RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521812.1

MEG3-218, Transcript of maternally expressed 3, humanhuman

TSL 2

Gene MEG3, Length 635 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEG3-218ENST00000521812 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.35■■■■■ 4.05
MEG3-218ENST00000521812 ABCC9O60706 1549 aa37.31■■■■□ 3.56
MEG3-218ENST00000521812 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.49■■■■□ 3.43
MEG3-218ENST00000521812 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.74■■■■□ 3.31
MEG3-218ENST00000521812 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.14■■■■□ 3.22
MEG3-218ENST00000521812 NACADO15069 1562 aa34.73■■■■□ 3.15
MEG3-218ENST00000521812 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.64■■■■□ 3.14
MEG3-218ENST00000521812 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.4■■■■□ 3.1
MEG3-218ENST00000521812 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.27■■■■□ 3.08
MEG3-218ENST00000521812 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.17■■■■□ 3.06
MEG3-218ENST00000521812 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.02■■■■□ 3.04
MEG3-218ENST00000521812 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.7■■■□□ 2.99
MEG3-218ENST00000521812 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.64■■■□□ 2.98
MEG3-218ENST00000521812 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.64■■■□□ 2.98
MEG3-218ENST00000521812 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.39■■■□□ 2.94
MEG3-218ENST00000521812 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.38■■■□□ 2.93
MEG3-218ENST00000521812 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.28■■■□□ 2.92
MEG3-218ENST00000521812 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.28■■■□□ 2.92
MEG3-218ENST00000521812 SCRIBQ14160 1630 aa33.22■■■□□ 2.91
MEG3-218ENST00000521812 CUX2O14529 1486 aa32.49■■■□□ 2.79
MEG3-218ENST00000521812 ERCC6Q03468 1493 aa32.27■■■□□ 2.76
MEG3-218ENST00000521812 NCAPD3P42695 1498 aa32.11■■■□□ 2.73
MEG3-218ENST00000521812 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.89■■■□□ 2.7
MEG3-218ENST00000521812 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP31.86■■■□□ 2.69
MEG3-218ENST00000521812 NESP48681 1621 aa31.83■■■□□ 2.69
MEG3-218ENST00000521812 HMGXB3Q12766 1538 aa31.77■■■□□ 2.68
MEG3-218ENST00000521812 SMARCA2P51531 1590 aa31.73■■■□□ 2.67
MEG3-218ENST00000521812 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.64■■■□□ 2.65
MEG3-218ENST00000521812 SMARCA4P51532 1647 aa31.62■■■□□ 2.65
MEG3-218ENST00000521812 TRIM41Q8WV44 630 aa31.58■■■□□ 2.65
MEG3-218ENST00000521812 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.52■■■□□ 2.64
MEG3-218ENST00000521812 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.46■■■□□ 2.63
MEG3-218ENST00000521812 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.36■■■□□ 2.61
MEG3-218ENST00000521812 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.34■■■□□ 2.61
MEG3-218ENST00000521812 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.34■■■□□ 2.61
MEG3-218ENST00000521812 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.32■■■□□ 2.6
MEG3-218ENST00000521812 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.11■■■□□ 2.57
MEG3-218ENST00000521812 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.1■■■□□ 2.57
MEG3-218ENST00000521812 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.09■■■□□ 2.57
MEG3-218ENST00000521812 WDR62O43379 1518 aa31.05■■■□□ 2.56
MEG3-218ENST00000521812 OSCARQ8IYS5 282 aa30.89■■■□□ 2.54
MEG3-218ENST00000521812 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.82■■■□□ 2.53
MEG3-218ENST00000521812 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.73■■■□□ 2.51
MEG3-218ENST00000521812 WIZO95785 1651 aa30.63■■■□□ 2.49
MEG3-218ENST00000521812 CFTRP13569 1480 aa30.57■■■□□ 2.48
MEG3-218ENST00000521812 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.52■■■□□ 2.48
MEG3-218ENST00000521812 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.52■■■□□ 2.48
