RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000571409.1

CTDNEP1-206, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 741 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-206ENST00000571409 MYO3AQ8NEV4 1616 aa47.23■■■■■ 5.15
CTDNEP1-206ENST00000571409 SHANK2Q9UPX8 1470 aa47.22■■■■■ 5.15
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CTDNEP1-206ENST00000571409 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP47.2■■■■■ 5.15
CTDNEP1-206ENST00000571409 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa47.2■■■■■ 5.15
CTDNEP1-206ENST00000571409 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP47.19■■■■■ 5.15
CTDNEP1-206ENST00000571409 DAPK1P53355 1430 aa47.19■■■■■ 5.14
CTDNEP1-206ENST00000571409 DUOX2Q9NRD8 1548 aa47.16■■■■■ 5.14
CTDNEP1-206ENST00000571409 DMRT2Q9Y5R5 561 aa47.16■■■■■ 5.14
CTDNEP1-206ENST00000571409 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP47.16■■■■■ 5.14
CTDNEP1-206ENST00000571409 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP47.11■■■■■ 5.13
CTDNEP1-206ENST00000571409 PZPP20742 1482 aa47.11■■■■■ 5.13
CTDNEP1-206ENST00000571409 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa47.11■■■■■ 5.13
CTDNEP1-206ENST00000571409 KIF15Q9NS87 1388 aa47.11■■■■■ 5.13
CTDNEP1-206ENST00000571409 NCOA1Q15788 1441 aa47.1■■■■■ 5.13
CTDNEP1-206ENST00000571409 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP47.06■■■■■ 5.12
CTDNEP1-206ENST00000571409 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa47.06■■■■■ 5.12
CTDNEP1-206ENST00000571409 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP47.05■■■■■ 5.12
CTDNEP1-206ENST00000571409 MROH1Q8NDA8 1641 aa47.05■■■■■ 5.12
CTDNEP1-206ENST00000571409 ABCC3O15438 1527 aa47.03■■■■■ 5.12
CTDNEP1-206ENST00000571409 PTPRTO14522 1441 aa47.03■■■■■ 5.12
CTDNEP1-206ENST00000571409 FBXO41Q8TF61 875 aa47.02■■■■■ 5.12
CTDNEP1-206ENST00000571409 TNRQ92752 1358 aa47.01■■■■■ 5.12
CTDNEP1-206ENST00000571409 ERBINQ96RT1 1412 aa47■■■■■ 5.11
CTDNEP1-206ENST00000571409 CHIC2Q9UKJ5 165 aa46.99■■■■■ 5.11
CTDNEP1-206ENST00000571409 A2ML1A8K2U0 1454 aa46.98■■■■■ 5.11
CTDNEP1-206ENST00000571409 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP46.97■■■■■ 5.11
CTDNEP1-206ENST00000571409 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa46.95■■■■■ 5.11
CTDNEP1-206ENST00000571409 CEP152O94986 1710 aa46.94■■■■■ 5.11
CTDNEP1-206ENST00000571409 PLA2R1Q13018 1463 aa46.94■■■■■ 5.1
CTDNEP1-206ENST00000571409 CERKQ8TCT0 537 aa46.91■■■■■ 5.1
CTDNEP1-206ENST00000571409 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP46.89■■■■■ 5.1
CTDNEP1-206ENST00000571409 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa46.89■■■■■ 5.1
CTDNEP1-206ENST00000571409 ADGRL2O95490 1459 aa46.84■■■■■ 5.09
CTDNEP1-206ENST00000571409 DEPDC5O75140 1603 aa46.83■■■■■ 5.09
CTDNEP1-206ENST00000571409 PKD2Q13563 968 aa46.82■■■■■ 5.09
CTDNEP1-206ENST00000571409 NLRP1Q9C000 1473 aa46.81■■■■■ 5.08
CTDNEP1-206ENST00000571409 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa46.81■■■■■ 5.08
CTDNEP1-206ENST00000571409 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP46.78■■■■■ 5.089e-7■■□□□ 12.2
CTDNEP1-206ENST00000571409 ERVK-7P63135 1459 aa46.77■■■■■ 5.08
CTDNEP1-206ENST00000571409 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP46.76■■■■■ 5.08
CTDNEP1-206ENST00000571409 KANK1Q14678 1352 aa46.73■■■■■ 5.07
CTDNEP1-206ENST00000571409 UGGT1Q9NYU2 1555 aa46.72■■■■■ 5.07
CTDNEP1-206ENST00000571409 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP46.71■■■■■ 5.07
CTDNEP1-206ENST00000571409 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa46.69■■■■■ 5.06
CTDNEP1-206ENST00000571409 LTBP4Q8N2S1 1624 aa46.68■■■■■ 5.06
CTDNEP1-206ENST00000571409 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP46.68■■■■■ 5.06
CTDNEP1-206ENST00000571409 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP46.66■■■■■ 5.06
CTDNEP1-206ENST00000571409 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP46.65■■■■■ 5.062e-14■■■■□ 24.3
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CTDNEP1-206ENST00000571409 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa46.62■■■■■ 5.05
CTDNEP1-206ENST00000571409 LMTK2Q8IWU2 1503 aa46.6■■■■■ 5.05
CTDNEP1-206ENST00000571409 NEURL4Q96JN8 1562 aa46.59■■■■■ 5.05
CTDNEP1-206ENST00000571409 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP46.55■■■■■ 5.04
CTDNEP1-206ENST00000571409 ANKLE2Q86XL3 938 aa46.55■■■■■ 5.04
CTDNEP1-206ENST00000571409 UBR1Q8IWV7 1749 aa46.5■■■■■ 5.03
CTDNEP1-206ENST00000571409 ROCK1Q13464 1354 aa46.49■■■■■ 5.03
CTDNEP1-206ENST00000571409 EFCAB6Q5THR3 1501 aa46.48■■■■■ 5.03
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CTDNEP1-206ENST00000571409 MED14O60244 1454 aa46.42■■■■■ 5.02
CTDNEP1-206ENST00000571409 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP46.4■■■■■ 5.02
CTDNEP1-206ENST00000571409 UNC13BO14795 1591 aa46.39■■■■■ 5.02
CTDNEP1-206ENST00000571409 PIK3C2BO00750 1634 aa46.38■■■■■ 5.01
CTDNEP1-206ENST00000571409 IQGAP1P46940 1657 aa46.35■■■■■ 5.01
CTDNEP1-206ENST00000571409 SYNMO15061 1565 aa46.35■■■■■ 5.01
CTDNEP1-206ENST00000571409 TET3O43151 1660 aa46.33■■■■■ 5.01
CTDNEP1-206ENST00000571409 NOS1P29475 1434 aa46.32■■■■■ 5.01
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CTDNEP1-206ENST00000571409 SLIT1O75093 1534 aa46.29■■■■■ 5
CTDNEP1-206ENST00000571409 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP46.29■■■■■ 5
CTDNEP1-206ENST00000571409 ARHGAP23Q9P227 1491 aa46.29■■■■■ 5
CTDNEP1-206ENST00000571409 IDI1Q13907 227 aa46.27■■■■■ 5
CTDNEP1-206ENST00000571409 GCC2Q8IWJ2 1684 aa46.27■■■■■ 5
CTDNEP1-206ENST00000571409 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP46.26■■■■■ 5
CTDNEP1-206ENST00000571409 STAG3Q9UJ98 1225 aa46.26■■■■■ 5
CTDNEP1-206ENST00000571409 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP46.25■■■■■ 4.99
CTDNEP1-206ENST00000571409 CPS1P31327 1500 aa46.22■■■■■ 4.99
CTDNEP1-206ENST00000571409 LTKP29376 864 aa46.2■■■■■ 4.99
CTDNEP1-206ENST00000571409 TXNDC2Q86VQ3 553 aa46.2■■■■■ 4.99
CTDNEP1-206ENST00000571409 IQGAP3Q86VI3 1631 aa46.2■■■■■ 4.99
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CTDNEP1-206ENST00000571409 ADGRB3O60242 1522 aa46.15■■■■■ 4.98
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CTDNEP1-206ENST00000571409 NUP155O75694 1391 aa46.13■■■■■ 4.98
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CTDNEP1-206ENST00000571409 LRRC7Q96NW7 1537 aa45.9■■■■■ 4.94
CTDNEP1-206ENST00000571409 ZFYVE9O95405 1425 aa45.86■■■■■ 4.93
CTDNEP1-206ENST00000571409 CHGAP10645 457 aaKnown RBP45.86■■■■■ 4.93
CTDNEP1-206ENST00000571409 HFM1A2PYH4 1435 aa45.85■■■■■ 4.93
CTDNEP1-206ENST00000571409 TOM1O60784 492 aa45.84■■■■■ 4.93
CTDNEP1-206ENST00000571409 RIMS2Q9UQ26 1411 aa45.84■■■■■ 4.93
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CTDNEP1-206ENST00000571409 SLC26A8Q96RN1 970 aa45.81■■■■■ 4.92
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