RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587269.5

SMAD2-208, Transcript of SMAD family member 2, human

TSL 3

Gene SMAD2, Length 1,042 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMAD2-208	ENST00000587269	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		45.95	■■■■■ 4.95
SMAD2-208	ENST00000587269	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		45.93	■■■■■ 4.94
SMAD2-208	ENST00000587269	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		45.92	■■■■■ 4.94
SMAD2-208	ENST00000587269	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	45.88	■■■■■ 4.94
SMAD2-208	ENST00000587269	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		45.87	■■■■■ 4.93
SMAD2-208	ENST00000587269	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		45.87	■■■■■ 4.93
SMAD2-208	ENST00000587269	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	45.87	■■■■■ 4.93
SMAD2-208	ENST00000587269	TNR	Q92752	1358 aa		45.85	■■■■■ 4.93
SMAD2-208	ENST00000587269	PKD2	Q13563	968 aa		45.85	■■■■■ 4.93
SMAD2-208	ENST00000587269	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	45.83	■■■■■ 4.93
SMAD2-208	ENST00000587269	PZP	P20742	1482 aa		45.82	■■■■■ 4.93
SMAD2-208	ENST00000587269	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		45.81	■■■■■ 4.92
SMAD2-208	ENST00000587269	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		45.8	■■■■■ 4.92
SMAD2-208	ENST00000587269	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		45.79	■■■■■ 4.92
SMAD2-208	ENST00000587269	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		45.78	■■■■■ 4.92
SMAD2-208	ENST00000587269	ABCC5	O15440	1437 aa		45.77	■■■■■ 4.92
SMAD2-208	ENST00000587269	PLA2R1	Q13018	1463 aa		45.76	■■■■■ 4.92
SMAD2-208	ENST00000587269	KIF15	Q9NS87	1388 aa		45.76	■■■■■ 4.92
SMAD2-208	ENST00000587269	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	45.76	■■■■■ 4.92
SMAD2-208	ENST00000587269	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		45.74	■■■■■ 4.91
SMAD2-208	ENST00000587269	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	45.74	■■■■■ 4.91
SMAD2-208	ENST00000587269	DAPK1	P53355	1430 aa		45.72	■■■■■ 4.91
SMAD2-208	ENST00000587269	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		45.69	■■■■■ 4.9
SMAD2-208	ENST00000587269	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	45.68	■■■■■ 4.9
SMAD2-208	ENST00000587269	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		45.67	■■■■■ 4.9
SMAD2-208	ENST00000587269	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	45.67	■■■■■ 4.9
SMAD2-208	ENST00000587269	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	45.66	■■■■■ 4.9
SMAD2-208	ENST00000587269	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	45.66	■■■■■ 4.9
SMAD2-208	ENST00000587269	ABCC3	O15438	1527 aa		45.65	■■■■■ 4.9
SMAD2-208	ENST00000587269	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	45.65	■■■■■ 4.9
SMAD2-208	ENST00000587269	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		45.64	■■■■■ 4.9
SMAD2-208	ENST00000587269	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	45.63	■■■■■ 4.9	2e-6	■■■□□ 16.4
SMAD2-208	ENST00000587269	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		45.62	■■■■■ 4.89
SMAD2-208	ENST00000587269	NLRP1	Q9C000	1473 aa		45.61	■■■■■ 4.89
SMAD2-208	ENST00000587269	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		45.57	■■■■■ 4.89
SMAD2-208	ENST00000587269	KANK1	Q14678	1352 aa		45.56	■■■■■ 4.88
SMAD2-208	ENST00000587269	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	45.52	■■■■■ 4.88
SMAD2-208	ENST00000587269	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		45.52	■■■■■ 4.88
SMAD2-208	ENST00000587269	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		45.52	■■■■■ 4.88
SMAD2-208	ENST00000587269	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		45.51	■■■■■ 4.88
SMAD2-208	ENST00000587269	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	45.51	■■■■■ 4.88
SMAD2-208	ENST00000587269	CEP152	O94986	1710 aa		45.51	■■■■■ 4.88
SMAD2-208	ENST00000587269	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	45.49	■■■■■ 4.87
SMAD2-208	ENST00000587269	ERVK-7	P63135	1459 aa		45.46	■■■■■ 4.87
SMAD2-208	ENST00000587269	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		45.45	■■■■■ 4.87
SMAD2-208	ENST00000587269	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	45.42	■■■■■ 4.86
SMAD2-208	ENST00000587269	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		45.42	■■■■■ 4.86
