RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477886.5

PRKRIP1-205, Transcript of PRKR interacting protein 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRKRIP1, Length 986 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1-205ENST00000477886 MAP3K1Q13233 1512 aa37.47■■■■□ 3.59
PRKRIP1-205ENST00000477886 APLP2Q06481 763 aa37.44■■■■□ 3.58
PRKRIP1-205ENST00000477886 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP37.43■■■■□ 3.58
PRKRIP1-205ENST00000477886 LTBP4Q8N2S1 1624 aa37.43■■■■□ 3.58
PRKRIP1-205ENST00000477886 PLA2R1Q13018 1463 aa37.42■■■■□ 3.58
PRKRIP1-205ENST00000477886 MYOM3Q5VTT5 1437 aa37.42■■■■□ 3.58
PRKRIP1-205ENST00000477886 PKD2Q13563 968 aa37.41■■■■□ 3.58
PRKRIP1-205ENST00000477886 A2ML1A8K2U0 1454 aa37.4■■■■□ 3.58
PRKRIP1-205ENST00000477886 TNRQ92752 1358 aa37.4■■■■□ 3.58
PRKRIP1-205ENST00000477886 FAM135AQ9P2D6 1515 aa37.39■■■■□ 3.58
PRKRIP1-205ENST00000477886 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP37.37■■■■□ 3.57
PRKRIP1-205ENST00000477886 PZPP20742 1482 aa37.37■■■■□ 3.57
PRKRIP1-205ENST00000477886 MAST1Q9Y2H9 1570 aa37.37■■■■□ 3.57
PRKRIP1-205ENST00000477886 MIA2Q96PC5 1412 aa37.36■■■■□ 3.57
PRKRIP1-205ENST00000477886 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP37.34■■■■□ 3.57
PRKRIP1-205ENST00000477886 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP37.34■■■■□ 3.57
PRKRIP1-205ENST00000477886 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP37.28■■■■□ 3.56
PRKRIP1-205ENST00000477886 IQSEC2Q5JU85 1478 aa37.26■■■■□ 3.56
PRKRIP1-205ENST00000477886 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP37.25■■■■□ 3.55
PRKRIP1-205ENST00000477886 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP37.24■■■■□ 3.55
PRKRIP1-205ENST00000477886 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP37.23■■■■□ 3.55
PRKRIP1-205ENST00000477886 PTPN23Q9H3S7 1636 aa37.21■■■■□ 3.55
PRKRIP1-205ENST00000477886 ABCC3O15438 1527 aa37.21■■■■□ 3.55
PRKRIP1-205ENST00000477886 DUOX2Q9NRD8 1548 aa37.19■■■■□ 3.54
PRKRIP1-205ENST00000477886 NLRP1Q9C000 1473 aa37.19■■■■□ 3.54
PRKRIP1-205ENST00000477886 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP37.18■■■■□ 3.54
PRKRIP1-205ENST00000477886 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP37.18■■■■□ 3.54
PRKRIP1-205ENST00000477886 UGGT1Q9NYU2 1555 aa37.17■■■■□ 3.54
PRKRIP1-205ENST00000477886 CEP152O94986 1710 aa37.17■■■■□ 3.54
PRKRIP1-205ENST00000477886 CROCC2H7BZ55 1655 aa37.17■■■■□ 3.54
PRKRIP1-205ENST00000477886 ANKLE2Q86XL3 938 aa37.15■■■■□ 3.54
PRKRIP1-205ENST00000477886 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa37.15■■■■□ 3.54
PRKRIP1-205ENST00000477886 UBAP1LF5GYI3 381 aa37.14■■■■□ 3.54
PRKRIP1-205ENST00000477886 KIF15Q9NS87 1388 aa37.14■■■■□ 3.54
PRKRIP1-205ENST00000477886 MROH1Q8NDA8 1641 aa37.13■■■■□ 3.53
PRKRIP1-205ENST00000477886 NEURL4Q96JN8 1562 aa37.12■■■■□ 3.53
PRKRIP1-205ENST00000477886 ABCC5O15440 1437 aa37.12■■■■□ 3.53
PRKRIP1-205ENST00000477886 SHANK2Q9UPX8 1470 aa37.1■■■■□ 3.53
PRKRIP1-205ENST00000477886 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP37.09■■■■□ 3.53
PRKRIP1-205ENST00000477886 DAPK1P53355 1430 aa37.09■■■■□ 3.53
PRKRIP1-205ENST00000477886 FGD6Q6ZV73 1430 aa37.09■■■■□ 3.53
PRKRIP1-205ENST00000477886 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa37.08■■■■□ 3.53
