RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519070.5

FAM49B-211, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, humanhuman

TSL 3

Gene FAM49B, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM49B-211ENST00000519070 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.81■■□□□ 1.56
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FAM49B-211ENST00000519070 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.79■■□□□ 1.56
FAM49B-211ENST00000519070 ERBINQ96RT1 1412 aa24.78■■□□□ 1.56
FAM49B-211ENST00000519070 ZMYM3Q14202 1370 aa24.77■■□□□ 1.56
FAM49B-211ENST00000519070 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.76■■□□□ 1.55
FAM49B-211ENST00000519070 LMTK3Q96Q04 1460 aa24.75■■□□□ 1.55
FAM49B-211ENST00000519070 DEPDC5O75140 1603 aa24.74■■□□□ 1.55
FAM49B-211ENST00000519070 ROCK1Q13464 1354 aa24.73■■□□□ 1.55
FAM49B-211ENST00000519070 KDM5DQ9BY66 1539 aa24.72■■□□□ 1.55
FAM49B-211ENST00000519070 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.72■■□□□ 1.55
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FAM49B-211ENST00000519070 ABCC3O15438 1527 aa24.7■■□□□ 1.54
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FAM49B-211ENST00000519070 NPATQ14207 1427 aa24.68■■□□□ 1.54
FAM49B-211ENST00000519070 VWDEQ8N2E2 1590 aa24.67■■□□□ 1.54
FAM49B-211ENST00000519070 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa24.67■■□□□ 1.54
FAM49B-211ENST00000519070 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
FAM49B-211ENST00000519070 PREX1Q8TCU6 1659 aa24.66■■□□□ 1.54
FAM49B-211ENST00000519070 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa24.64■■□□□ 1.54
FAM49B-211ENST00000519070 ITGAEP38570 1179 aa24.64■■□□□ 1.54
FAM49B-211ENST00000519070 CEP152O94986 1710 aa24.64■■□□□ 1.53
FAM49B-211ENST00000519070 PZPP20742 1482 aa24.63■■□□□ 1.53
FAM49B-211ENST00000519070 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
FAM49B-211ENST00000519070 LMTK2Q8IWU2 1503 aa24.6■■□□□ 1.53
FAM49B-211ENST00000519070 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa24.59■■□□□ 1.53
FAM49B-211ENST00000519070 UNC13BO14795 1591 aa24.57■■□□□ 1.52
FAM49B-211ENST00000519070 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa24.56■■□□□ 1.52
FAM49B-211ENST00000519070 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.56■■□□□ 1.52
FAM49B-211ENST00000519070 HSPA2P54652 639 aa24.56■■□□□ 1.52
FAM49B-211ENST00000519070 NAIPQ13075 1403 aa24.55■■□□□ 1.52
FAM49B-211ENST00000519070 MYO3AQ8NEV4 1616 aa24.54■■□□□ 1.52
FAM49B-211ENST00000519070 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa24.54■■□□□ 1.52
FAM49B-211ENST00000519070 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.53■■□□□ 1.52
FAM49B-211ENST00000519070 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
FAM49B-211ENST00000519070 ERVK-7P63135 1459 aa24.51■■□□□ 1.51
FAM49B-211ENST00000519070 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.51■■□□□ 1.51
FAM49B-211ENST00000519070 HFM1A2PYH4 1435 aa24.5■■□□□ 1.51
FAM49B-211ENST00000519070 TNRQ92752 1358 aa24.49■■□□□ 1.51
FAM49B-211ENST00000519070 KANK1Q14678 1352 aa24.48■■□□□ 1.51
FAM49B-211ENST00000519070 EFCAB6Q5THR3 1501 aa24.48■■□□□ 1.51
FAM49B-211ENST00000519070 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
FAM49B-211ENST00000519070 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
FAM49B-211ENST00000519070 STRCQ7RTU9 1775 aa24.47■■□□□ 1.51
FAM49B-211ENST00000519070 IQGAP3Q86VI3 1631 aa24.46■■□□□ 1.51
FAM49B-211ENST00000519070 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.45■■□□□ 1.5
