RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481220.5

SNHG12-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 12, human

TSL 3

Gene SNHG12, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG12-208	ENST00000481220	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		28.36	■■■□□ 2.13
SNHG12-208	ENST00000481220	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		28.35	■■■□□ 2.13
SNHG12-208	ENST00000481220	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	28.35	■■■□□ 2.13
SNHG12-208	ENST00000481220	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	28.33	■■■□□ 2.13
SNHG12-208	ENST00000481220	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		28.33	■■■□□ 2.13
SNHG12-208	ENST00000481220	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		28.32	■■■□□ 2.12
SNHG12-208	ENST00000481220	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	28.32	■■■□□ 2.12
SNHG12-208	ENST00000481220	KIF15	Q9NS87	1388 aa		28.29	■■■□□ 2.12
SNHG12-208	ENST00000481220	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		28.29	■■■□□ 2.12
SNHG12-208	ENST00000481220	PZP	P20742	1482 aa		28.28	■■■□□ 2.12
SNHG12-208	ENST00000481220	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	28.28	■■■□□ 2.12
SNHG12-208	ENST00000481220	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		28.28	■■■□□ 2.12
SNHG12-208	ENST00000481220	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		28.27	■■■□□ 2.12
SNHG12-208	ENST00000481220	NCOA1	Q15788	1441 aa		28.26	■■■□□ 2.12
SNHG12-208	ENST00000481220	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		28.26	■■■□□ 2.11
SNHG12-208	ENST00000481220	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	28.26	■■■□□ 2.11
SNHG12-208	ENST00000481220	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		28.25	■■■□□ 2.11
SNHG12-208	ENST00000481220	ABCC3	O15438	1527 aa		28.24	■■■□□ 2.11
SNHG12-208	ENST00000481220	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	28.24	■■■□□ 2.11
SNHG12-208	ENST00000481220	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		28.22	■■■□□ 2.11
SNHG12-208	ENST00000481220	PTPRT	O14522	1441 aa		28.21	■■■□□ 2.11
SNHG12-208	ENST00000481220	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		28.21	■■■□□ 2.11
SNHG12-208	ENST00000481220	TNR	Q92752	1358 aa		28.2	■■■□□ 2.1
SNHG12-208	ENST00000481220	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		28.2	■■■□□ 2.1
SNHG12-208	ENST00000481220	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	28.19	■■■□□ 2.1
SNHG12-208	ENST00000481220	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		28.19	■■■□□ 2.1
SNHG12-208	ENST00000481220	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	28.18	■■■□□ 2.1
SNHG12-208	ENST00000481220	ADGRL2	O95490	1459 aa		28.18	■■■□□ 2.1
SNHG12-208	ENST00000481220	PLA2R1	Q13018	1463 aa		28.17	■■■□□ 2.1
SNHG12-208	ENST00000481220	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	28.17	■■■□□ 2.1
SNHG12-208	ENST00000481220	FBXO41	Q8TF61	875 aa		28.15	■■■□□ 2.1
SNHG12-208	ENST00000481220	DEPDC5	O75140	1603 aa		28.14	■■■□□ 2.09
SNHG12-208	ENST00000481220	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		28.13	■■■□□ 2.09
SNHG12-208	ENST00000481220	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		28.11	■■■□□ 2.09
SNHG12-208	ENST00000481220	CERK	Q8TCT0	537 aa		28.11	■■■□□ 2.09
SNHG12-208	ENST00000481220	CEP152	O94986	1710 aa		28.1	■■■□□ 2.09
SNHG12-208	ENST00000481220	NLRP1	Q9C000	1473 aa		28.09	■■■□□ 2.09
SNHG12-208	ENST00000481220	PKD2	Q13563	968 aa		28.09	■■■□□ 2.09
SNHG12-208	ENST00000481220	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	28.09	■■■□□ 2.09
SNHG12-208	ENST00000481220	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		28.09	■■■□□ 2.09
SNHG12-208	ENST00000481220	ERVK-7	P63135	1459 aa		28.08	■■■□□ 2.09
SNHG12-208	ENST00000481220	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		28.06	■■■□□ 2.08
SNHG12-208	ENST00000481220	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	28.05	■■■□□ 2.08	5e-7	■■■□□ 16.9
SNHG12-208	ENST00000481220	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	28.03	■■■□□ 2.08	1e-7	■■□□□ 13.9
SNHG12-208	ENST00000481220	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		28.02	■■■□□ 2.08
SNHG12-208	ENST00000481220	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		28.02	■■■□□ 2.08
SNHG12-208	ENST00000481220	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		28.01	■■■□□ 2.08
SNHG12-208	ENST00000481220	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		28.01	■■■□□ 2.07
SNHG12-208	ENST00000481220	KANK1	Q14678	1352 aa		28	■■■□□ 2.07
SNHG12-208	ENST00000481220	ROCK1	Q13464	1354 aa		27.99	■■■□□ 2.07
SNHG12-208	ENST00000481220	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	27.99	■■■□□ 2.07
SNHG12-208	ENST00000481220	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		27.96	■■■□□ 2.07
SNHG12-208	ENST00000481220	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
SNHG12-208	ENST00000481220	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		27.92	■■■□□ 2.06
SNHG12-208	ENST00000481220	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	27.92	■■■□□ 2.06
SNHG12-208	ENST00000481220	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	27.92	■■■□□ 2.06
SNHG12-208	ENST00000481220	MED14	O60244	1454 aa		27.9	■■■□□ 2.06
SNHG12-208	ENST00000481220	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		27.9	■■■□□ 2.06
SNHG12-208	ENST00000481220	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
SNHG12-208	ENST00000481220	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		27.88	■■■□□ 2.05
SNHG12-208	ENST00000481220	NOS1	P29475	1434 aa		27.87	■■■□□ 2.05
SNHG12-208	ENST00000481220	ITGAE	P38570	1179 aa		27.86	■■■□□ 2.05
SNHG12-208	ENST00000481220	UNC13B	O14795	1591 aa		27.86	■■■□□ 2.05
SNHG12-208	ENST00000481220	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		27.84	■■■□□ 2.05
SNHG12-208	ENST00000481220	SYNM	O15061	1565 aa		27.84	■■■□□ 2.05
SNHG12-208	ENST00000481220	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
SNHG12-208	ENST00000481220	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.04
SNHG12-208	ENST00000481220	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		27.83	■■■□□ 2.04
SNHG12-208	ENST00000481220	IDI1	Q13907	227 aa		27.82	■■■□□ 2.04
SNHG12-208	ENST00000481220	SLIT1	O75093	1534 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SNHG12-208	ENST00000481220	PIK3C2B	O00750	1634 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SNHG12-208	ENST00000481220	TET3	O43151	1660 aa		27.8	■■■□□ 2.04
SNHG12-208	ENST00000481220	LTK	P29376	864 aa		27.77	■■■□□ 2.04
SNHG12-208	ENST00000481220	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	27.76	■■■□□ 2.03
SNHG12-208	ENST00000481220	IQGAP1	P46940	1657 aa		27.76	■■■□□ 2.03
SNHG12-208	ENST00000481220	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	27.76	■■■□□ 2.03
SNHG12-208	ENST00000481220	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		27.75	■■■□□ 2.03
SNHG12-208	ENST00000481220	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		27.74	■■■□□ 2.03
SNHG12-208	ENST00000481220	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		27.74	■■■□□ 2.03
SNHG12-208	ENST00000481220	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		27.73	■■■□□ 2.03
SNHG12-208	ENST00000481220	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		27.72	■■■□□ 2.03
SNHG12-208	ENST00000481220	NUP155	O75694	1391 aa		27.72	■■■□□ 2.03
SNHG12-208	ENST00000481220	CPS1	P31327	1500 aa		27.7	■■■□□ 2.02
SNHG12-208	ENST00000481220		E9PCH4	1651 aa		27.69	■■■□□ 2.02
SNHG12-208	ENST00000481220	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		27.68	■■■□□ 2.02
SNHG12-208	ENST00000481220	NAIP	Q13075	1403 aa		27.67	■■■□□ 2.02
SNHG12-208	ENST00000481220	ADGRB3	O60242	1522 aa		27.67	■■■□□ 2.02
SNHG12-208	ENST00000481220	EID1	Q9Y6B2	187 aa		27.66	■■■□□ 2.02
SNHG12-208	ENST00000481220	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		27.61	■■■□□ 2.01
SNHG12-208	ENST00000481220	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		27.59	■■■□□ 2.01
SNHG12-208	ENST00000481220	HFM1	A2PYH4	1435 aa		27.59	■■■□□ 2.01
SNHG12-208	ENST00000481220	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		27.58	■■■□□ 2.01
SNHG12-208	ENST00000481220	ZFYVE9	O95405	1425 aa		27.58	■■■□□ 2
SNHG12-208	ENST00000481220	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		27.55	■■■□□ 2
SNHG12-208	ENST00000481220	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		27.53	■■■□□ 2
SNHG12-208	ENST00000481220	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		27.5	■■□□□ 1.99
SNHG12-208	ENST00000481220	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		27.49	■■□□□ 1.99
SNHG12-208	ENST00000481220	ALK	Q9UM73	1620 aa		27.48	■■□□□ 1.99
SNHG12-208	ENST00000481220	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		27.48	■■□□□ 1.99
SNHG12-208	ENST00000481220	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		27.46	■■□□□ 1.99

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