RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490886.5

EXD3-211, Transcript of exonuclease 3'-5' domain containing 3, humanhuman

TSL 5

Gene EXD3, Length 1,123 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXD3-211ENST00000490886 KDM5DQ9BY66 1539 aa29.45■■■□□ 2.3
EXD3-211ENST00000490886 DAPK1P53355 1430 aa29.44■■■□□ 2.3
EXD3-211ENST00000490886 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
EXD3-211ENST00000490886 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
EXD3-211ENST00000490886 DUOX2Q9NRD8 1548 aa29.41■■■□□ 2.3
EXD3-211ENST00000490886 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa29.4■■■□□ 2.3
EXD3-211ENST00000490886 STRCQ7RTU9 1775 aa29.38■■■□□ 2.29
EXD3-211ENST00000490886 KIF15Q9NS87 1388 aa29.38■■■□□ 2.29
EXD3-211ENST00000490886 MYO3AQ8NEV4 1616 aa29.36■■■□□ 2.29
EXD3-211ENST00000490886 PZPP20742 1482 aa29.35■■■□□ 2.29
EXD3-211ENST00000490886 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa29.34■■■□□ 2.29
EXD3-211ENST00000490886 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
EXD3-211ENST00000490886 ERBINQ96RT1 1412 aa29.32■■■□□ 2.28
EXD3-211ENST00000490886 DMRT2Q9Y5R5 561 aa29.32■■■□□ 2.28
EXD3-211ENST00000490886 MROH1Q8NDA8 1641 aa29.31■■■□□ 2.28
EXD3-211ENST00000490886 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
EXD3-211ENST00000490886 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa29.3■■■□□ 2.28
EXD3-211ENST00000490886 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
EXD3-211ENST00000490886 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
EXD3-211ENST00000490886 ABCC3O15438 1527 aa29.3■■■□□ 2.28
EXD3-211ENST00000490886 NCOA1Q15788 1441 aa29.29■■■□□ 2.28
EXD3-211ENST00000490886 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
EXD3-211ENST00000490886 CHIC2Q9UKJ5 165 aa29.29■■■□□ 2.28
EXD3-211ENST00000490886 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa29.28■■■□□ 2.28
EXD3-211ENST00000490886 TNRQ92752 1358 aa29.27■■■□□ 2.28
EXD3-211ENST00000490886 ADGRL2O95490 1459 aa29.25■■■□□ 2.27
EXD3-211ENST00000490886 PTPRTO14522 1441 aa29.25■■■□□ 2.27
EXD3-211ENST00000490886 A2ML1A8K2U0 1454 aa29.24■■■□□ 2.27
EXD3-211ENST00000490886 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
EXD3-211ENST00000490886 CEP152O94986 1710 aa29.22■■■□□ 2.27
EXD3-211ENST00000490886 PLA2R1Q13018 1463 aa29.21■■■□□ 2.27
EXD3-211ENST00000490886 DEPDC5O75140 1603 aa29.2■■■□□ 2.26
EXD3-211ENST00000490886 FBXO41Q8TF61 875 aa29.19■■■□□ 2.26
EXD3-211ENST00000490886 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
EXD3-211ENST00000490886 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa29.16■■■□□ 2.26
EXD3-211ENST00000490886 NLRP1Q9C000 1473 aa29.16■■■□□ 2.26
EXD3-211ENST00000490886 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa29.15■■■□□ 2.26
EXD3-211ENST00000490886 PKD2Q13563 968 aa29.14■■■□□ 2.26
EXD3-211ENST00000490886 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP29.14■■■□□ 2.26
EXD3-211ENST00000490886 ERVK-7P63135 1459 aa29.14■■■□□ 2.26
EXD3-211ENST00000490886 KANK1Q14678 1352 aa29.13■■■□□ 2.25
EXD3-211ENST00000490886 CERKQ8TCT0 537 aa29.12■■■□□ 2.25
EXD3-211ENST00000490886 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa29.11■■■□□ 2.25
EXD3-211ENST00000490886 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29.09■■■□□ 2.253e-11■■■■■ 37.1
EXD3-211ENST00000490886 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa29.09■■■□□ 2.25
EXD3-211ENST00000490886 VWDEQ8N2E2 1590 aa29.09■■■□□ 2.25
EXD3-211ENST00000490886 LMTK2Q8IWU2 1503 aa29.07■■■□□ 2.24
