RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492099.1

SH3GL3-204, Transcript of SH3 domain containing GRB2 like 3, endophilin A3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SH3GL3, Length 1,170 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3-204ENST00000492099 DMRT2Q9Y5R5 561 aa42.03■■■■■ 4.32
SH3GL3-204ENST00000492099 DUOX2Q9NRD8 1548 aa42■■■■■ 4.31
SH3GL3-204ENST00000492099 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP42■■■■■ 4.31
SH3GL3-204ENST00000492099 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP42■■■■■ 4.31
SH3GL3-204ENST00000492099 CROCC2H7BZ55 1655 aa42■■■■■ 4.31
SH3GL3-204ENST00000492099 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP41.98■■■■■ 4.31
SH3GL3-204ENST00000492099 KIF15Q9NS87 1388 aa41.98■■■■■ 4.31
SH3GL3-204ENST00000492099 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP41.96■■■■■ 4.31
SH3GL3-204ENST00000492099 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa41.95■■■■■ 4.31
SH3GL3-204ENST00000492099 STRCQ7RTU9 1775 aa41.94■■■■■ 4.3
SH3GL3-204ENST00000492099 PZPP20742 1482 aa41.92■■■■■ 4.3
SH3GL3-204ENST00000492099 MYO3AQ8NEV4 1616 aa41.91■■■■■ 4.3
SH3GL3-204ENST00000492099 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP41.9■■■■■ 4.3
SH3GL3-204ENST00000492099 ERBINQ96RT1 1412 aa41.89■■■■■ 4.3
SH3GL3-204ENST00000492099 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa41.88■■■■■ 4.3
SH3GL3-204ENST00000492099 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP41.88■■■■■ 4.29
SH3GL3-204ENST00000492099 NCOA1Q15788 1441 aa41.87■■■■■ 4.29
SH3GL3-204ENST00000492099 CHIC2Q9UKJ5 165 aa41.87■■■■■ 4.29
SH3GL3-204ENST00000492099 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP41.85■■■■■ 4.29
SH3GL3-204ENST00000492099 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP41.84■■■■■ 4.29
SH3GL3-204ENST00000492099 TNRQ92752 1358 aa41.84■■■■■ 4.29
SH3GL3-204ENST00000492099 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa41.84■■■■■ 4.29
SH3GL3-204ENST00000492099 PTPRTO14522 1441 aa41.83■■■■■ 4.29
SH3GL3-204ENST00000492099 ABCC3O15438 1527 aa41.83■■■■■ 4.29
SH3GL3-204ENST00000492099 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP41.82■■■■■ 4.29
SH3GL3-204ENST00000492099 MROH1Q8NDA8 1641 aa41.8■■■■■ 4.28
SH3GL3-204ENST00000492099 A2ML1A8K2U0 1454 aa41.79■■■■■ 4.28
SH3GL3-204ENST00000492099 FBXO41Q8TF61 875 aa41.77■■■■■ 4.28
SH3GL3-204ENST00000492099 PLA2R1Q13018 1463 aa41.76■■■■■ 4.28
SH3GL3-204ENST00000492099 ADGRL2O95490 1459 aa41.74■■■■■ 4.27
SH3GL3-204ENST00000492099 PKD2Q13563 968 aa41.72■■■■■ 4.27
SH3GL3-204ENST00000492099 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP41.71■■■■■ 4.27
SH3GL3-204ENST00000492099 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa41.69■■■■■ 4.27
SH3GL3-204ENST00000492099 CERKQ8TCT0 537 aa41.69■■■■■ 4.26
SH3GL3-204ENST00000492099 NLRP1Q9C000 1473 aa41.68■■■■■ 4.26
SH3GL3-204ENST00000492099 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP41.68■■■■■ 4.26
SH3GL3-204ENST00000492099 KANK1Q14678 1352 aa41.67■■■■■ 4.26
SH3GL3-204ENST00000492099 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP41.66■■■■■ 4.26
SH3GL3-204ENST00000492099 CEP152O94986 1710 aa41.65■■■■■ 4.26
SH3GL3-204ENST00000492099 DEPDC5O75140 1603 aa41.64■■■■■ 4.26
SH3GL3-204ENST00000492099 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa41.63■■■■■ 4.26
SH3GL3-204ENST00000492099 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa41.61■■■■■ 4.25
SH3GL3-204ENST00000492099 ERVK-7P63135 1459 aa41.61■■■■■ 4.25
SH3GL3-204ENST00000492099 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP41.6■■■■■ 4.25
SH3GL3-204ENST00000492099 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa41.56■■■■■ 4.24
SH3GL3-204ENST00000492099 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP41.55■■■■■ 4.24
