RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526116.5

EML3-215, Transcript of echinoderm microtubule associated protein like 3, human

TSL 3

Gene EML3, Length 581 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EML3-215	ENST00000526116	DAPK1	P53355	1430 aa		33.12	■■■□□ 2.89
EML3-215	ENST00000526116	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		33.11	■■■□□ 2.89
EML3-215	ENST00000526116	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		33.09	■■■□□ 2.89
EML3-215	ENST00000526116	PTPRK	Q15262	1439 aa		33.08	■■■□□ 2.89
EML3-215	ENST00000526116	STRC	Q7RTU9	1775 aa		33.04	■■■□□ 2.88
EML3-215	ENST00000526116	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		33.03	■■■□□ 2.88
EML3-215	ENST00000526116	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	33.03	■■■□□ 2.88
EML3-215	ENST00000526116	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		33.02	■■■□□ 2.88
EML3-215	ENST00000526116	KIF15	Q9NS87	1388 aa		33.02	■■■□□ 2.88
EML3-215	ENST00000526116	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	33.01	■■■□□ 2.88
EML3-215	ENST00000526116	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		32.99	■■■□□ 2.87
EML3-215	ENST00000526116	PZP	P20742	1482 aa		32.98	■■■□□ 2.87
EML3-215	ENST00000526116	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		32.98	■■■□□ 2.87
EML3-215	ENST00000526116	ABCC3	O15438	1527 aa		32.96	■■■□□ 2.87
EML3-215	ENST00000526116	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	32.94	■■■□□ 2.86
EML3-215	ENST00000526116	ADGRL2	O95490	1459 aa		32.93	■■■□□ 2.86
EML3-215	ENST00000526116	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		32.93	■■■□□ 2.86
EML3-215	ENST00000526116	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		32.93	■■■□□ 2.86
EML3-215	ENST00000526116	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	32.92	■■■□□ 2.86
EML3-215	ENST00000526116	DEPDC5	O75140	1603 aa		32.92	■■■□□ 2.86
EML3-215	ENST00000526116	NCOA1	Q15788	1441 aa		32.92	■■■□□ 2.86
EML3-215	ENST00000526116	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	32.91	■■■□□ 2.86
EML3-215	ENST00000526116	CEP152	O94986	1710 aa		32.9	■■■□□ 2.86
EML3-215	ENST00000526116	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		32.88	■■■□□ 2.85
EML3-215	ENST00000526116	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		32.88	■■■□□ 2.85
EML3-215	ENST00000526116	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	32.85	■■■□□ 2.85
EML3-215	ENST00000526116	TNR	Q92752	1358 aa		32.84	■■■□□ 2.85
EML3-215	ENST00000526116	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		32.84	■■■□□ 2.85
EML3-215	ENST00000526116	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		32.83	■■■□□ 2.85
EML3-215	ENST00000526116	PLA2R1	Q13018	1463 aa		32.81	■■■□□ 2.84
EML3-215	ENST00000526116	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		32.8	■■■□□ 2.84
EML3-215	ENST00000526116	PTPRT	O14522	1441 aa		32.8	■■■□□ 2.84
EML3-215	ENST00000526116	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	32.78	■■■□□ 2.84
EML3-215	ENST00000526116	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		32.76	■■■□□ 2.84
EML3-215	ENST00000526116	NLRP1	Q9C000	1473 aa		32.76	■■■□□ 2.84
EML3-215	ENST00000526116	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	32.76	■■■□□ 2.83
EML3-215	ENST00000526116	ERVK-7	P63135	1459 aa		32.75	■■■□□ 2.83
EML3-215	ENST00000526116	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		32.75	■■■□□ 2.83
EML3-215	ENST00000526116	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	32.74	■■■□□ 2.83
EML3-215	ENST00000526116	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		32.72	■■■□□ 2.83
EML3-215	ENST00000526116	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	32.72	■■■□□ 2.83
EML3-215	ENST00000526116	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		32.71	■■■□□ 2.83
EML3-215	ENST00000526116	KANK1	Q14678	1352 aa		32.7	■■■□□ 2.83
EML3-215	ENST00000526116	ROCK1	Q13464	1354 aa		32.7	■■■□□ 2.82
EML3-215	ENST00000526116	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	32.67	■■■□□ 2.82
EML3-215	ENST00000526116	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		32.66	■■■□□ 2.82
EML3-215	ENST00000526116	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	32.66	■■■□□ 2.82
EML3-215	ENST00000526116	PKD2	Q13563	968 aa		32.66	■■■□□ 2.82
EML3-215	ENST00000526116	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		32.65	■■■□□ 2.82
EML3-215	ENST00000526116	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	32.64	■■■□□ 2.82
EML3-215	ENST00000526116	UNC13B	O14795	1591 aa		32.62	■■■□□ 2.81
EML3-215	ENST00000526116	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		32.61	■■■□□ 2.81
EML3-215	ENST00000526116	FBXO41	Q8TF61	875 aa		32.6	■■■□□ 2.81
EML3-215	ENST00000526116	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		32.58	■■■□□ 2.81
EML3-215	ENST00000526116	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		32.58	■■■□□ 2.81
EML3-215	ENST00000526116	CERK	Q8TCT0	537 aa		32.58	■■■□□ 2.81
EML3-215	ENST00000526116	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	32.57	■■■□□ 2.8
EML3-215	ENST00000526116	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		32.57	■■■□□ 2.8
EML3-215	ENST00000526116	TET3	O43151	1660 aa		32.54	■■■□□ 2.8
EML3-215	ENST00000526116	ITGAE	P38570	1179 aa		32.52	■■■□□ 2.8
EML3-215	ENST00000526116	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		32.51	■■■□□ 2.79
EML3-215	ENST00000526116	SYNM	O15061	1565 aa		32.5	■■■□□ 2.79
EML3-215	ENST00000526116	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	32.49	■■■□□ 2.79
EML3-215	ENST00000526116	PIK3C2B	O00750	1634 aa		32.49	■■■□□ 2.79
EML3-215	ENST00000526116	NOS1	P29475	1434 aa		32.49	■■■□□ 2.79
EML3-215	ENST00000526116	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	32.48	■■■□□ 2.79
EML3-215	ENST00000526116	MED14	O60244	1454 aa		32.48	■■■□□ 2.79
EML3-215	ENST00000526116	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		32.48	■■■□□ 2.79
EML3-215	ENST00000526116	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		32.47	■■■□□ 2.79
EML3-215	ENST00000526116	SLIT1	O75093	1534 aa		32.42	■■■□□ 2.78
EML3-215	ENST00000526116	IQGAP1	P46940	1657 aa		32.42	■■■□□ 2.78
EML3-215	ENST00000526116	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		32.42	■■■□□ 2.78
EML3-215	ENST00000526116	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	32.41	■■■□□ 2.78
EML3-215	ENST00000526116	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	32.4	■■■□□ 2.78
EML3-215	ENST00000526116	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		32.4	■■■□□ 2.78
EML3-215	ENST00000526116		E9PCH4	1651 aa		32.4	■■■□□ 2.78
EML3-215	ENST00000526116	IDI1	Q13907	227 aa		32.35	■■■□□ 2.77
EML3-215	ENST00000526116	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	32.35	■■■□□ 2.77
EML3-215	ENST00000526116	ADGRB3	O60242	1522 aa		32.34	■■■□□ 2.77
EML3-215	ENST00000526116	NUP155	O75694	1391 aa		32.33	■■■□□ 2.77
EML3-215	ENST00000526116	NAIP	Q13075	1403 aa		32.33	■■■□□ 2.77
EML3-215	ENST00000526116	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		32.32	■■■□□ 2.76
EML3-215	ENST00000526116	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		32.31	■■■□□ 2.76
EML3-215	ENST00000526116	HFM1	A2PYH4	1435 aa		32.27	■■■□□ 2.76
EML3-215	ENST00000526116	LTK	P29376	864 aa		32.27	■■■□□ 2.76
EML3-215	ENST00000526116	CPS1	P31327	1500 aa		32.26	■■■□□ 2.76
EML3-215	ENST00000526116	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		32.26	■■■□□ 2.75
EML3-215	ENST00000526116	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		32.26	■■■□□ 2.75
EML3-215	ENST00000526116	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		32.24	■■■□□ 2.75
EML3-215	ENST00000526116	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		32.22	■■■□□ 2.75
EML3-215	ENST00000526116	EID1	Q9Y6B2	187 aa		32.22	■■■□□ 2.75
EML3-215	ENST00000526116	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		32.2	■■■□□ 2.75
EML3-215	ENST00000526116	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		32.18	■■■□□ 2.74
EML3-215	ENST00000526116	ZFYVE9	O95405	1425 aa		32.14	■■■□□ 2.74
EML3-215	ENST00000526116	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		32.07	■■■□□ 2.72
EML3-215	ENST00000526116	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		32.05	■■■□□ 2.72
EML3-215	ENST00000526116	TRPM2	O94759	1503 aa		32.04	■■■□□ 2.72
EML3-215	ENST00000526116	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		32.02	■■■□□ 2.72
EML3-215	ENST00000526116	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		32.01	■■■□□ 2.71
EML3-215	ENST00000526116	CLTCL1	P53675	1640 aa		32	■■■□□ 2.71

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