RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527952.1

PTPRJ-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRJ, Length 626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-205ENST00000527952 TSPY10P0CW01 314 aa38.13■■■■□ 3.69
PTPRJ-205ENST00000527952 PKD2Q13563 968 aa38.13■■■■□ 3.69
PTPRJ-205ENST00000527952 ARHGEF5Q12774 1597 aa38.13■■■■□ 3.69
PTPRJ-205ENST00000527952 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP38.11■■■■□ 3.69
PTPRJ-205ENST00000527952 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa38.11■■■■□ 3.69
PTPRJ-205ENST00000527952 A2ML1A8K2U0 1454 aa38.1■■■■□ 3.69
PTPRJ-205ENST00000527952 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP38.1■■■■□ 3.69
PTPRJ-205ENST00000527952 KDM5DQ9BY66 1539 aa38.09■■■■□ 3.69
PTPRJ-205ENST00000527952 TNRQ92752 1358 aa38.07■■■■□ 3.69
PTPRJ-205ENST00000527952 PZPP20742 1482 aa38.03■■■■□ 3.68
PTPRJ-205ENST00000527952 IQSEC2Q5JU85 1478 aa38.03■■■■□ 3.68
PTPRJ-205ENST00000527952 DISP3Q9P2K9 1392 aa37.99■■■■□ 3.67
PTPRJ-205ENST00000527952 FAM135AQ9P2D6 1515 aa37.96■■■■□ 3.67
PTPRJ-205ENST00000527952 MYOM3Q5VTT5 1437 aa37.95■■■■□ 3.67
PTPRJ-205ENST00000527952 MAST1Q9Y2H9 1570 aa37.94■■■■□ 3.66
PTPRJ-205ENST00000527952 MAP3K1Q13233 1512 aa37.94■■■■□ 3.66
PTPRJ-205ENST00000527952 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP37.93■■■■□ 3.66
PTPRJ-205ENST00000527952 UBAP1LF5GYI3 381 aa37.93■■■■□ 3.66
PTPRJ-205ENST00000527952 MIA2Q96PC5 1412 aa37.92■■■■□ 3.66
PTPRJ-205ENST00000527952 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP37.91■■■■□ 3.66
PTPRJ-205ENST00000527952 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP37.9■■■■□ 3.66
PTPRJ-205ENST00000527952 NEURL4Q96JN8 1562 aa37.89■■■■□ 3.66
PTPRJ-205ENST00000527952 ABCC3O15438 1527 aa37.87■■■■□ 3.65
PTPRJ-205ENST00000527952 ILDR2Q71H61 639 aa37.86■■■■□ 3.65
PTPRJ-205ENST00000527952 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP37.85■■■■□ 3.65
PTPRJ-205ENST00000527952 UGGT1Q9NYU2 1555 aa37.84■■■■□ 3.65
PTPRJ-205ENST00000527952 ANKLE2Q86XL3 938 aa37.83■■■■□ 3.65
PTPRJ-205ENST00000527952 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP37.83■■■■□ 3.65
PTPRJ-205ENST00000527952 NLRP1Q9C000 1473 aa37.82■■■■□ 3.64
PTPRJ-205ENST00000527952 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP37.81■■■■□ 3.64
PTPRJ-205ENST00000527952 CEP152O94986 1710 aa37.81■■■■□ 3.64
PTPRJ-205ENST00000527952 MROH1Q8NDA8 1641 aa37.8■■■■□ 3.64
PTPRJ-205ENST00000527952 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP37.79■■■■□ 3.64
PTPRJ-205ENST00000527952 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa37.78■■■■□ 3.64
PTPRJ-205ENST00000527952 APLP2Q06481 763 aa37.77■■■■□ 3.64
PTPRJ-205ENST00000527952 DUOX2Q9NRD8 1548 aa37.74■■■■□ 3.63
PTPRJ-205ENST00000527952 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa37.74■■■■□ 3.63
PTPRJ-205ENST00000527952 SHANK2Q9UPX8 1470 aa37.74■■■■□ 3.63
PTPRJ-205ENST00000527952 PTPN23Q9H3S7 1636 aa37.73■■■■□ 3.63
PTPRJ-205ENST00000527952 ERVK-7P63135 1459 aa37.73■■■■□ 3.63
PTPRJ-205ENST00000527952 ABCC5O15440 1437 aa37.72■■■■□ 3.63
PTPRJ-205ENST00000527952 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP37.72■■■■□ 3.63
PTPRJ-205ENST00000527952 KIF15Q9NS87 1388 aa37.71■■■■□ 3.63
PTPRJ-205ENST00000527952 CROCC2H7BZ55 1655 aa37.7■■■■□ 3.63
PTPRJ-205ENST00000527952 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP37.7■■■■□ 3.63
PTPRJ-205ENST00000527952 VWDEQ8N2E2 1590 aa37.68■■■■□ 3.62
PTPRJ-205ENST00000527952 CPS1P31327 1500 aa37.67■■■■□ 3.62
PTPRJ-205ENST00000527952 PIP4K2BP78356 416 aa37.67■■■■□ 3.62
PTPRJ-205ENST00000527952 DEPDC5O75140 1603 aa37.67■■■■□ 3.62
PTPRJ-205ENST00000527952 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP37.66■■■■□ 3.62
PTPRJ-205ENST00000527952 MED14O60244 1454 aa37.64■■■■□ 3.62
PTPRJ-205ENST00000527952 IQGAP1P46940 1657 aa37.63■■■■□ 3.62
PTPRJ-205ENST00000527952 DAPK1P53355 1430 aa37.63■■■■□ 3.61
PTPRJ-205ENST00000527952 CHIC2Q9UKJ5 165 aa37.63■■■■□ 3.61
PTPRJ-205ENST00000527952 FGD6Q6ZV73 1430 aa37.6■■■■□ 3.61
PTPRJ-205ENST00000527952 UBR1Q8IWV7 1749 aa37.59■■■■□ 3.61
PTPRJ-205ENST00000527952 ERBINQ96RT1 1412 aa37.58■■■■□ 3.61
PTPRJ-205ENST00000527952 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP37.57■■■■□ 3.61
PTPRJ-205ENST00000527952 TOM1O60784 492 aa37.57■■■■□ 3.6
PTPRJ-205ENST00000527952 STRCP1A6NGW2 1772 aa37.55■■■■□ 3.6
PTPRJ-205ENST00000527952 HSPA1LP34931 641 aa37.55■■■■□ 3.6
PTPRJ-205ENST00000527952 SOCS7O14512 581 aa37.51■■■■□ 3.6
PTPRJ-205ENST00000527952 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa37.5■■■■□ 3.59
PTPRJ-205ENST00000527952 LTKP29376 864 aa37.49■■■■□ 3.59
PTPRJ-205ENST00000527952 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa37.46■■■■□ 3.59
PTPRJ-205ENST00000527952 TXNDC2Q86VQ3 553 aa37.46■■■■□ 3.59
PTPRJ-205ENST00000527952 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP37.45■■■■□ 3.59
PTPRJ-205ENST00000527952 KANK1Q14678 1352 aa37.45■■■■□ 3.59
PTPRJ-205ENST00000527952 PIK3C2BO00750 1634 aa37.43■■■■□ 3.58
PTPRJ-205ENST00000527952 ALKQ9UM73 1620 aa37.43■■■■□ 3.58
PTPRJ-205ENST00000527952 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP37.43■■■■□ 3.58
PTPRJ-205ENST00000527952 LRRC7Q96NW7 1537 aa37.42■■■■□ 3.58
PTPRJ-205ENST00000527952 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP37.41■■■■□ 3.58
PTPRJ-205ENST00000527952 ARHGAP23Q9P227 1491 aa37.4■■■■□ 3.58
PTPRJ-205ENST00000527952 STAG3Q9UJ98 1225 aa37.39■■■■□ 3.58
PTPRJ-205ENST00000527952 SLIT1O75093 1534 aa37.39■■■■□ 3.58
PTPRJ-205ENST00000527952 EID1Q9Y6B2 187 aa37.35■■■■□ 3.57
PTPRJ-205ENST00000527952 IDI1Q13907 227 aa37.34■■■■□ 3.57
PTPRJ-205ENST00000527952 SYNMO15061 1565 aa37.33■■■■□ 3.57
PTPRJ-205ENST00000527952 LMTK2Q8IWU2 1503 aa37.32■■■■□ 3.57
PTPRJ-205ENST00000527952 TMEM2Q9UHN6 1383 aa37.3■■■■□ 3.56
PTPRJ-205ENST00000527952 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP37.29■■■■□ 3.56
PTPRJ-205ENST00000527952 ADGRL2O95490 1459 aa37.27■■■■□ 3.56
PTPRJ-205ENST00000527952 EFCAB6Q5THR3 1501 aa37.26■■■■□ 3.55
PTPRJ-205ENST00000527952 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP37.24■■■■□ 3.55
PTPRJ-205ENST00000527952 NOS1P29475 1434 aa37.21■■■■□ 3.55
PTPRJ-205ENST00000527952 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa37.19■■■■□ 3.54
PTPRJ-205ENST00000527952 SLC26A8Q96RN1 970 aa37.19■■■■□ 3.54
PTPRJ-205ENST00000527952 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP37.18■■■■□ 3.54
PTPRJ-205ENST00000527952 ADGRB3O60242 1522 aa37.14■■■■□ 3.54
PTPRJ-205ENST00000527952 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP37.13■■■■□ 3.53
PTPRJ-205ENST00000527952 BCANQ96GW7 911 aa37.1■■■■□ 3.53
PTPRJ-205ENST00000527952 SLC52A1Q9NWF4 448 aa37.1■■■■□ 3.53
PTPRJ-205ENST00000527952 MYO5BQ9ULV0 1848 aa37.1■■■■□ 3.53
PTPRJ-205ENST00000527952 TET3O43151 1660 aa37.09■■■■□ 3.53
PTPRJ-205ENST00000527952 KCNA6P17658 529 aa37.07■■■■□ 3.52
PTPRJ-205ENST00000527952 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP37.07■■■■□ 3.52
PTPRJ-205ENST00000527952 TMEM94Q12767 1356 aa37.06■■■■□ 3.52
PTPRJ-205ENST00000527952 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP37.06■■■■□ 3.52
PTPRJ-205ENST00000527952 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP37.04■■■■□ 3.52
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