RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517924.5

LAPTM4B-202, Transcript of lysosomal protein transmembrane 4 beta, humanhuman

TSL 5

Gene LAPTM4B, Length 618 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4B-202ENST00000517924 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.99■■■■■ 7.35
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LAPTM4B-202ENST00000517924 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.49■■■■■ 5.83
LAPTM4B-202ENST00000517924 NACADO15069 1562 aa51.28■■■■■ 5.8
LAPTM4B-202ENST00000517924 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.2■■■■■ 5.79
LAPTM4B-202ENST00000517924 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.73■■■■■ 5.71
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LAPTM4B-202ENST00000517924 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.53■■■■■ 5.68
LAPTM4B-202ENST00000517924 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.36■■■■■ 5.65
LAPTM4B-202ENST00000517924 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP50.25■■■■■ 5.63
LAPTM4B-202ENST00000517924 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.07■■■■■ 5.61
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LAPTM4B-202ENST00000517924 SCRIBQ14160 1630 aa49.74■■■■■ 5.55
LAPTM4B-202ENST00000517924 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.26■■■■■ 5.48
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LAPTM4B-202ENST00000517924 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.7■■■■■ 5.39
LAPTM4B-202ENST00000517924 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.4■■■■■ 5.34
LAPTM4B-202ENST00000517924 SMARCA4P51532 1647 aa47.48■■■■■ 5.19
LAPTM4B-202ENST00000517924 NCAPD3P42695 1498 aa47.32■■■■■ 5.17
LAPTM4B-202ENST00000517924 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.32■■■■■ 5.17
LAPTM4B-202ENST00000517924 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.28■■■■■ 5.16
LAPTM4B-202ENST00000517924 SMARCA2P51531 1590 aa47.19■■■■■ 5.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.07■■■■■ 5.13
LAPTM4B-202ENST00000517924 HMGXB3Q12766 1538 aa47.05■■■■■ 5.12
LAPTM4B-202ENST00000517924 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.96■■■■■ 5.11
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LAPTM4B-202ENST00000517924 NESP48681 1621 aa46.5■■■■■ 5.04
LAPTM4B-202ENST00000517924 ERCC6Q03468 1493 aa46.39■■■■■ 5.02
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LAPTM4B-202ENST00000517924 CUX2O14529 1486 aa46.06■■■■■ 4.96
LAPTM4B-202ENST00000517924 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.96■■■■■ 4.95
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LAPTM4B-202ENST00000517924 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.92■■■■■ 4.94
LAPTM4B-202ENST00000517924 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.88■■■■■ 4.94
LAPTM4B-202ENST00000517924 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.83■■■■■ 4.93
LAPTM4B-202ENST00000517924 CFTRP13569 1480 aa45.55■■■■■ 4.88
LAPTM4B-202ENST00000517924 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.46■■■■■ 4.87
LAPTM4B-202ENST00000517924 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.44■■■■■ 4.87
LAPTM4B-202ENST00000517924 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.43■■■■■ 4.86
LAPTM4B-202ENST00000517924 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.41■■■■■ 4.86
LAPTM4B-202ENST00000517924 WDR62O43379 1518 aa45.35■■■■■ 4.85
LAPTM4B-202ENST00000517924 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.3■■■■■ 4.84
LAPTM4B-202ENST00000517924 PRDM2Q13029 1718 aa45.26■■■■■ 4.84
LAPTM4B-202ENST00000517924 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.07■■■■■ 4.81
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LAPTM4B-202ENST00000517924 TOPBP1Q92547 1522 aa44.68■■■■■ 4.74
LAPTM4B-202ENST00000517924 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.56■■■■■ 4.72
LAPTM4B-202ENST00000517924 ABCC8Q09428 1581 aa44.5■■■■■ 4.71
LAPTM4B-202ENST00000517924 IFT140Q96RY7 1462 aa44.45■■■■■ 4.71
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LAPTM4B-202ENST00000517924 CUX1P39880 1505 aa44.19■■■■■ 4.66
LAPTM4B-202ENST00000517924 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.12■■■■■ 4.65
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LAPTM4B-202ENST00000517924 SOGA1O94964 1423 aa44.03■■■■■ 4.64
LAPTM4B-202ENST00000517924 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.9■■■■■ 4.62
LAPTM4B-202ENST00000517924 CHD1O14646 1710 aa43.82■■■■■ 4.6
LAPTM4B-202ENST00000517924 WDR97A6NE52 1622 aa43.8■■■■■ 4.6
LAPTM4B-202ENST00000517924 TRIM41Q8WV44 630 aa43.65■■■■■ 4.58
LAPTM4B-202ENST00000517924 SYNJ1O43426 1573 aa43.65■■■■■ 4.58
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LAPTM4B-202ENST00000517924 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.64■■■■■ 4.58
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LAPTM4B-202ENST00000517924 TOP2BQ02880 1626 aa43.62■■■■■ 4.57
LAPTM4B-202ENST00000517924 FBLN2P98095 1184 aa43.61■■■■■ 4.57
LAPTM4B-202ENST00000517924 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.58■■■■■ 4.57
LAPTM4B-202ENST00000517924 PBRM1Q86U86 1689 aa43.56■■■■■ 4.56
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LAPTM4B-202ENST00000517924 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.54■■■■■ 4.56
LAPTM4B-202ENST00000517924 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.54■■■■■ 4.56
LAPTM4B-202ENST00000517924 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.52■■■■■ 4.56
LAPTM4B-202ENST00000517924 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.51■■■■■ 4.56
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LAPTM4B-202ENST00000517924 ARHGEF11O15085 1522 aa43.43■■■■■ 4.54
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LAPTM4B-202ENST00000517924 ARAP1Q96P48 1450 aa43.06■■■■■ 4.48
LAPTM4B-202ENST00000517924 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.03■■■■■ 4.48
LAPTM4B-202ENST00000517924 GRIN2AQ12879 1464 aa43.03■■■■■ 4.48
LAPTM4B-202ENST00000517924 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.03■■■■■ 4.48
LAPTM4B-202ENST00000517924 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.97■■■■■ 4.47
LAPTM4B-202ENST00000517924 CEP170Q5SW79 1584 aa42.91■■■■■ 4.46
LAPTM4B-202ENST00000517924 NUP160Q12769 1436 aa42.85■■■■■ 4.45
LAPTM4B-202ENST00000517924 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.71■■■■■ 4.43
LAPTM4B-202ENST00000517924 KIF27Q86VH2 1401 aa42.71■■■■■ 4.43
LAPTM4B-202ENST00000517924 IGF1RP08069 1367 aa42.65■■■■■ 4.42
LAPTM4B-202ENST00000517924 SHROOM2Q13796 1616 aa42.64■■■■■ 4.42
LAPTM4B-202ENST00000517924 CUL7Q14999 1698 aa42.57■■■■■ 4.4
LAPTM4B-202ENST00000517924 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.51■■■■■ 4.4
LAPTM4B-202ENST00000517924 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.39■■■■■ 4.38
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