RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517924.5

LAPTM4B-202, Transcript of lysosomal protein transmembrane 4 beta, humanhuman

TSL 5

Gene LAPTM4B, Length 618 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4B-202ENST00000517924 MYO3AQ8NEV4 1616 aa38.43■■■■□ 3.74
LAPTM4B-202ENST00000517924 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP38.42■■■■□ 3.74
LAPTM4B-202ENST00000517924 DAPK1P53355 1430 aa38.42■■■■□ 3.74
LAPTM4B-202ENST00000517924 SHANK2Q9UPX8 1470 aa38.41■■■■□ 3.74
LAPTM4B-202ENST00000517924 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP38.4■■■■□ 3.74
LAPTM4B-202ENST00000517924 FAM135AQ9P2D6 1515 aa38.37■■■■□ 3.73
LAPTM4B-202ENST00000517924 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP38.36■■■■□ 3.73
LAPTM4B-202ENST00000517924 DUOX2Q9NRD8 1548 aa38.36■■■■□ 3.73
LAPTM4B-202ENST00000517924 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa38.36■■■■□ 3.73
LAPTM4B-202ENST00000517924 MROH1Q8NDA8 1641 aa38.35■■■■□ 3.73
LAPTM4B-202ENST00000517924 KIF15Q9NS87 1388 aa38.33■■■■□ 3.73
LAPTM4B-202ENST00000517924 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP38.32■■■■□ 3.72
LAPTM4B-202ENST00000517924 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa38.32■■■■□ 3.72
LAPTM4B-202ENST00000517924 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP38.31■■■■□ 3.72
LAPTM4B-202ENST00000517924 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa38.3■■■■□ 3.72
LAPTM4B-202ENST00000517924 PZPP20742 1482 aa38.3■■■■□ 3.72
LAPTM4B-202ENST00000517924 CHIC2Q9UKJ5 165 aa38.29■■■■□ 3.72
LAPTM4B-202ENST00000517924 NCOA1Q15788 1441 aa38.29■■■■□ 3.72
LAPTM4B-202ENST00000517924 ABCC3O15438 1527 aa38.28■■■■□ 3.72
LAPTM4B-202ENST00000517924 CEP152O94986 1710 aa38.28■■■■□ 3.72
LAPTM4B-202ENST00000517924 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP38.26■■■■□ 3.71
LAPTM4B-202ENST00000517924 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP38.25■■■■□ 3.71
LAPTM4B-202ENST00000517924 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP38.23■■■■□ 3.71
LAPTM4B-202ENST00000517924 ERBINQ96RT1 1412 aa38.21■■■■□ 3.71
LAPTM4B-202ENST00000517924 TNRQ92752 1358 aa38.21■■■■□ 3.71
LAPTM4B-202ENST00000517924 DMRT2Q9Y5R5 561 aa38.19■■■■□ 3.7
LAPTM4B-202ENST00000517924 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP38.18■■■■□ 3.7
LAPTM4B-202ENST00000517924 A2ML1A8K2U0 1454 aa38.18■■■■□ 3.7
LAPTM4B-202ENST00000517924 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa38.18■■■■□ 3.7
LAPTM4B-202ENST00000517924 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP38.17■■■■□ 3.7
LAPTM4B-202ENST00000517924 PTPRTO14522 1441 aa38.16■■■■□ 3.7
LAPTM4B-202ENST00000517924 DEPDC5O75140 1603 aa38.15■■■■□ 3.7
LAPTM4B-202ENST00000517924 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa38.14■■■■□ 3.7
LAPTM4B-202ENST00000517924 ADGRL2O95490 1459 aa38.13■■■■□ 3.69
LAPTM4B-202ENST00000517924 PLA2R1Q13018 1463 aa38.11■■■■□ 3.69
LAPTM4B-202ENST00000517924 FBXO41Q8TF61 875 aa38.1■■■■□ 3.69
LAPTM4B-202ENST00000517924 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa38.08■■■■□ 3.69
LAPTM4B-202ENST00000517924 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP38.08■■■■□ 3.69
LAPTM4B-202ENST00000517924 CERKQ8TCT0 537 aa38.07■■■■□ 3.68
LAPTM4B-202ENST00000517924 ERVK-7P63135 1459 aa38.06■■■■□ 3.68
LAPTM4B-202ENST00000517924 NLRP1Q9C000 1473 aa38.02■■■■□ 3.68
LAPTM4B-202ENST00000517924 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP37.99■■■■□ 3.67
LAPTM4B-202ENST00000517924 VWDEQ8N2E2 1590 aa37.98■■■■□ 3.67
LAPTM4B-202ENST00000517924 PKD2Q13563 968 aa37.98■■■■□ 3.67
LAPTM4B-202ENST00000517924 UGGT1Q9NYU2 1555 aa37.97■■■■□ 3.67
LAPTM4B-202ENST00000517924 LTBP4Q8N2S1 1624 aa37.96■■■■□ 3.67
LAPTM4B-202ENST00000517924 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa37.95■■■■□ 3.67
LAPTM4B-202ENST00000517924 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa37.94■■■■□ 3.66
LAPTM4B-202ENST00000517924 KANK1Q14678 1352 aa37.93■■■■□ 3.66
LAPTM4B-202ENST00000517924 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP37.93■■■■□ 3.661e-8■■□□□ 13.4
LAPTM4B-202ENST00000517924 NEURL4Q96JN8 1562 aa37.93■■■■□ 3.66
LAPTM4B-202ENST00000517924 LMTK2Q8IWU2 1503 aa37.91■■■■□ 3.66
LAPTM4B-202ENST00000517924 ITGAEP38570 1179 aa37.87■■■■□ 3.65
LAPTM4B-202ENST00000517924 UBR1Q8IWV7 1749 aa37.87■■■■□ 3.65
LAPTM4B-202ENST00000517924 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP37.87■■■■□ 3.65
LAPTM4B-202ENST00000517924 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP37.86■■■■□ 3.65
LAPTM4B-202ENST00000517924 EFCAB6Q5THR3 1501 aa37.82■■■■□ 3.65
LAPTM4B-202ENST00000517924 ROCK1Q13464 1354 aa37.82■■■■□ 3.65
LAPTM4B-202ENST00000517924 ANKLE2Q86XL3 938 aa37.79■■■■□ 3.64
LAPTM4B-202ENST00000517924 UNC13BO14795 1591 aa37.79■■■■□ 3.64
LAPTM4B-202ENST00000517924 PIK3C2BO00750 1634 aa37.78■■■■□ 3.64
LAPTM4B-202ENST00000517924 SYNMO15061 1565 aa37.77■■■■□ 3.64
LAPTM4B-202ENST00000517924 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP37.74■■■■□ 3.63
LAPTM4B-202ENST00000517924 TET3O43151 1660 aa37.72■■■■□ 3.63
LAPTM4B-202ENST00000517924 IQGAP1P46940 1657 aa37.72■■■■□ 3.63
LAPTM4B-202ENST00000517924 MED14O60244 1454 aa37.71■■■■□ 3.63
LAPTM4B-202ENST00000517924 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP37.71■■■■□ 3.63
LAPTM4B-202ENST00000517924 NOS1P29475 1434 aa37.7■■■■□ 3.62
LAPTM4B-202ENST00000517924 GCC2Q8IWJ2 1684 aa37.69■■■■□ 3.62
LAPTM4B-202ENST00000517924 IDI1Q13907 227 aa37.65■■■■□ 3.62
LAPTM4B-202ENST00000517924 ARHGAP23Q9P227 1491 aa37.64■■■■□ 3.62
LAPTM4B-202ENST00000517924 SLIT1O75093 1534 aa37.64■■■■□ 3.62
LAPTM4B-202ENST00000517924 IQSEC2Q5JU85 1478 aa37.64■■■■□ 3.62
LAPTM4B-202ENST00000517924 IQGAP3Q86VI3 1631 aa37.63■■■■□ 3.61
LAPTM4B-202ENST00000517924 E9PCH4 1651 aa37.63■■■■□ 3.61
LAPTM4B-202ENST00000517924 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP37.62■■■■□ 3.61
LAPTM4B-202ENST00000517924 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP37.61■■■■□ 3.61
LAPTM4B-202ENST00000517924 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP37.61■■■■□ 3.61
LAPTM4B-202ENST00000517924 LTKP29376 864 aa37.61■■■■□ 3.61
LAPTM4B-202ENST00000517924 MYO5BQ9ULV0 1848 aa37.57■■■■□ 3.6
LAPTM4B-202ENST00000517924 STRCP1A6NGW2 1772 aa37.56■■■■□ 3.6
LAPTM4B-202ENST00000517924 STAG3Q9UJ98 1225 aa37.56■■■■□ 3.6
LAPTM4B-202ENST00000517924 TXNDC2Q86VQ3 553 aa37.55■■■■□ 3.6
LAPTM4B-202ENST00000517924 ADGRB3O60242 1522 aa37.55■■■■□ 3.6
LAPTM4B-202ENST00000517924 TMEM2Q9UHN6 1383 aa37.55■■■■□ 3.6
LAPTM4B-202ENST00000517924 NUP155O75694 1391 aa37.54■■■■□ 3.6
LAPTM4B-202ENST00000517924 CPS1P31327 1500 aa37.51■■■■□ 3.59
LAPTM4B-202ENST00000517924 SLC52A1Q9NWF4 448 aa37.48■■■■□ 3.59
LAPTM4B-202ENST00000517924 NAIPQ13075 1403 aa37.46■■■■□ 3.59
LAPTM4B-202ENST00000517924 EID1Q9Y6B2 187 aa37.46■■■■□ 3.59
LAPTM4B-202ENST00000517924 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa37.43■■■■□ 3.58
LAPTM4B-202ENST00000517924 UBAP1LF5GYI3 381 aa37.4■■■■□ 3.58
LAPTM4B-202ENST00000517924 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa37.33■■■■□ 3.57
LAPTM4B-202ENST00000517924 HFM1A2PYH4 1435 aa37.33■■■■□ 3.57
LAPTM4B-202ENST00000517924 ZFYVE9O95405 1425 aa37.33■■■■□ 3.57
LAPTM4B-202ENST00000517924 LRRC7Q96NW7 1537 aa37.32■■■■□ 3.57
LAPTM4B-202ENST00000517924 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP37.31■■■■□ 3.56
LAPTM4B-202ENST00000517924 CHGAP10645 457 aaKnown RBP37.3■■■■□ 3.56
LAPTM4B-202ENST00000517924 RIMS2Q9UQ26 1411 aa37.28■■■■□ 3.56
LAPTM4B-202ENST00000517924 SLC26A8Q96RN1 970 aa37.27■■■■□ 3.56
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