RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529677.1

PACS1-208, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene PACS1, Length 679 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-208ENST00000529677 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.83■■■■■ 4.13
PACS1-208ENST00000529677 ABCC9O60706 1549 aa37.91■■■■□ 3.66
PACS1-208ENST00000529677 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.04■■■■□ 3.52
PACS1-208ENST00000529677 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.48■■■■□ 3.43
PACS1-208ENST00000529677 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.62■■■■□ 3.29
PACS1-208ENST00000529677 NACADO15069 1562 aa35.17■■■■□ 3.22
PACS1-208ENST00000529677 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.1■■■■□ 3.21
PACS1-208ENST00000529677 UNC13AQ9UPW8 1703 aa35.03■■■■□ 3.2
PACS1-208ENST00000529677 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.83■■■■□ 3.17
PACS1-208ENST00000529677 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.59■■■■□ 3.13
PACS1-208ENST00000529677 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.41■■■■□ 3.1
PACS1-208ENST00000529677 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.23■■■■□ 3.07
PACS1-208ENST00000529677 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.21■■■■□ 3.07
PACS1-208ENST00000529677 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.05■■■■□ 3.04
PACS1-208ENST00000529677 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.01■■■■□ 3.03
PACS1-208ENST00000529677 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.94■■■■□ 3.02
PACS1-208ENST00000529677 SCRIBQ14160 1630 aa33.7■■■□□ 2.99
PACS1-208ENST00000529677 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.69■■■□□ 2.98
PACS1-208ENST00000529677 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.65■■■□□ 2.98
PACS1-208ENST00000529677 CUX2O14529 1486 aa32.99■■■□□ 2.87
PACS1-208ENST00000529677 ERCC6Q03468 1493 aa32.66■■■□□ 2.82
PACS1-208ENST00000529677 NCAPD3P42695 1498 aa32.51■■■□□ 2.79
PACS1-208ENST00000529677 NESP48681 1621 aa32.38■■■□□ 2.77
PACS1-208ENST00000529677 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.31■■■□□ 2.76
PACS1-208ENST00000529677 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.28■■■□□ 2.76
PACS1-208ENST00000529677 HMGXB3Q12766 1538 aa32.21■■■□□ 2.75
PACS1-208ENST00000529677 SMARCA2P51531 1590 aa32.08■■■□□ 2.73
PACS1-208ENST00000529677 SMARCA4P51532 1647 aa32.08■■■□□ 2.73
PACS1-208ENST00000529677 TRIM41Q8WV44 630 aa32.05■■■□□ 2.72
PACS1-208ENST00000529677 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.94■■■□□ 2.7
PACS1-208ENST00000529677 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.9■■■□□ 2.7
PACS1-208ENST00000529677 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.87■■■□□ 2.69
PACS1-208ENST00000529677 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.79■■■□□ 2.68
PACS1-208ENST00000529677 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.69■■■□□ 2.66
PACS1-208ENST00000529677 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.65■■■□□ 2.66
PACS1-208ENST00000529677 WDR62O43379 1518 aa31.55■■■□□ 2.64
PACS1-208ENST00000529677 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.52■■■□□ 2.64
PACS1-208ENST00000529677 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.51■■■□□ 2.63
PACS1-208ENST00000529677 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.43■■■□□ 2.62
PACS1-208ENST00000529677 OSCARQ8IYS5 282 aa31.2■■■□□ 2.59
PACS1-208ENST00000529677 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.19■■■□□ 2.58
PACS1-208ENST00000529677 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.13■■■□□ 2.57
PACS1-208ENST00000529677 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.13■■■□□ 2.57
PACS1-208ENST00000529677 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.13■■■□□ 2.57
PACS1-208ENST00000529677 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.1■■■□□ 2.57
PACS1-208ENST00000529677 WIZO95785 1651 aa31.09■■■□□ 2.57
PACS1-208ENST00000529677 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31■■■□□ 2.55
PACS1-208ENST00000529677 CFTRP13569 1480 aa30.94■■■□□ 2.54
PACS1-208ENST00000529677 ARHGEF11O15085 1522 aa30.9■■■□□ 2.54
PACS1-208ENST00000529677 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.77■■■□□ 2.52
PACS1-208ENST00000529677 PRDM2Q13029 1718 aa30.59■■■□□ 2.49
PACS1-208ENST00000529677 IFT140Q96RY7 1462 aa30.59■■■□□ 2.49
PACS1-208ENST00000529677 ARAP1Q96P48 1450 aa30.58■■■□□ 2.49
PACS1-208ENST00000529677 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.58■■■□□ 2.49
PACS1-208ENST00000529677 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.58■■■□□ 2.49
PACS1-208ENST00000529677 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.48
PACS1-208ENST00000529677 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.54■■■□□ 2.48
PACS1-208ENST00000529677 CHD1O14646 1710 aa30.5■■■□□ 2.47
PACS1-208ENST00000529677 TOPBP1Q92547 1522 aa30.46■■■□□ 2.47
PACS1-208ENST00000529677 TRHP20396 242 aaPredicted RBP30.44■■■□□ 2.46
PACS1-208ENST00000529677 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.33■■■□□ 2.45
PACS1-208ENST00000529677 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.3■■■□□ 2.44
PACS1-208ENST00000529677 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.24■■■□□ 2.43
PACS1-208ENST00000529677 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.24■■■□□ 2.43
PACS1-208ENST00000529677 ABCC8Q09428 1581 aa30.16■■■□□ 2.42
PACS1-208ENST00000529677 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.15■■■□□ 2.42
PACS1-208ENST00000529677 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.42
PACS1-208ENST00000529677 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
PACS1-208ENST00000529677 FBLN2P98095 1184 aa30.09■■■□□ 2.41
PACS1-208ENST00000529677 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
PACS1-208ENST00000529677 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.01■■■□□ 2.4
PACS1-208ENST00000529677 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.97■■■□□ 2.39
PACS1-208ENST00000529677 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
PACS1-208ENST00000529677 SYNJ1O43426 1573 aa29.89■■■□□ 2.38
PACS1-208ENST00000529677 SOGA1O94964 1423 aa29.83■■■□□ 2.37
PACS1-208ENST00000529677 WDR97A6NE52 1622 aa29.82■■■□□ 2.36
PACS1-208ENST00000529677 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
PACS1-208ENST00000529677 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.78■■■□□ 2.36
PACS1-208ENST00000529677 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.76■■■□□ 2.35
PACS1-208ENST00000529677 SYNJ2O15056 1496 aa29.73■■■□□ 2.35
PACS1-208ENST00000529677 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.72■■■□□ 2.35
PACS1-208ENST00000529677 GRIN2BQ13224 1484 aa29.69■■■□□ 2.34
PACS1-208ENST00000529677 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.67■■■□□ 2.34
PACS1-208ENST00000529677 CUX1P39880 1505 aa29.65■■■□□ 2.34
PACS1-208ENST00000529677 PBRM1Q86U86 1689 aa29.63■■■□□ 2.33
PACS1-208ENST00000529677 KIF13AQ9H1H9 1805 aa29.51■■■□□ 2.31
PACS1-208ENST00000529677 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.48■■■□□ 2.31
PACS1-208ENST00000529677 CEP170Q5SW79 1584 aa29.43■■■□□ 2.3
PACS1-208ENST00000529677 GRIN2AQ12879 1464 aa29.37■■■□□ 2.29
PACS1-208ENST00000529677 SHROOM2Q13796 1616 aa29.37■■■□□ 2.29
PACS1-208ENST00000529677 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.35■■■□□ 2.29
PACS1-208ENST00000529677 NUP160Q12769 1436 aa29.34■■■□□ 2.29
PACS1-208ENST00000529677 ADAMTS12P58397 1594 aa29.3■■■□□ 2.28
PACS1-208ENST00000529677 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa29.16■■■□□ 2.26
PACS1-208ENST00000529677 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
PACS1-208ENST00000529677 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.11■■■□□ 2.25
PACS1-208ENST00000529677 DIP2BQ9P265 1576 aa29.09■■■□□ 2.25
PACS1-208ENST00000529677 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.05■■■□□ 2.24
PACS1-208ENST00000529677 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
PACS1-208ENST00000529677 MAPKBP1O60336 1514 aa29.04■■■□□ 2.24
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