RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588337.5

KDM4B-205, Transcript of lysine demethylase 4B, humanhuman

TSL 5

Gene KDM4B, Length 504 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4B-205ENST00000588337 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP42.05■■■■■ 4.32
KDM4B-205ENST00000588337 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP42.04■■■■■ 4.32
KDM4B-205ENST00000588337 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP42.03■■■■■ 4.32
KDM4B-205ENST00000588337 SHANK2Q9UPX8 1470 aa42.02■■■■■ 4.32
KDM4B-205ENST00000588337 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP42.01■■■■■ 4.32
KDM4B-205ENST00000588337 ABCC5O15440 1437 aa41.98■■■■■ 4.31
KDM4B-205ENST00000588337 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP41.96■■■■■ 4.31
KDM4B-205ENST00000588337 DUOX2Q9NRD8 1548 aa41.95■■■■■ 4.31
KDM4B-205ENST00000588337 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa41.94■■■■■ 4.3
KDM4B-205ENST00000588337 DAPK1P53355 1430 aa41.94■■■■■ 4.3
KDM4B-205ENST00000588337 NCOA1Q15788 1441 aa41.94■■■■■ 4.3
KDM4B-205ENST00000588337 PZPP20742 1482 aa41.92■■■■■ 4.3
KDM4B-205ENST00000588337 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP41.92■■■■■ 4.3
KDM4B-205ENST00000588337 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa41.91■■■■■ 4.3
KDM4B-205ENST00000588337 MROH1Q8NDA8 1641 aa41.91■■■■■ 4.3
KDM4B-205ENST00000588337 DMRT2Q9Y5R5 561 aa41.89■■■■■ 4.3
KDM4B-205ENST00000588337 KIF15Q9NS87 1388 aa41.87■■■■■ 4.29
KDM4B-205ENST00000588337 ABCC3O15438 1527 aa41.86■■■■■ 4.29
KDM4B-205ENST00000588337 PTPRTO14522 1441 aa41.85■■■■■ 4.29
KDM4B-205ENST00000588337 FBXO41Q8TF61 875 aa41.83■■■■■ 4.29
KDM4B-205ENST00000588337 CEP152O94986 1710 aa41.82■■■■■ 4.29
KDM4B-205ENST00000588337 A2ML1A8K2U0 1454 aa41.8■■■■■ 4.28
KDM4B-205ENST00000588337 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP41.8■■■■■ 4.28
KDM4B-205ENST00000588337 ERBINQ96RT1 1412 aa41.79■■■■■ 4.28
KDM4B-205ENST00000588337 TNRQ92752 1358 aa41.79■■■■■ 4.28
KDM4B-205ENST00000588337 PLA2R1Q13018 1463 aa41.79■■■■■ 4.28
KDM4B-205ENST00000588337 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa41.76■■■■■ 4.28
KDM4B-205ENST00000588337 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP41.75■■■■■ 4.27
KDM4B-205ENST00000588337 DEPDC5O75140 1603 aa41.73■■■■■ 4.27
KDM4B-205ENST00000588337 CERKQ8TCT0 537 aa41.7■■■■■ 4.27
KDM4B-205ENST00000588337 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa41.69■■■■■ 4.26
KDM4B-205ENST00000588337 CHIC2Q9UKJ5 165 aa41.68■■■■■ 4.26
KDM4B-205ENST00000588337 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa41.68■■■■■ 4.26
KDM4B-205ENST00000588337 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa41.67■■■■■ 4.26
KDM4B-205ENST00000588337 ADGRL2O95490 1459 aa41.66■■■■■ 4.26
KDM4B-205ENST00000588337 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP41.65■■■■■ 4.26
KDM4B-205ENST00000588337 NLRP1Q9C000 1473 aa41.65■■■■■ 4.26
KDM4B-205ENST00000588337 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP41.64■■■■■ 4.26
KDM4B-205ENST00000588337 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP41.62■■■■■ 4.25
KDM4B-205ENST00000588337 ERVK-7P63135 1459 aa41.62■■■■■ 4.25
KDM4B-205ENST00000588337 PKD2Q13563 968 aa41.61■■■■■ 4.25
KDM4B-205ENST00000588337 LTBP4Q8N2S1 1624 aa41.58■■■■■ 4.25
KDM4B-205ENST00000588337 UGGT1Q9NYU2 1555 aa41.56■■■■■ 4.24
KDM4B-205ENST00000588337 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa41.52■■■■■ 4.24
KDM4B-205ENST00000588337 VWDEQ8N2E2 1590 aa41.52■■■■■ 4.24
KDM4B-205ENST00000588337 NEURL4Q96JN8 1562 aa41.52■■■■■ 4.24
KDM4B-205ENST00000588337 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP41.5■■■■■ 4.232e-9■□□□□ 10.3
KDM4B-205ENST00000588337 KANK1Q14678 1352 aa41.49■■■■■ 4.23
KDM4B-205ENST00000588337 LMTK2Q8IWU2 1503 aa41.47■■■■■ 4.23
KDM4B-205ENST00000588337 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP41.46■■■■■ 4.232e-6■■■■■ 36.5
KDM4B-205ENST00000588337 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP41.43■■■■■ 4.22
KDM4B-205ENST00000588337 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP41.43■■■■■ 4.22
KDM4B-205ENST00000588337 UBR1Q8IWV7 1749 aa41.43■■■■■ 4.22
KDM4B-205ENST00000588337 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa41.42■■■■■ 4.22
KDM4B-205ENST00000588337 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP41.4■■■■■ 4.22
KDM4B-205ENST00000588337 EFCAB6Q5THR3 1501 aa41.38■■■■■ 4.21
KDM4B-205ENST00000588337 IQSEC2Q5JU85 1478 aa41.36■■■■■ 4.21
KDM4B-205ENST00000588337 ANKLE2Q86XL3 938 aa41.34■■■■■ 4.21
KDM4B-205ENST00000588337 MED14O60244 1454 aa41.32■■■■■ 4.2
KDM4B-205ENST00000588337 ROCK1Q13464 1354 aa41.31■■■■■ 4.2
KDM4B-205ENST00000588337 PIK3C2BO00750 1634 aa41.3■■■■■ 4.2
KDM4B-205ENST00000588337 UNC13BO14795 1591 aa41.3■■■■■ 4.2
KDM4B-205ENST00000588337 IQGAP1P46940 1657 aa41.29■■■■■ 4.2
KDM4B-205ENST00000588337 SYNMO15061 1565 aa41.27■■■■■ 4.2
KDM4B-205ENST00000588337 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP41.27■■■■■ 4.2
KDM4B-205ENST00000588337 TET3O43151 1660 aa41.25■■■■■ 4.19
KDM4B-205ENST00000588337 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP41.22■■■■■ 4.19
KDM4B-205ENST00000588337 GCC2Q8IWJ2 1684 aa41.21■■■■■ 4.19
KDM4B-205ENST00000588337 SLIT1O75093 1534 aa41.21■■■■■ 4.19
KDM4B-205ENST00000588337 NOS1P29475 1434 aa41.2■■■■■ 4.19
KDM4B-205ENST00000588337 ARHGAP23Q9P227 1491 aa41.2■■■■■ 4.19
KDM4B-205ENST00000588337 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP41.18■■■■■ 4.18
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KDM4B-205ENST00000588337 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP41.15■■■■■ 4.18
KDM4B-205ENST00000588337 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP41.15■■■■■ 4.18
KDM4B-205ENST00000588337 CPS1P31327 1500 aa41.14■■■■■ 4.18
KDM4B-205ENST00000588337 IQGAP3Q86VI3 1631 aa41.13■■■■■ 4.17
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KDM4B-205ENST00000588337 ADGRB3O60242 1522 aa41.08■■■■■ 4.17
KDM4B-205ENST00000588337 E9PCH4 1651 aa41.08■■■■■ 4.17
KDM4B-205ENST00000588337 STRCP1A6NGW2 1772 aa41.05■■■■■ 4.16
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KDM4B-205ENST00000588337 STAG3Q9UJ98 1225 aa41.04■■■■■ 4.16
KDM4B-205ENST00000588337 TXNDC2Q86VQ3 553 aa41.02■■■■■ 4.16
KDM4B-205ENST00000588337 MYO5BQ9ULV0 1848 aa41■■■■■ 4.15
KDM4B-205ENST00000588337 SLC52A1Q9NWF4 448 aa40.99■■■■■ 4.15
KDM4B-205ENST00000588337 EID1Q9Y6B2 187 aa40.98■■■■■ 4.15
KDM4B-205ENST00000588337 UBAP1LF5GYI3 381 aa40.95■■■■■ 4.15
KDM4B-205ENST00000588337 NUP155O75694 1391 aa40.95■■■■■ 4.15
KDM4B-205ENST00000588337 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa40.91■■■■■ 4.14
KDM4B-205ENST00000588337 LRRC7Q96NW7 1537 aa40.85■■■■■ 4.13
KDM4B-205ENST00000588337 NAIPQ13075 1403 aa40.84■■■■■ 4.13
KDM4B-205ENST00000588337 ZFYVE9O95405 1425 aa40.81■■■■■ 4.12
KDM4B-205ENST00000588337 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa40.8■■■■■ 4.12
KDM4B-205ENST00000588337 ALKQ9UM73 1620 aa40.76■■■■■ 4.12
KDM4B-205ENST00000588337 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP40.76■■■■■ 4.12
KDM4B-205ENST00000588337 HFM1A2PYH4 1435 aa40.74■■■■■ 4.11
KDM4B-205ENST00000588337 RIMS2Q9UQ26 1411 aa40.74■■■■■ 4.11
KDM4B-205ENST00000588337 TOM1O60784 492 aa40.72■■■■■ 4.11
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