Protein–RNA interactions for Protein: Q05900

YHC1, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHC1Q05900 NSR1YGR159C 1245 nt19.57■□□□□ 0.72
YHC1Q05900 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.44■□□□□ 0.7
YHC1Q05900 NOP1YDL014W 984 nt18.78■□□□□ 0.6
YHC1Q05900 MDJ1YFL016C 1536 nt17.63■□□□□ 0.41
YHC1Q05900 YKL036CYKL036C 393 nt17.1■□□□□ 0.33
YHC1Q05900 SRX1YKL086W 384 nt16.43■□□□□ 0.22
YHC1Q05900 Q0297Q0297 156 nt16.39■□□□□ 0.21
YHC1Q05900 YJL027CYJL027C 417 nt16.22■□□□□ 0.19
YHC1Q05900 YCR051WYCR051W 669 nt15.55■□□□□ 0.08
YHC1Q05900 DBP2YNL112W 1641 nt15.53■□□□□ 0.08
YHC1Q05900 SCS3YGL126W 1143 nt15.44■□□□□ 0.06
YHC1Q05900 YBR190WYBR190W 312 nt15.09■□□□□ 0.01
YHC1Q05900 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.03■□□□□ -0
YHC1Q05900 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.03■□□□□ -0
YHC1Q05900 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.03■□□□□ -0
YHC1Q05900 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.03■□□□□ -0
YHC1Q05900 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.03■□□□□ -0
YHC1Q05900 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.03■□□□□ -0
YHC1Q05900 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.03■□□□□ -0
YHC1Q05900 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.03■□□□□ -0
YHC1Q05900 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.03■□□□□ -0
YHC1Q05900 CCC1YLR220W 969 nt14.84□□□□□ -0.03
YHC1Q05900 YOL085CYOL085C 342 nt14.84□□□□□ -0.03
YHC1Q05900 RTC3YHR087W 336 nt14.72□□□□□ -0.05
YHC1Q05900 RPP1BYDL130W 321 nt14.69□□□□□ -0.06
YHC1Q05900 PKP1YIL042C 1185 nt14.63□□□□□ -0.07
YHC1Q05900 RVS167YDR388W 1449 nt14.48□□□□□ -0.09
YHC1Q05900 SCJ1YMR214W 1134 nt14.4□□□□□ -0.1
YHC1Q05900 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.12□□□□□ -0.15
YHC1Q05900 PET122YER153C 765 nt14.08□□□□□ -0.16
YHC1Q05900 PUT4YOR348C 1884 nt13.94□□□□□ -0.18
YHC1Q05900 SHR5YOL110W 714 nt13.93□□□□□ -0.18
YHC1Q05900 SCR1SCR1 522 nt13.82□□□□□ -0.2
YHC1Q05900 ATS1YAL020C 1002 nt13.74□□□□□ -0.21
YHC1Q05900 URN1YPR152C 1398 nt13.71□□□□□ -0.22
YHC1Q05900 YDJ1YNL064C 1230 nt13.67□□□□□ -0.22
YHC1Q05900 RRN5YLR141W 1092 nt13.64□□□□□ -0.23
YHC1Q05900 SSA3YBL075C 1950 nt13.63□□□□□ -0.23
YHC1Q05900 DEP1YAL013W 1218 nt13.62□□□□□ -0.23
YHC1Q05900 ARE1YCR048W 1833 nt13.61□□□□□ -0.23
YHC1Q05900 OPI9YLR338W 858 nt13.57□□□□□ -0.24
YHC1Q05900 SAH1YER043C 1350 nt13.55□□□□□ -0.24
YHC1Q05900 POA1YBR022W 534 nt13.45□□□□□ -0.26
YHC1Q05900 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.4□□□□□ -0.26
YHC1Q05900 RPN10YHR200W 807 nt13.4□□□□□ -0.26
YHC1Q05900 GAR1YHR089C 618 nt13.39□□□□□ -0.27
YHC1Q05900 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.38□□□□□ -0.27
YHC1Q05900 YNL208WYNL208W 600 nt13.37□□□□□ -0.27
YHC1Q05900 RSB1YOR049C 1065 nt13.26□□□□□ -0.29
YHC1Q05900 BSC6YOL137W 1494 nt13.22□□□□□ -0.29
YHC1Q05900 PUN1YLR414C 792 nt13.15□□□□□ -0.3
YHC1Q05900 BUD23YCR047C 828 nt13.05□□□□□ -0.32
YHC1Q05900 YJR018WYJR018W 363 nt13.05□□□□□ -0.32
YHC1Q05900 PTC2YER089C 1395 nt13.05□□□□□ -0.32
YHC1Q05900 TIR1YER011W 765 nt12.96□□□□□ -0.33
YHC1Q05900 NAB2YGL122C 1578 nt12.91□□□□□ -0.34
YHC1Q05900 SSA1YAL005C 1929 nt12.88□□□□□ -0.35
YHC1Q05900 SPT5YML010W 3192 nt12.87□□□□□ -0.35
YHC1Q05900 YJR120WYJR120W 351 nt12.85□□□□□ -0.35
YHC1Q05900 PST2YDR032C 597 nt12.79□□□□□ -0.36
YHC1Q05900 FIS1YIL065C 468 nt12.73□□□□□ -0.37
YHC1Q05900 DAL1YIR027C 1383 nt12.69□□□□□ -0.38
YHC1Q05900 RPP2BYDR382W 333 nt12.69□□□□□ -0.38
YHC1Q05900 SRB2YHR041C 633 nt12.65□□□□□ -0.38
YHC1Q05900 FPR4YLR449W 1179 nt12.63□□□□□ -0.39
YHC1Q05900 INM2YDR287W 879 nt12.61□□□□□ -0.39
YHC1Q05900 PHO4YFR034C 939 nt12.57□□□□□ -0.4
YHC1Q05900 SSA4YER103W 1929 nt12.47□□□□□ -0.41
YHC1Q05900 YBL100CYBL100C 315 nt12.45□□□□□ -0.42
YHC1Q05900 YPS1YLR120C 1710 nt12.45□□□□□ -0.42
YHC1Q05900 MEP2YNL142W 1500 nt12.44□□□□□ -0.42
YHC1Q05900 BDH2YAL061W 1254 nt12.42□□□□□ -0.42
YHC1Q05900 WWM1YFL010C 636 nt12.35□□□□□ -0.43
YHC1Q05900 YDR095CYDR095C 411 nt12.32□□□□□ -0.44
YHC1Q05900 SHU1YHL006C 453 nt12.32□□□□□ -0.44
YHC1Q05900 FUN26YAL022C 1554 nt12.31□□□□□ -0.44
YHC1Q05900 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.29□□□□□ -0.44
YHC1Q05900 DCW1YKL046C 1350 nt12.25□□□□□ -0.45
YHC1Q05900 LSM3YLR438C-A 270 nt12.22□□□□□ -0.45
YHC1Q05900 TRM9YML014W 840 nt12.22□□□□□ -0.45
YHC1Q05900 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.21□□□□□ -0.45
YHC1Q05900 YGR021WYGR021W 873 nt12.18□□□□□ -0.46
YHC1Q05900 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.15□□□□□ -0.46
YHC1Q05900 HOM6YJR139C 1080 nt12.15□□□□□ -0.46
YHC1Q05900 ALF1YNL148C 765 nt12.15□□□□□ -0.46
YHC1Q05900 CCT6YDR188W 1641 nt12.14□□□□□ -0.47
YHC1Q05900 YKL097CYKL097C 411 nt12.1□□□□□ -0.47
YHC1Q05900 PTP1YDL230W 1008 nt12.09□□□□□ -0.47
YHC1Q05900 RPP2AYOL039W 321 nt12.08□□□□□ -0.48
YHC1Q05900 EMI2YDR516C 1503 nt12.07□□□□□ -0.48
YHC1Q05900 MNP1YGL068W 585 nt12.05□□□□□ -0.48
YHC1Q05900 BDF1YLR399C 2061 nt12.04□□□□□ -0.48
YHC1Q05900 CAC2YML102W 1407 nt12.03□□□□□ -0.48
YHC1Q05900 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.02□□□□□ -0.49
YHC1Q05900 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.02□□□□□ -0.49
YHC1Q05900 SIS1YNL007C 1059 nt12.02□□□□□ -0.49
YHC1Q05900 YDL221WYDL221W 552 nt11.97□□□□□ -0.49
YHC1Q05900 RKM5YLR137W 1104 nt11.97□□□□□ -0.49
YHC1Q05900 YMR090WYMR090W 684 nt11.97□□□□□ -0.49
YHC1Q05900 YBR220CYBR220C 1683 nt11.95□□□□□ -0.5
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