RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa22.82■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ATP10AO60312 1499 aa22.82■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.81■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.8■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.8■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.79■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.79■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.78■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.78■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.77■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.77■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LAMC1P11047 1609 aa22.76■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.75■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CCDC184Q52MB2 194 aa22.74■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.74■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.73■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 A2MP01023 1474 aa22.73■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DEPDC5O75140 1603 aa22.73■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 E9PCH4 1651 aa22.71■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FKBP8Q14318 412 aa22.7■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GPRASP1Q5JY77 1395 aa22.69■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MRS2Q9HD23 443 aa22.68■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FANCAO15360 1455 aa22.68■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NEFLP07196 543 aa22.67■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ATP7AQ04656 1500 aa22.67■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.66■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa22.64■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TET3O43151 1660 aa22.64■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CEP152O94986 1710 aa22.64■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 AFAP1Q8N556 730 aa22.64■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TRPM2O94759 1503 aa22.63■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 VWDEQ8N2E2 1590 aa22.62■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ASXL2Q76L83 1435 aa22.62■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RGL3Q3MIN7 710 aa22.61■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ADGRL1O94910 1474 aa22.61■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.61■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.6■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.59■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PTPRTO14522 1441 aa22.58■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.56■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NBPF1Q3BBV0 1214 aa22.56■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MADDQ8WXG6 1647 aa22.56■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CLTCL1P53675 1640 aa22.55■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 BCANQ96GW7 911 aa22.54■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.54■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MROH1Q8NDA8 1641 aa22.53■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.53■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.52■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KANK1Q14678 1352 aa22.51■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IQGAP1P46940 1657 aa22.5■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 STAC3Q96MF2 364 aa22.5■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RALBP1Q15311 655 aa22.48■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TESK2Q96S53 571 aa22.48■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.48■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa22.46■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.44■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.44■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 EFCAB6Q5THR3 1501 aa22.44■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.43■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KIF3BO15066 747 aa22.43■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KIF1BO60333 1816 aa22.43■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LMTK2Q8IWU2 1503 aa22.43■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.43■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PARD3Q8TEW0 1356 aa22.41■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TMC1Q8TDI8 760 aa22.41■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.4■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TMF1P82094 1093 aa22.4■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.4■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CD109Q6YHK3 1445 aa22.39■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IFT172Q9UG01 1749 aa22.39■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.38■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.37■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.37■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.36■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MYOM2P54296 1465 aa22.36■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.34■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NLRP13Q86W25 1043 aa22.33■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MROH2AA6NES4 1674 aa22.32■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 UGGT1Q9NYU2 1555 aa22.32■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.31■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ABCA6Q8N139 1617 aa22.3■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NEO1Q92859 1461 aa22.3■■□□□ 1.16
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