RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490886.5

EXD3-211, Transcript of exonuclease 3'-5' domain containing 3, humanhuman

TSL 5

Gene EXD3, Length 1,123 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXD3-211ENST00000490886 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.69■■■■■ 5.07
EXD3-211ENST00000490886 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.69■■■■■ 4.26
EXD3-211ENST00000490886 ABCC9O60706 1549 aa41.13■■■■■ 4.17
EXD3-211ENST00000490886 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.42■■■■□ 3.9
EXD3-211ENST00000490886 NACADO15069 1562 aa39.28■■■■□ 3.88
EXD3-211ENST00000490886 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.14■■■■□ 3.86
EXD3-211ENST00000490886 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.94■■■■□ 3.82
EXD3-211ENST00000490886 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.82■■■■□ 3.81
EXD3-211ENST00000490886 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.63■■■■□ 3.78
EXD3-211ENST00000490886 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.51■■■■□ 3.76
EXD3-211ENST00000490886 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.36■■■■□ 3.73
EXD3-211ENST00000490886 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.23■■■■□ 3.71
EXD3-211ENST00000490886 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.15■■■■□ 3.7
EXD3-211ENST00000490886 SCRIBQ14160 1630 aa37.99■■■■□ 3.67
EXD3-211ENST00000490886 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.82■■■■□ 3.64
EXD3-211ENST00000490886 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.25■■■■□ 3.55
EXD3-211ENST00000490886 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.19■■■■□ 3.54
EXD3-211ENST00000490886 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.01■■■■□ 3.51
EXD3-211ENST00000490886 SMARCA4P51532 1647 aa36.31■■■■□ 3.4
EXD3-211ENST00000490886 NCAPD3P42695 1498 aa36.25■■■■□ 3.39
EXD3-211ENST00000490886 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.23■■■■□ 3.39
EXD3-211ENST00000490886 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.21■■■■□ 3.39
EXD3-211ENST00000490886 SMARCA2P51531 1590 aa36.15■■■■□ 3.38
EXD3-211ENST00000490886 HMGXB3Q12766 1538 aa36.04■■■■□ 3.36
EXD3-211ENST00000490886 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.98■■■■□ 3.35
EXD3-211ENST00000490886 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.98■■■■□ 3.35
EXD3-211ENST00000490886 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.89■■■■□ 3.34
EXD3-211ENST00000490886 WIZO95785 1651 aa35.56■■■■□ 3.28
EXD3-211ENST00000490886 ERCC6Q03468 1493 aa35.48■■■■□ 3.27
EXD3-211ENST00000490886 NESP48681 1621 aa35.48■■■■□ 3.27
EXD3-211ENST00000490886 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.43■■■■□ 3.26
EXD3-211ENST00000490886 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.36■■■■□ 3.25
EXD3-211ENST00000490886 CUX2O14529 1486 aa35.26■■■■□ 3.23
EXD3-211ENST00000490886 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.17■■■■□ 3.22
EXD3-211ENST00000490886 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.17■■■■□ 3.22
EXD3-211ENST00000490886 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.14■■■■□ 3.22
EXD3-211ENST00000490886 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.05■■■■□ 3.2
EXD3-211ENST00000490886 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.04■■■■□ 3.2
EXD3-211ENST00000490886 CFTRP13569 1480 aa34.89■■■■□ 3.18
EXD3-211ENST00000490886 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.81■■■■□ 3.16
EXD3-211ENST00000490886 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.79■■■■□ 3.16
EXD3-211ENST00000490886 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.77■■■■□ 3.16
EXD3-211ENST00000490886 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.77■■■■□ 3.16
EXD3-211ENST00000490886 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.76■■■■□ 3.15
EXD3-211ENST00000490886 WDR62O43379 1518 aa34.69■■■■□ 3.14
EXD3-211ENST00000490886 PRDM2Q13029 1718 aa34.59■■■■□ 3.13
EXD3-211ENST00000490886 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.45■■■■□ 3.1
EXD3-211ENST00000490886 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.23■■■■□ 3.07
EXD3-211ENST00000490886 TOPBP1Q92547 1522 aa34.17■■■■□ 3.06
EXD3-211ENST00000490886 ABCC8Q09428 1581 aa34.15■■■■□ 3.06
EXD3-211ENST00000490886 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.11■■■■□ 3.05
EXD3-211ENST00000490886 IFT140Q96RY7 1462 aa34.06■■■■□ 3.04
EXD3-211ENST00000490886 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.92■■■■□ 3.02
EXD3-211ENST00000490886 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.86■■■■□ 3.01
EXD3-211ENST00000490886 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.83■■■■□ 3.01
EXD3-211ENST00000490886 CUX1P39880 1505 aa33.78■■■■□ 3
EXD3-211ENST00000490886 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.77■■■■□ 3
EXD3-211ENST00000490886 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.72■■■□□ 2.99
EXD3-211ENST00000490886 OSCARQ8IYS5 282 aa33.72■■■□□ 2.99
EXD3-211ENST00000490886 SOGA1O94964 1423 aa33.7■■■□□ 2.99
EXD3-211ENST00000490886 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.7■■■□□ 2.99
EXD3-211ENST00000490886 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.69■■■□□ 2.986e-7■■□□□ 11.9
EXD3-211ENST00000490886 WDR97A6NE52 1622 aa33.56■■■□□ 2.96
EXD3-211ENST00000490886 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.56■■■□□ 2.96
EXD3-211ENST00000490886 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.42■■■□□ 2.946e-6■■■■■ 36.2
EXD3-211ENST00000490886 CHD1O14646 1710 aa33.42■■■□□ 2.94
EXD3-211ENST00000490886 TOP2BQ02880 1626 aa33.39■■■□□ 2.94
EXD3-211ENST00000490886 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.39■■■□□ 2.94
EXD3-211ENST00000490886 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.38■■■□□ 2.93
EXD3-211ENST00000490886 GRIN2BQ13224 1484 aa33.37■■■□□ 2.93
EXD3-211ENST00000490886 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.37■■■□□ 2.93
EXD3-211ENST00000490886 SYNJ1O43426 1573 aa33.35■■■□□ 2.93
EXD3-211ENST00000490886 FBLN2P98095 1184 aa33.34■■■□□ 2.93
EXD3-211ENST00000490886 TRIM41Q8WV44 630 aa33.34■■■□□ 2.93
EXD3-211ENST00000490886 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.32■■■□□ 2.92
EXD3-211ENST00000490886 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.31■■■□□ 2.92
EXD3-211ENST00000490886 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.28■■■□□ 2.92
EXD3-211ENST00000490886 PBRM1Q86U86 1689 aa33.26■■■□□ 2.92
EXD3-211ENST00000490886 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.22■■■□□ 2.91
EXD3-211ENST00000490886 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.22■■■□□ 2.91
EXD3-211ENST00000490886 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.22■■■□□ 2.91
EXD3-211ENST00000490886 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.2■■■□□ 2.91
EXD3-211ENST00000490886 SYNJ2O15056 1496 aa33.19■■■□□ 2.9
EXD3-211ENST00000490886 ARHGEF11O15085 1522 aa33.18■■■□□ 2.9
EXD3-211ENST00000490886 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.07■■■□□ 2.88
EXD3-211ENST00000490886 ADAMTS12P58397 1594 aa32.99■■■□□ 2.87
EXD3-211ENST00000490886 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.97■■■□□ 2.87
EXD3-211ENST00000490886 GRIN2AQ12879 1464 aa32.93■■■□□ 2.86
EXD3-211ENST00000490886 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.93■■■□□ 2.86
EXD3-211ENST00000490886 ARAP1Q96P48 1450 aa32.89■■■□□ 2.86
EXD3-211ENST00000490886 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.87■■■□□ 2.85
EXD3-211ENST00000490886 NUP160Q12769 1436 aa32.81■■■□□ 2.84
EXD3-211ENST00000490886 CEP170Q5SW79 1584 aa32.79■■■□□ 2.84
EXD3-211ENST00000490886 KIF27Q86VH2 1401 aa32.75■■■□□ 2.83
EXD3-211ENST00000490886 IGF1RP08069 1367 aa32.67■■■□□ 2.82
EXD3-211ENST00000490886 CUL7Q14999 1698 aa32.6■■■□□ 2.81
EXD3-211ENST00000490886 SHROOM2Q13796 1616 aa32.6■■■□□ 2.81
EXD3-211ENST00000490886 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.57■■■□□ 2.8
EXD3-211ENST00000490886 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.51■■■□□ 2.79
EXD3-211ENST00000490886 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.46■■■□□ 2.79
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