Protein–RNA interactions for Protein: Q9P287

BCCIP, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCCIPQ9P287 GPI-212ENST00000589985 1516 ntTSL 320.07■□□□□ 0.81e-26■■■■■ 134.6
BCCIPQ9P287 GPI-204ENST00000586392 1706 ntTSL 215.44■□□□□ 0.061e-45■■■■■ 84.9
BCCIPQ9P287 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.614e-7■■■■■ 68.6
BCCIPQ9P287 GPI-208ENST00000588991 2021 ntTSL 221.62■■□□□ 1.054e-7■■■■■ 68.6
BCCIPQ9P287 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.224e-7■■■■■ 68.6
BCCIPQ9P287 GPI-202ENST00000415930 4000 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.044e-7■■■■■ 68.6
BCCIPQ9P287 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.067e-7■■■■■ 59.6
BCCIPQ9P287 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.977e-7■■■■■ 59.6
BCCIPQ9P287 PPFIA1-222ENST00000532504 5159 ntTSL 1 (best)17.24■□□□□ 0.357e-7■■■■■ 59.6
BCCIPQ9P287 PPFIA1-225ENST00000638133 814 ntTSL 315.57■□□□□ 0.087e-7■■■■■ 59.6
BCCIPQ9P287 PPFIA1-219ENST00000531657 3036 ntTSL 210.47□□□□□ -0.737e-7■■■■■ 59.6
BCCIPQ9P287 PPFIA1-206ENST00000526262 4537 ntTSL 1 (best)9.57□□□□□ -0.887e-7■■■■■ 59.6
BCCIPQ9P287 PPFIA1-215ENST00000530548 3774 ntTSL 28.54□□□□□ -1.047e-7■■■■■ 59.6
BCCIPQ9P287 PPFIA1-204ENST00000525922 358 ntTSL 38.18□□□□□ -1.17e-7■■■■■ 59.6
BCCIPQ9P287 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.871e-14■■■■■ 57
BCCIPQ9P287 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.481e-14■■■■■ 57
BCCIPQ9P287 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.341e-14■■■■■ 57
BCCIPQ9P287 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.211e-14■■■■■ 57
BCCIPQ9P287 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.421e-14■■■■■ 57
BCCIPQ9P287 RALGAPA1-206ENST00000554259 3354 ntTSL 52.63□□□□□ -1.991e-14■■■■■ 57
BCCIPQ9P287 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.057e-11■■■■■ 48.1
BCCIPQ9P287 SEC14L1-204ENST00000436233 5295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.133e-9■■■■■ 41.4
BCCIPQ9P287 SEC14L1-202ENST00000430767 5283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.193e-9■■■■■ 41.4
BCCIPQ9P287 SEC14L1-201ENST00000392476 2957 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.543e-9■■■■■ 41.4
BCCIPQ9P287 SEC14L1-205ENST00000443798 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.673e-9■■■■■ 41.4
BCCIPQ9P287 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.224e-12■■■■■ 38.6
BCCIPQ9P287 VAPB-204ENST00000475243 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.374e-12■■■■■ 38.6
BCCIPQ9P287 VAPB-201ENST00000265619 3596 ntTSL 210.66□□□□□ -0.74e-12■■■■■ 38.6
BCCIPQ9P287 VAPB-206ENST00000520497 937 ntTSL 28.61□□□□□ -1.034e-12■■■■■ 38.6
BCCIPQ9P287 CUL4A-208ENST00000474116 866 ntTSL 218.59■□□□□ 0.578e-7■■■■■ 38.5
BCCIPQ9P287 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.442e-7■■■■■ 37.5
BCCIPQ9P287 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.122e-7■■■■■ 37.5
BCCIPQ9P287 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.542e-7■■■■■ 37.2
BCCIPQ9P287 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.222e-7■■■■■ 37.2
BCCIPQ9P287 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.047e-7■■■■■ 36.2
BCCIPQ9P287 CUL4A-211ENST00000498562 790 ntTSL 327.31■■□□□ 1.967e-7■■■■■ 36.2
BCCIPQ9P287 CUL4A-205ENST00000463426 893 ntTSL 326.54■■□□□ 1.847e-7■■■■■ 36.2
BCCIPQ9P287 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.467e-7■■■■■ 36.2
BCCIPQ9P287 CUL4A-210ENST00000494985 292 ntTSL 523.78■■□□□ 1.47e-7■■■■■ 36.2
BCCIPQ9P287 CUL4A-203ENST00000375441 4037 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.067e-7■■■■■ 36.2
BCCIPQ9P287 CUL4A-204ENST00000451881 3724 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.147e-7■■■■■ 36.2
BCCIPQ9P287 CUL4A-212ENST00000617546 5666 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.537e-7■■■■■ 36.2
BCCIPQ9P287 CUL4A-201ENST00000326335 3705 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.557e-7■■■■■ 36.2
BCCIPQ9P287 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.12e-11■■■■■ 36
BCCIPQ9P287 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.982e-11■■■■■ 36
