RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608287.1

SGMS1-208, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 4

Gene SGMS1, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-208ENST00000608287 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.23■■■■■ 5.31
SGMS1-208ENST00000608287 ABCC9O60706 1549 aa44.29■■■■■ 4.68
SGMS1-208ENST00000608287 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.76■■■■■ 4.6
SGMS1-208ENST00000608287 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.06■■■■■ 4.32
SGMS1-208ENST00000608287 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.01■■■■■ 4.32
SGMS1-208ENST00000608287 NACADO15069 1562 aa41.54■■■■■ 4.24
SGMS1-208ENST00000608287 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.04■■■■■ 4.16
SGMS1-208ENST00000608287 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.96■■■■■ 4.15
SGMS1-208ENST00000608287 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.91■■■■■ 4.14
SGMS1-208ENST00000608287 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.76■■■■■ 4.12
SGMS1-208ENST00000608287 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.63■■■■■ 4.09
SGMS1-208ENST00000608287 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.32■■■■■ 4.04
SGMS1-208ENST00000608287 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.07■■■■■ 4
SGMS1-208ENST00000608287 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.04■■■■■ 4
SGMS1-208ENST00000608287 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.91■■■■□ 3.98
SGMS1-208ENST00000608287 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.81■■■■□ 3.96
SGMS1-208ENST00000608287 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.79■■■■□ 3.96
SGMS1-208ENST00000608287 SCRIBQ14160 1630 aa39.65■■■■□ 3.94
SGMS1-208ENST00000608287 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.42■■■■□ 3.9
SGMS1-208ENST00000608287 CUX2O14529 1486 aa38.69■■■■□ 3.78
SGMS1-208ENST00000608287 ERCC6Q03468 1493 aa38.45■■■■□ 3.75
SGMS1-208ENST00000608287 NCAPD3P42695 1498 aa38.29■■■■□ 3.72
SGMS1-208ENST00000608287 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.01■■■■□ 3.67
SGMS1-208ENST00000608287 SMARCA2P51531 1590 aa37.99■■■■□ 3.67
SGMS1-208ENST00000608287 HMGXB3Q12766 1538 aa37.99■■■■□ 3.67
SGMS1-208ENST00000608287 SMARCA4P51532 1647 aa37.8■■■■□ 3.64
SGMS1-208ENST00000608287 NESP48681 1621 aa37.77■■■■□ 3.64
SGMS1-208ENST00000608287 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.67■■■■□ 3.62
SGMS1-208ENST00000608287 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.67■■■■□ 3.62
SGMS1-208ENST00000608287 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.62■■■■□ 3.61
SGMS1-208ENST00000608287 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.58■■■■□ 3.61
SGMS1-208ENST00000608287 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.5■■■■□ 3.59
SGMS1-208ENST00000608287 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.44■■■■□ 3.58
SGMS1-208ENST00000608287 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.36■■■■□ 3.57
SGMS1-208ENST00000608287 TRIM41Q8WV44 630 aa37.31■■■■□ 3.56
SGMS1-208ENST00000608287 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.1■■■■□ 3.53
SGMS1-208ENST00000608287 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.07■■■■□ 3.53
SGMS1-208ENST00000608287 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.06■■■■□ 3.52
SGMS1-208ENST00000608287 WDR62O43379 1518 aa37.03■■■■□ 3.52
SGMS1-208ENST00000608287 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.82■■■■□ 3.48
SGMS1-208ENST00000608287 OSCARQ8IYS5 282 aa36.73■■■■□ 3.47
SGMS1-208ENST00000608287 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.65■■■■□ 3.46
SGMS1-208ENST00000608287 WIZO95785 1651 aa36.59■■■■□ 3.45
SGMS1-208ENST00000608287 CFTRP13569 1480 aa36.5■■■■□ 3.43
SGMS1-208ENST00000608287 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.32■■■■□ 3.4
SGMS1-208ENST00000608287 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.27■■■■□ 3.4
SGMS1-208ENST00000608287 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.27■■■■□ 3.4
SGMS1-208ENST00000608287 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.27■■■■□ 3.4
SGMS1-208ENST00000608287 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.18■■■■□ 3.38
SGMS1-208ENST00000608287 PRDM2Q13029 1718 aa36.16■■■■□ 3.38
SGMS1-208ENST00000608287 IFT140Q96RY7 1462 aa36.12■■■■□ 3.37
SGMS1-208ENST00000608287 ARHGEF11O15085 1522 aa36.1■■■■□ 3.37
SGMS1-208ENST00000608287 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.04■■■■□ 3.36
SGMS1-208ENST00000608287 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.96■■■■□ 3.35
SGMS1-208ENST00000608287 ABCC8Q09428 1581 aa35.89■■■■□ 3.34
SGMS1-208ENST00000608287 TOPBP1Q92547 1522 aa35.85■■■■□ 3.33
SGMS1-208ENST00000608287 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.84■■■■□ 3.33
SGMS1-208ENST00000608287 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.83■■■■□ 3.33
SGMS1-208ENST00000608287 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.74■■■■□ 3.31
SGMS1-208ENST00000608287 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.71■■■■□ 3.31
SGMS1-208ENST00000608287 CHD1O14646 1710 aa35.7■■■■□ 3.31
SGMS1-208ENST00000608287 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.69■■■■□ 3.3
SGMS1-208ENST00000608287 ARAP1Q96P48 1450 aa35.65■■■■□ 3.3
SGMS1-208ENST00000608287 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.57■■■■□ 3.29
SGMS1-208ENST00000608287 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.56■■■■□ 3.283e-7■■■□□ 16
SGMS1-208ENST00000608287 FBLN2P98095 1184 aa35.53■■■■□ 3.28
SGMS1-208ENST00000608287 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.42■■■■□ 3.26
SGMS1-208ENST00000608287 WDR97A6NE52 1622 aa35.38■■■■□ 3.25
SGMS1-208ENST00000608287 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP35.37■■■■□ 3.25
SGMS1-208ENST00000608287 SYNJ1O43426 1573 aa35.3■■■■□ 3.24
SGMS1-208ENST00000608287 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.28■■■■□ 3.24
SGMS1-208ENST00000608287 SOGA1O94964 1423 aa35.26■■■■□ 3.24
SGMS1-208ENST00000608287 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.24■■■■□ 3.23
SGMS1-208ENST00000608287 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.22■■■■□ 3.23
SGMS1-208ENST00000608287 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.22■■■■□ 3.23
SGMS1-208ENST00000608287 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.22■■■■□ 3.23
SGMS1-208ENST00000608287 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.21■■■■□ 3.23
SGMS1-208ENST00000608287 GRIN2BQ13224 1484 aa35.1■■■■□ 3.21
SGMS1-208ENST00000608287 SYNJ2O15056 1496 aa35.09■■■■□ 3.21
SGMS1-208ENST00000608287 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.09■■■■□ 3.21
SGMS1-208ENST00000608287 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.97■■■■□ 3.19
SGMS1-208ENST00000608287 PBRM1Q86U86 1689 aa34.89■■■■□ 3.18
SGMS1-208ENST00000608287 CUX1P39880 1505 aa34.89■■■■□ 3.18
SGMS1-208ENST00000608287 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.71■■■■□ 3.15
SGMS1-208ENST00000608287 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.7■■■■□ 3.14
SGMS1-208ENST00000608287 GRIN2AQ12879 1464 aa34.63■■■■□ 3.13
SGMS1-208ENST00000608287 CEP170Q5SW79 1584 aa34.56■■■■□ 3.12
SGMS1-208ENST00000608287 NUP160Q12769 1436 aa34.54■■■■□ 3.12
SGMS1-208ENST00000608287 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.53■■■■□ 3.12
SGMS1-208ENST00000608287 ADAMTS12P58397 1594 aa34.5■■■■□ 3.11
SGMS1-208ENST00000608287 SHROOM2Q13796 1616 aa34.48■■■■□ 3.11
SGMS1-208ENST00000608287 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.47■■■■□ 3.11
SGMS1-208ENST00000608287 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.45■■■■□ 3.115e-6■■■■■ 29.2
SGMS1-208ENST00000608287 KIF13AQ9H1H9 1805 aa34.41■■■■□ 3.1
SGMS1-208ENST00000608287 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.4■■■■□ 3.1
SGMS1-208ENST00000608287 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.3■■■■□ 3.08
SGMS1-208ENST00000608287 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.24■■■■□ 3.07
SGMS1-208ENST00000608287 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.22■■■■□ 3.07
SGMS1-208ENST00000608287 TOP2BQ02880 1626 aa34.22■■■■□ 3.07
SGMS1-208ENST00000608287 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP34.21■■■■□ 3.07
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