FAM49B-211ENST00000519070 TET3O43151 1660 aa24.44■■□□□ 1.5
FAM49B-211ENST00000519070 NOS1P29475 1434 aa24.43■■□□□ 1.5
FAM49B-211ENST00000519070 NLRP1Q9C000 1473 aa24.41■■□□□ 1.5
FAM49B-211ENST00000519070 SYNMO15061 1565 aa24.4■■□□□ 1.5
FAM49B-211ENST00000519070 NUP155O75694 1391 aa24.39■■□□□ 1.49
FAM49B-211ENST00000519070 E9PCH4 1651 aa24.38■■□□□ 1.49
FAM49B-211ENST00000519070 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
FAM49B-211ENST00000519070 PLA2R1Q13018 1463 aa24.35■■□□□ 1.49
FAM49B-211ENST00000519070 UGGT1Q9NYU2 1555 aa24.32■■□□□ 1.48
FAM49B-211ENST00000519070 UBR1Q8IWV7 1749 aa24.32■■□□□ 1.48
FAM49B-211ENST00000519070 PIK3C2BO00750 1634 aa24.3■■□□□ 1.48
FAM49B-211ENST00000519070 IDI1Q13907 227 aa24.29■■□□□ 1.48
FAM49B-211ENST00000519070 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa24.27■■□□□ 1.48
FAM49B-211ENST00000519070 NEURL4Q96JN8 1562 aa24.26■■□□□ 1.47
FAM49B-211ENST00000519070 PTPRTO14522 1441 aa24.26■■□□□ 1.47
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FAM49B-211ENST00000519070 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
FAM49B-211ENST00000519070 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.24■■□□□ 1.47
FAM49B-211ENST00000519070 ARHGAP23Q9P227 1491 aa24.24■■□□□ 1.47
FAM49B-211ENST00000519070 SLIT1O75093 1534 aa24.22■■□□□ 1.47
FAM49B-211ENST00000519070 PKD2Q13563 968 aa24.21■■□□□ 1.47
FAM49B-211ENST00000519070 SLC52A1Q9NWF4 448 aa24.21■■□□□ 1.47
FAM49B-211ENST00000519070 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
FAM49B-211ENST00000519070 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa24.19■■□□□ 1.46
FAM49B-211ENST00000519070 ADGRB3O60242 1522 aa24.19■■□□□ 1.46
FAM49B-211ENST00000519070 MED14O60244 1454 aa24.19■■□□□ 1.46
FAM49B-211ENST00000519070 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.18■■□□□ 1.46
FAM49B-211ENST00000519070 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa24.17■■□□□ 1.46
FAM49B-211ENST00000519070 TRIM52Q96A61 297 aa24.17■■□□□ 1.46
FAM49B-211ENST00000519070 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.17■■□□□ 1.46
FAM49B-211ENST00000519070 MYO5BQ9ULV0 1848 aa24.16■■□□□ 1.46
FAM49B-211ENST00000519070 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.16■■□□□ 1.46
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FAM49B-211ENST00000519070 TRPM2O94759 1503 aa24.14■■□□□ 1.45
FAM49B-211ENST00000519070 ANKLE2Q86XL3 938 aa24.13■■□□□ 1.45
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FAM49B-211ENST00000519070 CLTCL1P53675 1640 aa24.11■■□□□ 1.45
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FAM49B-211ENST00000519070 ZFYVE9O95405 1425 aa24.1■■□□□ 1.45
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FAM49B-211ENST00000519070 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.1■■□□□ 1.45
FAM49B-211ENST00000519070 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
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FAM49B-211ENST00000519070 FOXD1Q16676 465 aa24.07■■□□□ 1.44
FAM49B-211ENST00000519070 IQGAP1P46940 1657 aa24.07■■□□□ 1.44
FAM49B-211ENST00000519070 TXNDC2Q86VQ3 553 aa24.06■■□□□ 1.44
FAM49B-211ENST00000519070 STAG3Q9UJ98 1225 aa24.04■■□□□ 1.44
FAM49B-211ENST00000519070 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
FAM49B-211ENST00000519070 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
FAM49B-211ENST00000519070 RIMS2Q9UQ26 1411 aa24.01■■□□□ 1.43
FAM49B-211ENST00000519070 EID1Q9Y6B2 187 aa23.98■■□□□ 1.43
FAM49B-211ENST00000519070 STRCP1A6NGW2 1772 aa23.97■■□□□ 1.43
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