RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530500.5

ATG13-216, Transcript of autophagy related 13, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATG13, Length 2,030 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13-216ENST00000530500 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.25■■□□□ 1.15
ATG13-216ENST00000530500 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.25■■□□□ 1.15
ATG13-216ENST00000530500 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
ATG13-216ENST00000530500 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.24■■□□□ 1.15
ATG13-216ENST00000530500 ATP10AO60312 1499 aa22.24■■□□□ 1.15
ATG13-216ENST00000530500 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.24■■□□□ 1.15
ATG13-216ENST00000530500 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.24■■□□□ 1.15
ATG13-216ENST00000530500 PLA2R1Q13018 1463 aa22.22■■□□□ 1.15
ATG13-216ENST00000530500 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.21■■□□□ 1.15
ATG13-216ENST00000530500 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
ATG13-216ENST00000530500 NEFLP07196 543 aa22.19■■□□□ 1.14
ATG13-216ENST00000530500 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.19■■□□□ 1.14
ATG13-216ENST00000530500 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.18■■□□□ 1.14
ATG13-216ENST00000530500 MRS2Q9HD23 443 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG13-216ENST00000530500 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG13-216ENST00000530500 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
ATG13-216ENST00000530500 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG13-216ENST00000530500 FANCAO15360 1455 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG13-216ENST00000530500 FKBP8Q14318 412 aa22.14■■□□□ 1.14
ATG13-216ENST00000530500 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.14■■□□□ 1.13
ATG13-216ENST00000530500 A2MP01023 1474 aa22.13■■□□□ 1.13
ATG13-216ENST00000530500 CCDC184Q52MB2 194 aa22.13■■□□□ 1.13
ATG13-216ENST00000530500 LAMC1P11047 1609 aa22.13■■□□□ 1.13
ATG13-216ENST00000530500 AFAP1Q8N556 730 aa22.13■■□□□ 1.13
ATG13-216ENST00000530500 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
ATG13-216ENST00000530500 GPRASP1Q5JY77 1395 aa22.12■■□□□ 1.13
ATG13-216ENST00000530500 RGL3Q3MIN7 710 aa22.11■■□□□ 1.13
ATG13-216ENST00000530500 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.11■■□□□ 1.13
ATG13-216ENST00000530500 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
ATG13-216ENST00000530500 ASXL2Q76L83 1435 aa22.09■■□□□ 1.13
ATG13-216ENST00000530500 ATP7AQ04656 1500 aa22.09■■□□□ 1.13
ATG13-216ENST00000530500 DEPDC5O75140 1603 aa22.09■■□□□ 1.13
ATG13-216ENST00000530500 OSCARQ8IYS5 282 aa22.08■■□□□ 1.13
ATG13-216ENST00000530500 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.07■■□□□ 1.12
ATG13-216ENST00000530500 ADGRL1O94910 1474 aa22.06■■□□□ 1.12
ATG13-216ENST00000530500 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
ATG13-216ENST00000530500 STAC3Q96MF2 364 aa22.06■■□□□ 1.12
ATG13-216ENST00000530500 KANK1Q14678 1352 aa22.05■■□□□ 1.12
ATG13-216ENST00000530500 E9PCH4 1651 aa22.05■■□□□ 1.12
ATG13-216ENST00000530500 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.04■■□□□ 1.12
ATG13-216ENST00000530500 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.04■■□□□ 1.12
ATG13-216ENST00000530500 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.04■■□□□ 1.12
ATG13-216ENST00000530500 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
ATG13-216ENST00000530500 TRPM2O94759 1503 aa22.04■■□□□ 1.12
ATG13-216ENST00000530500 TET3O43151 1660 aa22.03■■□□□ 1.12
ATG13-216ENST00000530500 PTPRTO14522 1441 aa22.03■■□□□ 1.12
ATG13-216ENST00000530500 NBPF1Q3BBV0 1214 aa22.02■■□□□ 1.12
ATG13-216ENST00000530500 VWDEQ8N2E2 1590 aa22.01■■□□□ 1.11
ATG13-216ENST00000530500 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa22■■□□□ 1.11
ATG13-216ENST00000530500 CEP152O94986 1710 aa21.98■■□□□ 1.11
ATG13-216ENST00000530500 RALBP1Q15311 655 aa21.98■■□□□ 1.11
ATG13-216ENST00000530500 MYT1LQ9UL68 1186 aa21.97■■□□□ 1.11
ATG13-216ENST00000530500 BCANQ96GW7 911 aa21.97■■□□□ 1.11
ATG13-216ENST00000530500 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
ATG13-216ENST00000530500 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa21.96■■□□□ 1.11
ATG13-216ENST00000530500 KIF3BO15066 747 aa21.96■■□□□ 1.11
ATG13-216ENST00000530500 CFAP74Q9C0B2 1584 aa21.95■■□□□ 1.1
ATG13-216ENST00000530500 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
ATG13-216ENST00000530500 NEURL4Q96JN8 1562 aa21.95■■□□□ 1.1
ATG13-216ENST00000530500 ERICH6BQ5W0A0 696 aa21.93■■□□□ 1.1
ATG13-216ENST00000530500 TESK2Q96S53 571 aa21.93■■□□□ 1.1
ATG13-216ENST00000530500 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
ATG13-216ENST00000530500 TMC1Q8TDI8 760 aa21.92■■□□□ 1.1
ATG13-216ENST00000530500 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
ATG13-216ENST00000530500 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa21.92■■□□□ 1.1
ATG13-216ENST00000530500 CLTCL1P53675 1640 aa21.92■■□□□ 1.1
ATG13-216ENST00000530500 MADDQ8WXG6 1647 aa21.92■■□□□ 1.1
ATG13-216ENST00000530500 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa21.91■■□□□ 1.1
ATG13-216ENST00000530500 TMF1P82094 1093 aa21.91■■□□□ 1.1
ATG13-216ENST00000530500 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
ATG13-216ENST00000530500 MROH1Q8NDA8 1641 aa21.89■■□□□ 1.1
ATG13-216ENST00000530500 CD109Q6YHK3 1445 aa21.89■■□□□ 1.1
ATG13-216ENST00000530500 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
ATG13-216ENST00000530500 DISP3Q9P2K9 1392 aa21.86■■□□□ 1.09
ATG13-216ENST00000530500 LMTK2Q8IWU2 1503 aa21.86■■□□□ 1.09
ATG13-216ENST00000530500 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
ATG13-216ENST00000530500 IQGAP1P46940 1657 aa21.85■■□□□ 1.09
ATG13-216ENST00000530500 PARD3Q8TEW0 1356 aa21.85■■□□□ 1.09
ATG13-216ENST00000530500 EFCAB6Q5THR3 1501 aa21.85■■□□□ 1.09
ATG13-216ENST00000530500 POGZQ7Z3K3 1410 aa21.84■■□□□ 1.09
ATG13-216ENST00000530500 MLH3Q9UHC1 1453 aa21.84■■□□□ 1.09
ATG13-216ENST00000530500 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa21.84■■□□□ 1.09
ATG13-216ENST00000530500 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.84■■□□□ 1.09
ATG13-216ENST00000530500 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
ATG13-216ENST00000530500 NLRP13Q86W25 1043 aa21.82■■□□□ 1.08
ATG13-216ENST00000530500 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
ATG13-216ENST00000530500 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
ATG13-216ENST00000530500 CDCA8Q53HL2 280 aa21.81■■□□□ 1.08
ATG13-216ENST00000530500 KIF1BO60333 1816 aa21.81■■□□□ 1.08
ATG13-216ENST00000530500 MYOM2P54296 1465 aa21.79■■□□□ 1.08
ATG13-216ENST00000530500 SLC24A1O60721 1099 aa21.79■■□□□ 1.08
ATG13-216ENST00000530500 HECW2Q9P2P5 1572 aa21.78■■□□□ 1.08
ATG13-216ENST00000530500 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
ATG13-216ENST00000530500 NEO1Q92859 1461 aa21.78■■□□□ 1.08
ATG13-216ENST00000530500 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
ATG13-216ENST00000530500 MYT1Q01538 1121 aa21.77■■□□□ 1.08
ATG13-216ENST00000530500 PANK3Q9H999 370 aa21.77■■□□□ 1.08
ATG13-216ENST00000530500 NUDCQ9Y266 331 aa21.76■■□□□ 1.07
ATG13-216ENST00000530500 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa21.75■■□□□ 1.07
ATG13-216ENST00000530500 PPP4R2Q9NY27 417 aa21.73■■□□□ 1.07
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