RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468018.5

ATG4B-215, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4B, Length 721 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-215ENST00000468018 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.54■■□□□ 1.36
ATG4B-215ENST00000468018 KIF3BO15066 747 aa23.54■■□□□ 1.36
ATG4B-215ENST00000468018 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
ATG4B-215ENST00000468018 ADGRL2O95490 1459 aa23.52■■□□□ 1.36
ATG4B-215ENST00000468018 PTPRKQ15262 1439 aa23.51■■□□□ 1.35
ATG4B-215ENST00000468018 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.51■■□□□ 1.35
ATG4B-215ENST00000468018 KIF15Q9NS87 1388 aa23.51■■□□□ 1.35
ATG4B-215ENST00000468018 ERBINQ96RT1 1412 aa23.5■■□□□ 1.35
ATG4B-215ENST00000468018 DEPDC5O75140 1603 aa23.5■■□□□ 1.35
ATG4B-215ENST00000468018 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
ATG4B-215ENST00000468018 NCOA1Q15788 1441 aa23.49■■□□□ 1.35
ATG4B-215ENST00000468018 MYO3AQ8NEV4 1616 aa23.48■■□□□ 1.35
ATG4B-215ENST00000468018 HSPA2P54652 639 aa23.47■■□□□ 1.35
ATG4B-215ENST00000468018 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
ATG4B-215ENST00000468018 ABCC3O15438 1527 aa23.46■■□□□ 1.35
ATG4B-215ENST00000468018 PZPP20742 1482 aa23.46■■□□□ 1.35
ATG4B-215ENST00000468018 STRCQ7RTU9 1775 aa23.46■■□□□ 1.35
ATG4B-215ENST00000468018 CEP152O94986 1710 aa23.45■■□□□ 1.34
ATG4B-215ENST00000468018 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.45■■□□□ 1.34
ATG4B-215ENST00000468018 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.45■■□□□ 1.345e-9■■■■□ 24.7
ATG4B-215ENST00000468018 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
ATG4B-215ENST00000468018 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.42■■□□□ 1.34
ATG4B-215ENST00000468018 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa23.41■■□□□ 1.34
ATG4B-215ENST00000468018 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa23.4■■□□□ 1.34
ATG4B-215ENST00000468018 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
ATG4B-215ENST00000468018 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.39■■□□□ 1.33
ATG4B-215ENST00000468018 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
ATG4B-215ENST00000468018 VWDEQ8N2E2 1590 aa23.39■■□□□ 1.33
ATG4B-215ENST00000468018 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
ATG4B-215ENST00000468018 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa23.36■■□□□ 1.33
ATG4B-215ENST00000468018 ROCK1Q13464 1354 aa23.35■■□□□ 1.33
ATG4B-215ENST00000468018 LMTK2Q8IWU2 1503 aa23.33■■□□□ 1.33
ATG4B-215ENST00000468018 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
ATG4B-215ENST00000468018 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa23.33■■□□□ 1.32
ATG4B-215ENST00000468018 A2ML1A8K2U0 1454 aa23.32■■□□□ 1.32
ATG4B-215ENST00000468018 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
ATG4B-215ENST00000468018 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.32■■□□□ 1.32
ATG4B-215ENST00000468018 TNRQ92752 1358 aa23.31■■□□□ 1.32
ATG4B-215ENST00000468018 PLA2R1Q13018 1463 aa23.3■■□□□ 1.32
ATG4B-215ENST00000468018 ERVK-7P63135 1459 aa23.3■■□□□ 1.32
ATG4B-215ENST00000468018 UNC13BO14795 1591 aa23.29■■□□□ 1.32
ATG4B-215ENST00000468018 NLRP1Q9C000 1473 aa23.28■■□□□ 1.32
ATG4B-215ENST00000468018 PTPRTO14522 1441 aa23.25■■□□□ 1.31
ATG4B-215ENST00000468018 KANK1Q14678 1352 aa23.24■■□□□ 1.31
ATG4B-215ENST00000468018 EFCAB6Q5THR3 1501 aa23.23■■□□□ 1.31
ATG4B-215ENST00000468018 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
ATG4B-215ENST00000468018 TET3O43151 1660 aa23.21■■□□□ 1.31
ATG4B-215ENST00000468018 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.2■■□□□ 1.3
ATG4B-215ENST00000468018 UGGT1Q9NYU2 1555 aa23.2■■□□□ 1.3
ATG4B-215ENST00000468018 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.2■■□□□ 1.31e-13■□□□□ 10.9
ATG4B-215ENST00000468018 DMRT2Q9Y5R5 561 aa23.2■■□□□ 1.3
ATG4B-215ENST00000468018 UBR1Q8IWV7 1749 aa23.19■■□□□ 1.3
ATG4B-215ENST00000468018 IQGAP3Q86VI3 1631 aa23.19■■□□□ 1.3
ATG4B-215ENST00000468018 SYNMO15061 1565 aa23.16■■□□□ 1.3
ATG4B-215ENST00000468018 NEURL4Q96JN8 1562 aa23.16■■□□□ 1.3
ATG4B-215ENST00000468018 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
ATG4B-215ENST00000468018 NOS1P29475 1434 aa23.16■■□□□ 1.3
ATG4B-215ENST00000468018 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
ATG4B-215ENST00000468018 PKD2Q13563 968 aa23.15■■□□□ 1.3
ATG4B-215ENST00000468018 ITGAEP38570 1179 aa23.14■■□□□ 1.29
ATG4B-215ENST00000468018 E9PCH4 1651 aa23.13■■□□□ 1.29
ATG4B-215ENST00000468018 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa23.12■■□□□ 1.29
ATG4B-215ENST00000468018 PIK3C2BO00750 1634 aa23.12■■□□□ 1.29
ATG4B-215ENST00000468018 NAIPQ13075 1403 aa23.11■■□□□ 1.29
ATG4B-215ENST00000468018 LTBP4Q8N2S1 1624 aa23.1■■□□□ 1.29
ATG4B-215ENST00000468018 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
ATG4B-215ENST00000468018 MED14O60244 1454 aa23.09■■□□□ 1.29
ATG4B-215ENST00000468018 SLIT1O75093 1534 aa23.08■■□□□ 1.28
ATG4B-215ENST00000468018 ARHGAP23Q9P227 1491 aa23.07■■□□□ 1.28
ATG4B-215ENST00000468018 HFM1A2PYH4 1435 aa23.07■■□□□ 1.28
ATG4B-215ENST00000468018 IQGAP1P46940 1657 aa23.03■■□□□ 1.28
ATG4B-215ENST00000468018 NUP155O75694 1391 aa23.02■■□□□ 1.28
ATG4B-215ENST00000468018 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
ATG4B-215ENST00000468018 ADGRB3O60242 1522 aa23.02■■□□□ 1.28
ATG4B-215ENST00000468018 MYO5BQ9ULV0 1848 aa23.01■■□□□ 1.27
ATG4B-215ENST00000468018 IDI1Q13907 227 aa23.01■■□□□ 1.27
ATG4B-215ENST00000468018 ANKLE2Q86XL3 938 aa23.01■■□□□ 1.27
ATG4B-215ENST00000468018 CERKQ8TCT0 537 aa23■■□□□ 1.27
ATG4B-215ENST00000468018 SLC52A1Q9NWF4 448 aa22.99■■□□□ 1.27
ATG4B-215ENST00000468018 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
ATG4B-215ENST00000468018 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa22.97■■□□□ 1.27
ATG4B-215ENST00000468018 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa22.97■■□□□ 1.27
ATG4B-215ENST00000468018 FBXO41Q8TF61 875 aa22.97■■□□□ 1.27
ATG4B-215ENST00000468018 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
ATG4B-215ENST00000468018 TMEM2Q9UHN6 1383 aa22.96■■□□□ 1.27
ATG4B-215ENST00000468018 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.96■■□□□ 1.27
ATG4B-215ENST00000468018 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
ATG4B-215ENST00000468018 LTKP29376 864 aa22.92■■□□□ 1.26
ATG4B-215ENST00000468018 STRCP1A6NGW2 1772 aa22.91■■□□□ 1.26
ATG4B-215ENST00000468018 ZFYVE9O95405 1425 aa22.89■■□□□ 1.25
ATG4B-215ENST00000468018 CPS1P31327 1500 aa22.87■■□□□ 1.25
ATG4B-215ENST00000468018 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.87■■□□□ 1.25
ATG4B-215ENST00000468018 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.86■■□□□ 1.25
ATG4B-215ENST00000468018 TRPM2O94759 1503 aa22.86■■□□□ 1.25
ATG4B-215ENST00000468018 CLTCL1P53675 1640 aa22.83■■□□□ 1.25
ATG4B-215ENST00000468018 EID1Q9Y6B2 187 aa22.83■■□□□ 1.25
ATG4B-215ENST00000468018 KIF1BO60333 1816 aa22.8■■□□□ 1.24
ATG4B-215ENST00000468018 RIMS2Q9UQ26 1411 aa22.79■■□□□ 1.24
ATG4B-215ENST00000468018 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa22.76■■□□□ 1.23
ATG4B-215ENST00000468018 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.76■■□□□ 1.23
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