EXD3-211ENST00000490886 UGGT1Q9NYU2 1555 aa29.07■■■□□ 2.24
EXD3-211ENST00000490886 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
EXD3-211ENST00000490886 ROCK1Q13464 1354 aa29.05■■■□□ 2.24
EXD3-211ENST00000490886 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
EXD3-211ENST00000490886 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
EXD3-211ENST00000490886 LTBP4Q8N2S1 1624 aa29■■■□□ 2.23
EXD3-211ENST00000490886 ITGAEP38570 1179 aa28.98■■■□□ 2.23
EXD3-211ENST00000490886 NEURL4Q96JN8 1562 aa28.97■■■□□ 2.23
EXD3-211ENST00000490886 ANKLE2Q86XL3 938 aa28.97■■■□□ 2.23
EXD3-211ENST00000490886 EFCAB6Q5THR3 1501 aa28.97■■■□□ 2.23
EXD3-211ENST00000490886 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.23
EXD3-211ENST00000490886 UBR1Q8IWV7 1749 aa28.94■■■□□ 2.22
EXD3-211ENST00000490886 UNC13BO14795 1591 aa28.93■■■□□ 2.22
EXD3-211ENST00000490886 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
EXD3-211ENST00000490886 MED14O60244 1454 aa28.9■■■□□ 2.22
EXD3-211ENST00000490886 NOS1P29475 1434 aa28.89■■■□□ 2.22
EXD3-211ENST00000490886 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
EXD3-211ENST00000490886 TET3O43151 1660 aa28.88■■■□□ 2.21
EXD3-211ENST00000490886 PIK3C2BO00750 1634 aa28.87■■■□□ 2.21
EXD3-211ENST00000490886 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
EXD3-211ENST00000490886 IQSEC2Q5JU85 1478 aa28.87■■■□□ 2.21
EXD3-211ENST00000490886 SYNMO15061 1565 aa28.87■■■□□ 2.21
EXD3-211ENST00000490886 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28.84■■■□□ 2.21
EXD3-211ENST00000490886 SLIT1O75093 1534 aa28.84■■■□□ 2.21
EXD3-211ENST00000490886 IDI1Q13907 227 aa28.83■■■□□ 2.21
EXD3-211ENST00000490886 ARHGAP23Q9P227 1491 aa28.83■■■□□ 2.21
EXD3-211ENST00000490886 IQGAP1P46940 1657 aa28.83■■■□□ 2.21
EXD3-211ENST00000490886 IQGAP3Q86VI3 1631 aa28.82■■■□□ 2.2
EXD3-211ENST00000490886 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
EXD3-211ENST00000490886 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
EXD3-211ENST00000490886 STAG3Q9UJ98 1225 aa28.8■■■□□ 2.2
EXD3-211ENST00000490886 SLC52A1Q9NWF4 448 aa28.79■■■□□ 2.2
EXD3-211ENST00000490886 NUP155O75694 1391 aa28.77■■■□□ 2.2
EXD3-211ENST00000490886 TMEM2Q9UHN6 1383 aa28.76■■■□□ 2.2
EXD3-211ENST00000490886 LTKP29376 864 aa28.76■■■□□ 2.19
EXD3-211ENST00000490886 TXNDC2Q86VQ3 553 aa28.76■■■□□ 2.19
EXD3-211ENST00000490886 ADGRB3O60242 1522 aa28.75■■■□□ 2.19
EXD3-211ENST00000490886 E9PCH4 1651 aa28.75■■■□□ 2.19
EXD3-211ENST00000490886 EID1Q9Y6B2 187 aa28.75■■■□□ 2.19
EXD3-211ENST00000490886 CPS1P31327 1500 aa28.74■■■□□ 2.19
EXD3-211ENST00000490886 NAIPQ13075 1403 aa28.71■■■□□ 2.19
EXD3-211ENST00000490886 HFM1A2PYH4 1435 aa28.65■■■□□ 2.18
EXD3-211ENST00000490886 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa28.62■■■□□ 2.17
EXD3-211ENST00000490886 MYO5BQ9ULV0 1848 aa28.62■■■□□ 2.17
EXD3-211ENST00000490886 STRCP1A6NGW2 1772 aa28.61■■■□□ 2.17
EXD3-211ENST00000490886 UBAP1LF5GYI3 381 aa28.61■■■□□ 2.17
EXD3-211ENST00000490886 ZFYVE9O95405 1425 aa28.58■■■□□ 2.17
EXD3-211ENST00000490886 CHGAP10645 457 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
EXD3-211ENST00000490886 RIMS2Q9UQ26 1411 aa28.56■■■□□ 2.16
EXD3-211ENST00000490886 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa28.55■■■□□ 2.16
EXD3-211ENST00000490886 LRRC7Q96NW7 1537 aa28.54■■■□□ 2.16
EXD3-211ENST00000490886 HDGFP51858 240 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
EXD3-211ENST00000490886 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms