RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521812.1

MEG3-218, Transcript of maternally expressed 3, humanhuman

TSL 2

Gene MEG3, Length 635 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEG3-218ENST00000521812 TNRQ92752 1358 aa25.77■■□□□ 1.72
MEG3-218ENST00000521812 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.76■■□□□ 1.71
MEG3-218ENST00000521812 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
MEG3-218ENST00000521812 ANKLE2Q86XL3 938 aa25.75■■□□□ 1.71
MEG3-218ENST00000521812 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.74■■□□□ 1.71
MEG3-218ENST00000521812 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.74■■□□□ 1.71
MEG3-218ENST00000521812 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.72■■□□□ 1.71
MEG3-218ENST00000521812 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.71■■□□□ 1.71
MEG3-218ENST00000521812 PZPP20742 1482 aa25.69■■□□□ 1.7
MEG3-218ENST00000521812 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
MEG3-218ENST00000521812 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
MEG3-218ENST00000521812 MED14O60244 1454 aa25.68■■□□□ 1.7
MEG3-218ENST00000521812 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
MEG3-218ENST00000521812 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.65■■□□□ 1.7
MEG3-218ENST00000521812 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
MEG3-218ENST00000521812 MBD5Q9P267 1494 aa25.64■■□□□ 1.69
MEG3-218ENST00000521812 MIA2Q96PC5 1412 aa25.63■■□□□ 1.69
MEG3-218ENST00000521812 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.63■■□□□ 1.69
MEG3-218ENST00000521812 DEPDC5O75140 1603 aa25.63■■□□□ 1.69
MEG3-218ENST00000521812 KIF3BO15066 747 aa25.63■■□□□ 1.69
MEG3-218ENST00000521812 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
MEG3-218ENST00000521812 NLRP1Q9C000 1473 aa25.63■■□□□ 1.69
MEG3-218ENST00000521812 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.63■■□□□ 1.69
MEG3-218ENST00000521812 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.62■■□□□ 1.69
MEG3-218ENST00000521812 LRRC7Q96NW7 1537 aa25.62■■□□□ 1.69
MEG3-218ENST00000521812 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.61■■□□□ 1.69
MEG3-218ENST00000521812 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
MEG3-218ENST00000521812 IQGAP1P46940 1657 aa25.57■■□□□ 1.68
MEG3-218ENST00000521812 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.56■■□□□ 1.68
MEG3-218ENST00000521812 STRCP1A6NGW2 1772 aa25.55■■□□□ 1.68
MEG3-218ENST00000521812 SYNMO15061 1565 aa25.54■■□□□ 1.68
MEG3-218ENST00000521812 TIAM1Q13009 1591 aa25.53■■□□□ 1.68
MEG3-218ENST00000521812 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.47■■□□□ 1.67
MEG3-218ENST00000521812 POTEAQ6S8J7 498 aa25.44■■□□□ 1.66
MEG3-218ENST00000521812 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.42■■□□□ 1.66
MEG3-218ENST00000521812 CEP162Q5TB80 1403 aa25.42■■□□□ 1.66
MEG3-218ENST00000521812 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.42■■□□□ 1.66
MEG3-218ENST00000521812 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
MEG3-218ENST00000521812 FAM135BQ49AJ0 1406 aa25.38■■□□□ 1.65
MEG3-218ENST00000521812 ERVK-7P63135 1459 aa25.38■■□□□ 1.65
MEG3-218ENST00000521812 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
MEG3-218ENST00000521812 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.37■■□□□ 1.65
MEG3-218ENST00000521812 ABCC3O15438 1527 aa25.37■■□□□ 1.65
MEG3-218ENST00000521812 FOXD1Q16676 465 aa25.35■■□□□ 1.65
MEG3-218ENST00000521812 LTKP29376 864 aa25.34■■□□□ 1.65
MEG3-218ENST00000521812 NCOA2Q15596 1464 aa25.33■■□□□ 1.65
MEG3-218ENST00000521812 TSPY4P0CV99 314 aa25.32■■□□□ 1.64
MEG3-218ENST00000521812 TSPY10P0CW01 314 aa25.32■■□□□ 1.64
MEG3-218ENST00000521812 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
MEG3-218ENST00000521812 TXNDC2Q86VQ3 553 aa25.31■■□□□ 1.64
MEG3-218ENST00000521812 ARHGAP23Q9P227 1491 aa25.31■■□□□ 1.64
MEG3-218ENST00000521812 UBR1Q8IWV7 1749 aa25.31■■□□□ 1.64
MEG3-218ENST00000521812 SLIT1O75093 1534 aa25.29■■□□□ 1.64
MEG3-218ENST00000521812 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.29■■□□□ 1.64
MEG3-218ENST00000521812 EID1Q9Y6B2 187 aa25.25■■□□□ 1.63
MEG3-218ENST00000521812 TMEM94Q12767 1356 aa25.25■■□□□ 1.63
MEG3-218ENST00000521812 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.22■■□□□ 1.63
MEG3-218ENST00000521812 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa25.21■■□□□ 1.63
MEG3-218ENST00000521812 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.63
MEG3-218ENST00000521812 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
MEG3-218ENST00000521812 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25.18■■□□□ 1.62
MEG3-218ENST00000521812 TMEM2Q9UHN6 1383 aa25.18■■□□□ 1.62
MEG3-218ENST00000521812 KCNA6P17658 529 aa25.17■■□□□ 1.62
MEG3-218ENST00000521812 CEP152O94986 1710 aa25.17■■□□□ 1.62
MEG3-218ENST00000521812 MAP3K1Q13233 1512 aa25.17■■□□□ 1.62
MEG3-218ENST00000521812 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.16■■□□□ 1.62
MEG3-218ENST00000521812 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
MEG3-218ENST00000521812 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.15■■□□□ 1.62
MEG3-218ENST00000521812 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
MEG3-218ENST00000521812 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
MEG3-218ENST00000521812 JCADQ9P266 1359 aa25.12■■□□□ 1.61
MEG3-218ENST00000521812 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP25.1■■□□□ 1.61
MEG3-218ENST00000521812 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.1■■□□□ 1.61
MEG3-218ENST00000521812 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
MEG3-218ENST00000521812 PIK3C2BO00750 1634 aa25.09■■□□□ 1.61
MEG3-218ENST00000521812 SLC26A8Q96RN1 970 aa25.09■■□□□ 1.61
MEG3-218ENST00000521812 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.07■■□□□ 1.6
MEG3-218ENST00000521812 SLAIN2Q9P270 581 aa25.07■■□□□ 1.6
MEG3-218ENST00000521812 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
MEG3-218ENST00000521812 TET3O43151 1660 aa25.07■■□□□ 1.6
MEG3-218ENST00000521812 MSH6P52701 1360 aa25.06■■□□□ 1.6
MEG3-218ENST00000521812 PHLPP1O60346 1717 aa25.05■■□□□ 1.6
MEG3-218ENST00000521812 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.05■■□□□ 1.6
MEG3-218ENST00000521812 NWD1Q149M9 1564 aa25.03■■□□□ 1.6
MEG3-218ENST00000521812 IDI1Q13907 227 aa25.02■■□□□ 1.6
MEG3-218ENST00000521812 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
MEG3-218ENST00000521812 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
MEG3-218ENST00000521812 TRIM52Q96A61 297 aa25■■□□□ 1.59
MEG3-218ENST00000521812 LRP6O75581 1613 aa25■■□□□ 1.59
MEG3-218ENST00000521812 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa24.99■■□□□ 1.59
MEG3-218ENST00000521812 KIF15Q9NS87 1388 aa24.99■■□□□ 1.59
MEG3-218ENST00000521812 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
MEG3-218ENST00000521812 ERBINQ96RT1 1412 aa24.98■■□□□ 1.59
MEG3-218ENST00000521812 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
MEG3-218ENST00000521812 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.98■■□□□ 1.59
MEG3-218ENST00000521812 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.97■■□□□ 1.59
MEG3-218ENST00000521812 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.96■■□□□ 1.59
MEG3-218ENST00000521812 KANK1Q14678 1352 aa24.94■■□□□ 1.58
MEG3-218ENST00000521812 BCANQ96GW7 911 aa24.93■■□□□ 1.58
MEG3-218ENST00000521812 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.4 ms