RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497210.5

CTPS1-211, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 463 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-211ENST00000497210 GLI2P10070 1586 aa14.87□□□□□ -0.03
CTPS1-211ENST00000497210 CFAP74Q9C0B2 1584 aa14.87□□□□□ -0.03
CTPS1-211ENST00000497210 HAX1O00165 279 aa14.87□□□□□ -0.03
CTPS1-211ENST00000497210 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
CTPS1-211ENST00000497210 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CTPS1-211ENST00000497210 MIA2Q96PC5 1412 aa14.84□□□□□ -0.03
CTPS1-211ENST00000497210 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
CTPS1-211ENST00000497210 PHLDB1Q86UU1 1377 aa14.84□□□□□ -0.03
CTPS1-211ENST00000497210 FGD6Q6ZV73 1430 aa14.83□□□□□ -0.03
CTPS1-211ENST00000497210 ARHGAP5Q13017 1502 aa14.83□□□□□ -0.04
CTPS1-211ENST00000497210 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa14.83□□□□□ -0.04
CTPS1-211ENST00000497210 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
CTPS1-211ENST00000497210 PTPN23Q9H3S7 1636 aa14.82□□□□□ -0.04
CTPS1-211ENST00000497210 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
CTPS1-211ENST00000497210 CD44P16070 742 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
CTPS1-211ENST00000497210 KCNH8Q96L42 1107 aa14.81□□□□□ -0.04
CTPS1-211ENST00000497210 PCDHB8Q9UN66 801 aa14.81□□□□□ -0.04
CTPS1-211ENST00000497210 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa14.81□□□□□ -0.04
CTPS1-211ENST00000497210 STK24Q9Y6E0 443 aa14.81□□□□□ -0.04
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
CTPS1-211ENST00000497210 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa14.8□□□□□ -0.04
CTPS1-211ENST00000497210 KIF12Q96FN5 646 aa14.79□□□□□ -0.04
CTPS1-211ENST00000497210 KIF13AQ9H1H9 1805 aa14.79□□□□□ -0.04
CTPS1-211ENST00000497210 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
CTPS1-211ENST00000497210 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa14.78□□□□□ -0.04
CTPS1-211ENST00000497210 PLCH2O75038 1416 aa14.78□□□□□ -0.04
CTPS1-211ENST00000497210 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
CTPS1-211ENST00000497210 ZRANB1Q9UGI0 708 aa14.78□□□□□ -0.04
CTPS1-211ENST00000497210 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa14.77□□□□□ -0.04
CTPS1-211ENST00000497210 TEX14Q8IWB6 1497 aa14.77□□□□□ -0.04
CTPS1-211ENST00000497210 CD109Q6YHK3 1445 aa14.77□□□□□ -0.04
CTPS1-211ENST00000497210 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP14.77□□□□□ -0.04
CTPS1-211ENST00000497210 VSIG10Q8N0Z9 540 aa14.77□□□□□ -0.05
CTPS1-211ENST00000497210 MAP3K13O43283 966 aa14.76□□□□□ -0.05
CTPS1-211ENST00000497210 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
CTPS1-211ENST00000497210 FANCAO15360 1455 aa14.76□□□□□ -0.05
CTPS1-211ENST00000497210 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa14.74□□□□□ -0.05
CTPS1-211ENST00000497210 IFNL1Q8IU54 200 aa14.74□□□□□ -0.05
CTPS1-211ENST00000497210 ABCC1P33527 1531 aa14.74□□□□□ -0.05
CTPS1-211ENST00000497210 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CTPS1-211ENST00000497210 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CTPS1-211ENST00000497210 NEO1Q92859 1461 aa14.73□□□□□ -0.05
CTPS1-211ENST00000497210 CROCC2H7BZ55 1655 aa14.72□□□□□ -0.05
CTPS1-211ENST00000497210 FAM69CQ0P6D2 419 aa14.72□□□□□ -0.05
CTPS1-211ENST00000497210 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CTPS1-211ENST00000497210 ARHGEF5Q12774 1597 aa14.72□□□□□ -0.05
CTPS1-211ENST00000497210 C19orf67A6NJJ6 358 aa14.71□□□□□ -0.05
CTPS1-211ENST00000497210 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa14.71□□□□□ -0.05
CTPS1-211ENST00000497210 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa14.71□□□□□ -0.05
CTPS1-211ENST00000497210 SYCP2Q9BX26 1530 aa14.71□□□□□ -0.06
CTPS1-211ENST00000497210 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa14.7□□□□□ -0.06
CTPS1-211ENST00000497210 PSEN1P49768 467 aa14.7□□□□□ -0.06
CTPS1-211ENST00000497210 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CTPS1-211ENST00000497210 PHF12Q96QT6 1004 aa14.7□□□□□ -0.06
CTPS1-211ENST00000497210 ADGRL1O94910 1474 aa14.69□□□□□ -0.06
CTPS1-211ENST00000497210 TSPOAP1O95153 1857 aa14.69□□□□□ -0.06
CTPS1-211ENST00000497210 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CTPS1-211ENST00000497210 CCDC141Q6ZP82 1450 aa14.69□□□□□ -0.06
CTPS1-211ENST00000497210 SHANK2Q9UPX8 1470 aa14.69□□□□□ -0.06
CTPS1-211ENST00000497210 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa14.68□□□□□ -0.06
CTPS1-211ENST00000497210 ADGBQ8N7X0 1667 aa14.68□□□□□ -0.06
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CTPS1-211ENST00000497210 DAPK1P53355 1430 aa14.66□□□□□ -0.06
CTPS1-211ENST00000497210 AKNAQ7Z591 1439 aa14.66□□□□□ -0.06
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa14.65□□□□□ -0.06
CTPS1-211ENST00000497210 RSPH4AQ5TD94 716 aa14.63□□□□□ -0.07
CTPS1-211ENST00000497210 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CTPS1-211ENST00000497210 POGZQ7Z3K3 1410 aa14.63□□□□□ -0.07
CTPS1-211ENST00000497210 MAST1Q9Y2H9 1570 aa14.63□□□□□ -0.07
CTPS1-211ENST00000497210 MBD5Q9P267 1494 aa14.62□□□□□ -0.07
CTPS1-211ENST00000497210 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CTPS1-211ENST00000497210 PLXNC1O60486 1568 aa14.6□□□□□ -0.07
CTPS1-211ENST00000497210 KDM5CP41229 1560 aa14.6□□□□□ -0.07
CTPS1-211ENST00000497210 C9orf84Q5VXU9 1444 aa14.6□□□□□ -0.07
CTPS1-211ENST00000497210 SCAPERQ9BY12 1400 aa14.6□□□□□ -0.07
CTPS1-211ENST00000497210 RICTORQ6R327 1708 aa14.6□□□□□ -0.07
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CTPS1-211ENST00000497210 HECW2Q9P2P5 1572 aa14.6□□□□□ -0.07
CTPS1-211ENST00000497210 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CTPS1-211ENST00000497210 ABCC5O15440 1437 aa14.59□□□□□ -0.07
CTPS1-211ENST00000497210 GCC2Q8IWJ2 1684 aa14.59□□□□□ -0.07
CTPS1-211ENST00000497210 ADGRL2O95490 1459 aa14.59□□□□□ -0.07
CTPS1-211ENST00000497210 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa14.59□□□□□ -0.07
CTPS1-211ENST00000497210 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa14.58□□□□□ -0.08
CTPS1-211ENST00000497210 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa14.58□□□□□ -0.08
CTPS1-211ENST00000497210 ROCK1Q13464 1354 aa14.58□□□□□ -0.08
CTPS1-211ENST00000497210 ATP7AQ04656 1500 aa14.57□□□□□ -0.08
CTPS1-211ENST00000497210 TSPY4P0CV99 314 aa14.57□□□□□ -0.08
CTPS1-211ENST00000497210 TSPY10P0CW01 314 aa14.57□□□□□ -0.08
CTPS1-211ENST00000497210 ITGAEP38570 1179 aa14.56□□□□□ -0.08
CTPS1-211ENST00000497210 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa14.56□□□□□ -0.08
CTPS1-211ENST00000497210 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa14.56□□□□□ -0.08
CTPS1-211ENST00000497210 MS4A3Q96HJ5 214 aa14.55□□□□□ -0.08
CTPS1-211ENST00000497210 PCGF6Q9BYE7 350 aa14.55□□□□□ -0.08
CTPS1-211ENST00000497210 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa14.55□□□□□ -0.08
CTPS1-211ENST00000497210 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa14.55□□□□□ -0.08
CTPS1-211ENST00000497210 KDM6BO15054 1643 aa14.55□□□□□ -0.08
CTPS1-211ENST00000497210 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP14.54□□□□□ -0.08
CTPS1-211ENST00000497210 HFM1A2PYH4 1435 aa14.54□□□□□ -0.08
CTPS1-211ENST00000497210 MFRPQ9BY79 579 aa14.53□□□□□ -0.08
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