RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-213ENST00000496055 PKD2Q13563 968 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-213ENST00000496055 ZMYND15Q9H091 742 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-213ENST00000496055 LMTK3Q96Q04 1460 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-213ENST00000496055 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-213ENST00000496055 PLCB2Q00722 1185 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-213ENST00000496055 GGT6Q6P531 493 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-213ENST00000496055 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-213ENST00000496055 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-213ENST00000496055 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-213ENST00000496055 MYO5CQ9NQX4 1742 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGGTB-213ENST00000496055 MLH3Q9UHC1 1453 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGGTB-213ENST00000496055 PTPRTO14522 1441 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGGTB-213ENST00000496055 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RABGGTB-213ENST00000496055 TTC37Q6PGP7 1564 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGGTB-213ENST00000496055 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGGTB-213ENST00000496055 UBAP1LF5GYI3 381 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-213ENST00000496055 IGSF3O75054 1194 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-213ENST00000496055 FYCO1Q9BQS8 1478 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-213ENST00000496055 TOM1O60784 492 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-213ENST00000496055 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-213ENST00000496055 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-213ENST00000496055 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-213ENST00000496055 RICTORQ6R327 1708 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-213ENST00000496055 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-213ENST00000496055 NPATQ14207 1427 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-213ENST00000496055 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-213ENST00000496055 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa6.46□□□□□ -1.37
RABGGTB-213ENST00000496055 AGLP35573 1532 aa6.46□□□□□ -1.37
RABGGTB-213ENST00000496055 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-213ENST00000496055 STAG3Q9UJ98 1225 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-213ENST00000496055 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-213ENST00000496055 ANKLE2Q86XL3 938 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-213ENST00000496055 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-213ENST00000496055 ZMYM3Q14202 1370 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-213ENST00000496055 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-213ENST00000496055 PREX1Q8TCU6 1659 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-213ENST00000496055 KIF3BO15066 747 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-213ENST00000496055 A2MP01023 1474 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-213ENST00000496055 REREQ9P2R6 1566 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-213ENST00000496055 IQSEC2Q5JU85 1478 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-213ENST00000496055 CFAP44Q96MT7 982 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-213ENST00000496055 KDM5CP41229 1560 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-213ENST00000496055 EID1Q9Y6B2 187 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-213ENST00000496055 ABCC1P33527 1531 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-213ENST00000496055 SOCS7O14512 581 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-213ENST00000496055 POLR3GLQ9BT43 218 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-213ENST00000496055 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-213ENST00000496055 KANK1Q14678 1352 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-213ENST00000496055 TNRQ92752 1358 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-213ENST00000496055 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-213ENST00000496055 HDGFP51858 240 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-213ENST00000496055 NCOA1Q15788 1441 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-213ENST00000496055 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-213ENST00000496055 PREX2Q70Z35 1606 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-213ENST00000496055 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-213ENST00000496055 PIP4K2BP78356 416 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-213ENST00000496055 VSIG10Q8N0Z9 540 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-213ENST00000496055 ATP7AQ04656 1500 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-213ENST00000496055 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-213ENST00000496055 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM135AQ9P2D6 1515 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-213ENST00000496055 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa6.4□□□□□ -1.39
RABGGTB-213ENST00000496055 SYCP2Q9BX26 1530 aa6.4□□□□□ -1.39
RABGGTB-213ENST00000496055 PLA2R1Q13018 1463 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-213ENST00000496055 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-213ENST00000496055 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-213ENST00000496055 PTPRKQ15262 1439 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC141Q6ZP82 1450 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-213ENST00000496055 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-213ENST00000496055 CEP162Q5TB80 1403 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-213ENST00000496055 A2ML1A8K2U0 1454 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-213ENST00000496055 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-213ENST00000496055 ITSN2Q9NZM3 1697 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-213ENST00000496055 PCGF6Q9BYE7 350 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-213ENST00000496055 ABCA6Q8N139 1617 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-213ENST00000496055 NLRP1Q9C000 1473 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-213ENST00000496055 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-213ENST00000496055 CPS1P31327 1500 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-213ENST00000496055 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP6.36□□□□□ -1.399e-8■□□□□ 10.2
RABGGTB-213ENST00000496055 MROH2AA6NES4 1674 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-213ENST00000496055 BRPF3Q9ULD4 1205 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-213ENST00000496055 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-213ENST00000496055 MIA2Q96PC5 1412 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-213ENST00000496055 TXNDC2Q86VQ3 553 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-213ENST00000496055 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-213ENST00000496055 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-213ENST00000496055 C3P01024 1663 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-213ENST00000496055 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-213ENST00000496055 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-213ENST00000496055 MYOM3Q5VTT5 1437 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-213ENST00000496055 KDM5DQ9BY66 1539 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-213ENST00000496055 NCOA2Q15596 1464 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-213ENST00000496055 ADGBQ8N7X0 1667 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-213ENST00000496055 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-213ENST00000496055 PZPP20742 1482 aa6.33□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms