RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481705.1

MKRN1-212, Transcript of makorin ring finger protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene MKRN1, Length 636 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN1-212ENST00000481705 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa40.82■■■■■ 4.12
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MKRN1-212ENST00000481705 KDM5DQ9BY66 1539 aa40.8■■■■■ 4.12
MKRN1-212ENST00000481705 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP40.78■■■■■ 4.12
MKRN1-212ENST00000481705 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa40.72■■■■■ 4.11
MKRN1-212ENST00000481705 PTPN23Q9H3S7 1636 aa40.69■■■■■ 4.1
MKRN1-212ENST00000481705 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP40.68■■■■■ 4.1
MKRN1-212ENST00000481705 PZPP20742 1482 aa40.68■■■■■ 4.1
MKRN1-212ENST00000481705 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP40.67■■■■■ 4.1
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MKRN1-212ENST00000481705 CROCC2H7BZ55 1655 aa40.64■■■■■ 4.1
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MKRN1-212ENST00000481705 SHANK2Q9UPX8 1470 aa40.59■■■■■ 4.09
MKRN1-212ENST00000481705 DUOX2Q9NRD8 1548 aa40.59■■■■■ 4.09
MKRN1-212ENST00000481705 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP40.59■■■■■ 4.09
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MKRN1-212ENST00000481705 LTBP4Q8N2S1 1624 aa40.53■■■■■ 4.08
MKRN1-212ENST00000481705 MROH1Q8NDA8 1641 aa40.53■■■■■ 4.08
MKRN1-212ENST00000481705 DAPK1P53355 1430 aa40.52■■■■■ 4.08
MKRN1-212ENST00000481705 KIF15Q9NS87 1388 aa40.51■■■■■ 4.08
MKRN1-212ENST00000481705 CEP152O94986 1710 aa40.48■■■■■ 4.07
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MKRN1-212ENST00000481705 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa40.45■■■■■ 4.07
MKRN1-212ENST00000481705 ERBINQ96RT1 1412 aa40.44■■■■■ 4.06
MKRN1-212ENST00000481705 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP40.44■■■■■ 4.06
MKRN1-212ENST00000481705 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa40.4■■■■■ 4.06
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MKRN1-212ENST00000481705 UGGT1Q9NYU2 1555 aa40.38■■■■■ 4.05
MKRN1-212ENST00000481705 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP40.38■■■■■ 4.05
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MKRN1-212ENST00000481705 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP40.36■■■■■ 4.05
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MKRN1-212ENST00000481705 CHIC2Q9UKJ5 165 aa40.35■■■■■ 4.05
MKRN1-212ENST00000481705 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa40.35■■■■■ 4.05
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MKRN1-212ENST00000481705 NEURL4Q96JN8 1562 aa40.33■■■■■ 4.05
MKRN1-212ENST00000481705 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP40.33■■■■■ 4.05
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MKRN1-212ENST00000481705 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP40.28■■■■■ 4.04
MKRN1-212ENST00000481705 ANKLE2Q86XL3 938 aa40.27■■■■■ 4.04
MKRN1-212ENST00000481705 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP40.27■■■■■ 4.04
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MKRN1-212ENST00000481705 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa40.24■■■■■ 4.03
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MKRN1-212ENST00000481705 UBR1Q8IWV7 1749 aa40.16■■■■■ 4.02
MKRN1-212ENST00000481705 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP40.16■■■■■ 4.02
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MKRN1-212ENST00000481705 STRCP1A6NGW2 1772 aa39.87■■■■□ 3.97
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MKRN1-212ENST00000481705 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa39.6■■■■□ 3.93
MKRN1-212ENST00000481705 HSPA1LP34931 641 aa39.59■■■■□ 3.93
MKRN1-212ENST00000481705 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP39.58■■■■□ 3.93
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MKRN1-212ENST00000481705 SLC26A8Q96RN1 970 aa39.56■■■■□ 3.92
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