RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530500.5

ATG13-216, Transcript of autophagy related 13, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATG13, Length 2,030 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13-216ENST00000530500 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.61■■■■□ 3.13
ATG13-216ENST00000530500 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.79■■■□□ 2.36
ATG13-216ENST00000530500 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
ATG13-216ENST00000530500 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.82■■■□□ 2.2
ATG13-216ENST00000530500 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.61■■■□□ 2.17
ATG13-216ENST00000530500 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.46■■■□□ 2.15
ATG13-216ENST00000530500 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
ATG13-216ENST00000530500 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.99■■■□□ 2.07
ATG13-216ENST00000530500 NACADO15069 1562 aa27.61■■■□□ 2.01
ATG13-216ENST00000530500 ABCC9O60706 1549 aa27.56■■■□□ 2
ATG13-216ENST00000530500 SCRIBQ14160 1630 aa27.54■■■□□ 2
ATG13-216ENST00000530500 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.31■■□□□ 1.96
ATG13-216ENST00000530500 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.19■■□□□ 1.94
ATG13-216ENST00000530500 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
ATG13-216ENST00000530500 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.84■■□□□ 1.89
ATG13-216ENST00000530500 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.77■■□□□ 1.88
ATG13-216ENST00000530500 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
ATG13-216ENST00000530500 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.66■■□□□ 1.86
ATG13-216ENST00000530500 WIZO95785 1651 aa26.6■■□□□ 1.85
ATG13-216ENST00000530500 SMARCA4P51532 1647 aa26.44■■□□□ 1.82
ATG13-216ENST00000530500 TRIM41Q8WV44 630 aa26.41■■□□□ 1.82
ATG13-216ENST00000530500 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.34■■□□□ 1.81
ATG13-216ENST00000530500 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.8
ATG13-216ENST00000530500 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.31■■□□□ 1.8
ATG13-216ENST00000530500 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.19■■□□□ 1.78
ATG13-216ENST00000530500 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
ATG13-216ENST00000530500 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.1■■□□□ 1.77
ATG13-216ENST00000530500 SMARCA2P51531 1590 aa26.1■■□□□ 1.77
ATG13-216ENST00000530500 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.08■■□□□ 1.76
ATG13-216ENST00000530500 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
ATG13-216ENST00000530500 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.93■■□□□ 1.74
ATG13-216ENST00000530500 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.84■■□□□ 1.73
ATG13-216ENST00000530500 HRCP23327 699 aa25.79■■□□□ 1.72
ATG13-216ENST00000530500 ABCC8Q09428 1581 aa25.78■■□□□ 1.72
ATG13-216ENST00000530500 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
ATG13-216ENST00000530500 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
ATG13-216ENST00000530500 EEA1Q15075 1411 aa25.6■■□□□ 1.69
ATG13-216ENST00000530500 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.56■■□□□ 1.68
ATG13-216ENST00000530500 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.55■■□□□ 1.68
ATG13-216ENST00000530500 HMGXB3Q12766 1538 aa25.49■■□□□ 1.67
ATG13-216ENST00000530500 NCAPD3P42695 1498 aa25.49■■□□□ 1.67
ATG13-216ENST00000530500 SOGA1O94964 1423 aa25.47■■□□□ 1.67
ATG13-216ENST00000530500 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.42■■□□□ 1.66
ATG13-216ENST00000530500 SYNJ1O43426 1573 aa25.38■■□□□ 1.65
ATG13-216ENST00000530500 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.35■■□□□ 1.65
ATG13-216ENST00000530500 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.33■■□□□ 1.64
ATG13-216ENST00000530500 GOLGA3Q08378 1498 aa25.26■■□□□ 1.63
ATG13-216ENST00000530500 CEP162Q5TB80 1403 aa25.26■■□□□ 1.63
ATG13-216ENST00000530500 TOP2BQ02880 1626 aa25.23■■□□□ 1.63
ATG13-216ENST00000530500 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.19■■□□□ 1.62
ATG13-216ENST00000530500 KIF21BO75037 1637 aa25.19■■□□□ 1.62
ATG13-216ENST00000530500 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
ATG13-216ENST00000530500 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.18■■□□□ 1.62
ATG13-216ENST00000530500 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
ATG13-216ENST00000530500 CFTRP13569 1480 aa25.13■■□□□ 1.61
ATG13-216ENST00000530500 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
ATG13-216ENST00000530500 PRDM2Q13029 1718 aa25.01■■□□□ 1.59
ATG13-216ENST00000530500 CUX1P39880 1505 aa24.98■■□□□ 1.59
ATG13-216ENST00000530500 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.94■■□□□ 1.58
ATG13-216ENST00000530500 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.92■■□□□ 1.58
ATG13-216ENST00000530500 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.91■■□□□ 1.58
ATG13-216ENST00000530500 CLIP1P30622 1438 aa24.89■■□□□ 1.58
ATG13-216ENST00000530500 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.89■■□□□ 1.57
ATG13-216ENST00000530500 KIF27Q86VH2 1401 aa24.86■■□□□ 1.57
ATG13-216ENST00000530500 PRXQ9BXM0 1461 aa24.85■■□□□ 1.57
ATG13-216ENST00000530500 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.79■■□□□ 1.56
ATG13-216ENST00000530500 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
ATG13-216ENST00000530500 APLP2Q06481 763 aa24.64■■□□□ 1.54
ATG13-216ENST00000530500 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.63■■□□□ 1.53
ATG13-216ENST00000530500 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
ATG13-216ENST00000530500 CUX2O14529 1486 aa24.6■■□□□ 1.53
ATG13-216ENST00000530500 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.6■■□□□ 1.53
ATG13-216ENST00000530500 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
ATG13-216ENST00000530500 IGF1RP08069 1367 aa24.55■■□□□ 1.52
ATG13-216ENST00000530500 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
ATG13-216ENST00000530500 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.52■■□□□ 1.52
ATG13-216ENST00000530500 ARAP1Q96P48 1450 aa24.52■■□□□ 1.52
ATG13-216ENST00000530500 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.49■■□□□ 1.51
ATG13-216ENST00000530500 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.45■■□□□ 1.5
ATG13-216ENST00000530500 TOPBP1Q92547 1522 aa24.43■■□□□ 1.5
ATG13-216ENST00000530500 NESP48681 1621 aa24.42■■□□□ 1.5
ATG13-216ENST00000530500 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.4■■□□□ 1.5
ATG13-216ENST00000530500 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.39■■□□□ 1.5
ATG13-216ENST00000530500 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
ATG13-216ENST00000530500 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.31■■□□□ 1.48
ATG13-216ENST00000530500 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.31■■□□□ 1.48
ATG13-216ENST00000530500 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
ATG13-216ENST00000530500 CUL7Q14999 1698 aa24.27■■□□□ 1.48
ATG13-216ENST00000530500 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
ATG13-216ENST00000530500 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
ATG13-216ENST00000530500 MAP3K1Q13233 1512 aa24.22■■□□□ 1.47
ATG13-216ENST00000530500 WDR97A6NE52 1622 aa24.21■■□□□ 1.47
ATG13-216ENST00000530500 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
ATG13-216ENST00000530500 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.16■■□□□ 1.46
ATG13-216ENST00000530500 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.11■■□□□ 1.45
ATG13-216ENST00000530500 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.11■■□□□ 1.45
ATG13-216ENST00000530500 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.11■■□□□ 1.45
ATG13-216ENST00000530500 TIAM1Q13009 1591 aa24.11■■□□□ 1.45
ATG13-216ENST00000530500 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.1■■□□□ 1.45
ATG13-216ENST00000530500 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.09■■□□□ 1.45
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