RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493607.1

SERBP1-208, Transcript of SERPINE1 mRNA binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SERBP1, Length 615 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERBP1-208ENST00000493607 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.54■■■■■ 6.8
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SERBP1-208ENST00000493607 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.56■■■■■ 5.36
SERBP1-208ENST00000493607 NACADO15069 1562 aa48.43■■■■■ 5.34
SERBP1-208ENST00000493607 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.12■■■■■ 5.29
SERBP1-208ENST00000493607 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.95■■■■■ 5.27
SERBP1-208ENST00000493607 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.85■■■■■ 5.25
SERBP1-208ENST00000493607 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.72■■■■■ 5.23
SERBP1-208ENST00000493607 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.46■■■■■ 5.19
SERBP1-208ENST00000493607 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.07■■■■■ 5.13
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SERBP1-208ENST00000493607 SCRIBQ14160 1630 aa46.69■■■■■ 5.07
SERBP1-208ENST00000493607 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.69■■■■■ 5.06
SERBP1-208ENST00000493607 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.86■■■■■ 4.93
SERBP1-208ENST00000493607 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.75■■■■■ 4.91
SERBP1-208ENST00000493607 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.48■■■■■ 4.87
SERBP1-208ENST00000493607 SMARCA4P51532 1647 aa44.73■■■■■ 4.75
SERBP1-208ENST00000493607 NCAPD3P42695 1498 aa44.68■■■■■ 4.74
SERBP1-208ENST00000493607 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.65■■■■■ 4.74
SERBP1-208ENST00000493607 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.58■■■■■ 4.73
SERBP1-208ENST00000493607 SMARCA2P51531 1590 aa44.56■■■■■ 4.72
SERBP1-208ENST00000493607 HMGXB3Q12766 1538 aa44.44■■■■■ 4.7
SERBP1-208ENST00000493607 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.41■■■■■ 4.7
SERBP1-208ENST00000493607 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.26■■■■■ 4.68
SERBP1-208ENST00000493607 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.16■■■■■ 4.66
SERBP1-208ENST00000493607 WIZO95785 1651 aa43.77■■■■■ 4.6
SERBP1-208ENST00000493607 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.63■■■■■ 4.57
SERBP1-208ENST00000493607 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.58■■■■■ 4.57
SERBP1-208ENST00000493607 NESP48681 1621 aa43.57■■■■■ 4.57
SERBP1-208ENST00000493607 ERCC6Q03468 1493 aa43.57■■■■■ 4.56
SERBP1-208ENST00000493607 CUX2O14529 1486 aa43.4■■■■■ 4.54
SERBP1-208ENST00000493607 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.34■■■■■ 4.53
SERBP1-208ENST00000493607 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.29■■■■■ 4.52
SERBP1-208ENST00000493607 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.24■■■■■ 4.51
SERBP1-208ENST00000493607 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.14■■■■■ 4.5
SERBP1-208ENST00000493607 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.13■■■■■ 4.5
SERBP1-208ENST00000493607 CFTRP13569 1480 aa42.99■■■■■ 4.47
SERBP1-208ENST00000493607 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.81■■■■■ 4.44
SERBP1-208ENST00000493607 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.78■■■■■ 4.44
SERBP1-208ENST00000493607 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.77■■■■■ 4.44
SERBP1-208ENST00000493607 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.76■■■■■ 4.44
SERBP1-208ENST00000493607 WDR62O43379 1518 aa42.72■■■■■ 4.43
SERBP1-208ENST00000493607 PRDM2Q13029 1718 aa42.72■■■■■ 4.43
SERBP1-208ENST00000493607 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.48■■■■■ 4.39
