RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515221.2

RSAD1-208, Transcript of radical S-adenosyl methionine domain containing 1, human

TSL 2

Gene RSAD1, Length 1,029 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RSAD1-208	ENST00000515221	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	32.69	■■■□□ 2.82
RSAD1-208	ENST00000515221	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		32.68	■■■□□ 2.82
RSAD1-208	ENST00000515221	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	32.68	■■■□□ 2.82
RSAD1-208	ENST00000515221	NCOA1	Q15788	1441 aa		32.68	■■■□□ 2.82
RSAD1-208	ENST00000515221	FBXO41	Q8TF61	875 aa		32.67	■■■□□ 2.82
RSAD1-208	ENST00000515221	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		32.67	■■■□□ 2.82
RSAD1-208	ENST00000515221	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		32.66	■■■□□ 2.82
RSAD1-208	ENST00000515221	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	32.66	■■■□□ 2.82
RSAD1-208	ENST00000515221	PTPRT	O14522	1441 aa		32.64	■■■□□ 2.82
RSAD1-208	ENST00000515221	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		32.64	■■■□□ 2.82
RSAD1-208	ENST00000515221	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		32.64	■■■□□ 2.82
RSAD1-208	ENST00000515221	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	32.63	■■■□□ 2.81
RSAD1-208	ENST00000515221	PZP	P20742	1482 aa		32.63	■■■□□ 2.81
RSAD1-208	ENST00000515221	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	32.62	■■■□□ 2.81
RSAD1-208	ENST00000515221	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		32.62	■■■□□ 2.81
RSAD1-208	ENST00000515221	DAPK1	P53355	1430 aa		32.62	■■■□□ 2.81
RSAD1-208	ENST00000515221	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	32.61	■■■□□ 2.81
RSAD1-208	ENST00000515221	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		32.61	■■■□□ 2.81
RSAD1-208	ENST00000515221	ABCC3	O15438	1527 aa		32.56	■■■□□ 2.8
RSAD1-208	ENST00000515221	CERK	Q8TCT0	537 aa		32.56	■■■□□ 2.8
RSAD1-208	ENST00000515221	KIF15	Q9NS87	1388 aa		32.56	■■■□□ 2.8
RSAD1-208	ENST00000515221	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		32.54	■■■□□ 2.8
RSAD1-208	ENST00000515221	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	32.54	■■■□□ 2.8
RSAD1-208	ENST00000515221	TNR	Q92752	1358 aa		32.54	■■■□□ 2.8
RSAD1-208	ENST00000515221	PLA2R1	Q13018	1463 aa		32.54	■■■□□ 2.8
RSAD1-208	ENST00000515221	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		32.53	■■■□□ 2.8
RSAD1-208	ENST00000515221	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		32.51	■■■□□ 2.79
RSAD1-208	ENST00000515221	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		32.51	■■■□□ 2.79
RSAD1-208	ENST00000515221	CEP152	O94986	1710 aa		32.46	■■■□□ 2.79
RSAD1-208	ENST00000515221	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	32.46	■■■□□ 2.79
RSAD1-208	ENST00000515221	PKD2	Q13563	968 aa		32.45	■■■□□ 2.79
RSAD1-208	ENST00000515221	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		32.45	■■■□□ 2.79
RSAD1-208	ENST00000515221	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		32.44	■■■□□ 2.78
RSAD1-208	ENST00000515221	DEPDC5	O75140	1603 aa		32.44	■■■□□ 2.78
RSAD1-208	ENST00000515221	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		32.44	■■■□□ 2.78
RSAD1-208	ENST00000515221	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		32.44	■■■□□ 2.78
RSAD1-208	ENST00000515221	ADGRL2	O95490	1459 aa		32.42	■■■□□ 2.78
RSAD1-208	ENST00000515221	NLRP1	Q9C000	1473 aa		32.42	■■■□□ 2.78
RSAD1-208	ENST00000515221	ERVK-7	P63135	1459 aa		32.39	■■■□□ 2.78
RSAD1-208	ENST00000515221	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	32.38	■■■□□ 2.77
RSAD1-208	ENST00000515221	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		32.35	■■■□□ 2.77
RSAD1-208	ENST00000515221	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	32.34	■■■□□ 2.77
RSAD1-208	ENST00000515221	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		32.33	■■■□□ 2.77
RSAD1-208	ENST00000515221	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		32.33	■■■□□ 2.77
RSAD1-208	ENST00000515221	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		32.32	■■■□□ 2.77
RSAD1-208	ENST00000515221	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	32.31	■■■□□ 2.76
RSAD1-208	ENST00000515221	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	32.3	■■■□□ 2.76
RSAD1-208	ENST00000515221	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	32.3	■■■□□ 2.76
RSAD1-208	ENST00000515221	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	32.3	■■■□□ 2.76
RSAD1-208	ENST00000515221	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		32.29	■■■□□ 2.76
RSAD1-208	ENST00000515221	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	32.27	■■■□□ 2.76
RSAD1-208	ENST00000515221	KANK1	Q14678	1352 aa		32.25	■■■□□ 2.75
RSAD1-208	ENST00000515221	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		32.23	■■■□□ 2.75
RSAD1-208	ENST00000515221	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		32.23	■■■□□ 2.75
RSAD1-208	ENST00000515221	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	32.23	■■■□□ 2.75
RSAD1-208	ENST00000515221	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		32.22	■■■□□ 2.75
RSAD1-208	ENST00000515221	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		32.22	■■■□□ 2.75
RSAD1-208	ENST00000515221	MED14	O60244	1454 aa		32.21	■■■□□ 2.75
RSAD1-208	ENST00000515221	ROCK1	Q13464	1354 aa		32.17	■■■□□ 2.74
RSAD1-208	ENST00000515221	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		32.15	■■■□□ 2.74
RSAD1-208	ENST00000515221	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	32.14	■■■□□ 2.74
RSAD1-208	ENST00000515221	NOS1	P29475	1434 aa		32.11	■■■□□ 2.73
RSAD1-208	ENST00000515221	PIK3C2B	O00750	1634 aa		32.11	■■■□□ 2.73
RSAD1-208	ENST00000515221	SYNM	O15061	1565 aa		32.11	■■■□□ 2.73
RSAD1-208	ENST00000515221	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		32.1	■■■□□ 2.73
RSAD1-208	ENST00000515221	IQGAP1	P46940	1657 aa		32.09	■■■□□ 2.73
RSAD1-208	ENST00000515221	UNC13B	O14795	1591 aa		32.09	■■■□□ 2.73
RSAD1-208	ENST00000515221	SLIT1	O75093	1534 aa		32.09	■■■□□ 2.73
RSAD1-208	ENST00000515221	IDI1	Q13907	227 aa		32.06	■■■□□ 2.72
RSAD1-208	ENST00000515221	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	32.05	■■■□□ 2.72
RSAD1-208	ENST00000515221	LTK	P29376	864 aa		32.04	■■■□□ 2.72
RSAD1-208	ENST00000515221	TET3	O43151	1660 aa		32.04	■■■□□ 2.72
RSAD1-208	ENST00000515221	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	32.03	■■■□□ 2.72
RSAD1-208	ENST00000515221	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	32.03	■■■□□ 2.72
RSAD1-208	ENST00000515221	CPS1	P31327	1500 aa		32.02	■■■□□ 2.72
RSAD1-208	ENST00000515221	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	32.01	■■■□□ 2.72
RSAD1-208	ENST00000515221	ITGAE	P38570	1179 aa		32.01	■■■□□ 2.71
RSAD1-208	ENST00000515221	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		31.99	■■■□□ 2.71
RSAD1-208	ENST00000515221	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		31.99	■■■□□ 2.71
RSAD1-208	ENST00000515221	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		31.98	■■■□□ 2.71
RSAD1-208	ENST00000515221	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		31.96	■■■□□ 2.71
RSAD1-208	ENST00000515221	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		31.96	■■■□□ 2.71
RSAD1-208	ENST00000515221	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		31.95	■■■□□ 2.71
RSAD1-208	ENST00000515221	ADGRB3	O60242	1522 aa		31.93	■■■□□ 2.7
RSAD1-208	ENST00000515221		E9PCH4	1651 aa		31.92	■■■□□ 2.7
RSAD1-208	ENST00000515221	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		31.91	■■■□□ 2.7
RSAD1-208	ENST00000515221	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		31.91	■■■□□ 2.7
RSAD1-208	ENST00000515221	EID1	Q9Y6B2	187 aa		31.9	■■■□□ 2.7
RSAD1-208	ENST00000515221	NUP155	O75694	1391 aa		31.87	■■■□□ 2.69
RSAD1-208	ENST00000515221	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		31.84	■■■□□ 2.69
RSAD1-208	ENST00000515221	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		31.84	■■■□□ 2.69
RSAD1-208	ENST00000515221	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		31.83	■■■□□ 2.69
RSAD1-208	ENST00000515221	ALK	Q9UM73	1620 aa		31.8	■■■□□ 2.68
RSAD1-208	ENST00000515221	ZFYVE9	O95405	1425 aa		31.79	■■■□□ 2.68
RSAD1-208	ENST00000515221	NAIP	Q13075	1403 aa		31.79	■■■□□ 2.68
RSAD1-208	ENST00000515221	TOM1	O60784	492 aa		31.74	■■■□□ 2.67
RSAD1-208	ENST00000515221	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	31.72	■■■□□ 2.67
RSAD1-208	ENST00000515221	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		31.71	■■■□□ 2.67
RSAD1-208	ENST00000515221	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		31.7	■■■□□ 2.67
RSAD1-208	ENST00000515221	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		31.68	■■■□□ 2.66

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms