RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551936.5

CS-229, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-229ENST00000551936 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
CS-229ENST00000551936 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.72■■□□□ 1.23
CS-229ENST00000551936 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.72■■□□□ 1.23
CS-229ENST00000551936 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.72■■□□□ 1.23
CS-229ENST00000551936 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
CS-229ENST00000551936 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
CS-229ENST00000551936 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.69■■□□□ 1.22
CS-229ENST00000551936 PZPP20742 1482 aa22.67■■□□□ 1.22
CS-229ENST00000551936 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.67■■□□□ 1.22
CS-229ENST00000551936 PLA2R1Q13018 1463 aa22.66■■□□□ 1.22
CS-229ENST00000551936 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
CS-229ENST00000551936 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.66■■□□□ 1.22
CS-229ENST00000551936 ABCC5O15440 1437 aa22.65■■□□□ 1.22
CS-229ENST00000551936 PKD2Q13563 968 aa22.65■■□□□ 1.22
CS-229ENST00000551936 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
CS-229ENST00000551936 TNRQ92752 1358 aa22.64■■□□□ 1.22
CS-229ENST00000551936 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
CS-229ENST00000551936 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
CS-229ENST00000551936 LTBP4Q8N2S1 1624 aa22.63■■□□□ 1.21
CS-229ENST00000551936 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.63■■□□□ 1.21
CS-229ENST00000551936 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.62■■□□□ 1.21
CS-229ENST00000551936 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.61■■□□□ 1.21
CS-229ENST00000551936 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.6■■□□□ 1.21
CS-229ENST00000551936 DAPK1P53355 1430 aa22.6■■□□□ 1.21
CS-229ENST00000551936 ABCC3O15438 1527 aa22.6■■□□□ 1.21
CS-229ENST00000551936 MROH1Q8NDA8 1641 aa22.6■■□□□ 1.21
CS-229ENST00000551936 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.59■■□□□ 1.21
CS-229ENST00000551936 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
CS-229ENST00000551936 KIF15Q9NS87 1388 aa22.58■■□□□ 1.21
CS-229ENST00000551936 NLRP1Q9C000 1473 aa22.54■■□□□ 1.2
CS-229ENST00000551936 ERBINQ96RT1 1412 aa22.54■■□□□ 1.2
CS-229ENST00000551936 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
CS-229ENST00000551936 CEP152O94986 1710 aa22.54■■□□□ 1.2
CS-229ENST00000551936 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.53■■□□□ 1.2
CS-229ENST00000551936 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa22.53■■□□□ 1.2
CS-229ENST00000551936 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
CS-229ENST00000551936 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.51■■□□□ 1.19
CS-229ENST00000551936 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.5■■□□□ 1.19
CS-229ENST00000551936 UGGT1Q9NYU2 1555 aa22.5■■□□□ 1.19
CS-229ENST00000551936 ERVK-7P63135 1459 aa22.5■■□□□ 1.19
CS-229ENST00000551936 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
CS-229ENST00000551936 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
CS-229ENST00000551936 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
CS-229ENST00000551936 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.49■■□□□ 1.19
CS-229ENST00000551936 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.49■■□□□ 1.19
CS-229ENST00000551936 ANKLE2Q86XL3 938 aa22.48■■□□□ 1.19
CS-229ENST00000551936 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa22.47■■□□□ 1.19
CS-229ENST00000551936 DEPDC5O75140 1603 aa22.46■■□□□ 1.19
CS-229ENST00000551936 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.46■■□□□ 1.196e-9■□□□□ 10
CS-229ENST00000551936 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
CS-229ENST00000551936 ADGRL2O95490 1459 aa22.44■■□□□ 1.18
CS-229ENST00000551936 MED14O60244 1454 aa22.42■■□□□ 1.18
CS-229ENST00000551936 KANK1Q14678 1352 aa22.41■■□□□ 1.18
CS-229ENST00000551936 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
CS-229ENST00000551936 VWDEQ8N2E2 1590 aa22.39■■□□□ 1.18
CS-229ENST00000551936 LMTK2Q8IWU2 1503 aa22.39■■□□□ 1.17
CS-229ENST00000551936 UBR1Q8IWV7 1749 aa22.39■■□□□ 1.17
CS-229ENST00000551936 IQGAP1P46940 1657 aa22.33■■□□□ 1.17
CS-229ENST00000551936 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.33■■□□□ 1.17
CS-229ENST00000551936 CPS1P31327 1500 aa22.33■■□□□ 1.17
CS-229ENST00000551936 UBAP1LF5GYI3 381 aa22.33■■□□□ 1.17
CS-229ENST00000551936 ARHGAP23Q9P227 1491 aa22.32■■□□□ 1.16
CS-229ENST00000551936 LTKP29376 864 aa22.31■■□□□ 1.16
CS-229ENST00000551936 PIK3C2BO00750 1634 aa22.31■■□□□ 1.16
CS-229ENST00000551936 SLIT1O75093 1534 aa22.31■■□□□ 1.16
CS-229ENST00000551936 IDI1Q13907 227 aa22.29■■□□□ 1.16
CS-229ENST00000551936 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
CS-229ENST00000551936 EFCAB6Q5THR3 1501 aa22.28■■□□□ 1.16
CS-229ENST00000551936 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.28■■□□□ 1.16
CS-229ENST00000551936 NOS1P29475 1434 aa22.28■■□□□ 1.16
CS-229ENST00000551936 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CS-229ENST00000551936 SYNMO15061 1565 aa22.27■■□□□ 1.16
CS-229ENST00000551936 ROCK1Q13464 1354 aa22.25■■□□□ 1.15
CS-229ENST00000551936 STRCP1A6NGW2 1772 aa22.25■■□□□ 1.15
CS-229ENST00000551936 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.25■■□□□ 1.15
CS-229ENST00000551936 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
CS-229ENST00000551936 EID1Q9Y6B2 187 aa22.24■■□□□ 1.15
CS-229ENST00000551936 TMEM2Q9UHN6 1383 aa22.24■■□□□ 1.15
CS-229ENST00000551936 SLC52A1Q9NWF4 448 aa22.22■■□□□ 1.15
CS-229ENST00000551936 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
CS-229ENST00000551936 TOM1O60784 492 aa22.21■■□□□ 1.15
CS-229ENST00000551936 TET3O43151 1660 aa22.2■■□□□ 1.15
CS-229ENST00000551936 ITGAEP38570 1179 aa22.2■■□□□ 1.14
CS-229ENST00000551936 UNC13BO14795 1591 aa22.2■■□□□ 1.14
CS-229ENST00000551936 LRRC7Q96NW7 1537 aa22.19■■□□□ 1.14
CS-229ENST00000551936 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.17■■□□□ 1.14
CS-229ENST00000551936 ADGRB3O60242 1522 aa22.16■■□□□ 1.14
CS-229ENST00000551936 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.16■■□□□ 1.14
CS-229ENST00000551936 PIP4K2BP78356 416 aa22.16■■□□□ 1.14
CS-229ENST00000551936 ALKQ9UM73 1620 aa22.15■■□□□ 1.14
CS-229ENST00000551936 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
CS-229ENST00000551936 E9PCH4 1651 aa22.12■■□□□ 1.13
CS-229ENST00000551936 IQGAP3Q86VI3 1631 aa22.12■■□□□ 1.13
CS-229ENST00000551936 HSPA1LP34931 641 aa22.11■■□□□ 1.13
CS-229ENST00000551936 NUP155O75694 1391 aa22.11■■□□□ 1.13
CS-229ENST00000551936 MYO5BQ9ULV0 1848 aa22.1■■□□□ 1.13
CS-229ENST00000551936 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
CS-229ENST00000551936 SLC26A8Q96RN1 970 aa22.09■■□□□ 1.13
CS-229ENST00000551936 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa22.08■■□□□ 1.13
CS-229ENST00000551936 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
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