SMAD2-208	ENST00000587269	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	45.41	■■■■■ 4.86
SMAD2-208	ENST00000587269	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		45.36	■■■■■ 4.85
SMAD2-208	ENST00000587269	ADGRL2	O95490	1459 aa		45.32	■■■■■ 4.85
SMAD2-208	ENST00000587269	DEPDC5	O75140	1603 aa		45.32	■■■■■ 4.85
SMAD2-208	ENST00000587269	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		45.29	■■■■■ 4.84
SMAD2-208	ENST00000587269	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		45.28	■■■■■ 4.84
SMAD2-208	ENST00000587269	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	45.28	■■■■■ 4.84
SMAD2-208	ENST00000587269	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		45.27	■■■■■ 4.84
SMAD2-208	ENST00000587269	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	45.26	■■■■■ 4.84
SMAD2-208	ENST00000587269	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		45.24	■■■■■ 4.83
SMAD2-208	ENST00000587269	MED14	O60244	1454 aa		45.21	■■■■■ 4.83
SMAD2-208	ENST00000587269	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		45.18	■■■■■ 4.82
SMAD2-208	ENST00000587269	EID1	Q9Y6B2	187 aa		45.18	■■■■■ 4.82
SMAD2-208	ENST00000587269	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		45.16	■■■■■ 4.82
SMAD2-208	ENST00000587269	ITGAE	P38570	1179 aa		45.16	■■■■■ 4.82
SMAD2-208	ENST00000587269	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		45.16	■■■■■ 4.82
SMAD2-208	ENST00000587269	CPS1	P31327	1500 aa		45.14	■■■■■ 4.82
SMAD2-208	ENST00000587269	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		45.13	■■■■■ 4.82
SMAD2-208	ENST00000587269	IQGAP1	P46940	1657 aa		45.12	■■■■■ 4.81
SMAD2-208	ENST00000587269	IDI1	Q13907	227 aa		45.08	■■■■■ 4.81
SMAD2-208	ENST00000587269	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	45.07	■■■■■ 4.81
SMAD2-208	ENST00000587269	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		45.05	■■■■■ 4.8
SMAD2-208	ENST00000587269	ROCK1	Q13464	1354 aa		45.05	■■■■■ 4.8
SMAD2-208	ENST00000587269	LTK	P29376	864 aa		45.04	■■■■■ 4.8
SMAD2-208	ENST00000587269	TOM1	O60784	492 aa		45.03	■■■■■ 4.8
SMAD2-208	ENST00000587269	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		45.03	■■■■■ 4.8
SMAD2-208	ENST00000587269	PIK3C2B	O00750	1634 aa		45.03	■■■■■ 4.8
SMAD2-208	ENST00000587269	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	45.02	■■■■■ 4.8
SMAD2-208	ENST00000587269	SLIT1	O75093	1534 aa		45.01	■■■■■ 4.8
SMAD2-208	ENST00000587269	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		44.99	■■■■■ 4.79
SMAD2-208	ENST00000587269	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		44.98	■■■■■ 4.79
SMAD2-208	ENST00000587269	NOS1	P29475	1434 aa		44.96	■■■■■ 4.79
SMAD2-208	ENST00000587269	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	44.95	■■■■■ 4.79
SMAD2-208	ENST00000587269	PIP4K2B	P78356	416 aa		44.94	■■■■■ 4.78
SMAD2-208	ENST00000587269	SYNM	O15061	1565 aa		44.91	■■■■■ 4.78
SMAD2-208	ENST00000587269	TET3	O43151	1660 aa		44.89	■■■■■ 4.78
SMAD2-208	ENST00000587269	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	44.89	■■■■■ 4.78
SMAD2-208	ENST00000587269	BCAN	Q96GW7	911 aa		44.87	■■■■■ 4.77
SMAD2-208	ENST00000587269	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		44.86	■■■■■ 4.77
SMAD2-208	ENST00000587269	UNC13B	O14795	1591 aa		44.86	■■■■■ 4.77
SMAD2-208	ENST00000587269	NUP155	O75694	1391 aa		44.83	■■■■■ 4.77
SMAD2-208	ENST00000587269	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	44.82	■■■■■ 4.77
SMAD2-208	ENST00000587269	ADGRB3	O60242	1522 aa		44.81	■■■■■ 4.76
SMAD2-208	ENST00000587269	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		44.81	■■■■■ 4.76
SMAD2-208	ENST00000587269	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	44.8	■■■■■ 4.76
SMAD2-208	ENST00000587269	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		44.76	■■■■■ 4.76
SMAD2-208	ENST00000587269	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	44.75	■■■■■ 4.75
SMAD2-208	ENST00000587269	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		44.74	■■■■■ 4.75
SMAD2-208	ENST00000587269	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		44.73	■■■■■ 4.75
SMAD2-208	ENST00000587269	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		44.7	■■■■■ 4.75
SMAD2-208	ENST00000587269	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	44.67	■■■■■ 4.74
SMAD2-208	ENST00000587269	HSPA1L	P34931	641 aa		44.67	■■■■■ 4.74
SMAD2-208	ENST00000587269		E9PCH4	1651 aa		44.66	■■■■■ 4.74

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms