RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526116.5

EML3-215, Transcript of echinoderm microtubule associated protein like 3, humanhuman

TSL 3

Gene EML3, Length 581 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EML3-215ENST00000526116 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.55■■■■■ 6
EML3-215ENST00000526116 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.96■■■■■ 5.11
EML3-215ENST00000526116 ABCC9O60706 1549 aa46.14■■■■■ 4.98
EML3-215ENST00000526116 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.31■■■■■ 4.68
EML3-215ENST00000526116 NACADO15069 1562 aa44.18■■■■■ 4.66
EML3-215ENST00000526116 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.84■■■■■ 4.61
EML3-215ENST00000526116 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.84■■■■■ 4.61
EML3-215ENST00000526116 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.72■■■■■ 4.59
EML3-215ENST00000526116 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.51■■■■■ 4.56
EML3-215ENST00000526116 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.39■■■■■ 4.54
EML3-215ENST00000526116 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.01■■■■■ 4.48
EML3-215ENST00000526116 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43■■■■■ 4.47
EML3-215ENST00000526116 SCRIBQ14160 1630 aa42.72■■■■■ 4.43
EML3-215ENST00000526116 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.66■■■■■ 4.42
EML3-215ENST00000526116 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.55■■■■■ 4.4
EML3-215ENST00000526116 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.88■■■■■ 4.29
EML3-215ENST00000526116 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.79■■■■■ 4.28
EML3-215ENST00000526116 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.52■■■■■ 4.24
EML3-215ENST00000526116 SMARCA4P51532 1647 aa40.88■■■■■ 4.13
EML3-215ENST00000526116 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.76■■■■■ 4.12
EML3-215ENST00000526116 NCAPD3P42695 1498 aa40.75■■■■■ 4.11
EML3-215ENST00000526116 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.7■■■■■ 4.11
EML3-215ENST00000526116 SMARCA2P51531 1590 aa40.66■■■■■ 4.1
EML3-215ENST00000526116 HMGXB3Q12766 1538 aa40.56■■■■■ 4.08
EML3-215ENST00000526116 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.52■■■■■ 4.08
EML3-215ENST00000526116 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.48■■■■■ 4.07
EML3-215ENST00000526116 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.34■■■■■ 4.05
EML3-215ENST00000526116 WIZO95785 1651 aa40.04■■■■■ 4
EML3-215ENST00000526116 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.87■■■■□ 3.97
EML3-215ENST00000526116 NESP48681 1621 aa39.85■■■■□ 3.97
EML3-215ENST00000526116 ERCC6Q03468 1493 aa39.79■■■■□ 3.96
EML3-215ENST00000526116 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.76■■■■□ 3.95
EML3-215ENST00000526116 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.6■■■■□ 3.93
EML3-215ENST00000526116 CUX2O14529 1486 aa39.57■■■■□ 3.93
EML3-215ENST00000526116 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.5■■■■□ 3.91
EML3-215ENST00000526116 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.45■■■■□ 3.91
EML3-215ENST00000526116 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.43■■■■□ 3.9
EML3-215ENST00000526116 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.41■■■■□ 3.9
EML3-215ENST00000526116 CFTRP13569 1480 aa39.24■■■■□ 3.87
EML3-215ENST00000526116 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.1■■■■□ 3.85
EML3-215ENST00000526116 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.08■■■■□ 3.85
EML3-215ENST00000526116 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.06■■■■□ 3.84
EML3-215ENST00000526116 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.05■■■■□ 3.84
EML3-215ENST00000526116 PRDM2Q13029 1718 aa39.02■■■■□ 3.84
EML3-215ENST00000526116 WDR62O43379 1518 aa39■■■■□ 3.83
EML3-215ENST00000526116 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.72■■■■□ 3.79
EML3-215ENST00000526116 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.7■■■■□ 3.79
