RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497210.5

CTPS1-211, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 463 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-211ENST00000497210 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
CTPS1-211ENST00000497210 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.33■■■□□ 2.13
CTPS1-211ENST00000497210 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
CTPS1-211ENST00000497210 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
CTPS1-211ENST00000497210 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.18■■□□□ 1.3
CTPS1-211ENST00000497210 NISCHQ9Y2I1 1504 aa22.68■■□□□ 1.22
CTPS1-211ENST00000497210 FOXD1Q16676 465 aa22.38■■□□□ 1.17
CTPS1-211ENST00000497210 PPP6R1Q9UPN7 881 aa21.89■■□□□ 1.09
CTPS1-211ENST00000497210 ADRA2BP18089 450 aa21.86■■□□□ 1.09
CTPS1-211ENST00000497210 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
CTPS1-211ENST00000497210 POTEDQ86YR6 584 aa21.14■□□□□ 0.97
CTPS1-211ENST00000497210 MSH5O43196 834 aa20.52■□□□□ 0.88
CTPS1-211ENST00000497210 KCNA4P22459 653 aa20.5■□□□□ 0.87
CTPS1-211ENST00000497210 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa20.47■□□□□ 0.87
CTPS1-211ENST00000497210 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa20.11■□□□□ 0.81
CTPS1-211ENST00000497210 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
CTPS1-211ENST00000497210 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
CTPS1-211ENST00000497210 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa19.8■□□□□ 0.76
CTPS1-211ENST00000497210 NPM3O75607 178 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
CTPS1-211ENST00000497210 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
CTPS1-211ENST00000497210 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
CTPS1-211ENST00000497210 EHMT2Q96KQ7 1210 aa19.49■□□□□ 0.71
CTPS1-211ENST00000497210 DMRT2Q9Y5R5 561 aa19.37■□□□□ 0.69
CTPS1-211ENST00000497210 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP19.33■□□□□ 0.68
CTPS1-211ENST00000497210 DNAJC5BQ9UF47 199 aa19.21■□□□□ 0.67
CTPS1-211ENST00000497210 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
CTPS1-211ENST00000497210 CSRNP3Q8WYN3 585 aa19.12■□□□□ 0.65
CTPS1-211ENST00000497210 ABCC9O60706 1549 aa19.1■□□□□ 0.65
CTPS1-211ENST00000497210 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP19.03■□□□□ 0.64
CTPS1-211ENST00000497210 ZBTB22O15209 634 aa18.91■□□□□ 0.62
CTPS1-211ENST00000497210 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa18.86■□□□□ 0.61
CTPS1-211ENST00000497210 MYO15BQ96JP2 1530 aa18.79■□□□□ 0.6
CTPS1-211ENST00000497210 NACADO15069 1562 aa18.75■□□□□ 0.59
CTPS1-211ENST00000497210 FOXD4L1Q9NU39 408 aa18.74■□□□□ 0.59
CTPS1-211ENST00000497210 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa18.68■□□□□ 0.58
CTPS1-211ENST00000497210 DCAF8L2P0C7V8 631 aa18.65■□□□□ 0.58
CTPS1-211ENST00000497210 SLC4A2P04920 1241 aa18.59■□□□□ 0.57
CTPS1-211ENST00000497210 DCAF8L1A6NGE4 600 aa18.43■□□□□ 0.54
CTPS1-211ENST00000497210 SCRIBQ14160 1630 aa18.31■□□□□ 0.52
CTPS1-211ENST00000497210 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
CTPS1-211ENST00000497210 UNC13AQ9UPW8 1703 aa18.21■□□□□ 0.51
CTPS1-211ENST00000497210 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP18.18■□□□□ 0.56e-6■□□□□ 11
CTPS1-211ENST00000497210 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
CTPS1-211ENST00000497210 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa18.09■□□□□ 0.49
CTPS1-211ENST00000497210 ATXN8OSP0DMR3 200 aa18.05■□□□□ 0.48
CTPS1-211ENST00000497210 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
CTPS1-211ENST00000497210 BICRAQ9NZM4 1560 aa17.99■□□□□ 0.47
