RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568477.5

CMTM3-215, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CMTM3, Length 687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-215ENST00000568477 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.45■■□□□ 1.18
CMTM3-215ENST00000568477 STRCQ7RTU9 1775 aa22.45■■□□□ 1.18
CMTM3-215ENST00000568477 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.44■■□□□ 1.18
CMTM3-215ENST00000568477 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.43■■□□□ 1.18
CMTM3-215ENST00000568477 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
CMTM3-215ENST00000568477 DAPK1P53355 1430 aa22.43■■□□□ 1.18
CMTM3-215ENST00000568477 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
CMTM3-215ENST00000568477 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.42■■□□□ 1.18
CMTM3-215ENST00000568477 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
CMTM3-215ENST00000568477 NCOA1Q15788 1441 aa22.41■■□□□ 1.18
CMTM3-215ENST00000568477 KIF15Q9NS87 1388 aa22.41■■□□□ 1.18
CMTM3-215ENST00000568477 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
CMTM3-215ENST00000568477 PZPP20742 1482 aa22.41■■□□□ 1.18
CMTM3-215ENST00000568477 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
CMTM3-215ENST00000568477 FBXO41Q8TF61 875 aa22.39■■□□□ 1.17
CMTM3-215ENST00000568477 PTPRTO14522 1441 aa22.39■■□□□ 1.17
CMTM3-215ENST00000568477 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.39■■□□□ 1.17
CMTM3-215ENST00000568477 TNRQ92752 1358 aa22.38■■□□□ 1.17
CMTM3-215ENST00000568477 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
CMTM3-215ENST00000568477 ABCC3O15438 1527 aa22.36■■□□□ 1.17
CMTM3-215ENST00000568477 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.36■■□□□ 1.17
CMTM3-215ENST00000568477 ERBINQ96RT1 1412 aa22.36■■□□□ 1.17
CMTM3-215ENST00000568477 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.35■■□□□ 1.17
CMTM3-215ENST00000568477 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
CMTM3-215ENST00000568477 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.35■■□□□ 1.17
CMTM3-215ENST00000568477 MROH1Q8NDA8 1641 aa22.35■■□□□ 1.17
CMTM3-215ENST00000568477 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
CMTM3-215ENST00000568477 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.33■■□□□ 1.17
CMTM3-215ENST00000568477 PLA2R1Q13018 1463 aa22.33■■□□□ 1.16
CMTM3-215ENST00000568477 CERKQ8TCT0 537 aa22.32■■□□□ 1.16
CMTM3-215ENST00000568477 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.3■■□□□ 1.16
CMTM3-215ENST00000568477 PKD2Q13563 968 aa22.29■■□□□ 1.16
CMTM3-215ENST00000568477 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
CMTM3-215ENST00000568477 NLRP1Q9C000 1473 aa22.28■■□□□ 1.16
CMTM3-215ENST00000568477 CEP152O94986 1710 aa22.27■■□□□ 1.16
CMTM3-215ENST00000568477 ADGRL2O95490 1459 aa22.27■■□□□ 1.16
CMTM3-215ENST00000568477 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.25■■□□□ 1.15
CMTM3-215ENST00000568477 ERVK-7P63135 1459 aa22.25■■□□□ 1.15
CMTM3-215ENST00000568477 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa22.25■■□□□ 1.15
CMTM3-215ENST00000568477 KANK1Q14678 1352 aa22.25■■□□□ 1.15
CMTM3-215ENST00000568477 DEPDC5O75140 1603 aa22.24■■□□□ 1.15
CMTM3-215ENST00000568477 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa22.21■■□□□ 1.15
CMTM3-215ENST00000568477 UGGT1Q9NYU2 1555 aa22.21■■□□□ 1.15
CMTM3-215ENST00000568477 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CMTM3-215ENST00000568477 LTBP4Q8N2S1 1624 aa22.19■■□□□ 1.14
CMTM3-215ENST00000568477 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.18■■□□□ 1.14
CMTM3-215ENST00000568477 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CMTM3-215ENST00000568477 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.17■■□□□ 1.14
CMTM3-215ENST00000568477 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
CMTM3-215ENST00000568477 VWDEQ8N2E2 1590 aa22.16■■□□□ 1.14
CMTM3-215ENST00000568477 LMTK2Q8IWU2 1503 aa22.16■■□□□ 1.14
CMTM3-215ENST00000568477 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CMTM3-215ENST00000568477 ANKLE2Q86XL3 938 aa22.15■■□□□ 1.14
CMTM3-215ENST00000568477 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
CMTM3-215ENST00000568477 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.13■■□□□ 1.13
CMTM3-215ENST00000568477 ROCK1Q13464 1354 aa22.12■■□□□ 1.13
CMTM3-215ENST00000568477 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.1■■□□□ 1.13
CMTM3-215ENST00000568477 EFCAB6Q5THR3 1501 aa22.09■■□□□ 1.13
CMTM3-215ENST00000568477 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
CMTM3-215ENST00000568477 ITGAEP38570 1179 aa22.08■■□□□ 1.13
CMTM3-215ENST00000568477 UBR1Q8IWV7 1749 aa22.08■■□□□ 1.12
CMTM3-215ENST00000568477 MED14O60244 1454 aa22.08■■□□□ 1.12
CMTM3-215ENST00000568477 UNC13BO14795 1591 aa22.04■■□□□ 1.12
CMTM3-215ENST00000568477 NOS1P29475 1434 aa22.03■■□□□ 1.12
CMTM3-215ENST00000568477 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
CMTM3-215ENST00000568477 PIK3C2BO00750 1634 aa22.02■■□□□ 1.12
CMTM3-215ENST00000568477 IQGAP1P46940 1657 aa22.02■■□□□ 1.12
CMTM3-215ENST00000568477 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.02■■□□□ 1.12
CMTM3-215ENST00000568477 SYNMO15061 1565 aa22.02■■□□□ 1.12
CMTM3-215ENST00000568477 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
CMTM3-215ENST00000568477 TET3O43151 1660 aa22.01■■□□□ 1.11
CMTM3-215ENST00000568477 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
CMTM3-215ENST00000568477 ARHGAP23Q9P227 1491 aa22.01■■□□□ 1.11
CMTM3-215ENST00000568477 SLIT1O75093 1534 aa22.01■■□□□ 1.11
CMTM3-215ENST00000568477 IDI1Q13907 227 aa21.99■■□□□ 1.11
CMTM3-215ENST00000568477 CPS1P31327 1500 aa21.99■■□□□ 1.11
CMTM3-215ENST00000568477 TXNDC2Q86VQ3 553 aa21.98■■□□□ 1.11
CMTM3-215ENST00000568477 EID1Q9Y6B2 187 aa21.98■■□□□ 1.11
CMTM3-215ENST00000568477 SLC52A1Q9NWF4 448 aa21.97■■□□□ 1.11
CMTM3-215ENST00000568477 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
CMTM3-215ENST00000568477 TMEM2Q9UHN6 1383 aa21.97■■□□□ 1.11
CMTM3-215ENST00000568477 GCC2Q8IWJ2 1684 aa21.96■■□□□ 1.11
CMTM3-215ENST00000568477 LTKP29376 864 aa21.96■■□□□ 1.11
CMTM3-215ENST00000568477 ADGRB3O60242 1522 aa21.95■■□□□ 1.1
CMTM3-215ENST00000568477 IQGAP3Q86VI3 1631 aa21.95■■□□□ 1.1
CMTM3-215ENST00000568477 NUP155O75694 1391 aa21.94■■□□□ 1.1
CMTM3-215ENST00000568477 UBAP1LF5GYI3 381 aa21.93■■□□□ 1.1
CMTM3-215ENST00000568477 E9PCH4 1651 aa21.89■■□□□ 1.1
CMTM3-215ENST00000568477 NAIPQ13075 1403 aa21.85■■□□□ 1.09
CMTM3-215ENST00000568477 STRCP1A6NGW2 1772 aa21.84■■□□□ 1.09
CMTM3-215ENST00000568477 LRRC7Q96NW7 1537 aa21.82■■□□□ 1.08
CMTM3-215ENST00000568477 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa21.82■■□□□ 1.08
CMTM3-215ENST00000568477 TOM1O60784 492 aa21.82■■□□□ 1.08
CMTM3-215ENST00000568477 CHGAP10645 457 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
CMTM3-215ENST00000568477 ZFYVE9O95405 1425 aa21.8■■□□□ 1.08
CMTM3-215ENST00000568477 RIMS2Q9UQ26 1411 aa21.8■■□□□ 1.08
CMTM3-215ENST00000568477 HDGFP51858 240 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
CMTM3-215ENST00000568477 MYO5BQ9ULV0 1848 aa21.8■■□□□ 1.08
CMTM3-215ENST00000568477 HFM1A2PYH4 1435 aa21.8■■□□□ 1.08
CMTM3-215ENST00000568477 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
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