SERBP1-208ENST00000493607 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.36■■■■■ 4.37
SERBP1-208ENST00000493607 ABCC8Q09428 1581 aa42.14■■■■■ 4.34
SERBP1-208ENST00000493607 TOPBP1Q92547 1522 aa42.05■■■■■ 4.32
SERBP1-208ENST00000493607 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.01■■■■■ 4.32
SERBP1-208ENST00000493607 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42■■■■■ 4.31
SERBP1-208ENST00000493607 IFT140Q96RY7 1462 aa41.92■■■■■ 4.3
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SERBP1-208ENST00000493607 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.66■■■■■ 4.26
SERBP1-208ENST00000493607 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.56■■■■■ 4.24
SERBP1-208ENST00000493607 CUX1P39880 1505 aa41.56■■■■■ 4.24
SERBP1-208ENST00000493607 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.48■■■■■ 4.23
SERBP1-208ENST00000493607 SOGA1O94964 1423 aa41.46■■■■■ 4.23
SERBP1-208ENST00000493607 WDR97A6NE52 1622 aa41.45■■■■■ 4.23
SERBP1-208ENST00000493607 OSCARQ8IYS5 282 aa41.43■■■■■ 4.22
SERBP1-208ENST00000493607 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.41■■■■■ 4.22
SERBP1-208ENST00000493607 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.37■■■■■ 4.216e-6■■■■□ 19.5
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SERBP1-208ENST00000493607 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.19■■■■■ 4.18
SERBP1-208ENST00000493607 TOP2BQ02880 1626 aa41.17■■■■■ 4.18
SERBP1-208ENST00000493607 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.15■■■■■ 4.18
SERBP1-208ENST00000493607 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.13■■■■■ 4.18
SERBP1-208ENST00000493607 CHD1O14646 1710 aa41.12■■■■■ 4.17
SERBP1-208ENST00000493607 GRIN2BQ13224 1484 aa41.07■■■■■ 4.16
SERBP1-208ENST00000493607 SYNJ1O43426 1573 aa41.05■■■■■ 4.16
SERBP1-208ENST00000493607 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.05■■■■■ 4.16
SERBP1-208ENST00000493607 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.01■■■■■ 4.16
SERBP1-208ENST00000493607 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.01■■■■■ 4.16
SERBP1-208ENST00000493607 GAPVD1Q14C86 1478 aa41■■■■■ 4.15
SERBP1-208ENST00000493607 PBRM1Q86U86 1689 aa40.98■■■■■ 4.15
SERBP1-208ENST00000493607 SYNJ2O15056 1496 aa40.86■■■■■ 4.13
SERBP1-208ENST00000493607 FBLN2P98095 1184 aa40.85■■■■■ 4.13
SERBP1-208ENST00000493607 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.84■■■■■ 4.13
SERBP1-208ENST00000493607 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.84■■■■■ 4.13
SERBP1-208ENST00000493607 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.84■■■■■ 4.13
SERBP1-208ENST00000493607 ARHGEF11O15085 1522 aa40.78■■■■■ 4.12
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SERBP1-208ENST00000493607 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.71■■■■■ 4.11
SERBP1-208ENST00000493607 TRIM41Q8WV44 630 aa40.7■■■■■ 4.11
SERBP1-208ENST00000493607 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.66■■■■■ 4.1
SERBP1-208ENST00000493607 ADAMTS12P58397 1594 aa40.62■■■■■ 4.09
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SERBP1-208ENST00000493607 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.53■■■■■ 4.08
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SERBP1-208ENST00000493607 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.31■■■■■ 4.04
SERBP1-208ENST00000493607 CUL7Q14999 1698 aa40.21■■■■■ 4.03
SERBP1-208ENST00000493607 IGF1RP08069 1367 aa40.21■■■■■ 4.03
SERBP1-208ENST00000493607 SHROOM2Q13796 1616 aa40.2■■■■■ 4.03
SERBP1-208ENST00000493607 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.03■■■■■ 4
SERBP1-208ENST00000493607 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.99■■■■□ 3.99
SERBP1-208ENST00000493607 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.95■■■■□ 3.99
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