RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608287.1

SGMS1-208, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 4

Gene SGMS1, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-208ENST00000608287 FAM135AQ9P2D6 1515 aa30.82■■■□□ 2.52
SGMS1-208ENST00000608287 TNRQ92752 1358 aa30.77■■■□□ 2.52
SGMS1-208ENST00000608287 NEURL4Q96JN8 1562 aa30.76■■■□□ 2.52
SGMS1-208ENST00000608287 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa30.75■■■□□ 2.51
SGMS1-208ENST00000608287 ANKLE2Q86XL3 938 aa30.75■■■□□ 2.51
SGMS1-208ENST00000608287 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.74■■■□□ 2.51
SGMS1-208ENST00000608287 CEP162Q5TB80 1403 aa30.73■■■□□ 2.51
SGMS1-208ENST00000608287 PZPP20742 1482 aa30.72■■■□□ 2.51
SGMS1-208ENST00000608287 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP30.71■■■□□ 2.51
SGMS1-208ENST00000608287 KDM5DQ9BY66 1539 aa30.71■■■□□ 2.51
SGMS1-208ENST00000608287 MTUS2Q5JR59 1369 aa30.7■■■□□ 2.51
SGMS1-208ENST00000608287 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP30.7■■■□□ 2.51
SGMS1-208ENST00000608287 NLRP1Q9C000 1473 aa30.69■■■□□ 2.5
SGMS1-208ENST00000608287 DEPDC5O75140 1603 aa30.68■■■□□ 2.5
SGMS1-208ENST00000608287 VWDEQ8N2E2 1590 aa30.66■■■□□ 2.5
SGMS1-208ENST00000608287 MED14O60244 1454 aa30.66■■■□□ 2.5
SGMS1-208ENST00000608287 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP30.64■■■□□ 2.49
SGMS1-208ENST00000608287 UGGT1Q9NYU2 1555 aa30.63■■■□□ 2.49
SGMS1-208ENST00000608287 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP30.63■■■□□ 2.491e-7■□□□□ 9.5
SGMS1-208ENST00000608287 MBD5Q9P267 1494 aa30.63■■■□□ 2.49
SGMS1-208ENST00000608287 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa30.62■■■□□ 2.49
SGMS1-208ENST00000608287 SYNMO15061 1565 aa30.6■■■□□ 2.49
SGMS1-208ENST00000608287 KIF3BO15066 747 aa30.6■■■□□ 2.49
SGMS1-208ENST00000608287 MIA2Q96PC5 1412 aa30.6■■■□□ 2.49
SGMS1-208ENST00000608287 IQGAP1P46940 1657 aa30.59■■■□□ 2.49
SGMS1-208ENST00000608287 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP30.59■■■□□ 2.49
SGMS1-208ENST00000608287 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP30.58■■■□□ 2.49
SGMS1-208ENST00000608287 TIAM1Q13009 1591 aa30.58■■■□□ 2.49
SGMS1-208ENST00000608287 RSPH4AQ5TD94 716 aa30.57■■■□□ 2.48
SGMS1-208ENST00000608287 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa30.57■■■□□ 2.48
SGMS1-208ENST00000608287 CCDC141Q6ZP82 1450 aa30.55■■■□□ 2.48
SGMS1-208ENST00000608287 ALKQ9UM73 1620 aa30.55■■■□□ 2.48
SGMS1-208ENST00000608287 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP30.52■■■□□ 2.48
SGMS1-208ENST00000608287 LRRC7Q96NW7 1537 aa30.48■■■□□ 2.47
SGMS1-208ENST00000608287 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
SGMS1-208ENST00000608287 STRCP1A6NGW2 1772 aa30.41■■■□□ 2.46
SGMS1-208ENST00000608287 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa30.4■■■□□ 2.46
SGMS1-208ENST00000608287 TSPY4P0CV99 314 aa30.39■■■□□ 2.46
SGMS1-208ENST00000608287 TSPY10P0CW01 314 aa30.39■■■□□ 2.46
SGMS1-208ENST00000608287 ARHGEF5Q12774 1597 aa30.37■■■□□ 2.45
SGMS1-208ENST00000608287 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP30.36■■■□□ 2.45
SGMS1-208ENST00000608287 VPS8Q8N3P4 1428 aa30.36■■■□□ 2.45
SGMS1-208ENST00000608287 ABCC3O15438 1527 aa30.33■■■□□ 2.45
SGMS1-208ENST00000608287 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP30.33■■■□□ 2.45
SGMS1-208ENST00000608287 ERVK-7P63135 1459 aa30.32■■■□□ 2.44
SGMS1-208ENST00000608287 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP30.31■■■□□ 2.44
SGMS1-208ENST00000608287 UBR1Q8IWV7 1749 aa30.29■■■□□ 2.44
SGMS1-208ENST00000608287 NCOA2Q15596 1464 aa30.29■■■□□ 2.44