MEG3-218ENST00000521812 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.52■■■□□ 2.48
MEG3-218ENST00000521812 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.52■■■□□ 2.48
MEG3-218ENST00000521812 ARHGEF11O15085 1522 aa30.37■■■□□ 2.45
MEG3-218ENST00000521812 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.27■■■□□ 2.44
MEG3-218ENST00000521812 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.27■■■□□ 2.44
MEG3-218ENST00000521812 IFT140Q96RY7 1462 aa30.25■■■□□ 2.43
MEG3-218ENST00000521812 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.22■■■□□ 2.43
MEG3-218ENST00000521812 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
MEG3-218ENST00000521812 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
MEG3-218ENST00000521812 TRHP20396 242 aaPredicted RBP30.13■■■□□ 2.41
MEG3-218ENST00000521812 PRDM2Q13029 1718 aa30.07■■■□□ 2.4
MEG3-218ENST00000521812 TOPBP1Q92547 1522 aa30.05■■■□□ 2.4
MEG3-218ENST00000521812 ARAP1Q96P48 1450 aa30.03■■■□□ 2.4
MEG3-218ENST00000521812 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
MEG3-218ENST00000521812 ABCC8Q09428 1581 aa29.93■■■□□ 2.38
MEG3-218ENST00000521812 CHD1O14646 1710 aa29.91■■■□□ 2.38
MEG3-218ENST00000521812 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.91■■■□□ 2.38
MEG3-218ENST00000521812 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.91■■■□□ 2.38
MEG3-218ENST00000521812 FBLN2P98095 1184 aa29.87■■■□□ 2.37
MEG3-218ENST00000521812 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.86■■■□□ 2.37
MEG3-218ENST00000521812 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
MEG3-218ENST00000521812 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.35
MEG3-218ENST00000521812 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.62■■■□□ 2.33
MEG3-218ENST00000521812 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.61■■■□□ 2.33
MEG3-218ENST00000521812 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
MEG3-218ENST00000521812 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.57■■■□□ 2.32
MEG3-218ENST00000521812 SOGA1O94964 1423 aa29.56■■■□□ 2.32
MEG3-218ENST00000521812 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
MEG3-218ENST00000521812 SYNJ1O43426 1573 aa29.52■■■□□ 2.32
MEG3-218ENST00000521812 WDR97A6NE52 1622 aa29.46■■■□□ 2.31
MEG3-218ENST00000521812 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
MEG3-218ENST00000521812 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.4■■■□□ 2.3
MEG3-218ENST00000521812 GRIN2BQ13224 1484 aa29.39■■■□□ 2.3
MEG3-218ENST00000521812 SYNJ2O15056 1496 aa29.38■■■□□ 2.29
MEG3-218ENST00000521812 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.37■■■□□ 2.29
MEG3-218ENST00000521812 CUX1P39880 1505 aa29.25■■■□□ 2.27
MEG3-218ENST00000521812 PBRM1Q86U86 1689 aa29.14■■■□□ 2.26
MEG3-218ENST00000521812 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.09■■■□□ 2.25
MEG3-218ENST00000521812 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.03■■■□□ 2.24
MEG3-218ENST00000521812 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.02■■■□□ 2.24
MEG3-218ENST00000521812 GRIN2AQ12879 1464 aa29.01■■■□□ 2.23
MEG3-218ENST00000521812 CEP170Q5SW79 1584 aa28.98■■■□□ 2.23
MEG3-218ENST00000521812 NUP160Q12769 1436 aa28.95■■■□□ 2.23
MEG3-218ENST00000521812 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.87■■■□□ 2.21
MEG3-218ENST00000521812 ADAMTS12P58397 1594 aa28.87■■■□□ 2.21
MEG3-218ENST00000521812 SHROOM2Q13796 1616 aa28.87■■■□□ 2.21
MEG3-218ENST00000521812 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.78■■■□□ 2.2
MEG3-218ENST00000521812 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.77■■■□□ 2.2
MEG3-218ENST00000521812 FAM69CQ0P6D2 419 aa28.73■■■□□ 2.19
MEG3-218ENST00000521812 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
MEG3-218ENST00000521812 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.72■■■□□ 2.19
MEG3-218ENST00000521812 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa28.67■■■□□ 2.18
MEG3-218ENST00000521812 JPH4Q96JJ6 628 aa28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.7 ms