PRKRIP1-205ENST00000477886 ERVK-7P63135 1459 aa37.07■■■■□ 3.53
PRKRIP1-205ENST00000477886 DISP3Q9P2K9 1392 aa37.07■■■■□ 3.53
PRKRIP1-205ENST00000477886 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP37.07■■■■□ 3.524e-9■■□□□ 11.4
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PRKRIP1-205ENST00000477886 ERBINQ96RT1 1412 aa37.04■■■■□ 3.52
PRKRIP1-205ENST00000477886 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP37.01■■■■□ 3.51
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PRKRIP1-205ENST00000477886 DEPDC5O75140 1603 aa36.99■■■■□ 3.51
PRKRIP1-205ENST00000477886 CPS1P31327 1500 aa36.97■■■■□ 3.51
PRKRIP1-205ENST00000477886 KANK1Q14678 1352 aa36.96■■■■□ 3.51
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PRKRIP1-205ENST00000477886 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa36.95■■■■□ 3.51
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PRKRIP1-205ENST00000477886 VWDEQ8N2E2 1590 aa36.9■■■■□ 3.5
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PRKRIP1-205ENST00000477886 TOM1O60784 492 aa36.84■■■■□ 3.49
PRKRIP1-205ENST00000477886 STAG3Q9UJ98 1225 aa36.83■■■■□ 3.49
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PRKRIP1-205ENST00000477886 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP36.79■■■■□ 3.48
PRKRIP1-205ENST00000477886 PIK3C2BO00750 1634 aa36.78■■■■□ 3.48
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PRKRIP1-205ENST00000477886 EID1Q9Y6B2 187 aa36.76■■■■□ 3.48
PRKRIP1-205ENST00000477886 ADGRL2O95490 1459 aa36.74■■■■□ 3.47
PRKRIP1-205ENST00000477886 STRCP1A6NGW2 1772 aa36.73■■■■□ 3.47
PRKRIP1-205ENST00000477886 LTKP29376 864 aa36.73■■■■□ 3.47
PRKRIP1-205ENST00000477886 SLIT1O75093 1534 aa36.72■■■■□ 3.47
PRKRIP1-205ENST00000477886 LMTK2Q8IWU2 1503 aa36.72■■■■□ 3.47
PRKRIP1-205ENST00000477886 ARHGAP23Q9P227 1491 aa36.7■■■■□ 3.47
PRKRIP1-205ENST00000477886 HSPA1LP34931 641 aa36.69■■■■□ 3.46
PRKRIP1-205ENST00000477886 EFCAB6Q5THR3 1501 aa36.67■■■■□ 3.46
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PRKRIP1-205ENST00000477886 LRRC7Q96NW7 1537 aa36.66■■■■□ 3.46
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PRKRIP1-205ENST00000477886 TMEM2Q9UHN6 1383 aa36.65■■■■□ 3.46
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PRKRIP1-205ENST00000477886 BCANQ96GW7 911 aa36.54■■■■□ 3.44
PRKRIP1-205ENST00000477886 ADGRB3O60242 1522 aa36.54■■■■□ 3.44
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PRKRIP1-205ENST00000477886 ITGAEP38570 1179 aa36.53■■■■□ 3.44
PRKRIP1-205ENST00000477886 SLC52A1Q9NWF4 448 aa36.53■■■■□ 3.44
PRKRIP1-205ENST00000477886 TET3O43151 1660 aa36.51■■■■□ 3.44
PRKRIP1-205ENST00000477886 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP36.5■■■■□ 3.43
PRKRIP1-205ENST00000477886 SLC26A8Q96RN1 970 aa36.49■■■■□ 3.43
PRKRIP1-205ENST00000477886 GCC2Q8IWJ2 1684 aa36.46■■■■□ 3.43
PRKRIP1-205ENST00000477886 UNC13BO14795 1591 aa36.46■■■■□ 3.43
PRKRIP1-205ENST00000477886 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP36.45■■■■□ 3.43
PRKRIP1-205ENST00000477886 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP36.43■■■■□ 3.42
PRKRIP1-205ENST00000477886 CHGAP10645 457 aaKnown RBP36.42■■■■□ 3.42
PRKRIP1-205ENST00000477886 MYO5BQ9ULV0 1848 aa36.41■■■■□ 3.42
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