SGMS1-208ENST00000608287 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP30.27■■■□□ 2.44
SGMS1-208ENST00000608287 FAM135BQ49AJ0 1406 aa30.25■■■□□ 2.43
SGMS1-208ENST00000608287 SLIT1O75093 1534 aa30.23■■■□□ 2.43
SGMS1-208ENST00000608287 EID1Q9Y6B2 187 aa30.23■■■□□ 2.43
SGMS1-208ENST00000608287 MAST1Q9Y2H9 1570 aa30.23■■■□□ 2.43
SGMS1-208ENST00000608287 ARHGAP23Q9P227 1491 aa30.21■■■□□ 2.43
SGMS1-208ENST00000608287 TXNDC2Q86VQ3 553 aa30.2■■■□□ 2.43
SGMS1-208ENST00000608287 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
SGMS1-208ENST00000608287 CEP152O94986 1710 aa30.16■■■□□ 2.42
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SGMS1-208ENST00000608287 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa30.14■■■□□ 2.42
SGMS1-208ENST00000608287 MROH1Q8NDA8 1641 aa30.13■■■□□ 2.41
SGMS1-208ENST00000608287 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa30.13■■■□□ 2.41
SGMS1-208ENST00000608287 LTKP29376 864 aa30.12■■■□□ 2.41
SGMS1-208ENST00000608287 MAP3K1Q13233 1512 aa30.1■■■□□ 2.41
SGMS1-208ENST00000608287 DUOX2Q9NRD8 1548 aa30.1■■■□□ 2.41
SGMS1-208ENST00000608287 POTEAQ6S8J7 498 aa30.09■■■□□ 2.41
SGMS1-208ENST00000608287 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa30.08■■■□□ 2.41
SGMS1-208ENST00000608287 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.41
SGMS1-208ENST00000608287 STAG3Q9UJ98 1225 aa30.07■■■□□ 2.4
SGMS1-208ENST00000608287 TMEM94Q12767 1356 aa30.06■■■□□ 2.4
SGMS1-208ENST00000608287 TMEM2Q9UHN6 1383 aa30.06■■■□□ 2.4
SGMS1-208ENST00000608287 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
SGMS1-208ENST00000608287 APLP2Q06481 763 aa30.05■■■□□ 2.4
SGMS1-208ENST00000608287 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP30.04■■■□□ 2.4
SGMS1-208ENST00000608287 KCNA6P17658 529 aa30.03■■■□□ 2.4
SGMS1-208ENST00000608287 PIK3C2BO00750 1634 aa30.02■■■□□ 2.4
SGMS1-208ENST00000608287 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
SGMS1-208ENST00000608287 EFCAB6Q5THR3 1501 aa30■■■□□ 2.39
SGMS1-208ENST00000608287 MYOM3Q5VTT5 1437 aa29.99■■■□□ 2.39
SGMS1-208ENST00000608287 ERBINQ96RT1 1412 aa29.99■■■□□ 2.39
SGMS1-208ENST00000608287 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
SGMS1-208ENST00000608287 MSH6P52701 1360 aa29.97■■■□□ 2.39
SGMS1-208ENST00000608287 KANK1Q14678 1352 aa29.97■■■□□ 2.39
SGMS1-208ENST00000608287 JCADQ9P266 1359 aa29.97■■■□□ 2.39
SGMS1-208ENST00000608287 PHLPP1O60346 1717 aa29.93■■■□□ 2.38
SGMS1-208ENST00000608287 KIF15Q9NS87 1388 aa29.93■■■□□ 2.38
SGMS1-208ENST00000608287 NWD1Q149M9 1564 aa29.93■■■□□ 2.38
SGMS1-208ENST00000608287 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
SGMS1-208ENST00000608287 TET3O43151 1660 aa29.9■■■□□ 2.38
SGMS1-208ENST00000608287 SLAIN2Q9P270 581 aa29.87■■■□□ 2.37
SGMS1-208ENST00000608287 SLC26A8Q96RN1 970 aa29.86■■■□□ 2.37
SGMS1-208ENST00000608287 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
SGMS1-208ENST00000608287 CROCC2H7BZ55 1655 aa29.85■■■□□ 2.37
SGMS1-208ENST00000608287 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP29.84■■■□□ 2.372e-6■■■□□ 15
SGMS1-208ENST00000608287 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa29.84■■■□□ 2.37
SGMS1-208ENST00000608287 LMTK2Q8IWU2 1503 aa29.84■■■□□ 2.37
SGMS1-208ENST00000608287 ADGRB3O60242 1522 aa29.83■■■□□ 2.37
SGMS1-208ENST00000608287 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.83■■■□□ 2.37
SGMS1-208ENST00000608287 IDI1Q13907 227 aa29.82■■■□□ 2.36
SGMS1-208ENST00000608287 BCANQ96GW7 911 aa29.82■■■□□ 2.36
SGMS1-208ENST00000608287 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
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