CTPS1-211ENST00000497210 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
CTPS1-211ENST00000497210 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
CTPS1-211ENST00000497210 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
CTPS1-211ENST00000497210 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP17.82■□□□□ 0.44
CTPS1-211ENST00000497210 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
CTPS1-211ENST00000497210 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP17.63■□□□□ 0.41
CTPS1-211ENST00000497210 RNF39Q9H2S5 420 aa17.6■□□□□ 0.41
CTPS1-211ENST00000497210 APLP2Q06481 763 aa17.56■□□□□ 0.4
CTPS1-211ENST00000497210 SMARCA4P51532 1647 aa17.55■□□□□ 0.4
CTPS1-211ENST00000497210 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
CTPS1-211ENST00000497210 CECR2Q9BXF3 1484 aa17.53■□□□□ 0.4
CTPS1-211ENST00000497210 MROH2BQ7Z745 1585 aa17.45■□□□□ 0.38
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
CTPS1-211ENST00000497210 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.38
CTPS1-211ENST00000497210 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
CTPS1-211ENST00000497210 SMARCA2P51531 1590 aa17.39■□□□□ 0.37
CTPS1-211ENST00000497210 PEG3Q9GZU2 1588 aa17.39■□□□□ 0.37
CTPS1-211ENST00000497210 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
CTPS1-211ENST00000497210 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa17.35■□□□□ 0.37
CTPS1-211ENST00000497210 WIZO95785 1651 aa17.31■□□□□ 0.36
CTPS1-211ENST00000497210 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa17.3■□□□□ 0.36
CTPS1-211ENST00000497210 HMGXB3Q12766 1538 aa17.27■□□□□ 0.36
CTPS1-211ENST00000497210 TRHP20396 242 aaPredicted RBP17.24■□□□□ 0.35
CTPS1-211ENST00000497210 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
CTPS1-211ENST00000497210 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
CTPS1-211ENST00000497210 CAPN15O75808 1086 aa17.22■□□□□ 0.35
CTPS1-211ENST00000497210 FKBP8Q14318 412 aa17.22■□□□□ 0.35
CTPS1-211ENST00000497210 NCAPD3P42695 1498 aa17.22■□□□□ 0.35
CTPS1-211ENST00000497210 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.35
CTPS1-211ENST00000497210 POLA2Q14181 598 aa17.08■□□□□ 0.32
CTPS1-211ENST00000497210 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
CTPS1-211ENST00000497210 ABCB7O75027 752 aa16.95■□□□□ 0.3
CTPS1-211ENST00000497210 FBLN2P98095 1184 aa16.92■□□□□ 0.3
CTPS1-211ENST00000497210 CCDC88BA6NC98 1476 aa16.92■□□□□ 0.3
CTPS1-211ENST00000497210 DSG3P32926 999 aa16.89■□□□□ 0.29
CTPS1-211ENST00000497210 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
CTPS1-211ENST00000497210 PRDM2Q13029 1718 aa16.8■□□□□ 0.28
CTPS1-211ENST00000497210 SPDYE4A6NLX3 237 aa16.8■□□□□ 0.28
CTPS1-211ENST00000497210 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa16.79■□□□□ 0.28
CTPS1-211ENST00000497210 CFTRP13569 1480 aa16.74■□□□□ 0.27
CTPS1-211ENST00000497210 CADPSQ9ULU8 1353 aa16.73■□□□□ 0.27
CTPS1-211ENST00000497210 PROM2Q8N271 834 aa16.66■□□□□ 0.26
CTPS1-211ENST00000497210 PDS5BQ9NTI5 1447 aa16.62■□□□□ 0.25
CTPS1-211ENST00000497210 NESP48681 1621 aa16.62■□□□□ 0.25
CTPS1-211ENST00000497210 FANCD2Q9BXW9 1451 aa16.58■□□□□ 0.24
CTPS1-211ENST00000497210 CEP164Q9UPV0 1460 aa16.57■□□□□ 0.24
CTPS1-211ENST00000497210 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa16.55■□□□□ 0.24
CTPS1-211ENST00000497210 ERCC6Q03468 1493 aa16.53■□□□□ 0.24
CTPS1-211ENST00000497210 OSCARQ8IYS5 282 aa16.51■□□□□ 0.23
CTPS1-211ENST00000497210 FBXO3Q9UK99 471 aa16.48■□□□□ 0.23
CTPS1-211ENST00000497210 POTEHQ6S545 545 aa16.47■□□□□ 0.23
CTPS1-211ENST00000497210 ABCC8Q09428 1581 aa16.46■□□□□ 0.23
CTPS1-211ENST00000497210 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
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