RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526055.5

TSPAN4-216, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 469 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-216ENST00000526055 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
TSPAN4-216ENST00000526055 CROCC2H7BZ55 1655 aa28.56■■■□□ 2.16
TSPAN4-216ENST00000526055 PTPRKQ15262 1439 aa28.56■■■□□ 2.16
TSPAN4-216ENST00000526055 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
TSPAN4-216ENST00000526055 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa28.54■■■□□ 2.16
TSPAN4-216ENST00000526055 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
TSPAN4-216ENST00000526055 KIF15Q9NS87 1388 aa28.52■■■□□ 2.16
TSPAN4-216ENST00000526055 DMRT2Q9Y5R5 561 aa28.5■■■□□ 2.15
TSPAN4-216ENST00000526055 ERBINQ96RT1 1412 aa28.5■■■□□ 2.15
TSPAN4-216ENST00000526055 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa28.49■■■□□ 2.15
TSPAN4-216ENST00000526055 PZPP20742 1482 aa28.48■■■□□ 2.15
TSPAN4-216ENST00000526055 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.46■■■□□ 2.15
TSPAN4-216ENST00000526055 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
TSPAN4-216ENST00000526055 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
TSPAN4-216ENST00000526055 NCOA1Q15788 1441 aa28.43■■■□□ 2.14
TSPAN4-216ENST00000526055 ADGRL2O95490 1459 aa28.42■■■□□ 2.14
TSPAN4-216ENST00000526055 MYO3AQ8NEV4 1616 aa28.42■■■□□ 2.14
TSPAN4-216ENST00000526055 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
TSPAN4-216ENST00000526055 ABCC3O15438 1527 aa28.41■■■□□ 2.14
TSPAN4-216ENST00000526055 STRCQ7RTU9 1775 aa28.41■■■□□ 2.14
TSPAN4-216ENST00000526055 MROH1Q8NDA8 1641 aa28.4■■■□□ 2.14
TSPAN4-216ENST00000526055 TNRQ92752 1358 aa28.4■■■□□ 2.14
TSPAN4-216ENST00000526055 FBXO41Q8TF61 875 aa28.39■■■□□ 2.14
TSPAN4-216ENST00000526055 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.39■■■□□ 2.14
TSPAN4-216ENST00000526055 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
TSPAN4-216ENST00000526055 PTPRTO14522 1441 aa28.38■■■□□ 2.13
TSPAN4-216ENST00000526055 A2ML1A8K2U0 1454 aa28.37■■■□□ 2.13
TSPAN4-216ENST00000526055 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
TSPAN4-216ENST00000526055 PLA2R1Q13018 1463 aa28.36■■■□□ 2.13
TSPAN4-216ENST00000526055 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
TSPAN4-216ENST00000526055 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa28.36■■■□□ 2.13
TSPAN4-216ENST00000526055 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.35■■■□□ 2.134e-6■■■■■ 46.2
TSPAN4-216ENST00000526055 KANK1Q14678 1352 aa28.32■■■□□ 2.12
TSPAN4-216ENST00000526055 NLRP1Q9C000 1473 aa28.32■■■□□ 2.12
TSPAN4-216ENST00000526055 DEPDC5O75140 1603 aa28.32■■■□□ 2.12
TSPAN4-216ENST00000526055 PKD2Q13563 968 aa28.31■■■□□ 2.12
TSPAN4-216ENST00000526055 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa28.3■■■□□ 2.12
TSPAN4-216ENST00000526055 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa28.28■■■□□ 2.12
TSPAN4-216ENST00000526055 ROCK1Q13464 1354 aa28.27■■■□□ 2.12
TSPAN4-216ENST00000526055 ERVK-7P63135 1459 aa28.27■■■□□ 2.12
TSPAN4-216ENST00000526055 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa28.26■■■□□ 2.12
TSPAN4-216ENST00000526055 CEP152O94986 1710 aa28.26■■■□□ 2.11
TSPAN4-216ENST00000526055 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.25■■■□□ 2.11
TSPAN4-216ENST00000526055 LMTK2Q8IWU2 1503 aa28.24■■■□□ 2.11
TSPAN4-216ENST00000526055 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
TSPAN4-216ENST00000526055 VWDEQ8N2E2 1590 aa28.23■■■□□ 2.11
TSPAN4-216ENST00000526055 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
TSPAN4-216ENST00000526055 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa28.21■■■□□ 2.11
TSPAN4-216ENST00000526055 CERKQ8TCT0 537 aa28.2■■■□□ 2.1
TSPAN4-216ENST00000526055 UGGT1Q9NYU2 1555 aa28.19■■■□□ 2.1
TSPAN4-216ENST00000526055 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
TSPAN4-216ENST00000526055 ANKLE2Q86XL3 938 aa28.13■■■□□ 2.09
TSPAN4-216ENST00000526055 EFCAB6Q5THR3 1501 aa28.1■■■□□ 2.09
TSPAN4-216ENST00000526055 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
TSPAN4-216ENST00000526055 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
TSPAN4-216ENST00000526055 ITGAEP38570 1179 aa28.08■■■□□ 2.09
TSPAN4-216ENST00000526055 LTBP4Q8N2S1 1624 aa28.07■■■□□ 2.08
TSPAN4-216ENST00000526055 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
TSPAN4-216ENST00000526055 UNC13BO14795 1591 aa28.07■■■□□ 2.08
TSPAN4-216ENST00000526055 MED14O60244 1454 aa28.05■■■□□ 2.08
TSPAN4-216ENST00000526055 NOS1P29475 1434 aa28.05■■■□□ 2.08
TSPAN4-216ENST00000526055 NEURL4Q96JN8 1562 aa28.05■■■□□ 2.08
TSPAN4-216ENST00000526055 IQSEC2Q5JU85 1478 aa28.03■■■□□ 2.08
TSPAN4-216ENST00000526055 UBR1Q8IWV7 1749 aa28.02■■■□□ 2.08
TSPAN4-216ENST00000526055 TET3O43151 1660 aa28.02■■■□□ 2.08
TSPAN4-216ENST00000526055 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
TSPAN4-216ENST00000526055 SLC52A1Q9NWF4 448 aa28■■■□□ 2.07
TSPAN4-216ENST00000526055 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
TSPAN4-216ENST00000526055 SLIT1O75093 1534 aa27.98■■■□□ 2.07
TSPAN4-216ENST00000526055 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
TSPAN4-216ENST00000526055 ARHGAP23Q9P227 1491 aa27.98■■■□□ 2.07
TSPAN4-216ENST00000526055 IDI1Q13907 227 aa27.97■■■□□ 2.07
TSPAN4-216ENST00000526055 SYNMO15061 1565 aa27.96■■■□□ 2.07
TSPAN4-216ENST00000526055 STAG3Q9UJ98 1225 aa27.96■■■□□ 2.07
TSPAN4-216ENST00000526055 GCC2Q8IWJ2 1684 aa27.96■■■□□ 2.07
TSPAN4-216ENST00000526055 IQGAP3Q86VI3 1631 aa27.96■■■□□ 2.07
TSPAN4-216ENST00000526055 PIK3C2BO00750 1634 aa27.95■■■□□ 2.06
TSPAN4-216ENST00000526055 NUP155O75694 1391 aa27.95■■■□□ 2.06
TSPAN4-216ENST00000526055 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
TSPAN4-216ENST00000526055 TMEM2Q9UHN6 1383 aa27.92■■■□□ 2.06
TSPAN4-216ENST00000526055 EID1Q9Y6B2 187 aa27.92■■■□□ 2.06
TSPAN4-216ENST00000526055 IQGAP1P46940 1657 aa27.91■■■□□ 2.06
TSPAN4-216ENST00000526055 TXNDC2Q86VQ3 553 aa27.9■■■□□ 2.06
TSPAN4-216ENST00000526055 NAIPQ13075 1403 aa27.89■■■□□ 2.06
TSPAN4-216ENST00000526055 ADGRB3O60242 1522 aa27.88■■■□□ 2.05
TSPAN4-216ENST00000526055 CPS1P31327 1500 aa27.88■■■□□ 2.05
TSPAN4-216ENST00000526055 LTKP29376 864 aa27.87■■■□□ 2.05
TSPAN4-216ENST00000526055 HFM1A2PYH4 1435 aa27.86■■■□□ 2.05
TSPAN4-216ENST00000526055 E9PCH4 1651 aa27.85■■■□□ 2.05
TSPAN4-216ENST00000526055 HDGFP51858 240 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
TSPAN4-216ENST00000526055 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa27.75■■■□□ 2.03
TSPAN4-216ENST00000526055 ZFYVE9O95405 1425 aa27.73■■■□□ 2.03
TSPAN4-216ENST00000526055 UBAP1LF5GYI3 381 aa27.71■■■□□ 2.03
TSPAN4-216ENST00000526055 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP27.71■■■□□ 2.03
TSPAN4-216ENST00000526055 RIMS2Q9UQ26 1411 aa27.7■■■□□ 2.03
TSPAN4-216ENST00000526055 CHGAP10645 457 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
TSPAN4-216ENST00000526055 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa27.68■■■□□ 2.02
TSPAN4-216ENST00000526055 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa27.67■■■□□ 2.02
TSPAN4-216ENST00000526055 TRIM52Q96A61 297 aa27.67■■■□□ 2.02
TSPAN4-216ENST00000526055 LRRC7Q96NW7 1537 aa27.66■■■□□ 2.02
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