RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492947.1

AGRN-209, Transcript of agrin, humanhuman

TSL 2

Gene AGRN, Length 690 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRN-209ENST00000492947 ABCC5O15440 1437 aa26.34■■□□□ 1.81
AGRN-209ENST00000492947 DMRT2Q9Y5R5 561 aa26.34■■□□□ 1.81
AGRN-209ENST00000492947 MYO3AQ8NEV4 1616 aa26.34■■□□□ 1.81
AGRN-209ENST00000492947 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
AGRN-209ENST00000492947 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
AGRN-209ENST00000492947 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
AGRN-209ENST00000492947 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.31■■□□□ 1.8
AGRN-209ENST00000492947 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.31■■□□□ 1.8
AGRN-209ENST00000492947 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.31■■□□□ 1.8
AGRN-209ENST00000492947 PZPP20742 1482 aa26.3■■□□□ 1.8
AGRN-209ENST00000492947 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
AGRN-209ENST00000492947 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.3■■□□□ 1.8
AGRN-209ENST00000492947 CERKQ8TCT0 537 aa26.29■■□□□ 1.8
AGRN-209ENST00000492947 MROH1Q8NDA8 1641 aa26.28■■□□□ 1.8
AGRN-209ENST00000492947 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
AGRN-209ENST00000492947 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
AGRN-209ENST00000492947 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa26.27■■□□□ 1.8
AGRN-209ENST00000492947 PLA2R1Q13018 1463 aa26.26■■□□□ 1.79
AGRN-209ENST00000492947 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.25■■□□□ 1.79
AGRN-209ENST00000492947 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.25■■□□□ 1.79
AGRN-209ENST00000492947 DAPK1P53355 1430 aa26.25■■□□□ 1.79
AGRN-209ENST00000492947 A2ML1A8K2U0 1454 aa26.24■■□□□ 1.79
AGRN-209ENST00000492947 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
AGRN-209ENST00000492947 ABCC3O15438 1527 aa26.24■■□□□ 1.79
AGRN-209ENST00000492947 LTBP4Q8N2S1 1624 aa26.21■■□□□ 1.79
AGRN-209ENST00000492947 TNRQ92752 1358 aa26.21■■□□□ 1.79
AGRN-209ENST00000492947 KIF15Q9NS87 1388 aa26.2■■□□□ 1.79
AGRN-209ENST00000492947 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa26.2■■□□□ 1.79
AGRN-209ENST00000492947 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
AGRN-209ENST00000492947 ERBINQ96RT1 1412 aa26.17■■□□□ 1.78
AGRN-209ENST00000492947 PKD2Q13563 968 aa26.16■■□□□ 1.78
AGRN-209ENST00000492947 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.15■■□□□ 1.78
AGRN-209ENST00000492947 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa26.15■■□□□ 1.78
AGRN-209ENST00000492947 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
AGRN-209ENST00000492947 NLRP1Q9C000 1473 aa26.12■■□□□ 1.77
AGRN-209ENST00000492947 DEPDC5O75140 1603 aa26.11■■□□□ 1.77
AGRN-209ENST00000492947 ADGRL2O95490 1459 aa26.11■■□□□ 1.77
AGRN-209ENST00000492947 ERVK-7P63135 1459 aa26.1■■□□□ 1.77
AGRN-209ENST00000492947 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa26.09■■□□□ 1.77
AGRN-209ENST00000492947 NEURL4Q96JN8 1562 aa26.08■■□□□ 1.77
AGRN-209ENST00000492947 CEP152O94986 1710 aa26.08■■□□□ 1.76
AGRN-209ENST00000492947 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.07■■□□□ 1.76
AGRN-209ENST00000492947 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.06■■□□□ 1.76
AGRN-209ENST00000492947 VWDEQ8N2E2 1590 aa26.06■■□□□ 1.76
AGRN-209ENST00000492947 FOXD1Q16676 465 aa26.05■■□□□ 1.76
AGRN-209ENST00000492947 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
AGRN-209ENST00000492947 UGGT1Q9NYU2 1555 aa26.04■■□□□ 1.76