SH3GL3-204ENST00000492099 UGGT1Q9NYU2 1555 aa41.54■■■■■ 4.24
SH3GL3-204ENST00000492099 LMTK2Q8IWU2 1503 aa41.51■■■■■ 4.24
SH3GL3-204ENST00000492099 ROCK1Q13464 1354 aa41.5■■■■■ 4.23
SH3GL3-204ENST00000492099 VWDEQ8N2E2 1590 aa41.5■■■■■ 4.23
SH3GL3-204ENST00000492099 ANKLE2Q86XL3 938 aa41.48■■■■■ 4.23
SH3GL3-204ENST00000492099 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP41.45■■■■■ 4.23
SH3GL3-204ENST00000492099 LTBP4Q8N2S1 1624 aa41.43■■■■■ 4.22
SH3GL3-204ENST00000492099 ITGAEP38570 1179 aa41.42■■■■■ 4.22
SH3GL3-204ENST00000492099 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP41.38■■■■■ 4.22
SH3GL3-204ENST00000492099 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP41.37■■■■■ 4.21
SH3GL3-204ENST00000492099 NEURL4Q96JN8 1562 aa41.35■■■■■ 4.21
SH3GL3-204ENST00000492099 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP41.34■■■■■ 4.21
SH3GL3-204ENST00000492099 EFCAB6Q5THR3 1501 aa41.34■■■■■ 4.21
SH3GL3-204ENST00000492099 MED14O60244 1454 aa41.31■■■■■ 4.2
SH3GL3-204ENST00000492099 IQSEC2Q5JU85 1478 aa41.29■■■■■ 4.2
SH3GL3-204ENST00000492099 UBR1Q8IWV7 1749 aa41.29■■■■■ 4.2
SH3GL3-204ENST00000492099 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP41.27■■■■■ 4.2
SH3GL3-204ENST00000492099 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP41.27■■■■■ 4.2
SH3GL3-204ENST00000492099 NOS1P29475 1434 aa41.27■■■■■ 4.2
SH3GL3-204ENST00000492099 UNC13BO14795 1591 aa41.26■■■■■ 4.2
SH3GL3-204ENST00000492099 IDI1Q13907 227 aa41.24■■■■■ 4.19
SH3GL3-204ENST00000492099 STAG3Q9UJ98 1225 aa41.24■■■■■ 4.19
SH3GL3-204ENST00000492099 TET3O43151 1660 aa41.2■■■■■ 4.19
SH3GL3-204ENST00000492099 SLC52A1Q9NWF4 448 aa41.2■■■■■ 4.19
SH3GL3-204ENST00000492099 SLIT1O75093 1534 aa41.19■■■■■ 4.18
SH3GL3-204ENST00000492099 PIK3C2BO00750 1634 aa41.19■■■■■ 4.18
SH3GL3-204ENST00000492099 ARHGAP23Q9P227 1491 aa41.19■■■■■ 4.18
SH3GL3-204ENST00000492099 SYNMO15061 1565 aa41.19■■■■■ 4.18
SH3GL3-204ENST00000492099 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP41.16■■■■■ 4.18
SH3GL3-204ENST00000492099 TXNDC2Q86VQ3 553 aa41.16■■■■■ 4.18
SH3GL3-204ENST00000492099 EID1Q9Y6B2 187 aa41.16■■■■■ 4.18
SH3GL3-204ENST00000492099 IQGAP1P46940 1657 aa41.15■■■■■ 4.18
SH3GL3-204ENST00000492099 NUP155O75694 1391 aa41.14■■■■■ 4.18
SH3GL3-204ENST00000492099 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP41.13■■■■■ 4.18
SH3GL3-204ENST00000492099 TMEM2Q9UHN6 1383 aa41.13■■■■■ 4.18
SH3GL3-204ENST00000492099 LTKP29376 864 aa41.13■■■■■ 4.17
SH3GL3-204ENST00000492099 GCC2Q8IWJ2 1684 aa41.13■■■■■ 4.17
SH3GL3-204ENST00000492099 IQGAP3Q86VI3 1631 aa41.11■■■■■ 4.17
SH3GL3-204ENST00000492099 CPS1P31327 1500 aa41.09■■■■■ 4.17
SH3GL3-204ENST00000492099 ADGRB3O60242 1522 aa41.03■■■■■ 4.16
SH3GL3-204ENST00000492099 E9PCH4 1651 aa41.01■■■■■ 4.15
SH3GL3-204ENST00000492099 NAIPQ13075 1403 aa41■■■■■ 4.15
SH3GL3-204ENST00000492099 UBAP1LF5GYI3 381 aa40.97■■■■■ 4.15
SH3GL3-204ENST00000492099 HFM1A2PYH4 1435 aa40.91■■■■■ 4.14
SH3GL3-204ENST00000492099 HDGFP51858 240 aaKnown RBP40.89■■■■■ 4.14
SH3GL3-204ENST00000492099 CHGAP10645 457 aaKnown RBP40.86■■■■■ 4.13
SH3GL3-204ENST00000492099 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa40.85■■■■■ 4.13
SH3GL3-204ENST00000492099 TOM1O60784 492 aa40.82■■■■■ 4.13
SH3GL3-204ENST00000492099 ZFYVE9O95405 1425 aa40.82■■■■■ 4.12
SH3GL3-204ENST00000492099 STRCP1A6NGW2 1772 aa40.81■■■■■ 4.12
SH3GL3-204ENST00000492099 RIMS2Q9UQ26 1411 aa40.81■■■■■ 4.12
SH3GL3-204ENST00000492099 LRRC7Q96NW7 1537 aa40.79■■■■■ 4.12
SH3GL3-204ENST00000492099 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP40.78■■■■■ 4.12
SH3GL3-204ENST00000492099 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP40.78■■■■■ 4.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 6.9 ms