EML3-215ENST00000526116 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.46■■■■□ 3.75
EML3-215ENST00000526116 TOPBP1Q92547 1522 aa38.42■■■■□ 3.74
EML3-215ENST00000526116 ABCC8Q09428 1581 aa38.39■■■■□ 3.74
EML3-215ENST00000526116 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.36■■■■□ 3.73
EML3-215ENST00000526116 IFT140Q96RY7 1462 aa38.25■■■■□ 3.71
EML3-215ENST00000526116 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.11■■■■□ 3.69
EML3-215ENST00000526116 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.08■■■■□ 3.69
EML3-215ENST00000526116 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.07■■■■□ 3.68
EML3-215ENST00000526116 CUX1P39880 1505 aa38■■■■□ 3.67
EML3-215ENST00000526116 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.99■■■■□ 3.67
EML3-215ENST00000526116 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.91■■■■□ 3.66
EML3-215ENST00000526116 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.87■■■■□ 3.65
EML3-215ENST00000526116 SOGA1O94964 1423 aa37.86■■■■□ 3.65
EML3-215ENST00000526116 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.82■■■■□ 3.641e-6■□□□□ 8.8
EML3-215ENST00000526116 WDR97A6NE52 1622 aa37.77■■■■□ 3.64
EML3-215ENST00000526116 OSCARQ8IYS5 282 aa37.77■■■■□ 3.64
EML3-215ENST00000526116 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.67■■■■□ 3.62
EML3-215ENST00000526116 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.64■■■■□ 3.62
EML3-215ENST00000526116 TOP2BQ02880 1626 aa37.61■■■■□ 3.61
EML3-215ENST00000526116 CHD1O14646 1710 aa37.59■■■■□ 3.61
EML3-215ENST00000526116 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.59■■■■□ 3.61
EML3-215ENST00000526116 SYNJ1O43426 1573 aa37.57■■■■□ 3.6
EML3-215ENST00000526116 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.55■■■■□ 3.6
EML3-215ENST00000526116 GRIN2BQ13224 1484 aa37.49■■■■□ 3.59
EML3-215ENST00000526116 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.48■■■■□ 3.59
EML3-215ENST00000526116 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.47■■■■□ 3.59
EML3-215ENST00000526116 PBRM1Q86U86 1689 aa37.46■■■■□ 3.59
EML3-215ENST00000526116 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.45■■■■□ 3.59
EML3-215ENST00000526116 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.44■■■■□ 3.58
EML3-215ENST00000526116 FBLN2P98095 1184 aa37.34■■■■□ 3.57
EML3-215ENST00000526116 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.31■■■■□ 3.56
EML3-215ENST00000526116 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.31■■■■□ 3.56
EML3-215ENST00000526116 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.31■■■■□ 3.56
EML3-215ENST00000526116 SYNJ2O15056 1496 aa37.3■■■■□ 3.56
EML3-215ENST00000526116 ARHGEF11O15085 1522 aa37.25■■■■□ 3.55
EML3-215ENST00000526116 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.22■■■■□ 3.55
EML3-215ENST00000526116 TRIM41Q8WV44 630 aa37.2■■■■□ 3.55
EML3-215ENST00000526116 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.18■■■■□ 3.54
EML3-215ENST00000526116 ADAMTS12P58397 1594 aa37.12■■■■□ 3.53
EML3-215ENST00000526116 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.1■■■■□ 3.53
EML3-215ENST00000526116 GRIN2AQ12879 1464 aa37.02■■■■□ 3.52
EML3-215ENST00000526116 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.99■■■■□ 3.51
EML3-215ENST00000526116 ARAP1Q96P48 1450 aa36.91■■■■□ 3.5
EML3-215ENST00000526116 NUP160Q12769 1436 aa36.88■■■■□ 3.49
EML3-215ENST00000526116 CEP170Q5SW79 1584 aa36.87■■■■□ 3.49
EML3-215ENST00000526116 KIF27Q86VH2 1401 aa36.82■■■■□ 3.48
EML3-215ENST00000526116 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.81■■■■□ 3.48
EML3-215ENST00000526116 IGF1RP08069 1367 aa36.72■■■■□ 3.47
EML3-215ENST00000526116 CUL7Q14999 1698 aa36.72■■■■□ 3.47
EML3-215ENST00000526116 SHROOM2Q13796 1616 aa36.7■■■■□ 3.47
EML3-215ENST00000526116 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.6■■■■□ 3.45
EML3-215ENST00000526116 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.6■■■■□ 3.45
EML3-215ENST00000526116 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.47■■■■□ 3.43
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