RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627746.2

PPP4C-214, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PPP4C, Length 1,301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-214ENST00000627746 DAPK1P53355 1430 aa36.45■■■■□ 3.42
PPP4C-214ENST00000627746 CHIC2Q9UKJ5 165 aa36.44■■■■□ 3.42
PPP4C-214ENST00000627746 KDM5DQ9BY66 1539 aa36.43■■■■□ 3.42
PPP4C-214ENST00000627746 CROCC2H7BZ55 1655 aa36.43■■■■□ 3.42
PPP4C-214ENST00000627746 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP36.4■■■■□ 3.42
PPP4C-214ENST00000627746 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP36.4■■■■□ 3.42
PPP4C-214ENST00000627746 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP36.39■■■■□ 3.42
PPP4C-214ENST00000627746 MYO3AQ8NEV4 1616 aa36.39■■■■□ 3.42
PPP4C-214ENST00000627746 DMRT2Q9Y5R5 561 aa36.38■■■■□ 3.41
PPP4C-214ENST00000627746 KIF15Q9NS87 1388 aa36.38■■■■□ 3.41
PPP4C-214ENST00000627746 SHANK2Q9UPX8 1470 aa36.37■■■■□ 3.41
PPP4C-214ENST00000627746 DUOX2Q9NRD8 1548 aa36.37■■■■□ 3.41
PPP4C-214ENST00000627746 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa36.36■■■■□ 3.41
PPP4C-214ENST00000627746 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP36.36■■■■□ 3.41
PPP4C-214ENST00000627746 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP36.34■■■■□ 3.41
PPP4C-214ENST00000627746 NCOA1Q15788 1441 aa36.33■■■■□ 3.41
PPP4C-214ENST00000627746 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa36.33■■■■□ 3.41
PPP4C-214ENST00000627746 PZPP20742 1482 aa36.32■■■■□ 3.41
PPP4C-214ENST00000627746 FAM135AQ9P2D6 1515 aa36.32■■■■□ 3.4
PPP4C-214ENST00000627746 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP36.32■■■■□ 3.4
PPP4C-214ENST00000627746 TNRQ92752 1358 aa36.31■■■■□ 3.4
PPP4C-214ENST00000627746 MROH1Q8NDA8 1641 aa36.3■■■■□ 3.4
PPP4C-214ENST00000627746 FBXO41Q8TF61 875 aa36.3■■■■□ 3.4
PPP4C-214ENST00000627746 ABCC3O15438 1527 aa36.29■■■■□ 3.4
PPP4C-214ENST00000627746 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP36.29■■■■□ 3.4
PPP4C-214ENST00000627746 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP36.27■■■■□ 3.4
PPP4C-214ENST00000627746 CERKQ8TCT0 537 aa36.26■■■■□ 3.39
PPP4C-214ENST00000627746 PTPRTO14522 1441 aa36.26■■■■□ 3.39
PPP4C-214ENST00000627746 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa36.25■■■■□ 3.39
PPP4C-214ENST00000627746 A2ML1A8K2U0 1454 aa36.24■■■■□ 3.39
PPP4C-214ENST00000627746 CEP152O94986 1710 aa36.23■■■■□ 3.39
PPP4C-214ENST00000627746 ERBINQ96RT1 1412 aa36.23■■■■□ 3.39
PPP4C-214ENST00000627746 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP36.19■■■■□ 3.38
PPP4C-214ENST00000627746 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP36.18■■■■□ 3.38
PPP4C-214ENST00000627746 PLA2R1Q13018 1463 aa36.15■■■■□ 3.38
PPP4C-214ENST00000627746 PKD2Q13563 968 aa36.13■■■■□ 3.37
PPP4C-214ENST00000627746 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP36.12■■■■□ 3.37
PPP4C-214ENST00000627746 ADGRL2O95490 1459 aa36.11■■■■□ 3.37
PPP4C-214ENST00000627746 ERVK-7P63135 1459 aa36.09■■■■□ 3.37
PPP4C-214ENST00000627746 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa36.08■■■■□ 3.37
PPP4C-214ENST00000627746 DEPDC5O75140 1603 aa36.08■■■■□ 3.37
PPP4C-214ENST00000627746 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP36.07■■■■□ 3.371e-10■■□□□ 12.5
PPP4C-214ENST00000627746 NLRP1Q9C000 1473 aa36.07■■■■□ 3.37
PPP4C-214ENST00000627746 ITGAEP38570 1179 aa36.07■■■■□ 3.36
PPP4C-214ENST00000627746 KANK1Q14678 1352 aa36.05■■■■□ 3.36
PPP4C-214ENST00000627746 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP36.05■■■■□ 3.36
PPP4C-214ENST00000627746 UGGT1Q9NYU2 1555 aa36.04■■■■□ 3.36
PPP4C-214ENST00000627746 LTBP4Q8N2S1 1624 aa36.02■■■■□ 3.36
PPP4C-214ENST00000627746 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP36.02■■■■□ 3.36
PPP4C-214ENST00000627746 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa36.01■■■■□ 3.35
PPP4C-214ENST00000627746 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa36■■■■□ 3.35
PPP4C-214ENST00000627746 ANKLE2Q86XL3 938 aa35.98■■■■□ 3.35
PPP4C-214ENST00000627746 VWDEQ8N2E2 1590 aa35.96■■■■□ 3.35
PPP4C-214ENST00000627746 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP35.95■■■■□ 3.34
PPP4C-214ENST00000627746 NEURL4Q96JN8 1562 aa35.94■■■■□ 3.34
PPP4C-214ENST00000627746 LMTK2Q8IWU2 1503 aa35.91■■■■□ 3.34
PPP4C-214ENST00000627746 ROCK1Q13464 1354 aa35.87■■■■□ 3.33
PPP4C-214ENST00000627746 UBR1Q8IWV7 1749 aa35.87■■■■□ 3.33
PPP4C-214ENST00000627746 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP35.83■■■■□ 3.33
PPP4C-214ENST00000627746 IDI1Q13907 227 aa35.83■■■■□ 3.33
PPP4C-214ENST00000627746 EFCAB6Q5THR3 1501 aa35.82■■■■□ 3.32
PPP4C-214ENST00000627746 PIK3C2BO00750 1634 aa35.8■■■■□ 3.32
PPP4C-214ENST00000627746 STAG3Q9UJ98 1225 aa35.79■■■■□ 3.32
PPP4C-214ENST00000627746 MED14O60244 1454 aa35.78■■■■□ 3.32
PPP4C-214ENST00000627746 SYNMO15061 1565 aa35.78■■■■□ 3.32
PPP4C-214ENST00000627746 LTKP29376 864 aa35.78■■■■□ 3.32
PPP4C-214ENST00000627746 TXNDC2Q86VQ3 553 aa35.76■■■■□ 3.31
PPP4C-214ENST00000627746 NOS1P29475 1434 aa35.76■■■■□ 3.31
PPP4C-214ENST00000627746 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP35.76■■■■□ 3.31
PPP4C-214ENST00000627746 UNC13BO14795 1591 aa35.75■■■■□ 3.31
PPP4C-214ENST00000627746 IQGAP1P46940 1657 aa35.73■■■■□ 3.31
PPP4C-214ENST00000627746 IQSEC2Q5JU85 1478 aa35.71■■■■□ 3.31
PPP4C-214ENST00000627746 TET3O43151 1660 aa35.71■■■■□ 3.31
PPP4C-214ENST00000627746 ARHGAP23Q9P227 1491 aa35.7■■■■□ 3.31
PPP4C-214ENST00000627746 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP35.69■■■■□ 3.3
PPP4C-214ENST00000627746 SLIT1O75093 1534 aa35.69■■■■□ 3.3
PPP4C-214ENST00000627746 NUP155O75694 1391 aa35.68■■■■□ 3.3
PPP4C-214ENST00000627746 TMEM2Q9UHN6 1383 aa35.66■■■■□ 3.3
PPP4C-214ENST00000627746 EID1Q9Y6B2 187 aa35.66■■■■□ 3.3
PPP4C-214ENST00000627746 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP35.66■■■■□ 3.3
PPP4C-214ENST00000627746 SLC52A1Q9NWF4 448 aa35.65■■■■□ 3.3
PPP4C-214ENST00000627746 GCC2Q8IWJ2 1684 aa35.65■■■■□ 3.3
PPP4C-214ENST00000627746 UBAP1LF5GYI3 381 aa35.64■■■■□ 3.3
PPP4C-214ENST00000627746 E9PCH4 1651 aa35.62■■■■□ 3.29
PPP4C-214ENST00000627746 IQGAP3Q86VI3 1631 aa35.61■■■■□ 3.29
PPP4C-214ENST00000627746 CPS1P31327 1500 aa35.59■■■■□ 3.29
PPP4C-214ENST00000627746 STRCP1A6NGW2 1772 aa35.58■■■■□ 3.29
PPP4C-214ENST00000627746 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP35.58■■■■□ 3.29
PPP4C-214ENST00000627746 ADGRB3O60242 1522 aa35.57■■■■□ 3.28
PPP4C-214ENST00000627746 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP35.57■■■■□ 3.28
PPP4C-214ENST00000627746 CHGAP10645 457 aaKnown RBP35.54■■■■□ 3.28
PPP4C-214ENST00000627746 NAIPQ13075 1403 aa35.53■■■■□ 3.28
PPP4C-214ENST00000627746 MYO5BQ9ULV0 1848 aa35.52■■■■□ 3.28
PPP4C-214ENST00000627746 SLC26A8Q96RN1 970 aa35.5■■■■□ 3.27
PPP4C-214ENST00000627746 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa35.46■■■■□ 3.27
PPP4C-214ENST00000627746 BCANQ96GW7 911 aa35.46■■■■□ 3.27
PPP4C-214ENST00000627746 PIP4K2BP78356 416 aa35.45■■■■□ 3.27
PPP4C-214ENST00000627746 LRRC7Q96NW7 1537 aa35.45■■■■□ 3.27
PPP4C-214ENST00000627746 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP35.44■■■■□ 3.26
PPP4C-214ENST00000627746 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP35.43■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.9 ms