RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529677.1

PACS1-208, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene PACS1, Length 679 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-208ENST00000529677 A2MP01023 1474 aa26.16■■□□□ 1.78
PACS1-208ENST00000529677 NCOA2Q15596 1464 aa26.13■■□□□ 1.77
PACS1-208ENST00000529677 TOM1O60784 492 aa26.12■■□□□ 1.77
PACS1-208ENST00000529677 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
PACS1-208ENST00000529677 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
PACS1-208ENST00000529677 STRCP1A6NGW2 1772 aa26.1■■□□□ 1.77
PACS1-208ENST00000529677 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.08■■□□□ 1.77
PACS1-208ENST00000529677 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
PACS1-208ENST00000529677 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
PACS1-208ENST00000529677 GGT6Q6P531 493 aa26.06■■□□□ 1.76
PACS1-208ENST00000529677 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.05■■□□□ 1.76
PACS1-208ENST00000529677 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
PACS1-208ENST00000529677 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.03■■□□□ 1.76
PACS1-208ENST00000529677 MED14O60244 1454 aa25.99■■□□□ 1.75
PACS1-208ENST00000529677 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
PACS1-208ENST00000529677 DEPDC5O75140 1603 aa25.99■■□□□ 1.75
PACS1-208ENST00000529677 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.98■■□□□ 1.75
PACS1-208ENST00000529677 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.98■■□□□ 1.75
PACS1-208ENST00000529677 TNRQ92752 1358 aa25.97■■□□□ 1.75
PACS1-208ENST00000529677 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.97■■□□□ 1.75
PACS1-208ENST00000529677 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
PACS1-208ENST00000529677 LRRC7Q96NW7 1537 aa25.97■■□□□ 1.75
PACS1-208ENST00000529677 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
PACS1-208ENST00000529677 PZPP20742 1482 aa25.95■■□□□ 1.74
PACS1-208ENST00000529677 IQGAP1P46940 1657 aa25.94■■□□□ 1.74
PACS1-208ENST00000529677 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
PACS1-208ENST00000529677 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
PACS1-208ENST00000529677 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.93■■□□□ 1.74
PACS1-208ENST00000529677 MIA2Q96PC5 1412 aa25.93■■□□□ 1.74
PACS1-208ENST00000529677 SYNMO15061 1565 aa25.91■■□□□ 1.74
PACS1-208ENST00000529677 MBD5Q9P267 1494 aa25.91■■□□□ 1.74
PACS1-208ENST00000529677 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.89■■□□□ 1.74
PACS1-208ENST00000529677 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.88■■□□□ 1.73
PACS1-208ENST00000529677 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
PACS1-208ENST00000529677 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.88■■□□□ 1.73
PACS1-208ENST00000529677 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
PACS1-208ENST00000529677 ANKLE2Q86XL3 938 aa25.87■■□□□ 1.73
PACS1-208ENST00000529677 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
PACS1-208ENST00000529677 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
PACS1-208ENST00000529677 NLRP1Q9C000 1473 aa25.85■■□□□ 1.73
PACS1-208ENST00000529677 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
PACS1-208ENST00000529677 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
PACS1-208ENST00000529677 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.84■■□□□ 1.73
PACS1-208ENST00000529677 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.83■■□□□ 1.73
PACS1-208ENST00000529677 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.81■■□□□ 1.72
PACS1-208ENST00000529677 POTEAQ6S8J7 498 aa25.81■■□□□ 1.72
PACS1-208ENST00000529677 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
PACS1-208ENST00000529677 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.8■■□□□ 1.72
PACS1-208ENST00000529677 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
PACS1-208ENST00000529677 KIF3BO15066 747 aa25.74■■□□□ 1.71
PACS1-208ENST00000529677 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.73■■□□□ 1.71
PACS1-208ENST00000529677 UBR1Q8IWV7 1749 aa25.7■■□□□ 1.7
PACS1-208ENST00000529677 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.68■■□□□ 1.7
PACS1-208ENST00000529677 ABCC3O15438 1527 aa25.66■■□□□ 1.7
PACS1-208ENST00000529677 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.65■■□□□ 1.7
PACS1-208ENST00000529677 ERVK-7P63135 1459 aa25.65■■□□□ 1.7
PACS1-208ENST00000529677 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.65■■□□□ 1.7
PACS1-208ENST00000529677 FAM135BQ49AJ0 1406 aa25.64■■□□□ 1.7
PACS1-208ENST00000529677 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
PACS1-208ENST00000529677 ARHGAP23Q9P227 1491 aa25.62■■□□□ 1.69
PACS1-208ENST00000529677 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.62■■□□□ 1.69
PACS1-208ENST00000529677 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa25.61■■□□□ 1.69
PACS1-208ENST00000529677 DAPK1P53355 1430 aa25.61■■□□□ 1.69
PACS1-208ENST00000529677 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
PACS1-208ENST00000529677 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.6■■□□□ 1.69
PACS1-208ENST00000529677 ABCC5O15440 1437 aa25.6■■□□□ 1.69
PACS1-208ENST00000529677 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25.6■■□□□ 1.69
PACS1-208ENST00000529677 LTKP29376 864 aa25.59■■□□□ 1.69
PACS1-208ENST00000529677 SLIT1O75093 1534 aa25.58■■□□□ 1.69
PACS1-208ENST00000529677 CEP152O94986 1710 aa25.55■■□□□ 1.68
PACS1-208ENST00000529677 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
PACS1-208ENST00000529677 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
PACS1-208ENST00000529677 ADGRL2O95490 1459 aa25.51■■□□□ 1.67
PACS1-208ENST00000529677 TMEM94Q12767 1356 aa25.49■■□□□ 1.67
PACS1-208ENST00000529677 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
PACS1-208ENST00000529677 ROCK1Q13464 1354 aa25.45■■□□□ 1.67
PACS1-208ENST00000529677 TXNDC2Q86VQ3 553 aa25.45■■□□□ 1.66
PACS1-208ENST00000529677 PIK3C2BO00750 1634 aa25.45■■□□□ 1.66
PACS1-208ENST00000529677 TSPY4P0CV99 314 aa25.44■■□□□ 1.66
PACS1-208ENST00000529677 TSPY10P0CW01 314 aa25.44■■□□□ 1.66
PACS1-208ENST00000529677 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP25.43■■□□□ 1.66
PACS1-208ENST00000529677 LRP6O75581 1613 aa25.43■■□□□ 1.66
PACS1-208ENST00000529677 PHLPP1O60346 1717 aa25.43■■□□□ 1.66
PACS1-208ENST00000529677 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
PACS1-208ENST00000529677 TET3O43151 1660 aa25.42■■□□□ 1.66
PACS1-208ENST00000529677 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
PACS1-208ENST00000529677 NWD1Q149M9 1564 aa25.4■■□□□ 1.66
PACS1-208ENST00000529677 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
PACS1-208ENST00000529677 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.38■■□□□ 1.65
PACS1-208ENST00000529677 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.38■■□□□ 1.65
PACS1-208ENST00000529677 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa25.38■■□□□ 1.65
PACS1-208ENST00000529677 TMEM2Q9UHN6 1383 aa25.37■■□□□ 1.65
PACS1-208ENST00000529677 ITGAEP38570 1179 aa25.37■■□□□ 1.65
PACS1-208ENST00000529677 HFM1A2PYH4 1435 aa25.35■■□□□ 1.65
PACS1-208ENST00000529677 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.35■■□□□ 1.65
PACS1-208ENST00000529677 JCADQ9P266 1359 aa25.34■■□□□ 1.65
PACS1-208ENST00000529677 KCNA6P17658 529 aa25.33■■□□□ 1.65
PACS1-208ENST00000529677 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.33■■□□□ 1.65
PACS1-208ENST00000529677 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
PACS1-208ENST00000529677 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.32■■□□□ 1.64
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