AGRN-209ENST00000492947 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.04■■□□□ 1.76
AGRN-209ENST00000492947 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.03■■□□□ 1.76
AGRN-209ENST00000492947 LMTK2Q8IWU2 1503 aa26.03■■□□□ 1.76
AGRN-209ENST00000492947 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
AGRN-209ENST00000492947 MED14O60244 1454 aa26■■□□□ 1.75
AGRN-209ENST00000492947 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
AGRN-209ENST00000492947 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
AGRN-209ENST00000492947 ANKLE2Q86XL3 938 aa25.96■■□□□ 1.75
AGRN-209ENST00000492947 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.95■■□□□ 1.74
AGRN-209ENST00000492947 UBR1Q8IWV7 1749 aa25.93■■□□□ 1.74
AGRN-209ENST00000492947 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.92■■□□□ 1.74
AGRN-209ENST00000492947 ADRA2BP18089 450 aa25.91■■□□□ 1.74
AGRN-209ENST00000492947 KANK1Q14678 1352 aa25.91■■□□□ 1.74
AGRN-209ENST00000492947 ARHGAP23Q9P227 1491 aa25.91■■□□□ 1.74
AGRN-209ENST00000492947 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
AGRN-209ENST00000492947 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
AGRN-209ENST00000492947 ROCK1Q13464 1354 aa25.89■■□□□ 1.74
AGRN-209ENST00000492947 NOS1P29475 1434 aa25.88■■□□□ 1.73
AGRN-209ENST00000492947 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.88■■□□□ 1.73
AGRN-209ENST00000492947 SLIT1O75093 1534 aa25.88■■□□□ 1.73
AGRN-209ENST00000492947 SYNMO15061 1565 aa25.86■■□□□ 1.73
AGRN-209ENST00000492947 LTKP29376 864 aa25.84■■□□□ 1.73
AGRN-209ENST00000492947 PIK3C2BO00750 1634 aa25.84■■□□□ 1.73
AGRN-209ENST00000492947 IQGAP1P46940 1657 aa25.83■■□□□ 1.73
AGRN-209ENST00000492947 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
AGRN-209ENST00000492947 CPS1P31327 1500 aa25.83■■□□□ 1.72
AGRN-209ENST00000492947 IDI1Q13907 227 aa25.82■■□□□ 1.72
AGRN-209ENST00000492947 UNC13BO14795 1591 aa25.82■■□□□ 1.72
AGRN-209ENST00000492947 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
AGRN-209ENST00000492947 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
AGRN-209ENST00000492947 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
AGRN-209ENST00000492947 TMEM2Q9UHN6 1383 aa25.79■■□□□ 1.72
AGRN-209ENST00000492947 TET3O43151 1660 aa25.76■■□□□ 1.71
AGRN-209ENST00000492947 STRCP1A6NGW2 1772 aa25.76■■□□□ 1.71
AGRN-209ENST00000492947 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
AGRN-209ENST00000492947 TXNDC2Q86VQ3 553 aa25.75■■□□□ 1.71
AGRN-209ENST00000492947 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25.73■■□□□ 1.71
AGRN-209ENST00000492947 UBAP1LF5GYI3 381 aa25.72■■□□□ 1.71
AGRN-209ENST00000492947 ALKQ9UM73 1620 aa25.71■■□□□ 1.71
AGRN-209ENST00000492947 ADGRB3O60242 1522 aa25.71■■□□□ 1.71
AGRN-209ENST00000492947 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.7■■□□□ 1.7
AGRN-209ENST00000492947 IQGAP3Q86VI3 1631 aa25.7■■□□□ 1.7
AGRN-209ENST00000492947 LRRC7Q96NW7 1537 aa25.69■■□□□ 1.7
AGRN-209ENST00000492947 E9PCH4 1651 aa25.67■■□□□ 1.7
AGRN-209ENST00000492947 ITGAEP38570 1179 aa25.66■■□□□ 1.7
AGRN-209ENST00000492947 EID1Q9Y6B2 187 aa25.66■■□□□ 1.7
AGRN-209ENST00000492947 ZFYVE9O95405 1425 aa25.64■■□□□ 1.7
AGRN-209ENST00000492947 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.63■■□□□ 1.69
AGRN-209ENST00000492947 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa25.63■■□□□ 1.69
AGRN-209ENST00000492947 NUP155O75694 1391 aa25.62■■□□□ 1.69
AGRN-209ENST00000492947 NAIPQ13075 1403 aa25.58■■□□□ 1.69
AGRN-209ENST00000492947 TOM1O60784 492 aa25.58■■□□□ 1.69
AGRN-209ENST00000492947 MYO5BQ9ULV0 1848 aa25.56■■□□□ 1.68
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