RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479480.5

CTPS1-208, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 777 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-208ENST00000479480 ATXN8OSP0DMR3 200 aa13.64□□□□□ -0.23
CTPS1-208ENST00000479480 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
CTPS1-208ENST00000479480 ATP7AQ04656 1500 aa13.64□□□□□ -0.23
CTPS1-208ENST00000479480 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa13.62□□□□□ -0.23
CTPS1-208ENST00000479480 MBD5Q9P267 1494 aa13.62□□□□□ -0.23
CTPS1-208ENST00000479480 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
CTPS1-208ENST00000479480 IQSEC2Q5JU85 1478 aa13.61□□□□□ -0.23
CTPS1-208ENST00000479480 KIF3BO15066 747 aa13.6□□□□□ -0.23
CTPS1-208ENST00000479480 PLXNC1O60486 1568 aa13.6□□□□□ -0.23
CTPS1-208ENST00000479480 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
CTPS1-208ENST00000479480 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
CTPS1-208ENST00000479480 MROH2AA6NES4 1674 aa13.59□□□□□ -0.23
CTPS1-208ENST00000479480 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.23
CTPS1-208ENST00000479480 PLA2R1Q13018 1463 aa13.58□□□□□ -0.24
CTPS1-208ENST00000479480 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa13.57□□□□□ -0.24
CTPS1-208ENST00000479480 POTEDQ86YR6 584 aa13.57□□□□□ -0.24
CTPS1-208ENST00000479480 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
CTPS1-208ENST00000479480 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa13.55□□□□□ -0.24
CTPS1-208ENST00000479480 CEP162Q5TB80 1403 aa13.55□□□□□ -0.24
CTPS1-208ENST00000479480 A2ML1A8K2U0 1454 aa13.55□□□□□ -0.24
CTPS1-208ENST00000479480 TIAM1Q13009 1591 aa13.54□□□□□ -0.24
CTPS1-208ENST00000479480 HSPA1LP34931 641 aa13.54□□□□□ -0.24
CTPS1-208ENST00000479480 PIP4K2BP78356 416 aa13.54□□□□□ -0.24
CTPS1-208ENST00000479480 TNRQ92752 1358 aa13.54□□□□□ -0.24
CTPS1-208ENST00000479480 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa13.54□□□□□ -0.24
CTPS1-208ENST00000479480 MYO3AQ8NEV4 1616 aa13.53□□□□□ -0.24
CTPS1-208ENST00000479480 RSPH4AQ5TD94 716 aa13.53□□□□□ -0.24
CTPS1-208ENST00000479480 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
CTPS1-208ENST00000479480 ANKLE2Q86XL3 938 aa13.52□□□□□ -0.25
CTPS1-208ENST00000479480 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP13.52□□□□□ -0.25
CTPS1-208ENST00000479480 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
CTPS1-208ENST00000479480 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
CTPS1-208ENST00000479480 NCOA2Q15596 1464 aa13.5□□□□□ -0.25
CTPS1-208ENST00000479480 MIA2Q96PC5 1412 aa13.5□□□□□ -0.25
CTPS1-208ENST00000479480 TSPY4P0CV99 314 aa13.5□□□□□ -0.25
CTPS1-208ENST00000479480 TSPY10P0CW01 314 aa13.5□□□□□ -0.25
CTPS1-208ENST00000479480 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa13.49□□□□□ -0.25
CTPS1-208ENST00000479480 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa13.49□□□□□ -0.25
CTPS1-208ENST00000479480 TOM1O60784 492 aa13.49□□□□□ -0.25
CTPS1-208ENST00000479480 ADGBQ8N7X0 1667 aa13.49□□□□□ -0.25
CTPS1-208ENST00000479480 CCDC141Q6ZP82 1450 aa13.48□□□□□ -0.25
CTPS1-208ENST00000479480 PZPP20742 1482 aa13.48□□□□□ -0.25
CTPS1-208ENST00000479480 SHANK2Q9UPX8 1470 aa13.48□□□□□ -0.25
CTPS1-208ENST00000479480 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
CTPS1-208ENST00000479480 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa13.47□□□□□ -0.25
CTPS1-208ENST00000479480 NEURL4Q96JN8 1562 aa13.45□□□□□ -0.26
CTPS1-208ENST00000479480 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
CTPS1-208ENST00000479480 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
CTPS1-208ENST00000479480 KDM5DQ9BY66 1539 aa13.44□□□□□ -0.26
CTPS1-208ENST00000479480 CPS1P31327 1500 aa13.42□□□□□ -0.26
CTPS1-208ENST00000479480 NLRP1Q9C000 1473 aa13.42□□□□□ -0.26
CTPS1-208ENST00000479480 VWDEQ8N2E2 1590 aa13.41□□□□□ -0.26
CTPS1-208ENST00000479480 MED14O60244 1454 aa13.41□□□□□ -0.26
CTPS1-208ENST00000479480 UGGT1Q9NYU2 1555 aa13.41□□□□□ -0.26
CTPS1-208ENST00000479480 FAM135AQ9P2D6 1515 aa13.4□□□□□ -0.26
CTPS1-208ENST00000479480 LTKP29376 864 aa13.4□□□□□ -0.26
CTPS1-208ENST00000479480 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa13.39□□□□□ -0.27
CTPS1-208ENST00000479480 ARHGEF5Q12774 1597 aa13.39□□□□□ -0.27
CTPS1-208ENST00000479480 ALKQ9UM73 1620 aa13.39□□□□□ -0.27
CTPS1-208ENST00000479480 TXNDC2Q86VQ3 553 aa13.38□□□□□ -0.27
CTPS1-208ENST00000479480 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa13.37□□□□□ -0.27
CTPS1-208ENST00000479480 ABCC3O15438 1527 aa13.37□□□□□ -0.27
CTPS1-208ENST00000479480 LRRC7Q96NW7 1537 aa13.36□□□□□ -0.27
CTPS1-208ENST00000479480 ERVK-7P63135 1459 aa13.36□□□□□ -0.27
CTPS1-208ENST00000479480 VPS8Q8N3P4 1428 aa13.35□□□□□ -0.27
CTPS1-208ENST00000479480 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
CTPS1-208ENST00000479480 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
CTPS1-208ENST00000479480 RNF39Q9H2S5 420 aa13.34□□□□□ -0.27
CTPS1-208ENST00000479480 DEPDC5O75140 1603 aa13.34□□□□□ -0.27
CTPS1-208ENST00000479480 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
CTPS1-208ENST00000479480 STRCP1A6NGW2 1772 aa13.32□□□□□ -0.28
CTPS1-208ENST00000479480 MAST1Q9Y2H9 1570 aa13.32□□□□□ -0.28
CTPS1-208ENST00000479480 MROH1Q8NDA8 1641 aa13.31□□□□□ -0.28
CTPS1-208ENST00000479480 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
CTPS1-208ENST00000479480 ABCC5O15440 1437 aa13.31□□□□□ -0.28
CTPS1-208ENST00000479480 MYOM3Q5VTT5 1437 aa13.31□□□□□ -0.28
CTPS1-208ENST00000479480 IDI1Q13907 227 aa13.31□□□□□ -0.28
CTPS1-208ENST00000479480 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
CTPS1-208ENST00000479480 CHIC2Q9UKJ5 165 aa13.3□□□□□ -0.28
CTPS1-208ENST00000479480 IQGAP1P46940 1657 aa13.3□□□□□ -0.28
CTPS1-208ENST00000479480 KIF15Q9NS87 1388 aa13.3□□□□□ -0.28
CTPS1-208ENST00000479480 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
CTPS1-208ENST00000479480 EID1Q9Y6B2 187 aa13.29□□□□□ -0.28
CTPS1-208ENST00000479480 ARHGAP23Q9P227 1491 aa13.29□□□□□ -0.28
CTPS1-208ENST00000479480 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa13.28□□□□□ -0.28
CTPS1-208ENST00000479480 DUOX2Q9NRD8 1548 aa13.28□□□□□ -0.28
CTPS1-208ENST00000479480 SLC26A8Q96RN1 970 aa13.27□□□□□ -0.29
CTPS1-208ENST00000479480 STAG3Q9UJ98 1225 aa13.27□□□□□ -0.29
CTPS1-208ENST00000479480 MAP3K1Q13233 1512 aa13.27□□□□□ -0.29
CTPS1-208ENST00000479480 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
CTPS1-208ENST00000479480 TMEM2Q9UHN6 1383 aa13.26□□□□□ -0.29
CTPS1-208ENST00000479480 UBR1Q8IWV7 1749 aa13.25□□□□□ -0.29
CTPS1-208ENST00000479480 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
CTPS1-208ENST00000479480 SLIT1O75093 1534 aa13.25□□□□□ -0.29
CTPS1-208ENST00000479480 KCNA6P17658 529 aa13.25□□□□□ -0.29
CTPS1-208ENST00000479480 CEP152O94986 1710 aa13.25□□□□□ -0.29
CTPS1-208ENST00000479480 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
CTPS1-208ENST00000479480 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
CTPS1-208ENST00000479480 TMEM94Q12767 1356 aa13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.8 ms