RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590509.5

PTPRS-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRS, Length 893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-208ENST00000590509 ALKQ9UM73 1620 aa26.19■■□□□ 1.78
PTPRS-208ENST00000590509 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
PTPRS-208ENST00000590509 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.15■■□□□ 1.78
PTPRS-208ENST00000590509 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.15■■□□□ 1.78
PTPRS-208ENST00000590509 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
PTPRS-208ENST00000590509 TNRQ92752 1358 aa26.14■■□□□ 1.78
PTPRS-208ENST00000590509 VWDEQ8N2E2 1590 aa26.13■■□□□ 1.77
PTPRS-208ENST00000590509 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.11■■□□□ 1.77
PTPRS-208ENST00000590509 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.11■■□□□ 1.77
PTPRS-208ENST00000590509 CPS1P31327 1500 aa26.1■■□□□ 1.77
PTPRS-208ENST00000590509 KIF3BO15066 747 aa26.1■■□□□ 1.77
PTPRS-208ENST00000590509 PZPP20742 1482 aa26.1■■□□□ 1.77
PTPRS-208ENST00000590509 STRCP1A6NGW2 1772 aa26.07■■□□□ 1.76
PTPRS-208ENST00000590509 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.06■■□□□ 1.76
PTPRS-208ENST00000590509 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.05■■□□□ 1.76
PTPRS-208ENST00000590509 TOM1O60784 492 aa26.05■■□□□ 1.76
PTPRS-208ENST00000590509 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
PTPRS-208ENST00000590509 CEP162Q5TB80 1403 aa26.02■■□□□ 1.76
PTPRS-208ENST00000590509 MIA2Q96PC5 1412 aa26.02■■□□□ 1.76
PTPRS-208ENST00000590509 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
PTPRS-208ENST00000590509 UGGT1Q9NYU2 1555 aa26■■□□□ 1.75
PTPRS-208ENST00000590509 MED14O60244 1454 aa26■■□□□ 1.75
PTPRS-208ENST00000590509 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26■■□□□ 1.75
PTPRS-208ENST00000590509 ANKLE2Q86XL3 938 aa26■■□□□ 1.75
PTPRS-208ENST00000590509 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.99■■□□□ 1.75
PTPRS-208ENST00000590509 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.99■■□□□ 1.75
PTPRS-208ENST00000590509 DEPDC5O75140 1603 aa25.98■■□□□ 1.75
PTPRS-208ENST00000590509 IQGAP1P46940 1657 aa25.96■■□□□ 1.75
PTPRS-208ENST00000590509 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
PTPRS-208ENST00000590509 NCOA2Q15596 1464 aa25.95■■□□□ 1.74
PTPRS-208ENST00000590509 NLRP1Q9C000 1473 aa25.95■■□□□ 1.74
PTPRS-208ENST00000590509 LRRC7Q96NW7 1537 aa25.94■■□□□ 1.74
PTPRS-208ENST00000590509 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.93■■□□□ 1.74
PTPRS-208ENST00000590509 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.73
PTPRS-208ENST00000590509 ABCC3O15438 1527 aa25.88■■□□□ 1.73
PTPRS-208ENST00000590509 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
PTPRS-208ENST00000590509 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.87■■□□□ 1.73
PTPRS-208ENST00000590509 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.87■■□□□ 1.73
PTPRS-208ENST00000590509 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
PTPRS-208ENST00000590509 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
PTPRS-208ENST00000590509 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
PTPRS-208ENST00000590509 ERVK-7P63135 1459 aa25.85■■□□□ 1.73
PTPRS-208ENST00000590509 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
PTPRS-208ENST00000590509 CEP152O94986 1710 aa25.83■■□□□ 1.73
PTPRS-208ENST00000590509 UBR1Q8IWV7 1749 aa25.83■■□□□ 1.72
PTPRS-208ENST00000590509 SYNMO15061 1565 aa25.81■■□□□ 1.72
PTPRS-208ENST00000590509 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.8■■□□□ 1.72
PTPRS-208ENST00000590509 LTKP29376 864 aa25.79■■□□□ 1.72
PTPRS-208ENST00000590509 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25.78■■□□□ 1.72
PTPRS-208ENST00000590509 TSPY4P0CV99 314 aa25.76■■□□□ 1.71
PTPRS-208ENST00000590509 TSPY10P0CW01 314 aa25.76■■□□□ 1.71
PTPRS-208ENST00000590509 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
PTPRS-208ENST00000590509 ARHGAP23Q9P227 1491 aa25.73■■□□□ 1.71
PTPRS-208ENST00000590509 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
PTPRS-208ENST00000590509 SLIT1O75093 1534 aa25.69■■□□□ 1.7
PTPRS-208ENST00000590509 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.68■■□□□ 1.7
PTPRS-208ENST00000590509 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
PTPRS-208ENST00000590509 TXNDC2Q86VQ3 553 aa25.68■■□□□ 1.7
PTPRS-208ENST00000590509 POTEAQ6S8J7 498 aa25.65■■□□□ 1.7
PTPRS-208ENST00000590509 PIK3C2BO00750 1634 aa25.65■■□□□ 1.7
PTPRS-208ENST00000590509 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
PTPRS-208ENST00000590509 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
PTPRS-208ENST00000590509 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.6■■□□□ 1.69
PTPRS-208ENST00000590509 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.59■■□□□ 1.69
PTPRS-208ENST00000590509 FAM135BQ49AJ0 1406 aa25.58■■□□□ 1.69
PTPRS-208ENST00000590509 MAP3K1Q13233 1512 aa25.58■■□□□ 1.68
PTPRS-208ENST00000590509 TMEM94Q12767 1356 aa25.57■■□□□ 1.68
PTPRS-208ENST00000590509 TMEM2Q9UHN6 1383 aa25.56■■□□□ 1.68
PTPRS-208ENST00000590509 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.56■■□□□ 1.68
PTPRS-208ENST00000590509 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa25.56■■□□□ 1.68
PTPRS-208ENST00000590509 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.54■■□□□ 1.68
PTPRS-208ENST00000590509 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.54■■□□□ 1.68
PTPRS-208ENST00000590509 TET3O43151 1660 aa25.54■■□□□ 1.68
PTPRS-208ENST00000590509 KIF15Q9NS87 1388 aa25.54■■□□□ 1.68
PTPRS-208ENST00000590509 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.54■■□□□ 1.68
PTPRS-208ENST00000590509 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
PTPRS-208ENST00000590509 ABCC5O15440 1437 aa25.53■■□□□ 1.68
PTPRS-208ENST00000590509 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.52■■□□□ 1.68
PTPRS-208ENST00000590509 SLC26A8Q96RN1 970 aa25.52■■□□□ 1.68
PTPRS-208ENST00000590509 IDI1Q13907 227 aa25.51■■□□□ 1.67
PTPRS-208ENST00000590509 EID1Q9Y6B2 187 aa25.51■■□□□ 1.67
PTPRS-208ENST00000590509 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.48■■□□□ 1.67
PTPRS-208ENST00000590509 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.48■■□□□ 1.67
PTPRS-208ENST00000590509 KCNA6P17658 529 aa25.48■■□□□ 1.67
PTPRS-208ENST00000590509 ERBINQ96RT1 1412 aa25.47■■□□□ 1.67
PTPRS-208ENST00000590509 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
PTPRS-208ENST00000590509 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
PTPRS-208ENST00000590509 NWD1Q149M9 1564 aa25.44■■□□□ 1.66
PTPRS-208ENST00000590509 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.43■■□□□ 1.66
PTPRS-208ENST00000590509 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.43■■□□□ 1.66
PTPRS-208ENST00000590509 DAPK1P53355 1430 aa25.41■■□□□ 1.66
PTPRS-208ENST00000590509 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.41■■□□□ 1.66
PTPRS-208ENST00000590509 NOS1P29475 1434 aa25.4■■□□□ 1.66
PTPRS-208ENST00000590509 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.39■■□□□ 1.66
PTPRS-208ENST00000590509 PHLPP1O60346 1717 aa25.39■■□□□ 1.65
PTPRS-208ENST00000590509 ADGRB3O60242 1522 aa25.38■■□□□ 1.65
PTPRS-208ENST00000590509 MYO5BQ9ULV0 1848 aa25.37■■□□□ 1.65
PTPRS-208ENST00000590509 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
PTPRS-208ENST00000590509 LRP6O75581 1613 aa25.34■■□□□ 1.65
PTPRS-208ENST00000590509 KANK1Q14678 1352 aa25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.5 ms