BCCIPQ9P287 KANSL1-225ENST00000639356 1717 ntTSL 519.42■□□□□ 0.72e-11■■■■■ 36
BCCIPQ9P287 KANSL1-223ENST00000639150 1815 ntTSL 517.33■□□□□ 0.362e-11■■■■■ 36
BCCIPQ9P287 KANSL1-209ENST00000574655 1681 ntTSL 516.64■□□□□ 0.252e-11■■■■■ 36
BCCIPQ9P287 KANSL1-222ENST00000639099 1724 ntTSL 516.53■□□□□ 0.242e-11■■■■■ 36
BCCIPQ9P287 KANSL1-203ENST00000571698 2276 ntTSL 516.47■□□□□ 0.232e-11■■■■■ 36
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BCCIPQ9P287 KANSL1-229ENST00000639531 2731 ntTSL 513.61□□□□□ -0.232e-11■■■■■ 36
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BCCIPQ9P287 KANSL1-201ENST00000262419 5309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.412e-11■■■■■ 36
BCCIPQ9P287 KANSL1-217ENST00000638269 3365 ntTSL 512.47□□□□□ -0.412e-11■■■■■ 36
BCCIPQ9P287 KANSL1-226ENST00000639375 3392 ntTSL 512.14□□□□□ -0.472e-11■■■■■ 36
BCCIPQ9P287 KANSL1-205ENST00000572904 4973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.712e-11■■■■■ 36
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BCCIPQ9P287 ORC4-206ENST00000461711 528 ntTSL 418.22■□□□□ 0.512e-7■■■■■ 35.6
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BCCIPQ9P287 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.592e-7■■■■■ 35.6
BCCIPQ9P287 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.622e-7■■■■■ 35.6
BCCIPQ9P287 ORC4-213ENST00000496670 645 ntTSL 53.24□□□□□ -1.892e-7■■■■■ 35.6
BCCIPQ9P287 ORC4-203ENST00000416719 571 ntTSL 32.94□□□□□ -1.942e-7■■■■■ 35.6
BCCIPQ9P287 PWAR5-201ENST00000624480 3180 ntBASIC11.1□□□□□ -0.634e-20■■■■■ 35.5
BCCIPQ9P287 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC5.88□□□□□ -1.474e-20■■■■■ 35.5
BCCIPQ9P287 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.34e-11■■■■■ 35.4
BCCIPQ9P287 PRKCZ-201ENST00000378567 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)23.82■■□□□ 1.41e-6■■■■■ 35.1
BCCIPQ9P287 PRKCZ-208ENST00000468310 690 ntTSL 522.67■■□□□ 1.221e-6■■■■■ 35.1
BCCIPQ9P287 PRKCZ-210ENST00000470596 788 ntTSL 221.91■■□□□ 1.11e-6■■■■■ 35.1
BCCIPQ9P287 PRKCZ-220ENST00000486681 966 ntTSL 319.36■□□□□ 0.691e-6■■■■■ 35.1
BCCIPQ9P287 PRKCZ-218ENST00000482686 614 ntTSL 319.36■□□□□ 0.691e-6■■■■■ 35.1
BCCIPQ9P287 PRKCZ-205ENST00000461465 480 ntTSL 417.62■□□□□ 0.411e-6■■■■■ 35.1
BCCIPQ9P287 PRKCZ-204ENST00000461106 1916 ntTSL 217.05■□□□□ 0.321e-6■■■■■ 35.1
BCCIPQ9P287 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.271e-6■■■■■ 35.1
BCCIPQ9P287 PRKCZ-221ENST00000495347 698 ntTSL 416.47■□□□□ 0.231e-6■■■■■ 35.1
BCCIPQ9P287 PRKCZ-222ENST00000496325 563 ntTSL 416.31■□□□□ 0.21e-6■■■■■ 35.1
BCCIPQ9P287 PRKCZ-211ENST00000470986 706 ntTSL 212.88□□□□□ -0.351e-6■■■■■ 35.1
BCCIPQ9P287 PRKCZ-207ENST00000466651 425 ntTSL 512.17□□□□□ -0.461e-6■■■■■ 35.1
BCCIPQ9P287 PRKCZ-209ENST00000470511 567 ntTSL 410.55□□□□□ -0.721e-6■■■■■ 35.1
BCCIPQ9P287 PRKCZ-217ENST00000481140 713 ntTSL 48.57□□□□□ -1.041e-6■■■■■ 35.1
BCCIPQ9P287 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.978e-8■■■■■ 34.1
BCCIPQ9P287 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.918e-8■■■■■ 34.1
BCCIPQ9P287 FOXN3-204ENST00000553840 555 ntTSL 418.57■□□□□ 0.568e-8■■■■■ 34.1
BCCIPQ9P287 FOXN3-219ENST00000615335 2421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.058e-8■■■■■ 34.1
BCCIPQ9P287 FOXN3-201ENST00000261302 2542 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.028e-8■■■■■ 34.1
BCCIPQ9P287 FOXN3-202ENST00000345097 7832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.778e-8■■■■■ 34.1
BCCIPQ9P287 FOXN3-218ENST00000557718 398 ntTSL 55.86□□□□□ -1.478e-8■■■■■ 34.1
BCCIPQ9P287 FOXN3-206ENST00000554005 450 ntTSL 55.77□□□□□ -1.498e-8■■■■■ 34.1
BCCIPQ9P287 FOXN3-210ENST00000555658 648 ntTSL 35.25□□□□□ -1.578e-8■■■■■ 34.1
BCCIPQ9P287 FOXN3-213ENST00000556916 467 ntTSL 34.35□□□□□ -1.718e-8■■■■■ 34.1
BCCIPQ9P287 FOXN3-203ENST00000553353 366 ntTSL 34.07□□□□□ -1.768e-8■■■■■ 34.1
BCCIPQ9P287 DOCK1-206ENST00000623213 5761 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.727e-7■■■■■ 34
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