RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493607.1

SERBP1-208, Transcript of SERPINE1 mRNA binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SERBP1, Length 615 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERBP1-208ENST00000493607 KDM5DQ9BY66 1539 aa36.25■■■■□ 3.39
SERBP1-208ENST00000493607 DAPK1P53355 1430 aa36.25■■■■□ 3.39
SERBP1-208ENST00000493607 DUOX2Q9NRD8 1548 aa36.24■■■■□ 3.39
SERBP1-208ENST00000493607 PTPRKQ15262 1439 aa36.23■■■■□ 3.39
SERBP1-208ENST00000493607 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP36.17■■■■□ 3.38
SERBP1-208ENST00000493607 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP36.16■■■■□ 3.38
SERBP1-208ENST00000493607 STRCQ7RTU9 1775 aa36.16■■■■□ 3.38
SERBP1-208ENST00000493607 MYO3AQ8NEV4 1616 aa36.14■■■■□ 3.38
SERBP1-208ENST00000493607 ERBINQ96RT1 1412 aa36.14■■■■□ 3.38
SERBP1-208ENST00000493607 PZPP20742 1482 aa36.13■■■■□ 3.37
SERBP1-208ENST00000493607 KIF15Q9NS87 1388 aa36.13■■■■□ 3.37
SERBP1-208ENST00000493607 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa36.12■■■■□ 3.37
SERBP1-208ENST00000493607 MROH1Q8NDA8 1641 aa36.11■■■■□ 3.37
SERBP1-208ENST00000493607 ADGRL2O95490 1459 aa36.07■■■■□ 3.37
SERBP1-208ENST00000493607 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa36.07■■■■□ 3.36
SERBP1-208ENST00000493607 DMRT2Q9Y5R5 561 aa36.07■■■■□ 3.36
SERBP1-208ENST00000493607 ABCC3O15438 1527 aa36.06■■■■□ 3.36
SERBP1-208ENST00000493607 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP36.06■■■■□ 3.36
SERBP1-208ENST00000493607 NCOA1Q15788 1441 aa36.04■■■■□ 3.36
SERBP1-208ENST00000493607 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP36.03■■■■□ 3.36
SERBP1-208ENST00000493607 DEPDC5O75140 1603 aa36.03■■■■□ 3.36
SERBP1-208ENST00000493607 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa36.01■■■■□ 3.36
SERBP1-208ENST00000493607 PTPRTO14522 1441 aa36■■■■□ 3.35
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SERBP1-208ENST00000493607 A2ML1A8K2U0 1454 aa35.99■■■■□ 3.35
SERBP1-208ENST00000493607 PLA2R1Q13018 1463 aa35.99■■■■□ 3.35
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SERBP1-208ENST00000493607 TNRQ92752 1358 aa35.97■■■■□ 3.35
SERBP1-208ENST00000493607 CEP152O94986 1710 aa35.97■■■■□ 3.35
SERBP1-208ENST00000493607 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP35.94■■■■□ 3.34
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SERBP1-208ENST00000493607 CHIC2Q9UKJ5 165 aa35.92■■■■□ 3.34
SERBP1-208ENST00000493607 NLRP1Q9C000 1473 aa35.92■■■■□ 3.34
SERBP1-208ENST00000493607 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa35.91■■■■□ 3.34
SERBP1-208ENST00000493607 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP35.87■■■■□ 3.33
SERBP1-208ENST00000493607 VWDEQ8N2E2 1590 aa35.87■■■■□ 3.33
SERBP1-208ENST00000493607 LMTK2Q8IWU2 1503 aa35.85■■■■□ 3.33
SERBP1-208ENST00000493607 PKD2Q13563 968 aa35.85■■■■□ 3.33
SERBP1-208ENST00000493607 ERVK-7P63135 1459 aa35.85■■■■□ 3.33
SERBP1-208ENST00000493607 KANK1Q14678 1352 aa35.84■■■■□ 3.33
SERBP1-208ENST00000493607 ROCK1Q13464 1354 aa35.83■■■■□ 3.33
SERBP1-208ENST00000493607 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa35.82■■■■□ 3.32
SERBP1-208ENST00000493607 FBXO41Q8TF61 875 aa35.78■■■■□ 3.32
SERBP1-208ENST00000493607 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP35.77■■■■□ 3.32
SERBP1-208ENST00000493607 UGGT1Q9NYU2 1555 aa35.76■■■■□ 3.32
SERBP1-208ENST00000493607 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP35.76■■■■□ 3.31
SERBP1-208ENST00000493607 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP35.73■■■■□ 3.31
SERBP1-208ENST00000493607 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP35.73■■■■□ 3.31
SERBP1-208ENST00000493607 CERKQ8TCT0 537 aa35.72■■■■□ 3.31
SERBP1-208ENST00000493607 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP35.72■■■■□ 3.312e-9■□□□□ 11.3
SERBP1-208ENST00000493607 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa35.72■■■■□ 3.31
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SERBP1-208ENST00000493607 EFCAB6Q5THR3 1501 aa35.68■■■■□ 3.3
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SERBP1-208ENST00000493607 UBR1Q8IWV7 1749 aa35.66■■■■□ 3.3
SERBP1-208ENST00000493607 NEURL4Q96JN8 1562 aa35.65■■■■□ 3.3
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SERBP1-208ENST00000493607 TET3O43151 1660 aa35.62■■■■□ 3.29
SERBP1-208ENST00000493607 MED14O60244 1454 aa35.61■■■■□ 3.29
SERBP1-208ENST00000493607 ANKLE2Q86XL3 938 aa35.61■■■■□ 3.29
SERBP1-208ENST00000493607 IQSEC2Q5JU85 1478 aa35.6■■■■□ 3.29
SERBP1-208ENST00000493607 GCC2Q8IWJ2 1684 aa35.59■■■■□ 3.29
SERBP1-208ENST00000493607 NOS1P29475 1434 aa35.58■■■■□ 3.29
SERBP1-208ENST00000493607 SYNMO15061 1565 aa35.54■■■■□ 3.28
SERBP1-208ENST00000493607 PIK3C2BO00750 1634 aa35.54■■■■□ 3.28
SERBP1-208ENST00000493607 IQGAP3Q86VI3 1631 aa35.54■■■■□ 3.28
SERBP1-208ENST00000493607 SLIT1O75093 1534 aa35.53■■■■□ 3.28
SERBP1-208ENST00000493607 ARHGAP23Q9P227 1491 aa35.52■■■■□ 3.28
SERBP1-208ENST00000493607 ITGAEP38570 1179 aa35.5■■■■□ 3.27
SERBP1-208ENST00000493607 IQGAP1P46940 1657 aa35.49■■■■□ 3.27
SERBP1-208ENST00000493607 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP35.49■■■■□ 3.27
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SERBP1-208ENST00000493607 E9PCH4 1651 aa35.43■■■■□ 3.26
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SERBP1-208ENST00000493607 NUP155O75694 1391 aa35.38■■■■□ 3.26
SERBP1-208ENST00000493607 TMEM2Q9UHN6 1383 aa35.38■■■■□ 3.26
SERBP1-208ENST00000493607 CPS1P31327 1500 aa35.38■■■■□ 3.25
SERBP1-208ENST00000493607 NAIPQ13075 1403 aa35.37■■■■□ 3.25
SERBP1-208ENST00000493607 STAG3Q9UJ98 1225 aa35.34■■■■□ 3.25
SERBP1-208ENST00000493607 EID1Q9Y6B2 187 aa35.33■■■■□ 3.25
SERBP1-208ENST00000493607 HFM1A2PYH4 1435 aa35.32■■■■□ 3.25
SERBP1-208ENST00000493607 LTKP29376 864 aa35.32■■■■□ 3.24
SERBP1-208ENST00000493607 TXNDC2Q86VQ3 553 aa35.32■■■■□ 3.24
SERBP1-208ENST00000493607 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa35.27■■■■□ 3.24
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SERBP1-208ENST00000493607 STRCP1A6NGW2 1772 aa35.2■■■■□ 3.23
SERBP1-208ENST00000493607 ZFYVE9O95405 1425 aa35.18■■■■□ 3.22
SERBP1-208ENST00000493607 HDGFP51858 240 aaKnown RBP35.15■■■■□ 3.22
SERBP1-208ENST00000493607 RIMS2Q9UQ26 1411 aa35.09■■■■□ 3.21
SERBP1-208ENST00000493607 LRRC7Q96NW7 1537 aa35.09■■■■□ 3.21
SERBP1-208ENST00000493607 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa35.08■■■■□ 3.21
SERBP1-208ENST00000493607 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP35.07■■■■□ 3.2
SERBP1-208ENST00000493607 TRPM2O94759 1503 aa35.06■■■■□ 3.2
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