 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.65□□□□□ -0.38
PRM1P53835 YLR281CYLR281C 468 nt12.58□□□□□ -0.4
PRM1P53835 CCT6YDR188W 1641 nt12.55□□□□□ -0.4
PRM1P53835 PUS2YGL063W 1113 nt12.54□□□□□ -0.4
PRM1P53835 WHI5YOR083W 888 nt12.53□□□□□ -0.4
PRM1P53835 ALF1YNL148C 765 nt12.5□□□□□ -0.41
PRM1P53835 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.46□□□□□ -0.41
PRM1P53835 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.46□□□□□ -0.41
PRM1P53835 YPS1YLR120C 1710 nt12.45□□□□□ -0.42
PRM1P53835 YDR095CYDR095C 411 nt12.41□□□□□ -0.42
PRM1P53835 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.39□□□□□ -0.43
PRM1P53835 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.34□□□□□ -0.43
PRM1P53835 DSK2YMR276W 1122 nt12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.1 ms